Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

S7XJM1

Protein Details
Accession S7XJM1    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-103VTDKEMVKKDKKEKDWKSMRFDGBasic
194-219DDDEKTRKGKKKGKDKKRNIKRESALBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
198-216KTRKGKKKGKDKKRNIKRE
288-298KEKEIREERNR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
Amino Acid Sequences MNFLVEITTTNNKTFVGNLLGMEDDNLILDNCCIDNDMSIKYKIWIKRSDIVEIEEINGDINKPEDYSNINKSIEGVNDIVTDKEMVKKDKKEKDWKSMRFDGDIEILEGSARNWNQFEANEKLFGVKPHFDESLYTEVLDKNAEYYKKNLDEALKIEKEILSSKTRDSHRLEERGIRVNGNEEEKYSLVKKFDDDEKTRKGKKKGKDKKRNIKRESALVGQGKLTEEIKGWNIEESRRRMEERNKMSREKEVTGEKNKTSREKEITGEKNVMNKGKEIQEERNKTNKEKEIREERNRMNKEKADEKNKLNKEININISKNTINETKNTSIIHNTNKESKLPIKVSYTRSIADTFKNVKIYIGNITNKFTGSLEPKESWFMKEEIKDKHYNKES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.2
4 0.19
5 0.18
6 0.18
7 0.18
8 0.18
9 0.17
10 0.14
11 0.08
12 0.07
13 0.08
14 0.07
15 0.07
16 0.07
17 0.08
18 0.07
19 0.08
20 0.09
21 0.09
22 0.1
23 0.12
24 0.16
25 0.19
26 0.2
27 0.21
28 0.23
29 0.3
30 0.33
31 0.38
32 0.41
33 0.44
34 0.5
35 0.52
36 0.55
37 0.5
38 0.48
39 0.43
40 0.37
41 0.32
42 0.25
43 0.22
44 0.16
45 0.14
46 0.11
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.09
51 0.09
52 0.1
53 0.15
54 0.21
55 0.26
56 0.3
57 0.3
58 0.29
59 0.3
60 0.31
61 0.28
62 0.24
63 0.19
64 0.15
65 0.16
66 0.16
67 0.15
68 0.12
69 0.12
70 0.1
71 0.16
72 0.19
73 0.24
74 0.31
75 0.4
76 0.5
77 0.58
78 0.67
79 0.72
80 0.76
81 0.8
82 0.84
83 0.83
84 0.81
85 0.8
86 0.72
87 0.64
88 0.56
89 0.47
90 0.39
91 0.32
92 0.24
93 0.16
94 0.13
95 0.11
96 0.1
97 0.08
98 0.11
99 0.11
100 0.12
101 0.12
102 0.13
103 0.15
104 0.15
105 0.2
106 0.2
107 0.21
108 0.21
109 0.2
110 0.22
111 0.21
112 0.22
113 0.21
114 0.19
115 0.2
116 0.22
117 0.23
118 0.21
119 0.21
120 0.22
121 0.22
122 0.19
123 0.17
124 0.15
125 0.15
126 0.15
127 0.14
128 0.11
129 0.08
130 0.12
131 0.14
132 0.14
133 0.17
134 0.23
135 0.24
136 0.25
137 0.26
138 0.24
139 0.25
140 0.26
141 0.31
142 0.25
143 0.23
144 0.23
145 0.21
146 0.2
147 0.19
148 0.2
149 0.16
150 0.17
151 0.18
152 0.24
153 0.26
154 0.32
155 0.34
156 0.39
157 0.42
158 0.46
159 0.46
160 0.45
161 0.46
162 0.47
163 0.43
164 0.35
165 0.28
166 0.27
167 0.27
168 0.25
169 0.22
170 0.15
171 0.16
172 0.15
173 0.17
174 0.15
175 0.15
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.15
180 0.21
181 0.26
182 0.29
183 0.33
184 0.39
185 0.46
186 0.52
187 0.56
188 0.6
189 0.61
190 0.65
191 0.71
192 0.74
193 0.78
194 0.82
195 0.87
196 0.88
197 0.92
198 0.94
199 0.88
200 0.86
201 0.78
202 0.73
203 0.65
204 0.57
205 0.52
206 0.42
207 0.38
208 0.28
209 0.26
210 0.2
211 0.17
212 0.15
213 0.09
214 0.08
215 0.09
216 0.1
217 0.11
218 0.1
219 0.12
220 0.13
221 0.16
222 0.22
223 0.25
224 0.28
225 0.29
226 0.32
227 0.36
228 0.44
229 0.5
230 0.53
231 0.59
232 0.6
233 0.62
234 0.61
235 0.62
236 0.58
237 0.5
238 0.45
239 0.43
240 0.45
241 0.48
242 0.5
243 0.46
244 0.47
245 0.48
246 0.51
247 0.47
248 0.48
249 0.46
250 0.44
251 0.45
252 0.49
253 0.51
254 0.47
255 0.47
256 0.41
257 0.4
258 0.41
259 0.42
260 0.33
261 0.29
262 0.29
263 0.3
264 0.33
265 0.32
266 0.38
267 0.44
268 0.5
269 0.54
270 0.59
271 0.58
272 0.57
273 0.61
274 0.6
275 0.58
276 0.58
277 0.62
278 0.64
279 0.7
280 0.75
281 0.76
282 0.76
283 0.79
284 0.79
285 0.75
286 0.72
287 0.67
288 0.63
289 0.64
290 0.64
291 0.63
292 0.64
293 0.67
294 0.69
295 0.69
296 0.72
297 0.66
298 0.62
299 0.61
300 0.61
301 0.61
302 0.59
303 0.55
304 0.48
305 0.47
306 0.42
307 0.35
308 0.33
309 0.31
310 0.24
311 0.26
312 0.32
313 0.32
314 0.34
315 0.35
316 0.32
317 0.33
318 0.37
319 0.42
320 0.41
321 0.43
322 0.47
323 0.48
324 0.48
325 0.47
326 0.47
327 0.47
328 0.44
329 0.45
330 0.44
331 0.5
332 0.53
333 0.54
334 0.52
335 0.44
336 0.44
337 0.42
338 0.38
339 0.34
340 0.37
341 0.36
342 0.37
343 0.39
344 0.37
345 0.35
346 0.33
347 0.32
348 0.31
349 0.34
350 0.36
351 0.35
352 0.39
353 0.38
354 0.37
355 0.36
356 0.29
357 0.28
358 0.27
359 0.3
360 0.32
361 0.33
362 0.34
363 0.4
364 0.4
365 0.36
366 0.34
367 0.31
368 0.32
369 0.37
370 0.43
371 0.44
372 0.5
373 0.57
374 0.56