Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S8C4E6

Protein Details
Accession S8C4E6    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
92-117AEDGQPAKRRKRTKNTTPKDPNAPKKBasic
217-261ATPKSAKGKKEKSESSKKKSSKDKATPKEKSSRKRSTKEVTPPPSHydrophilic
265-285EEQQPAPATKSPRKRKRKAADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
98-112AKRRKRTKNTTPKDP
213-255PKPIATPKSAKGKKEKSESSKKKSSKDKATPKEKSSRKRSTKE
271-284PATKSPRKRKRKAA
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito_nucl 12, mito 10.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MARSKEKTAAAAAAAVAVPPPTKDITNKYQALCVSLDTLANAAQQASYAASQYMSAAFPGINLGEQNFFGAFSRPKSALGGPTTEEAEEEAAEDGQPAKRRKRTKNTTPKDPNAPKKPLTAYFAFAKVSRPEVVAELPGASNKEITEELAARWANMKDTGEQQPFRDQYAIEMKTYNKVLAVYKAKLSGLPVPEEVVEAEVEEEEEEEPAPPPKPIATPKSAKGKKEKSESSKKKSSKDKATPKEKSSRKRSTKEVTPPPSAGEEEQQPAPATKSPRKRKRKAAD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.12
3 0.09
4 0.08
5 0.08
6 0.07
7 0.1
8 0.11
9 0.13
10 0.18
11 0.25
12 0.32
13 0.41
14 0.45
15 0.44
16 0.46
17 0.44
18 0.42
19 0.36
20 0.29
21 0.22
22 0.18
23 0.17
24 0.13
25 0.13
26 0.11
27 0.1
28 0.1
29 0.07
30 0.06
31 0.06
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.09
41 0.08
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.06
46 0.07
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.07
51 0.08
52 0.08
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.12
58 0.13
59 0.14
60 0.18
61 0.18
62 0.18
63 0.2
64 0.22
65 0.24
66 0.23
67 0.23
68 0.2
69 0.21
70 0.21
71 0.18
72 0.17
73 0.11
74 0.1
75 0.08
76 0.07
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.07
82 0.09
83 0.16
84 0.21
85 0.28
86 0.36
87 0.45
88 0.55
89 0.65
90 0.73
91 0.77
92 0.84
93 0.84
94 0.88
95 0.88
96 0.83
97 0.82
98 0.81
99 0.79
100 0.76
101 0.74
102 0.64
103 0.59
104 0.58
105 0.5
106 0.46
107 0.37
108 0.32
109 0.28
110 0.28
111 0.24
112 0.21
113 0.2
114 0.17
115 0.17
116 0.15
117 0.14
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.11
122 0.1
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.07
131 0.06
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.11
137 0.11
138 0.1
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.1
145 0.15
146 0.21
147 0.23
148 0.24
149 0.25
150 0.3
151 0.3
152 0.3
153 0.27
154 0.2
155 0.2
156 0.27
157 0.27
158 0.21
159 0.22
160 0.21
161 0.23
162 0.24
163 0.2
164 0.13
165 0.13
166 0.14
167 0.19
168 0.23
169 0.21
170 0.22
171 0.23
172 0.23
173 0.22
174 0.22
175 0.2
176 0.17
177 0.18
178 0.17
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.14
183 0.1
184 0.08
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.05
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.11
201 0.16
202 0.22
203 0.27
204 0.32
205 0.37
206 0.43
207 0.54
208 0.57
209 0.58
210 0.62
211 0.65
212 0.67
213 0.71
214 0.74
215 0.73
216 0.8
217 0.84
218 0.83
219 0.83
220 0.81
221 0.8
222 0.82
223 0.82
224 0.81
225 0.82
226 0.84
227 0.84
228 0.89
229 0.89
230 0.85
231 0.85
232 0.83
233 0.83
234 0.83
235 0.83
236 0.83
237 0.81
238 0.83
239 0.82
240 0.83
241 0.84
242 0.84
243 0.8
244 0.75
245 0.69
246 0.62
247 0.56
248 0.49
249 0.4
250 0.33
251 0.3
252 0.28
253 0.28
254 0.27
255 0.25
256 0.24
257 0.25
258 0.26
259 0.3
260 0.36
261 0.46
262 0.55
263 0.65
264 0.74
265 0.82