FuNGI

F4RPE0

Protein Details

Accession

F4RPE0

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-20	MGKREKKTAKGRLDKYYRLA	Basic
242-261	NAQNVFKPEKKKRARDGYED	Hydrophilic
378-401	EESGLQKKRERRRLNEKRTRDLQR	Basic
780-804	AEAKGRKKLRTLRRIEKMQNKANLV	Hydrophilic
819-884	IERLMNRMSKNPKQKNEVKVVVAKGFNRGQKGRPKGVKGRYKMVDPRGRKELRAKKRKERETKKRS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
384-394	KKRERRRLNEK
769-794	RALDARPIKKVAEAKGRKKLRTLRRI
841-884	AKGFNRGQKGRPKGVKGRYKMVDPRGRKELRAKKRKERETKKRS

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 12, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002877 RNA_MeTrfase_FtsJ_dom IPR015507 rRNA-MeTfrase_E IPR012920 rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C IPR024576 rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381 IPR029063 SAM-dependent_MTases_sf IPR028589 SPB1-like
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0030687 C:preribosome, large subunit precursor GO:0070039 F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity GO:0008650 F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity GO:0000466 P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000463 P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	mlr:MELLADRAFT_48684 -
Pfam	View protein in Pfam PF11861 DUF3381 PF01728 FtsJ PF07780 Spb1_C

Amino Acid Sequences

MGKREKKTAKGRLDKYYRLAKEQGYRARSAFKLIQLNKRYQFLESARCCIDLCAAPGGWLQVAAKWMPANSLILGVDLVPIKPIPKVVTATEDIRTDSCRRWLRSELKDWKADVVLHDGAPNVGTAWVQDAFSQAELVLHSFKLATEMLAPGGTFVTKVFRSKDYNSLLYVFNQLFKKVESTKPPSSRNVSAEIFVVCQDFLAPKKIDPRLLDPAHVFKDLDLVPIAADGDTEGHSNKLTPNAQNVFKPEKKKRARDGYEDGDYILHKTVAATELIKANDPIKLLGVANTITFGKTDEDKMILKMKCTSKAILTDLQDLKVLGKGEFKKILKWRLAVREILGLTIKKDPAEDLPQDAVEIQPLDEDEEMEQELQRIQEESGLQKKRERRRLNEKRTRDLQRMQLQMTTPMDIGLERADDEVFGLEEIDQNDFGSDHGQEGFENGESDEEESVYSEESDDEDLSEDEKKLQILEDSVGVAYDTYQEKILNKDTKRKVREEARLRRHHDEGEQEWTGLNEDDGGSVHSGDDIEMVRKKRARFAKTSKSDDEEDSDSEGEDVTDQAARIMAERGLSSKASTSKSKKRLLTDLTEKTNYSSEVKNQATEMWFDQPVFKDVKGLQGQLNFDDDDEEEEDEDEDEDDEVHAGSSDESADEETGKFDESDDDFEIVPKEPVKPTVWDEEDSDQDEKNARIVQQKGLLTPAAMQLALDLVNRRKTKDQMVDSGFRRDAFFDEKDQLPPWFQDDEMRHFREHVPVTKEAVKILRDKMRALDARPIKKVAEAKGRKKLRTLRRIEKMQNKANLVNASSDLTEKEKSGEIERLMNRMSKNPKQKNEVKVVVAKGFNRGQKGRPKGVKGRYKMVDPRGRKELRAKKRKERETKKRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.81
2	0.78
3	0.78
4	0.71
5	0.66
6	0.64
7	0.6
8	0.6
9	0.63
10	0.65
11	0.59
12	0.59
13	0.55
14	0.57
15	0.51
16	0.49
17	0.44
18	0.42
19	0.47
20	0.51
21	0.59
22	0.58
23	0.67
24	0.64
25	0.64
26	0.58
27	0.5
28	0.51
29	0.46
30	0.51
31	0.45
32	0.46
33	0.43
34	0.42
35	0.41
36	0.34
37	0.33
38	0.25
39	0.24
40	0.23
41	0.21
42	0.21
43	0.21
44	0.22
45	0.17
46	0.15
47	0.13
48	0.1
49	0.13
50	0.12
51	0.14
52	0.14
53	0.14
54	0.14
55	0.15
56	0.15
57	0.13
58	0.15
59	0.13
60	0.12
61	0.12
62	0.1
63	0.11
64	0.1
65	0.1
66	0.09
67	0.1
68	0.1
69	0.11
70	0.14
71	0.14
72	0.17
73	0.2
74	0.21
75	0.26
76	0.29
77	0.31
78	0.32
79	0.3
80	0.28
81	0.26
82	0.29
83	0.26
84	0.27
85	0.33
86	0.38
87	0.42
88	0.46
89	0.54
90	0.59
91	0.64
92	0.71
93	0.72
94	0.7
95	0.71
96	0.66
97	0.6
98	0.52
99	0.45
100	0.36
101	0.32
102	0.28
103	0.23
104	0.23
105	0.2
106	0.17
107	0.16
108	0.14
109	0.08
110	0.07
111	0.06
112	0.06
113	0.08
114	0.09
115	0.09
116	0.09
117	0.11
118	0.11
119	0.12
120	0.12
121	0.09
122	0.09
123	0.09
124	0.1
125	0.1
126	0.09
127	0.09
128	0.09
129	0.09
130	0.1
131	0.1
132	0.09
133	0.09
134	0.1
135	0.1
136	0.1
137	0.1
138	0.08
139	0.08
140	0.08
141	0.06
142	0.06
143	0.11
144	0.12
145	0.16
146	0.19
147	0.23
148	0.29
149	0.33
150	0.41
151	0.42
152	0.43
153	0.41
154	0.4
155	0.37
156	0.32
157	0.33
158	0.25
159	0.25
160	0.23
161	0.23
162	0.21
163	0.21
164	0.25
165	0.25
166	0.31
167	0.35
168	0.42
169	0.51
170	0.57
171	0.61
172	0.62
173	0.64
174	0.64
175	0.57
176	0.55
177	0.47
178	0.4
179	0.37
180	0.31
181	0.24
182	0.19
183	0.16
184	0.1
185	0.09
186	0.08
187	0.09
188	0.1
189	0.16
190	0.16
191	0.17
192	0.26
193	0.29
194	0.34
195	0.35
196	0.4
197	0.43
198	0.43
199	0.44
200	0.38
201	0.41
202	0.38
203	0.36
204	0.3
205	0.2
206	0.24
207	0.22
208	0.21
209	0.15
210	0.13
211	0.11
212	0.12
213	0.12
214	0.06
215	0.06
216	0.04
217	0.05
218	0.06
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.09
224	0.1
225	0.15
226	0.18
227	0.19
228	0.27
229	0.31
230	0.34
231	0.35
232	0.39
233	0.42
234	0.43
235	0.51
236	0.52
237	0.58
238	0.65
239	0.73
240	0.77
241	0.79
242	0.81
243	0.79
244	0.78
245	0.74
246	0.68
247	0.59
248	0.49
249	0.39
250	0.32
251	0.25
252	0.18
253	0.12
254	0.08
255	0.08
256	0.08
257	0.09
258	0.09
259	0.08
260	0.09
261	0.13
262	0.13
263	0.14
264	0.14
265	0.13
266	0.14
267	0.14
268	0.13
269	0.1
270	0.11
271	0.11
272	0.11
273	0.11
274	0.1
275	0.09
276	0.1
277	0.09
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.09
282	0.1
283	0.11
284	0.11
285	0.14
286	0.14
287	0.16
288	0.23
289	0.22
290	0.22
291	0.27
292	0.29
293	0.32
294	0.33
295	0.33
296	0.28
297	0.31
298	0.33
299	0.31
300	0.29
301	0.31
302	0.3
303	0.29
304	0.27
305	0.23
306	0.2
307	0.18
308	0.17
309	0.1
310	0.16
311	0.17
312	0.21
313	0.28
314	0.28
315	0.32
316	0.38
317	0.45
318	0.42
319	0.44
320	0.46
321	0.47
322	0.49
323	0.44
324	0.38
325	0.35
326	0.31
327	0.28
328	0.24
329	0.16
330	0.15
331	0.17
332	0.16
333	0.12
334	0.12
335	0.12
336	0.14
337	0.19
338	0.18
339	0.17
340	0.18
341	0.17
342	0.17
343	0.16
344	0.13
345	0.08
346	0.08
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.05
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.05
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.06
364	0.08
365	0.09
366	0.12
367	0.2
368	0.24
369	0.24
370	0.28
371	0.37
372	0.44
373	0.54
374	0.58
375	0.59
376	0.67
377	0.77
378	0.84
379	0.86
380	0.83
381	0.8
382	0.81
383	0.78
384	0.73
385	0.66
386	0.64
387	0.61
388	0.58
389	0.51
390	0.45
391	0.39
392	0.36
393	0.32
394	0.24
395	0.16
396	0.12
397	0.11
398	0.09
399	0.09
400	0.06
401	0.05
402	0.04
403	0.05
404	0.05
405	0.04
406	0.05
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.03
412	0.05
413	0.06
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.06
425	0.05
426	0.06
427	0.06
428	0.05
429	0.06
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.06
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.04
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.06
449	0.06
450	0.07
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.07
457	0.07
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.07
462	0.06
463	0.06
464	0.06
465	0.05
466	0.04
467	0.06
468	0.06
469	0.07
470	0.08
471	0.09
472	0.1
473	0.12
474	0.19
475	0.24
476	0.26
477	0.35
478	0.43
479	0.51
480	0.55
481	0.56
482	0.57
483	0.58
484	0.66
485	0.67
486	0.7
487	0.71
488	0.75
489	0.77
490	0.74
491	0.67
492	0.59
493	0.51
494	0.46
495	0.38
496	0.35
497	0.3
498	0.25
499	0.23
500	0.21
501	0.19
502	0.13
503	0.11
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.06
509	0.05
510	0.05
511	0.05
512	0.05
513	0.05
514	0.04
515	0.06
516	0.05
517	0.08
518	0.12
519	0.14
520	0.18
521	0.22
522	0.23
523	0.29
524	0.38
525	0.41
526	0.47
527	0.55
528	0.61
529	0.66
530	0.72
531	0.67
532	0.62
533	0.58
534	0.5
535	0.44
536	0.35
537	0.28
538	0.23
539	0.2
540	0.16
541	0.13
542	0.12
543	0.08
544	0.06
545	0.05
546	0.04
547	0.05
548	0.05
549	0.05
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.07
554	0.07
555	0.07
556	0.08
557	0.09
558	0.1
559	0.1
560	0.1
561	0.12
562	0.16
563	0.18
564	0.26
565	0.32
566	0.41
567	0.49
568	0.56
569	0.58
570	0.59
571	0.63
572	0.61
573	0.61
574	0.61
575	0.59
576	0.56
577	0.53
578	0.48
579	0.42
580	0.38
581	0.32
582	0.25
583	0.21
584	0.2
585	0.27
586	0.28
587	0.27
588	0.26
589	0.26
590	0.25
591	0.24
592	0.22
593	0.16
594	0.16
595	0.16
596	0.18
597	0.17
598	0.18
599	0.18
600	0.16
601	0.17
602	0.17
603	0.25
604	0.24
605	0.25
606	0.25
607	0.27
608	0.28
609	0.25
610	0.26
611	0.18
612	0.16
613	0.15
614	0.12
615	0.11
616	0.12
617	0.11
618	0.09
619	0.09
620	0.1
621	0.09
622	0.09
623	0.07
624	0.06
625	0.06
626	0.06
627	0.05
628	0.05
629	0.05
630	0.05
631	0.05
632	0.04
633	0.05
634	0.05
635	0.05
636	0.05
637	0.05
638	0.06
639	0.06
640	0.07
641	0.07
642	0.07
643	0.08
644	0.08
645	0.08
646	0.08
647	0.11
648	0.11
649	0.15
650	0.15
651	0.16
652	0.15
653	0.16
654	0.17
655	0.15
656	0.15
657	0.13
658	0.14
659	0.14
660	0.18
661	0.19
662	0.21
663	0.24
664	0.31
665	0.32
666	0.31
667	0.33
668	0.32
669	0.32
670	0.32
671	0.3
672	0.21
673	0.2
674	0.21
675	0.19
676	0.19
677	0.19
678	0.18
679	0.24
680	0.26
681	0.29
682	0.33
683	0.34
684	0.32
685	0.31
686	0.29
687	0.22
688	0.21
689	0.19
690	0.13
691	0.12
692	0.1
693	0.08
694	0.09
695	0.09
696	0.09
697	0.11
698	0.14
699	0.23
700	0.24
701	0.28
702	0.32
703	0.36
704	0.45
705	0.5
706	0.52
707	0.52
708	0.57
709	0.61
710	0.58
711	0.61
712	0.53
713	0.44
714	0.39
715	0.31
716	0.29
717	0.27
718	0.27
719	0.24
720	0.27
721	0.29
722	0.3
723	0.31
724	0.29
725	0.26
726	0.25
727	0.24
728	0.21
729	0.19
730	0.24
731	0.26
732	0.33
733	0.39
734	0.41
735	0.38
736	0.39
737	0.4
738	0.41
739	0.43
740	0.42
741	0.39
742	0.39
743	0.44
744	0.47
745	0.46
746	0.4
747	0.39
748	0.35
749	0.35
750	0.4
751	0.43
752	0.39
753	0.4
754	0.4
755	0.45
756	0.46
757	0.43
758	0.46
759	0.46
760	0.51
761	0.53
762	0.52
763	0.43
764	0.45
765	0.48
766	0.47
767	0.49
768	0.52
769	0.58
770	0.66
771	0.73
772	0.7
773	0.73
774	0.75
775	0.75
776	0.76
777	0.77
778	0.77
779	0.79
780	0.86
781	0.87
782	0.88
783	0.86
784	0.84
785	0.81
786	0.75
787	0.68
788	0.64
789	0.57
790	0.48
791	0.4
792	0.33
793	0.28
794	0.23
795	0.22
796	0.18
797	0.18
798	0.18
799	0.16
800	0.17
801	0.19
802	0.21
803	0.24
804	0.28
805	0.27
806	0.34
807	0.36
808	0.37
809	0.36
810	0.38
811	0.36
812	0.39
813	0.46
814	0.47
815	0.56
816	0.62
817	0.69
818	0.74
819	0.8
820	0.81
821	0.82
822	0.79
823	0.74
824	0.7
825	0.66
826	0.63
827	0.59
828	0.5
829	0.47
830	0.47
831	0.45
832	0.47
833	0.46
834	0.48
835	0.53
836	0.61
837	0.65
838	0.67
839	0.72
840	0.74
841	0.81
842	0.83
843	0.79
844	0.8
845	0.74
846	0.74
847	0.74
848	0.75
849	0.75
850	0.71
851	0.73
852	0.73
853	0.72
854	0.69
855	0.71
856	0.71
857	0.72
858	0.76
859	0.79
860	0.79
861	0.87
862	0.92
863	0.93
864	0.93

F4RPE0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer