Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S7WA54

Protein Details
Accession S7WA54    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-50NKSVDIKKSIQKKKSKKKDSDDDRKESMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-63KKSIQKKKSKKKDSDDDRKESMEIKRKFSKSKKIK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MIINSDDESLIKQENHIINSNDNKSVDIKKSIQKKKSKKKDSDDDRKESMEIKRKFSKSKKIKVDVEGKTIKVIDRMKYLLEEDIKLNKEKKAALNRINNLDEIMTDLNYKPFYDTLLKNGILNHLKMWLEPLPDNSLPNHRIKKEILGLLYRMPVRREHLLQSDVGKIINFYSKNLFESKDIRHLAKDLVKKWTMMLYNN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.28
3 0.32
4 0.32
5 0.35
6 0.43
7 0.45
8 0.42
9 0.38
10 0.36
11 0.34
12 0.38
13 0.36
14 0.34
15 0.36
16 0.39
17 0.5
18 0.57
19 0.63
20 0.67
21 0.74
22 0.79
23 0.85
24 0.89
25 0.89
26 0.9
27 0.92
28 0.92
29 0.92
30 0.9
31 0.86
32 0.78
33 0.7
34 0.6
35 0.54
36 0.51
37 0.49
38 0.44
39 0.44
40 0.5
41 0.52
42 0.61
43 0.64
44 0.67
45 0.68
46 0.74
47 0.77
48 0.77
49 0.78
50 0.76
51 0.78
52 0.7
53 0.67
54 0.6
55 0.5
56 0.42
57 0.38
58 0.3
59 0.27
60 0.27
61 0.21
62 0.22
63 0.22
64 0.21
65 0.22
66 0.22
67 0.19
68 0.17
69 0.16
70 0.14
71 0.18
72 0.19
73 0.21
74 0.22
75 0.2
76 0.21
77 0.23
78 0.28
79 0.32
80 0.38
81 0.44
82 0.49
83 0.51
84 0.53
85 0.51
86 0.45
87 0.35
88 0.28
89 0.19
90 0.14
91 0.11
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.07
100 0.1
101 0.14
102 0.14
103 0.16
104 0.2
105 0.21
106 0.21
107 0.21
108 0.24
109 0.21
110 0.21
111 0.18
112 0.17
113 0.17
114 0.16
115 0.18
116 0.15
117 0.15
118 0.16
119 0.17
120 0.2
121 0.2
122 0.21
123 0.2
124 0.24
125 0.25
126 0.32
127 0.36
128 0.32
129 0.35
130 0.35
131 0.4
132 0.39
133 0.39
134 0.34
135 0.3
136 0.3
137 0.28
138 0.31
139 0.27
140 0.24
141 0.22
142 0.22
143 0.24
144 0.29
145 0.3
146 0.31
147 0.34
148 0.34
149 0.35
150 0.34
151 0.32
152 0.27
153 0.25
154 0.2
155 0.15
156 0.14
157 0.19
158 0.17
159 0.16
160 0.21
161 0.23
162 0.25
163 0.27
164 0.28
165 0.25
166 0.3
167 0.33
168 0.36
169 0.38
170 0.38
171 0.38
172 0.38
173 0.41
174 0.43
175 0.46
176 0.41
177 0.45
178 0.45
179 0.43
180 0.43
181 0.43