Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8A5N4

Protein Details
Accession S8A5N4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
224-260INSLTAMKKTKKKRDVLKLLPKHKQSRRAARKVDAASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
231-255KKTKKKRDVLKLLPKHKQSRRAARK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.833, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001529  DNA-dir_RNA_pol_M/15kDasu  
IPR012164  Rpa12/Rpb9/Rpc10/TFS  
IPR001222  Znf_TFIIS  
Gene Ontology GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02150  RNA_POL_M_15KD  
PF01096  TFIIS_C  
Amino Acid Sequences MEEEDGAALQNPREREASEKITFRFCRECSNMLYPREDRANNRLLFGCRNCKFVEEAASQCVFRNVLSSAAEETAGVTTDVGSDPTLPRSNRTCPACNESEAVFFQSQQRKEDTKMASNIILRLDCITTIKLTPKQYKASKYYELDLKEMKERKKRGDPLGEFDVRAVGEIYADEMRPTRNNLLRQKREQQALKDLIEEQNRLNQLGGGMIDYAGGGLDVLENINSLTAMKKTKKKRDVLKLLPKHKQSRRAARKVDAASMTKGQENQNDAADPFV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.25
3 0.31
4 0.37
5 0.39
6 0.43
7 0.43
8 0.5
9 0.51
10 0.5
11 0.5
12 0.43
13 0.47
14 0.47
15 0.48
16 0.45
17 0.53
18 0.55
19 0.5
20 0.56
21 0.48
22 0.48
23 0.51
24 0.48
25 0.44
26 0.44
27 0.5
28 0.44
29 0.45
30 0.44
31 0.4
32 0.43
33 0.44
34 0.48
35 0.4
36 0.43
37 0.4
38 0.38
39 0.37
40 0.32
41 0.33
42 0.27
43 0.27
44 0.29
45 0.29
46 0.28
47 0.26
48 0.25
49 0.18
50 0.14
51 0.15
52 0.11
53 0.12
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.13
59 0.11
60 0.1
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.12
73 0.17
74 0.17
75 0.21
76 0.25
77 0.3
78 0.36
79 0.41
80 0.41
81 0.4
82 0.46
83 0.44
84 0.41
85 0.37
86 0.31
87 0.28
88 0.24
89 0.23
90 0.16
91 0.15
92 0.19
93 0.24
94 0.25
95 0.25
96 0.29
97 0.28
98 0.31
99 0.37
100 0.34
101 0.33
102 0.34
103 0.33
104 0.31
105 0.29
106 0.28
107 0.22
108 0.19
109 0.13
110 0.12
111 0.1
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.08
117 0.12
118 0.16
119 0.21
120 0.26
121 0.29
122 0.36
123 0.4
124 0.45
125 0.47
126 0.47
127 0.48
128 0.44
129 0.43
130 0.4
131 0.36
132 0.33
133 0.29
134 0.25
135 0.26
136 0.3
137 0.34
138 0.37
139 0.4
140 0.45
141 0.52
142 0.58
143 0.59
144 0.64
145 0.6
146 0.58
147 0.61
148 0.54
149 0.45
150 0.38
151 0.31
152 0.21
153 0.19
154 0.13
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.09
164 0.1
165 0.13
166 0.18
167 0.23
168 0.32
169 0.41
170 0.51
171 0.58
172 0.63
173 0.69
174 0.68
175 0.71
176 0.68
177 0.63
178 0.61
179 0.58
180 0.51
181 0.44
182 0.4
183 0.37
184 0.35
185 0.32
186 0.23
187 0.24
188 0.24
189 0.23
190 0.21
191 0.16
192 0.13
193 0.13
194 0.12
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.03
202 0.03
203 0.02
204 0.02
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.06
215 0.09
216 0.17
217 0.24
218 0.33
219 0.43
220 0.54
221 0.63
222 0.71
223 0.78
224 0.82
225 0.86
226 0.88
227 0.89
228 0.89
229 0.89
230 0.88
231 0.87
232 0.86
233 0.83
234 0.82
235 0.82
236 0.83
237 0.85
238 0.86
239 0.85
240 0.81
241 0.82
242 0.75
243 0.72
244 0.66
245 0.59
246 0.53
247 0.49
248 0.44
249 0.38
250 0.39
251 0.36
252 0.36
253 0.37
254 0.35
255 0.33
256 0.33