FuNGI

S7XUC7

Protein Details

Accession

S7XUC7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
147-176	KGCHTRKICIHCKTRYPKYIKGRNLRILKE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1023-1026	KRKL

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 14, cyto 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR047107 DNA-dir_RNA_pol1_lsu_C IPR015699 DNA-dir_RNA_pol1_lsu_N IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR044893 RNA_pol_Rpb1_clamp_domain IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd02735 RNAP_I_Rpa1_C cd01435 RNAP_I_RPA1_N

Amino Acid Sequences

MSLIFSPENVSFDFYKNDDIEKISVAEIKSILAFDSFGHPLPDGLYDLRMGPLSPEKSCETCKLSYFNCQGHFGRINLGVYVYNPLCFAQLYKLIRASCIKCNRFNATDEQKIFIQKDLLAIKYTEESKINADNLQIHHNLTNEFFKGCHTRKICIHCKTRYPKYIKGRNLRILKEIDGTPMFIRPDELVENLKGLFETEVELCHAIFGTNDHLMFFVKNIIVQPNKFRPVSYNDGKLYENNRNMILTSIIKETIKVQREASDENIGNLQRLVYFYFDSSKNENKNIPGMKQILEKKEGLFRQNMMGKRVNYAARSVISPDPNLEPREVGVPQIFAETLTFPEQVTPYNLEKLRQLVLNGSKYPGCVYIEENGVLRNIKFISDKDRIIAANQLLQGNKRVWRHLQNGDFVLLNRQPTLHKPSIMGHIVRVLPEEKTIRFNYANCSSYNADFDGDEMNIHFVQSHISRAEVQNVCLNDNNYLVSTDGNPIRGLIQDYIVVCSRMTLKNTFYSEEQYKAIVNNGLSCGIGTDRLKKLLKRKIILEKPCIKTPVKIYSGKQIISTILKNLGLKINIKEVNRLNKQLINEYEDERIVQIVDGTLVSGVLDKSQIGPSAFGLVHACGEVYGYEVCNDLFTVFGRILNKEIMYNGFTTGIDDLLLDQEAEKERNRIILEGIEEGKNIARKQMTDMYFRDQEKVKEIDMMTMRKMNEVTTKILNNSLVTGQKKKYPNNGMGLIINSGARGSIVNLSQISALLGQQELEGRRVPLMISGASLPCFKPYDPNPITGGFIFHRFLTGLQPAEYFFHCMAGREGLMDTAVKTHVSGYLQRSLIKHLESLKVEYDHTVRSDKRVISFKYGEDGLDPRKEKYLKRMDFLEDNKKEIANGQDVDIYSYKKERAYIEPGEPVGIIAAQSIGEPSTQMTLNTFHLAGVGGGNVTLGMPRLKEIVMVASKEIKNPYVKVNINENFLNNKDFIKLEKVMLSECIEQFKITQNIVRVDGLSKEIKIDFYAKTEIKRVMKVIKRKLLKKLIEESNKLNKSKSVIAVSAKKEETREMEIKEEKIESSVEDSSSDNEELNKDDSSTNNPDLEEIEEEIIVDDILEMPSRIDTTEKVTLKDNIITITLYTPVETELPFYQILEQLVAETKIEEHGGISATSIEKDNIILYGGKLDDLFFKLDTPIPLTFDQCIDIYSAYTNDIYKTLTILGVEAARNVIVEEINGVFSVYGIKINKRHIILIADYMTRDGGFSAFSRTGMLSTGSALQKISFESCFSRLRESAIFHDIDFLENPSARIILGQPIKHGTGSFELIHKYDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.27
3	0.26
4	0.28
5	0.26
6	0.27
7	0.26
8	0.24
9	0.24
10	0.2
11	0.23
12	0.2
13	0.21
14	0.18
15	0.17
16	0.16
17	0.15
18	0.14
19	0.1
20	0.1
21	0.09
22	0.14
23	0.15
24	0.15
25	0.16
26	0.16
27	0.16
28	0.17
29	0.17
30	0.15
31	0.14
32	0.14
33	0.13
34	0.14
35	0.15
36	0.14
37	0.13
38	0.14
39	0.21
40	0.24
41	0.24
42	0.27
43	0.3
44	0.34
45	0.38
46	0.41
47	0.38
48	0.38
49	0.41
50	0.44
51	0.42
52	0.47
53	0.51
54	0.5
55	0.48
56	0.5
57	0.48
58	0.49
59	0.5
60	0.41
61	0.39
62	0.37
63	0.34
64	0.28
65	0.28
66	0.21
67	0.18
68	0.24
69	0.19
70	0.16
71	0.16
72	0.16
73	0.15
74	0.15
75	0.16
76	0.14
77	0.22
78	0.24
79	0.27
80	0.32
81	0.31
82	0.35
83	0.42
84	0.41
85	0.43
86	0.5
87	0.53
88	0.55
89	0.61
90	0.65
91	0.6
92	0.59
93	0.59
94	0.58
95	0.61
96	0.55
97	0.52
98	0.47
99	0.49
100	0.46
101	0.38
102	0.32
103	0.24
104	0.29
105	0.29
106	0.28
107	0.25
108	0.24
109	0.23
110	0.25
111	0.26
112	0.22
113	0.21
114	0.21
115	0.23
116	0.27
117	0.27
118	0.24
119	0.25
120	0.27
121	0.27
122	0.31
123	0.29
124	0.26
125	0.27
126	0.27
127	0.26
128	0.24
129	0.26
130	0.21
131	0.21
132	0.19
133	0.21
134	0.29
135	0.31
136	0.38
137	0.36
138	0.41
139	0.48
140	0.58
141	0.63
142	0.63
143	0.69
144	0.67
145	0.75
146	0.79
147	0.82
148	0.82
149	0.79
150	0.8
151	0.81
152	0.84
153	0.83
154	0.84
155	0.83
156	0.83
157	0.84
158	0.77
159	0.72
160	0.65
161	0.58
162	0.52
163	0.42
164	0.38
165	0.3
166	0.3
167	0.24
168	0.25
169	0.23
170	0.18
171	0.19
172	0.15
173	0.17
174	0.17
175	0.18
176	0.18
177	0.18
178	0.19
179	0.17
180	0.17
181	0.13
182	0.12
183	0.1
184	0.07
185	0.09
186	0.08
187	0.09
188	0.11
189	0.11
190	0.1
191	0.1
192	0.1
193	0.07
194	0.07
195	0.08
196	0.1
197	0.12
198	0.12
199	0.12
200	0.13
201	0.13
202	0.13
203	0.13
204	0.12
205	0.1
206	0.11
207	0.13
208	0.19
209	0.22
210	0.25
211	0.33
212	0.38
213	0.43
214	0.42
215	0.41
216	0.39
217	0.42
218	0.49
219	0.46
220	0.46
221	0.42
222	0.44
223	0.45
224	0.45
225	0.44
226	0.44
227	0.43
228	0.37
229	0.36
230	0.34
231	0.33
232	0.29
233	0.26
234	0.19
235	0.17
236	0.16
237	0.17
238	0.17
239	0.17
240	0.21
241	0.26
242	0.29
243	0.29
244	0.28
245	0.31
246	0.35
247	0.37
248	0.36
249	0.35
250	0.31
251	0.3
252	0.33
253	0.28
254	0.25
255	0.22
256	0.19
257	0.12
258	0.12
259	0.12
260	0.1
261	0.11
262	0.11
263	0.16
264	0.17
265	0.2
266	0.24
267	0.31
268	0.33
269	0.36
270	0.38
271	0.36
272	0.43
273	0.42
274	0.39
275	0.37
276	0.36
277	0.34
278	0.39
279	0.43
280	0.39
281	0.39
282	0.39
283	0.35
284	0.4
285	0.41
286	0.37
287	0.34
288	0.3
289	0.34
290	0.39
291	0.4
292	0.37
293	0.4
294	0.37
295	0.37
296	0.41
297	0.36
298	0.31
299	0.3
300	0.28
301	0.23
302	0.23
303	0.24
304	0.24
305	0.23
306	0.23
307	0.23
308	0.24
309	0.27
310	0.28
311	0.25
312	0.2
313	0.19
314	0.22
315	0.2
316	0.17
317	0.14
318	0.13
319	0.13
320	0.13
321	0.12
322	0.09
323	0.09
324	0.08
325	0.09
326	0.11
327	0.11
328	0.1
329	0.12
330	0.12
331	0.13
332	0.15
333	0.18
334	0.17
335	0.24
336	0.25
337	0.24
338	0.26
339	0.27
340	0.26
341	0.23
342	0.22
343	0.21
344	0.27
345	0.3
346	0.29
347	0.28
348	0.26
349	0.25
350	0.26
351	0.22
352	0.17
353	0.14
354	0.15
355	0.16
356	0.17
357	0.18
358	0.17
359	0.15
360	0.15
361	0.14
362	0.12
363	0.12
364	0.1
365	0.11
366	0.13
367	0.14
368	0.2
369	0.24
370	0.25
371	0.23
372	0.25
373	0.24
374	0.23
375	0.26
376	0.19
377	0.18
378	0.2
379	0.21
380	0.19
381	0.2
382	0.22
383	0.21
384	0.25
385	0.24
386	0.26
387	0.3
388	0.37
389	0.43
390	0.48
391	0.49
392	0.47
393	0.47
394	0.44
395	0.38
396	0.31
397	0.29
398	0.22
399	0.19
400	0.15
401	0.15
402	0.15
403	0.19
404	0.27
405	0.25
406	0.25
407	0.26
408	0.28
409	0.34
410	0.36
411	0.32
412	0.23
413	0.25
414	0.24
415	0.22
416	0.22
417	0.16
418	0.13
419	0.16
420	0.18
421	0.15
422	0.2
423	0.21
424	0.23
425	0.24
426	0.25
427	0.28
428	0.32
429	0.32
430	0.27
431	0.31
432	0.28
433	0.27
434	0.28
435	0.22
436	0.16
437	0.14
438	0.14
439	0.11
440	0.09
441	0.08
442	0.07
443	0.08
444	0.08
445	0.08
446	0.07
447	0.06
448	0.09
449	0.09
450	0.11
451	0.1
452	0.11
453	0.13
454	0.14
455	0.22
456	0.2
457	0.21
458	0.22
459	0.22
460	0.23
461	0.23
462	0.23
463	0.15
464	0.15
465	0.14
466	0.11
467	0.11
468	0.1
469	0.08
470	0.08
471	0.11
472	0.12
473	0.12
474	0.12
475	0.12
476	0.12
477	0.12
478	0.13
479	0.1
480	0.09
481	0.11
482	0.11
483	0.13
484	0.13
485	0.12
486	0.1
487	0.1
488	0.13
489	0.14
490	0.16
491	0.16
492	0.18
493	0.23
494	0.25
495	0.26
496	0.24
497	0.26
498	0.26
499	0.26
500	0.24
501	0.19
502	0.18
503	0.17
504	0.17
505	0.14
506	0.12
507	0.11
508	0.11
509	0.11
510	0.1
511	0.09
512	0.08
513	0.06
514	0.1
515	0.09
516	0.14
517	0.15
518	0.21
519	0.24
520	0.27
521	0.36
522	0.41
523	0.47
524	0.45
525	0.51
526	0.55
527	0.62
528	0.64
529	0.64
530	0.65
531	0.62
532	0.62
533	0.59
534	0.49
535	0.44
536	0.43
537	0.43
538	0.38
539	0.39
540	0.37
541	0.42
542	0.44
543	0.41
544	0.36
545	0.29
546	0.25
547	0.24
548	0.23
549	0.16
550	0.14
551	0.15
552	0.14
553	0.15
554	0.15
555	0.14
556	0.16
557	0.15
558	0.2
559	0.23
560	0.23
561	0.27
562	0.29
563	0.37
564	0.38
565	0.4
566	0.35
567	0.34
568	0.34
569	0.34
570	0.31
571	0.26
572	0.24
573	0.24
574	0.23
575	0.2
576	0.19
577	0.14
578	0.12
579	0.08
580	0.07
581	0.05
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.03
586	0.03
587	0.03
588	0.03
589	0.04
590	0.03
591	0.03
592	0.04
593	0.04
594	0.05
595	0.06
596	0.08
597	0.07
598	0.08
599	0.08
600	0.11
601	0.1
602	0.1
603	0.09
604	0.08
605	0.08
606	0.07
607	0.07
608	0.04
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.04
613	0.04
614	0.05
615	0.05
616	0.05
617	0.05
618	0.05
619	0.04
620	0.04
621	0.04
622	0.06
623	0.05
624	0.07
625	0.08
626	0.09
627	0.1
628	0.11
629	0.11
630	0.09
631	0.1
632	0.09
633	0.09
634	0.09
635	0.08
636	0.08
637	0.08
638	0.08
639	0.08
640	0.06
641	0.05
642	0.05
643	0.05
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.03
648	0.05
649	0.06
650	0.08
651	0.08
652	0.09
653	0.1
654	0.13
655	0.13
656	0.12
657	0.12
658	0.12
659	0.12
660	0.13
661	0.14
662	0.11
663	0.1
664	0.1
665	0.11
666	0.12
667	0.11
668	0.12
669	0.11
670	0.12
671	0.16
672	0.23
673	0.24
674	0.25
675	0.27
676	0.29
677	0.34
678	0.34
679	0.33
680	0.28
681	0.26
682	0.26
683	0.26
684	0.22
685	0.2
686	0.2
687	0.22
688	0.23
689	0.23
690	0.2
691	0.22
692	0.21
693	0.19
694	0.19
695	0.15
696	0.17
697	0.18
698	0.19
699	0.19
700	0.2
701	0.19
702	0.2
703	0.2
704	0.15
705	0.14
706	0.13
707	0.15
708	0.16
709	0.2
710	0.19
711	0.26
712	0.31
713	0.34
714	0.41
715	0.43
716	0.46
717	0.46
718	0.47
719	0.41
720	0.36
721	0.33
722	0.25
723	0.19
724	0.14
725	0.08
726	0.06
727	0.05
728	0.04
729	0.04
730	0.04
731	0.06
732	0.06
733	0.08
734	0.08
735	0.08
736	0.08
737	0.08
738	0.08
739	0.06
740	0.06
741	0.05
742	0.05
743	0.04
744	0.05
745	0.07
746	0.08
747	0.09
748	0.1
749	0.09
750	0.1
751	0.1
752	0.09
753	0.08
754	0.09
755	0.07
756	0.07
757	0.08
758	0.08
759	0.09
760	0.1
761	0.09
762	0.1
763	0.11
764	0.1
765	0.16
766	0.18
767	0.28
768	0.28
769	0.31
770	0.31
771	0.3
772	0.32
773	0.25
774	0.25
775	0.15
776	0.16
777	0.14
778	0.12
779	0.11
780	0.1
781	0.11
782	0.11
783	0.13
784	0.12
785	0.11
786	0.12
787	0.12
788	0.13
789	0.13
790	0.13
791	0.1
792	0.13
793	0.12
794	0.13
795	0.13
796	0.13
797	0.12
798	0.1
799	0.1
800	0.07
801	0.08
802	0.07
803	0.06
804	0.06
805	0.06
806	0.06
807	0.06
808	0.06
809	0.08
810	0.09
811	0.13
812	0.15
813	0.21
814	0.22
815	0.24
816	0.25
817	0.26
818	0.28
819	0.24
820	0.24
821	0.21
822	0.25
823	0.24
824	0.25
825	0.24
826	0.23
827	0.22
828	0.21
829	0.2
830	0.16
831	0.17
832	0.2
833	0.18
834	0.2
835	0.26
836	0.25
837	0.29
838	0.35
839	0.35
840	0.37
841	0.39
842	0.36
843	0.33
844	0.32
845	0.27
846	0.21
847	0.22
848	0.19
849	0.23
850	0.24
851	0.21
852	0.28
853	0.31
854	0.31
855	0.39
856	0.46
857	0.43
858	0.44
859	0.47
860	0.44
861	0.48
862	0.51
863	0.52
864	0.42
865	0.42
866	0.39
867	0.36
868	0.32
869	0.28
870	0.26
871	0.19
872	0.18
873	0.17
874	0.18
875	0.18
876	0.21
877	0.19
878	0.17
879	0.14
880	0.16
881	0.17
882	0.16
883	0.19
884	0.19
885	0.24
886	0.3
887	0.33
888	0.33
889	0.34
890	0.33
891	0.3
892	0.27
893	0.21
894	0.14
895	0.1
896	0.07
897	0.04
898	0.04
899	0.04
900	0.04
901	0.04
902	0.04
903	0.04
904	0.04
905	0.05
906	0.06
907	0.07
908	0.07
909	0.08
910	0.1
911	0.12
912	0.13
913	0.13
914	0.11
915	0.11
916	0.11
917	0.09
918	0.07
919	0.06
920	0.04
921	0.04
922	0.04
923	0.03
924	0.03
925	0.03
926	0.04
927	0.05
928	0.05
929	0.06
930	0.08
931	0.07
932	0.08
933	0.08
934	0.13
935	0.14
936	0.15
937	0.16
938	0.22
939	0.22
940	0.25
941	0.26
942	0.24
943	0.25
944	0.26
945	0.3
946	0.31
947	0.34
948	0.34
949	0.42
950	0.42
951	0.42
952	0.42
953	0.38
954	0.34
955	0.32
956	0.3
957	0.22
958	0.19
959	0.17
960	0.17
961	0.17
962	0.19
963	0.19
964	0.19
965	0.21
966	0.21
967	0.2
968	0.21
969	0.22
970	0.2
971	0.19
972	0.2
973	0.18
974	0.18
975	0.18
976	0.23
977	0.23
978	0.2
979	0.22
980	0.23
981	0.26
982	0.28
983	0.27
984	0.21
985	0.19
986	0.19
987	0.2
988	0.17
989	0.15
990	0.15
991	0.15
992	0.15
993	0.16
994	0.17
995	0.15
996	0.17
997	0.23
998	0.23
999	0.24
1000	0.28
1001	0.34
1002	0.34
1003	0.36
1004	0.36
1005	0.39
1006	0.45
1007	0.52
1008	0.57
1009	0.59
1010	0.65
1011	0.68
1012	0.74
1013	0.75
1014	0.73
1015	0.71
1016	0.7
1017	0.71
1018	0.7
1019	0.68
1020	0.65
1021	0.66
1022	0.66
1023	0.61
1024	0.53
1025	0.45
1026	0.41
1027	0.43
1028	0.41
1029	0.34
1030	0.31
1031	0.37
1032	0.43
1033	0.44
1034	0.46
1035	0.42
1036	0.39
1037	0.36
1038	0.36
1039	0.34
1040	0.34
1041	0.36
1042	0.31
1043	0.37
1044	0.39
1045	0.39
1046	0.37
1047	0.34
1048	0.27
1049	0.23
1050	0.21
1051	0.15
1052	0.16
1053	0.16
1054	0.14
1055	0.14
1056	0.15
1057	0.15
1058	0.18
1059	0.18
1060	0.14
1061	0.14
1062	0.15
1063	0.16
1064	0.18
1065	0.16
1066	0.14
1067	0.15
1068	0.16
1069	0.22
1070	0.27
1071	0.27
1072	0.26
1073	0.26
1074	0.25
1075	0.25
1076	0.25
1077	0.2
1078	0.15
1079	0.13
1080	0.12
1081	0.12
1082	0.11
1083	0.1
1084	0.08
1085	0.06
1086	0.04
1087	0.04
1088	0.05
1089	0.05
1090	0.05
1091	0.06
1092	0.06
1093	0.07
1094	0.07
1095	0.08
1096	0.09
1097	0.15
1098	0.24
1099	0.25
1100	0.26
1101	0.3
1102	0.33
1103	0.34
1104	0.36
1105	0.3
1106	0.23
1107	0.22
1108	0.21
1109	0.18
1110	0.15
1111	0.15
1112	0.12
1113	0.11
1114	0.1
1115	0.1
1116	0.12
1117	0.11
1118	0.13
1119	0.12
1120	0.14
1121	0.14
1122	0.14
1123	0.15
1124	0.16
1125	0.16
1126	0.14
1127	0.13
1128	0.11
1129	0.14
1130	0.14
1131	0.12
1132	0.1
1133	0.1
1134	0.1
1135	0.11
1136	0.09
1137	0.08
1138	0.09
1139	0.1
1140	0.09
1141	0.09
1142	0.1
1143	0.1
1144	0.11
1145	0.12
1146	0.11
1147	0.1
1148	0.11
1149	0.11
1150	0.09
1151	0.1
1152	0.1
1153	0.09
1154	0.12
1155	0.12
1156	0.12
1157	0.11
1158	0.12
1159	0.13
1160	0.14
1161	0.16
1162	0.13
1163	0.13
1164	0.15
1165	0.18
1166	0.19
1167	0.2
1168	0.19
1169	0.21
1170	0.22
1171	0.23
1172	0.23
1173	0.21
1174	0.21
1175	0.17
1176	0.16
1177	0.14
1178	0.13
1179	0.12
1180	0.12
1181	0.12
1182	0.11
1183	0.12
1184	0.13
1185	0.12
1186	0.13
1187	0.13
1188	0.12
1189	0.13
1190	0.12
1191	0.12
1192	0.11
1193	0.11
1194	0.11
1195	0.13
1196	0.13
1197	0.12
1198	0.12
1199	0.11
1200	0.1
1201	0.1
1202	0.1
1203	0.07
1204	0.07
1205	0.08
1206	0.08
1207	0.09
1208	0.09
1209	0.09
1210	0.07
1211	0.07
1212	0.1
1213	0.08
1214	0.13
1215	0.15
1216	0.21
1217	0.26
1218	0.33
1219	0.39
1220	0.39
1221	0.4
1222	0.38
1223	0.4
1224	0.37
1225	0.37
1226	0.34
1227	0.29
1228	0.27
1229	0.26
1230	0.23
1231	0.18
1232	0.16
1233	0.11
1234	0.08
1235	0.09
1236	0.09
1237	0.15
1238	0.15
1239	0.15
1240	0.17
1241	0.17
1242	0.17
1243	0.16
1244	0.17
1245	0.11
1246	0.12
1247	0.19
1248	0.18
1249	0.18
1250	0.18
1251	0.18
1252	0.17
1253	0.19
1254	0.2
1255	0.15
1256	0.17
1257	0.2
1258	0.24
1259	0.3
1260	0.31
1261	0.35
1262	0.33
1263	0.36
1264	0.38
1265	0.38
1266	0.39
1267	0.38
1268	0.37
1269	0.3
1270	0.35
1271	0.3
1272	0.28
1273	0.25
1274	0.23
1275	0.21
1276	0.21
1277	0.22
1278	0.18
1279	0.17
1280	0.15
1281	0.15
1282	0.14
1283	0.19
1284	0.24
1285	0.25
1286	0.27
1287	0.31
1288	0.33
1289	0.32
1290	0.31
1291	0.26
1292	0.24
1293	0.27
1294	0.25
1295	0.24
1296	0.26

S7XUC7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer