FuNGI

S8CAG1

Protein Details

Accession

S8CAG1

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
92-122	PGERPKPKLKFAPKNTLRKTKEQRAELNRIY	Hydrophilic
334-378	SPKATRRSTRSPEVKKKQSSSSPEDKRRKPKPRSRSRLRRNSGIV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
95-110	RPKPKLKFAPKNTLRK
141-157	PSARGARGRGRGRGGSM
287-304	PKKKGDAAVKKKKGKGNE
311-373	EERKSRGGRRDSGVGPRVKIESESPKATRRSTRSPEVKKKQSSSSPEDKRRKPKPRSRSRLRR

Subcellular Location(s)

mito 21, mito_nucl 13.666, cyto_mito 11.666, nucl 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKARGRPPRTRGGAAAAAASADESTNQQEVEQAVPVETAPESAMAIPPPSGRLEGLTNPPALRSSGRAAAASATAEVSAAAAATLPLLAPGERPKPKLKFAPKNTLRKTKEQRAELNRIYDPPPPDESLNAFGITRGGPSARGARGRGRGRGGSMGRGDTKREEVAVASGPFALGSVMTNGGKQKVSIERMGRSFRTGRSSGSSSRIKREGEDGSGVKDELYSSSDSEGGPKVDVEMIELISTDEEDEDGEGGERKHSIKGFAPVRIERHEHVDKTAAQPQTSDPKKKGDAAVKKKKGKGNEVEIEIMEERKSRGGRRDSGVGPRVKIESESPKATRRSTRSPEVKKKQSSSSPEDKRRKPKPRSRSRLRRNSGIVPQSQEDFEENDRFEVDRFSMLTELGPALPEQKPVDADGDHAMGEEADALPQPSSDEKENKLYLFQFPPILPVLEPVAAVEDGDSEIKQEEAGAAATADSSTNPTDPETGSKPVVAEAKAKKERFTSFEEIQRAKLPVGTAGKLQVHRSGRVTIIFGGVEFEVHRGVECEFLQDVVVLQKESGTLDERGKPKGRAWGMGQLKGKFVATPDISKLI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.59
3	0.49
4	0.43
5	0.32
6	0.25
7	0.2
8	0.18
9	0.11
10	0.06
11	0.06
12	0.07
13	0.1
14	0.12
15	0.12
16	0.12
17	0.14
18	0.15
19	0.16
20	0.17
21	0.14
22	0.13
23	0.14
24	0.13
25	0.12
26	0.11
27	0.1
28	0.08
29	0.08
30	0.08
31	0.08
32	0.1
33	0.1
34	0.11
35	0.11
36	0.12
37	0.13
38	0.14
39	0.15
40	0.14
41	0.15
42	0.18
43	0.22
44	0.28
45	0.29
46	0.3
47	0.29
48	0.29
49	0.28
50	0.26
51	0.23
52	0.2
53	0.22
54	0.25
55	0.26
56	0.25
57	0.25
58	0.24
59	0.23
60	0.2
61	0.15
62	0.1
63	0.08
64	0.08
65	0.07
66	0.06
67	0.05
68	0.04
69	0.03
70	0.03
71	0.03
72	0.03
73	0.03
74	0.03
75	0.04
76	0.04
77	0.05
78	0.07
79	0.13
80	0.22
81	0.27
82	0.32
83	0.4
84	0.45
85	0.52
86	0.6
87	0.66
88	0.68
89	0.71
90	0.79
91	0.79
92	0.85
93	0.86
94	0.87
95	0.81
96	0.81
97	0.82
98	0.81
99	0.8
100	0.77
101	0.78
102	0.76
103	0.81
104	0.74
105	0.7
106	0.61
107	0.55
108	0.5
109	0.46
110	0.4
111	0.34
112	0.34
113	0.3
114	0.29
115	0.28
116	0.29
117	0.27
118	0.26
119	0.22
120	0.18
121	0.16
122	0.16
123	0.14
124	0.12
125	0.09
126	0.08
127	0.08
128	0.1
129	0.16
130	0.19
131	0.22
132	0.24
133	0.3
134	0.38
135	0.42
136	0.45
137	0.44
138	0.42
139	0.41
140	0.47
141	0.41
142	0.38
143	0.35
144	0.33
145	0.33
146	0.33
147	0.33
148	0.28
149	0.29
150	0.24
151	0.23
152	0.2
153	0.15
154	0.16
155	0.18
156	0.16
157	0.13
158	0.12
159	0.11
160	0.1
161	0.1
162	0.08
163	0.04
164	0.04
165	0.04
166	0.06
167	0.07
168	0.08
169	0.09
170	0.12
171	0.12
172	0.11
173	0.15
174	0.19
175	0.23
176	0.27
177	0.3
178	0.32
179	0.36
180	0.41
181	0.37
182	0.35
183	0.35
184	0.32
185	0.35
186	0.32
187	0.29
188	0.3
189	0.33
190	0.32
191	0.35
192	0.41
193	0.37
194	0.41
195	0.44
196	0.39
197	0.37
198	0.39
199	0.34
200	0.29
201	0.31
202	0.25
203	0.23
204	0.23
205	0.21
206	0.16
207	0.14
208	0.12
209	0.08
210	0.09
211	0.08
212	0.08
213	0.09
214	0.1
215	0.1
216	0.11
217	0.12
218	0.1
219	0.1
220	0.09
221	0.09
222	0.09
223	0.09
224	0.08
225	0.08
226	0.07
227	0.07
228	0.07
229	0.06
230	0.05
231	0.05
232	0.04
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.03
239	0.04
240	0.05
241	0.05
242	0.06
243	0.07
244	0.08
245	0.11
246	0.11
247	0.14
248	0.15
249	0.23
250	0.25
251	0.27
252	0.3
253	0.3
254	0.32
255	0.33
256	0.33
257	0.26
258	0.3
259	0.31
260	0.27
261	0.26
262	0.27
263	0.25
264	0.26
265	0.31
266	0.24
267	0.2
268	0.21
269	0.21
270	0.28
271	0.31
272	0.32
273	0.28
274	0.31
275	0.33
276	0.35
277	0.38
278	0.37
279	0.43
280	0.5
281	0.59
282	0.63
283	0.68
284	0.71
285	0.69
286	0.66
287	0.64
288	0.59
289	0.57
290	0.53
291	0.48
292	0.44
293	0.4
294	0.36
295	0.28
296	0.22
297	0.13
298	0.09
299	0.08
300	0.1
301	0.12
302	0.14
303	0.22
304	0.27
305	0.31
306	0.33
307	0.38
308	0.37
309	0.42
310	0.46
311	0.4
312	0.34
313	0.31
314	0.3
315	0.24
316	0.23
317	0.2
318	0.21
319	0.23
320	0.26
321	0.27
322	0.32
323	0.35
324	0.38
325	0.41
326	0.4
327	0.45
328	0.48
329	0.55
330	0.59
331	0.67
332	0.74
333	0.77
334	0.8
335	0.77
336	0.74
337	0.71
338	0.69
339	0.66
340	0.63
341	0.63
342	0.64
343	0.68
344	0.74
345	0.75
346	0.78
347	0.82
348	0.84
349	0.85
350	0.85
351	0.86
352	0.88
353	0.9
354	0.92
355	0.92
356	0.93
357	0.93
358	0.88
359	0.85
360	0.79
361	0.75
362	0.71
363	0.65
364	0.56
365	0.48
366	0.44
367	0.37
368	0.32
369	0.26
370	0.19
371	0.16
372	0.17
373	0.17
374	0.16
375	0.15
376	0.15
377	0.15
378	0.14
379	0.13
380	0.11
381	0.09
382	0.09
383	0.1
384	0.1
385	0.1
386	0.09
387	0.08
388	0.08
389	0.07
390	0.07
391	0.06
392	0.09
393	0.1
394	0.12
395	0.12
396	0.13
397	0.13
398	0.14
399	0.16
400	0.13
401	0.14
402	0.13
403	0.13
404	0.12
405	0.11
406	0.1
407	0.07
408	0.07
409	0.06
410	0.04
411	0.04
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.07
417	0.08
418	0.11
419	0.15
420	0.19
421	0.22
422	0.28
423	0.3
424	0.3
425	0.31
426	0.3
427	0.3
428	0.29
429	0.27
430	0.24
431	0.22
432	0.24
433	0.22
434	0.21
435	0.16
436	0.15
437	0.15
438	0.12
439	0.12
440	0.1
441	0.1
442	0.09
443	0.09
444	0.08
445	0.06
446	0.07
447	0.08
448	0.07
449	0.06
450	0.07
451	0.07
452	0.07
453	0.06
454	0.05
455	0.06
456	0.06
457	0.05
458	0.05
459	0.05
460	0.05
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.07
465	0.08
466	0.09
467	0.09
468	0.1
469	0.12
470	0.13
471	0.18
472	0.2
473	0.22
474	0.23
475	0.23
476	0.22
477	0.23
478	0.26
479	0.23
480	0.27
481	0.29
482	0.39
483	0.46
484	0.47
485	0.47
486	0.49
487	0.52
488	0.49
489	0.51
490	0.48
491	0.45
492	0.52
493	0.56
494	0.52
495	0.5
496	0.49
497	0.43
498	0.36
499	0.32
500	0.25
501	0.25
502	0.27
503	0.26
504	0.23
505	0.27
506	0.32
507	0.32
508	0.34
509	0.35
510	0.35
511	0.37
512	0.39
513	0.36
514	0.34
515	0.33
516	0.33
517	0.26
518	0.24
519	0.2
520	0.17
521	0.16
522	0.13
523	0.12
524	0.1
525	0.1
526	0.09
527	0.09
528	0.09
529	0.09
530	0.09
531	0.13
532	0.12
533	0.15
534	0.14
535	0.14
536	0.14
537	0.13
538	0.14
539	0.13
540	0.15
541	0.12
542	0.11
543	0.11
544	0.12
545	0.13
546	0.14
547	0.14
548	0.16
549	0.21
550	0.29
551	0.31
552	0.38
553	0.43
554	0.44
555	0.44
556	0.51
557	0.5
558	0.49
559	0.51
560	0.53
561	0.54
562	0.58
563	0.61
564	0.52
565	0.5
566	0.46
567	0.42
568	0.32
569	0.28
570	0.29
571	0.27
572	0.29

S8CAG1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer