Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8CD28

Protein Details
Accession S8CD28    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-31IPTSMDPRSHRPNKKRALSPASAHydrophilic
119-147RDDAKTAKNRAKRQKKKLAQEKKREREGTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-144KTAKNRAKRQKKKLAQEKKRER
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009548  Prkrip1  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06658  DUF1168  
Amino Acid Sequences MSENIPESIPTSMDPRSHRPNKKRALSPASAQAAQLASLMKNPDRHISTTKSRDKKLAPPPEIVANVQGSSAGAGSGEFHVYKASRRREYERLKMMDDELKKEKEKEDFETKTDEWKTRDDAKTAKNRAKRQKKKLAQEKKREREGTGTPQLEGDDNADSEPGDVAVPTEDNAGPQIKIIKNISSSTAGTSAGGAANGYEATPPNVGNRSVVIFDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.33
3 0.42
4 0.52
5 0.62
6 0.68
7 0.75
8 0.8
9 0.84
10 0.85
11 0.84
12 0.83
13 0.77
14 0.71
15 0.7
16 0.65
17 0.55
18 0.47
19 0.39
20 0.3
21 0.26
22 0.22
23 0.14
24 0.1
25 0.12
26 0.15
27 0.16
28 0.19
29 0.21
30 0.27
31 0.29
32 0.32
33 0.34
34 0.38
35 0.45
36 0.51
37 0.59
38 0.59
39 0.59
40 0.62
41 0.62
42 0.64
43 0.65
44 0.66
45 0.59
46 0.55
47 0.54
48 0.53
49 0.5
50 0.4
51 0.32
52 0.23
53 0.19
54 0.16
55 0.14
56 0.09
57 0.08
58 0.07
59 0.04
60 0.03
61 0.03
62 0.04
63 0.05
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.07
68 0.08
69 0.13
70 0.2
71 0.28
72 0.33
73 0.37
74 0.43
75 0.52
76 0.59
77 0.63
78 0.63
79 0.58
80 0.54
81 0.5
82 0.46
83 0.42
84 0.35
85 0.31
86 0.27
87 0.27
88 0.26
89 0.27
90 0.27
91 0.27
92 0.29
93 0.3
94 0.34
95 0.33
96 0.33
97 0.37
98 0.35
99 0.36
100 0.35
101 0.33
102 0.26
103 0.26
104 0.3
105 0.33
106 0.34
107 0.3
108 0.33
109 0.37
110 0.45
111 0.49
112 0.51
113 0.51
114 0.58
115 0.67
116 0.73
117 0.77
118 0.78
119 0.82
120 0.84
121 0.88
122 0.9
123 0.9
124 0.89
125 0.9
126 0.9
127 0.88
128 0.89
129 0.8
130 0.7
131 0.65
132 0.61
133 0.59
134 0.56
135 0.48
136 0.39
137 0.37
138 0.36
139 0.3
140 0.25
141 0.17
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.05
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.1
160 0.11
161 0.1
162 0.11
163 0.18
164 0.17
165 0.22
166 0.24
167 0.25
168 0.27
169 0.28
170 0.3
171 0.26
172 0.26
173 0.23
174 0.22
175 0.19
176 0.17
177 0.16
178 0.13
179 0.1
180 0.1
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.1
189 0.11
190 0.12
191 0.15
192 0.18
193 0.19
194 0.19
195 0.2
196 0.2
197 0.21