FuNGI

S8CCV2

Protein Details

Accession

S8CCV2

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
29-55	YFNQDNSDQWKKRKQTKEESQAAKRAK	Hydrophilic
68-125	EEERTRQRTEREEKRRKLNEDGVGYETKSQMKARKKEEKRRERRDKKQLDPKPQAGEK	Basic
164-184	KEQHHPAKRKEVKQNGVKPNG	Basic
347-371	LMDQRRKRDELRKERKKQMRLQAKI	Basic
480-509	DESLLKKSLKRQEKAKKKSEREWNERNANV	Hydrophilic
511-558	KAKVMRQKKRDANIAARKEQKKAGKSGKKAPRKAPSKKSKGRAGFEGT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
98-116	MKARKKEEKRRERRDKKQL
350-366	QRRKRDELRKERKKQMR
485-568	KKSLKRQEKAKKKSEREWNERNANVVKAKVMRQKKRDANIAARKEQKKAGKSGKKAPRKAPSKKSKGRAGFEGTGFSGAGKKKR

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 12.666

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR029190 Rrp14/SURF6_C IPR029188 Rrp14_N IPR007019 SURF6
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF15459 RRP14 PF04935 SURF6

Amino Acid Sequences

MSGQDIEDRLRSHAKAFDSLLNLIPAKLYFNQDNSDQWKKRKQTKEESQAAKRAKLDPDQAVTVKEVEEERTRQRTEREEKRRKLNEDGVGYETKSQMKARKKEEKRRERRDKKQLDPKPQAGEKNTLAEEDNHVPEETTVPTSKKQKIETPKNAAKAVESPVKEQHHPAKRKEVKQNGVKPNGVQIRVNGTQNTGKATIQKPAPKPTPKPATAKPSSEGGDEDRDEEEEMVEDGDQIADEMPDVSDSEEDEEAADDDSGDEEGDSIRRIKGLASTMDETTSASPSPAPSNTTDTSTAQKSLAEKLKNSKDPAVQQQLKERLAKRIEELRQARKADGGQAPRTRTELMDQRRKRDELRKERKKQMRLQAKIEAAKSQEDPAPADASKPHAKSNGVSTAPANYSFGQVNFDDGEGLSANLDSLRSAKKKRGPTDVLGALKQVEAKKARLANMSDDKRADIQEKDRWSKALKMASGEKLQDDESLLKKSLKRQEKAKKKSEREWNERNANVVKAKVMRQKKRDANIAARKEQKKAGKSGKKAPRKAPSKKSKGRAGFEGTGFSGAGKKKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.35
3	0.36
4	0.37
5	0.35
6	0.36
7	0.34
8	0.32
9	0.29
10	0.24
11	0.22
12	0.18
13	0.18
14	0.19
15	0.23
16	0.23
17	0.25
18	0.28
19	0.29
20	0.35
21	0.39
22	0.47
23	0.48
24	0.52
25	0.59
26	0.65
27	0.74
28	0.78
29	0.81
30	0.81
31	0.86
32	0.88
33	0.89
34	0.89
35	0.86
36	0.84
37	0.79
38	0.72
39	0.65
40	0.6
41	0.56
42	0.53
43	0.52
44	0.49
45	0.48
46	0.48
47	0.46
48	0.41
49	0.37
50	0.31
51	0.24
52	0.21
53	0.18
54	0.18
55	0.22
56	0.25
57	0.32
58	0.38
59	0.4
60	0.42
61	0.47
62	0.53
63	0.57
64	0.64
65	0.67
66	0.71
67	0.77
68	0.84
69	0.87
70	0.82
71	0.81
72	0.79
73	0.75
74	0.69
75	0.64
76	0.57
77	0.5
78	0.45
79	0.38
80	0.32
81	0.26
82	0.24
83	0.26
84	0.3
85	0.38
86	0.46
87	0.54
88	0.63
89	0.71
90	0.79
91	0.86
92	0.89
93	0.9
94	0.93
95	0.95
96	0.95
97	0.95
98	0.95
99	0.94
100	0.93
101	0.93
102	0.91
103	0.9
104	0.88
105	0.83
106	0.81
107	0.75
108	0.71
109	0.64
110	0.61
111	0.52
112	0.48
113	0.42
114	0.34
115	0.31
116	0.26
117	0.27
118	0.25
119	0.24
120	0.2
121	0.2
122	0.19
123	0.18
124	0.18
125	0.15
126	0.14
127	0.15
128	0.16
129	0.22
130	0.29
131	0.36
132	0.4
133	0.42
134	0.47
135	0.56
136	0.65
137	0.69
138	0.72
139	0.71
140	0.7
141	0.68
142	0.6
143	0.5
144	0.43
145	0.38
146	0.35
147	0.29
148	0.28
149	0.33
150	0.36
151	0.36
152	0.38
153	0.42
154	0.45
155	0.51
156	0.53
157	0.57
158	0.63
159	0.7
160	0.75
161	0.75
162	0.74
163	0.77
164	0.83
165	0.81
166	0.78
167	0.7
168	0.6
169	0.59
170	0.55
171	0.47
172	0.37
173	0.29
174	0.3
175	0.32
176	0.33
177	0.25
178	0.23
179	0.24
180	0.24
181	0.26
182	0.2
183	0.18
184	0.22
185	0.23
186	0.25
187	0.27
188	0.34
189	0.35
190	0.42
191	0.5
192	0.51
193	0.55
194	0.59
195	0.63
196	0.6
197	0.63
198	0.61
199	0.62
200	0.59
201	0.57
202	0.49
203	0.44
204	0.41
205	0.35
206	0.3
207	0.23
208	0.22
209	0.19
210	0.19
211	0.15
212	0.14
213	0.14
214	0.13
215	0.1
216	0.07
217	0.07
218	0.06
219	0.05
220	0.05
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.04
252	0.05
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.07
258	0.09
259	0.11
260	0.12
261	0.14
262	0.16
263	0.16
264	0.16
265	0.15
266	0.13
267	0.11
268	0.11
269	0.08
270	0.06
271	0.06
272	0.07
273	0.09
274	0.09
275	0.1
276	0.11
277	0.16
278	0.17
279	0.19
280	0.2
281	0.19
282	0.21
283	0.21
284	0.2
285	0.15
286	0.16
287	0.15
288	0.19
289	0.24
290	0.22
291	0.23
292	0.3
293	0.37
294	0.4
295	0.41
296	0.39
297	0.37
298	0.39
299	0.45
300	0.47
301	0.44
302	0.41
303	0.46
304	0.48
305	0.47
306	0.48
307	0.42
308	0.4
309	0.39
310	0.38
311	0.34
312	0.37
313	0.37
314	0.41
315	0.45
316	0.45
317	0.49
318	0.49
319	0.46
320	0.4
321	0.37
322	0.35
323	0.34
324	0.32
325	0.32
326	0.36
327	0.37
328	0.36
329	0.37
330	0.31
331	0.26
332	0.26
333	0.28
334	0.32
335	0.41
336	0.43
337	0.48
338	0.53
339	0.55
340	0.56
341	0.57
342	0.6
343	0.61
344	0.69
345	0.73
346	0.77
347	0.85
348	0.88
349	0.87
350	0.85
351	0.83
352	0.83
353	0.77
354	0.74
355	0.71
356	0.67
357	0.62
358	0.54
359	0.46
360	0.37
361	0.33
362	0.29
363	0.24
364	0.21
365	0.18
366	0.18
367	0.17
368	0.19
369	0.16
370	0.16
371	0.15
372	0.18
373	0.24
374	0.24
375	0.25
376	0.25
377	0.27
378	0.27
379	0.32
380	0.34
381	0.29
382	0.28
383	0.26
384	0.26
385	0.26
386	0.25
387	0.21
388	0.14
389	0.15
390	0.15
391	0.15
392	0.15
393	0.13
394	0.15
395	0.13
396	0.12
397	0.11
398	0.1
399	0.1
400	0.08
401	0.08
402	0.06
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.04
408	0.07
409	0.14
410	0.19
411	0.23
412	0.31
413	0.39
414	0.48
415	0.54
416	0.62
417	0.61
418	0.6
419	0.64
420	0.63
421	0.58
422	0.49
423	0.44
424	0.34
425	0.29
426	0.29
427	0.22
428	0.21
429	0.22
430	0.23
431	0.29
432	0.32
433	0.35
434	0.36
435	0.37
436	0.39
437	0.46
438	0.48
439	0.46
440	0.43
441	0.41
442	0.38
443	0.38
444	0.33
445	0.28
446	0.3
447	0.33
448	0.41
449	0.45
450	0.45
451	0.45
452	0.45
453	0.47
454	0.47
455	0.47
456	0.4
457	0.4
458	0.44
459	0.46
460	0.47
461	0.42
462	0.36
463	0.31
464	0.29
465	0.25
466	0.22
467	0.21
468	0.2
469	0.22
470	0.23
471	0.26
472	0.28
473	0.36
474	0.44
475	0.49
476	0.52
477	0.6
478	0.69
479	0.76
480	0.83
481	0.84
482	0.85
483	0.84
484	0.88
485	0.88
486	0.88
487	0.86
488	0.86
489	0.86
490	0.84
491	0.76
492	0.73
493	0.65
494	0.59
495	0.53
496	0.44
497	0.39
498	0.35
499	0.41
500	0.45
501	0.52
502	0.56
503	0.61
504	0.7
505	0.75
506	0.78
507	0.8
508	0.79
509	0.79
510	0.8
511	0.8
512	0.78
513	0.79
514	0.75
515	0.7
516	0.7
517	0.68
518	0.64
519	0.66
520	0.68
521	0.68
522	0.73
523	0.78
524	0.81
525	0.83
526	0.85
527	0.85
528	0.84
529	0.85
530	0.88
531	0.88
532	0.89
533	0.9
534	0.91
535	0.9
536	0.9
537	0.89
538	0.85
539	0.81
540	0.79
541	0.74
542	0.65
543	0.59
544	0.5
545	0.41
546	0.35
547	0.27
548	0.25

S8CCV2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer