Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8AF71

Protein Details
Accession S8AF71    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
505-550HVESPPTKKNRPSTPKDQLDPPTQSPSKRKPVVRRPKPVDNPGTTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
532-539KRKPVVRR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR037796  TAF6  
IPR011442  TAF6_C  
IPR046344  TAF6_C_sf  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0046695  C:SLIK (SAGA-like) complex  
GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0016251  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF07571  TAF6_C  
CDD cd08050  TAF6C  
Amino Acid Sequences MNPSPAEARMNDLTPKGATTTHALGATGNAENATVKPLAKHIISVELQMFFEKVTTGITDPPNEQYREAALSALRTEPTIHQLLPYFVQFVTERVTHDMKSDRKLMESMMDICEALFANESLYIEPYINSLCPPILTCMLAKQLGDNAQDQLSTYPLRDKAASIVGIICRQFGDSSHELKSRLARSFLKAFMDNTKPPATWYGAIIGLANMGVVDAIRYLLLPNVKIFEEFIRDEINGDGPKKDECQKCLGAILGALKKLKTEEVELLMGGKSVDLDKDGLRKKLTDDLGPLAANECPKPRGKKKVAHIHNSRVNDTVDISLIQDRNGTTLLKQSNGPEDRERTMEKEQAEQVQMDAQSVEQEVVVVPDHSDGGGEEEQTAVEDTQRSKARDSTAESLSEVEEPETPINLFSEPEGDSVVIQNQEPGETSGGVIEDESSLLITEGEKTTTKGPKTRRTGSTQNAIILPSDLANATSAPARRVNTVRSATPRTGERTKSHEDIQDHVESPPTKKNRPSTPKDQLDPPTQSPSKRKPVVRRPKPVDNPGTTTIREYSLRSRKSGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.21
4 0.19
5 0.18
6 0.2
7 0.22
8 0.23
9 0.23
10 0.22
11 0.21
12 0.21
13 0.22
14 0.17
15 0.14
16 0.11
17 0.1
18 0.11
19 0.11
20 0.13
21 0.12
22 0.12
23 0.13
24 0.16
25 0.21
26 0.2
27 0.22
28 0.2
29 0.26
30 0.26
31 0.28
32 0.27
33 0.24
34 0.24
35 0.22
36 0.21
37 0.13
38 0.13
39 0.1
40 0.08
41 0.08
42 0.09
43 0.1
44 0.16
45 0.19
46 0.21
47 0.23
48 0.29
49 0.34
50 0.34
51 0.33
52 0.29
53 0.29
54 0.29
55 0.27
56 0.22
57 0.17
58 0.17
59 0.18
60 0.18
61 0.16
62 0.13
63 0.15
64 0.15
65 0.2
66 0.21
67 0.19
68 0.2
69 0.21
70 0.23
71 0.22
72 0.21
73 0.18
74 0.14
75 0.18
76 0.16
77 0.15
78 0.18
79 0.17
80 0.18
81 0.21
82 0.24
83 0.21
84 0.25
85 0.32
86 0.32
87 0.35
88 0.4
89 0.36
90 0.36
91 0.37
92 0.33
93 0.29
94 0.27
95 0.25
96 0.2
97 0.2
98 0.17
99 0.16
100 0.16
101 0.13
102 0.1
103 0.08
104 0.06
105 0.06
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.1
121 0.12
122 0.12
123 0.13
124 0.13
125 0.14
126 0.17
127 0.18
128 0.17
129 0.14
130 0.16
131 0.19
132 0.21
133 0.19
134 0.18
135 0.17
136 0.17
137 0.17
138 0.14
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.14
143 0.15
144 0.17
145 0.17
146 0.17
147 0.18
148 0.2
149 0.2
150 0.15
151 0.16
152 0.16
153 0.18
154 0.17
155 0.15
156 0.11
157 0.12
158 0.11
159 0.1
160 0.16
161 0.17
162 0.2
163 0.24
164 0.26
165 0.26
166 0.28
167 0.33
168 0.31
169 0.3
170 0.32
171 0.3
172 0.33
173 0.37
174 0.37
175 0.34
176 0.3
177 0.3
178 0.31
179 0.34
180 0.3
181 0.3
182 0.3
183 0.26
184 0.26
185 0.27
186 0.24
187 0.19
188 0.18
189 0.16
190 0.14
191 0.14
192 0.13
193 0.1
194 0.07
195 0.06
196 0.05
197 0.03
198 0.03
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.02
203 0.02
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.05
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.1
216 0.13
217 0.12
218 0.13
219 0.13
220 0.12
221 0.13
222 0.12
223 0.14
224 0.12
225 0.13
226 0.12
227 0.12
228 0.13
229 0.15
230 0.23
231 0.23
232 0.24
233 0.29
234 0.29
235 0.29
236 0.29
237 0.26
238 0.18
239 0.15
240 0.17
241 0.13
242 0.13
243 0.13
244 0.12
245 0.12
246 0.13
247 0.13
248 0.1
249 0.11
250 0.11
251 0.13
252 0.13
253 0.13
254 0.13
255 0.11
256 0.1
257 0.08
258 0.06
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.06
265 0.13
266 0.16
267 0.18
268 0.19
269 0.19
270 0.2
271 0.26
272 0.27
273 0.21
274 0.2
275 0.2
276 0.2
277 0.2
278 0.18
279 0.12
280 0.12
281 0.11
282 0.1
283 0.1
284 0.11
285 0.15
286 0.23
287 0.3
288 0.39
289 0.46
290 0.52
291 0.61
292 0.69
293 0.73
294 0.75
295 0.74
296 0.72
297 0.71
298 0.66
299 0.57
300 0.49
301 0.41
302 0.32
303 0.27
304 0.18
305 0.13
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.11
315 0.11
316 0.08
317 0.14
318 0.15
319 0.15
320 0.16
321 0.16
322 0.24
323 0.26
324 0.29
325 0.27
326 0.29
327 0.29
328 0.31
329 0.31
330 0.27
331 0.29
332 0.3
333 0.27
334 0.27
335 0.28
336 0.28
337 0.28
338 0.23
339 0.2
340 0.18
341 0.17
342 0.14
343 0.12
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.05
349 0.05
350 0.04
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.04
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.09
368 0.05
369 0.06
370 0.08
371 0.09
372 0.16
373 0.22
374 0.23
375 0.24
376 0.28
377 0.3
378 0.33
379 0.37
380 0.36
381 0.33
382 0.32
383 0.31
384 0.28
385 0.25
386 0.21
387 0.15
388 0.11
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.09
395 0.1
396 0.09
397 0.09
398 0.07
399 0.09
400 0.09
401 0.09
402 0.1
403 0.09
404 0.09
405 0.1
406 0.12
407 0.1
408 0.09
409 0.11
410 0.1
411 0.1
412 0.11
413 0.11
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.08
421 0.07
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.04
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.07
431 0.08
432 0.1
433 0.1
434 0.12
435 0.19
436 0.25
437 0.29
438 0.34
439 0.42
440 0.5
441 0.58
442 0.66
443 0.65
444 0.67
445 0.72
446 0.72
447 0.72
448 0.65
449 0.59
450 0.51
451 0.45
452 0.37
453 0.29
454 0.22
455 0.14
456 0.12
457 0.09
458 0.08
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.11
463 0.12
464 0.14
465 0.19
466 0.2
467 0.25
468 0.29
469 0.32
470 0.37
471 0.39
472 0.42
473 0.45
474 0.5
475 0.47
476 0.47
477 0.48
478 0.47
479 0.5
480 0.5
481 0.48
482 0.49
483 0.53
484 0.53
485 0.54
486 0.53
487 0.48
488 0.46
489 0.47
490 0.44
491 0.38
492 0.35
493 0.36
494 0.31
495 0.33
496 0.38
497 0.4
498 0.42
499 0.49
500 0.58
501 0.62
502 0.71
503 0.76
504 0.77
505 0.81
506 0.83
507 0.8
508 0.79
509 0.75
510 0.73
511 0.71
512 0.64
513 0.63
514 0.58
515 0.61
516 0.62
517 0.65
518 0.67
519 0.68
520 0.73
521 0.75
522 0.82
523 0.87
524 0.88
525 0.89
526 0.87
527 0.9
528 0.91
529 0.9
530 0.88
531 0.83
532 0.79
533 0.74
534 0.7
535 0.6
536 0.53
537 0.45
538 0.4
539 0.35
540 0.33
541 0.38
542 0.43
543 0.46