FuNGI

S7WA53

Protein Details

Accession

S7WA53

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1076-1098	INSTDSKKKKEPYFQFKDLKRSI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
303-308	KGKHGR

Subcellular Location(s)

cyto 11.5, cyto_nucl 10.5, nucl 8.5, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR044893 RNA_pol_Rpb1_clamp_domain IPR035697 RNAP_III_RPC1_N IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd02583 RNAP_III_RPC1_N

Amino Acid Sequences

MKEKVKQCPTLVTNFDGISFGLFSDEEILKMSVVEIKIKDLYDAENNIPAKSGPLDGKLGASLISNECEECKKSVSECNGHFGHIKLELPVFHVGFIKQIYNIMQMVCKSCGEMLLSEDRKFYYKKKIREVNDLEIVKKIILESKTCNICYSCNSYNGTVRKTGLKINYEKKIDVDGEEVNVKENLNPMTVYNIFKLIKEEDFELLAVKDPKNLIIKNIIVPPSVIRPSVSMEAENGSNEDDLTVKLSKIVHCNELLKNSISKGNGFSIIQDDWDFLQIQCGMLINSDVGKDKPIRGLIQRLKGKHGRFRGNLSGKRVDFSGRTVISPDPNISIEEVGIPQHMAKILTIEEKVTDFNKKKMQELIENGPNKYPGANYITSKQTKVKRFLMFGDRKTEAKNIKIGDKVERHLIDGDVVLFNRQPSLHRQSIMAHKTKIFNQRTLKLNICVCAPYNADFDGDEMNVHVPQRVEARAEALTLMGVKENLTTAKNGEILITPSQDFITALYLISSKDVFFDKVKVGNVLSWFLDGKVDIKPTITHPVELYTGKQILEALIKNSVSDFKTINLETKNKNLKKIEDGILAEEDGFVVIREGKYLFGRLDKSIVGGGYNSSLLYRIFKSSPKNCVNFMDNASKLCSRIMAELGFSIGLDDVIPTPSLVHGKSKIIDKGRSECKAEIKKYFDGNLEHIPGLTLEKTLEKILSHNLSQIRDDCGTLCINELSHKNSPLIMHRCGSKGSKINISQMVMCVGQQVISGGRIPNGFETRTLPHFSDSFAPEAKGFVGSSFFNGLTATEFLFHAVSGREGLVDTAVKTAETGYMQRRLMKALEDVVVTYDGKVRNLFNEIIQYKYGDDDFDPNKVEDGSINKERIFLDLISSVYTNNLKTTNISKKIPDFNEIEEAEIKKFLENKQPKIQKYELDDFENIFKARYQEEKNKILINFGTPVGVLAGQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVSSMNITLGVPRLKEIINSTKNISTPILTIYSEQENVESARAIVENVKNYKTKDLIKSMKEVINKYELILELEVIDIKNVEIIKRQLKKEFKLENILVNNCKVIINSTDSKKKKEPYFQFKDLKRSILECDIKGIKEICRSVINKYQGSNYNILMEGSGLLKIFKINHIDQRKCVTNNIIEIYEVLGIEAARNSIINEIEYTMSNHGMKIDRKHIMLLADSMCARGEVLGITRFGINKMKISTLMMASFEQTADHLFDAAVYNRKDGIKGVSENIIVGSNIPIGTGMVELIYKE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.38
3	0.29
4	0.25
5	0.18
6	0.14
7	0.11
8	0.09
9	0.09
10	0.08
11	0.13
12	0.13
13	0.12
14	0.14
15	0.14
16	0.13
17	0.13
18	0.14
19	0.13
20	0.14
21	0.19
22	0.17
23	0.21
24	0.24
25	0.24
26	0.25
27	0.21
28	0.24
29	0.25
30	0.29
31	0.27
32	0.31
33	0.31
34	0.3
35	0.3
36	0.26
37	0.22
38	0.19
39	0.22
40	0.18
41	0.2
42	0.23
43	0.23
44	0.24
45	0.21
46	0.2
47	0.16
48	0.14
49	0.14
50	0.13
51	0.14
52	0.14
53	0.14
54	0.16
55	0.19
56	0.21
57	0.2
58	0.22
59	0.23
60	0.25
61	0.33
62	0.39
63	0.44
64	0.44
65	0.49
66	0.46
67	0.45
68	0.45
69	0.37
70	0.32
71	0.27
72	0.25
73	0.2
74	0.22
75	0.2
76	0.21
77	0.25
78	0.22
79	0.2
80	0.21
81	0.19
82	0.2
83	0.21
84	0.19
85	0.15
86	0.17
87	0.17
88	0.19
89	0.2
90	0.18
91	0.19
92	0.2
93	0.23
94	0.23
95	0.21
96	0.19
97	0.18
98	0.19
99	0.17
100	0.16
101	0.16
102	0.24
103	0.28
104	0.28
105	0.29
106	0.28
107	0.3
108	0.33
109	0.34
110	0.36
111	0.41
112	0.49
113	0.59
114	0.67
115	0.69
116	0.77
117	0.79
118	0.75
119	0.76
120	0.68
121	0.59
122	0.52
123	0.47
124	0.36
125	0.29
126	0.21
127	0.18
128	0.19
129	0.21
130	0.24
131	0.31
132	0.37
133	0.37
134	0.39
135	0.34
136	0.34
137	0.36
138	0.39
139	0.34
140	0.33
141	0.36
142	0.36
143	0.43
144	0.46
145	0.44
146	0.39
147	0.38
148	0.39
149	0.38
150	0.41
151	0.41
152	0.43
153	0.49
154	0.54
155	0.6
156	0.58
157	0.56
158	0.51
159	0.49
160	0.43
161	0.35
162	0.3
163	0.23
164	0.22
165	0.23
166	0.22
167	0.19
168	0.18
169	0.17
170	0.14
171	0.17
172	0.16
173	0.15
174	0.15
175	0.14
176	0.18
177	0.21
178	0.22
179	0.2
180	0.24
181	0.24
182	0.24
183	0.27
184	0.24
185	0.23
186	0.23
187	0.24
188	0.19
189	0.19
190	0.19
191	0.17
192	0.14
193	0.17
194	0.19
195	0.17
196	0.19
197	0.18
198	0.23
199	0.28
200	0.28
201	0.27
202	0.29
203	0.31
204	0.32
205	0.37
206	0.34
207	0.28
208	0.28
209	0.27
210	0.27
211	0.27
212	0.23
213	0.18
214	0.18
215	0.22
216	0.26
217	0.25
218	0.19
219	0.18
220	0.19
221	0.19
222	0.18
223	0.15
224	0.11
225	0.1
226	0.1
227	0.09
228	0.08
229	0.07
230	0.1
231	0.11
232	0.09
233	0.12
234	0.15
235	0.18
236	0.24
237	0.27
238	0.27
239	0.29
240	0.34
241	0.34
242	0.35
243	0.35
244	0.3
245	0.29
246	0.27
247	0.28
248	0.25
249	0.23
250	0.23
251	0.22
252	0.22
253	0.21
254	0.2
255	0.19
256	0.18
257	0.17
258	0.15
259	0.14
260	0.12
261	0.13
262	0.13
263	0.1
264	0.13
265	0.12
266	0.12
267	0.11
268	0.11
269	0.09
270	0.09
271	0.09
272	0.06
273	0.07
274	0.08
275	0.09
276	0.09
277	0.12
278	0.14
279	0.16
280	0.2
281	0.22
282	0.25
283	0.27
284	0.38
285	0.41
286	0.49
287	0.53
288	0.5
289	0.55
290	0.58
291	0.6
292	0.58
293	0.6
294	0.6
295	0.57
296	0.62
297	0.65
298	0.67
299	0.67
300	0.65
301	0.64
302	0.55
303	0.53
304	0.47
305	0.39
306	0.3
307	0.28
308	0.29
309	0.22
310	0.22
311	0.23
312	0.24
313	0.24
314	0.25
315	0.23
316	0.17
317	0.17
318	0.17
319	0.16
320	0.14
321	0.11
322	0.11
323	0.1
324	0.08
325	0.08
326	0.07
327	0.06
328	0.07
329	0.08
330	0.08
331	0.07
332	0.08
333	0.09
334	0.12
335	0.12
336	0.11
337	0.11
338	0.11
339	0.13
340	0.14
341	0.21
342	0.21
343	0.27
344	0.33
345	0.34
346	0.36
347	0.41
348	0.43
349	0.41
350	0.44
351	0.46
352	0.47
353	0.48
354	0.46
355	0.41
356	0.38
357	0.31
358	0.26
359	0.19
360	0.15
361	0.17
362	0.19
363	0.2
364	0.23
365	0.31
366	0.32
367	0.34
368	0.37
369	0.4
370	0.45
371	0.5
372	0.54
373	0.5
374	0.51
375	0.54
376	0.58
377	0.57
378	0.52
379	0.52
380	0.46
381	0.42
382	0.42
383	0.43
384	0.36
385	0.32
386	0.34
387	0.3
388	0.32
389	0.34
390	0.34
391	0.35
392	0.36
393	0.34
394	0.36
395	0.34
396	0.32
397	0.29
398	0.27
399	0.2
400	0.17
401	0.16
402	0.1
403	0.1
404	0.09
405	0.08
406	0.08
407	0.09
408	0.09
409	0.1
410	0.16
411	0.23
412	0.26
413	0.26
414	0.27
415	0.31
416	0.39
417	0.45
418	0.42
419	0.36
420	0.36
421	0.38
422	0.43
423	0.49
424	0.43
425	0.44
426	0.46
427	0.51
428	0.53
429	0.55
430	0.52
431	0.47
432	0.45
433	0.38
434	0.33
435	0.27
436	0.22
437	0.21
438	0.19
439	0.16
440	0.16
441	0.15
442	0.14
443	0.13
444	0.13
445	0.11
446	0.1
447	0.08
448	0.07
449	0.07
450	0.08
451	0.08
452	0.09
453	0.08
454	0.09
455	0.12
456	0.12
457	0.13
458	0.12
459	0.14
460	0.13
461	0.13
462	0.12
463	0.09
464	0.08
465	0.07
466	0.07
467	0.05
468	0.05
469	0.04
470	0.05
471	0.05
472	0.07
473	0.07
474	0.08
475	0.08
476	0.1
477	0.1
478	0.1
479	0.1
480	0.1
481	0.12
482	0.12
483	0.13
484	0.11
485	0.11
486	0.11
487	0.1
488	0.09
489	0.07
490	0.08
491	0.07
492	0.06
493	0.06
494	0.07
495	0.07
496	0.08
497	0.07
498	0.05
499	0.07
500	0.08
501	0.09
502	0.1
503	0.12
504	0.13
505	0.16
506	0.16
507	0.16
508	0.16
509	0.16
510	0.16
511	0.15
512	0.13
513	0.11
514	0.11
515	0.09
516	0.09
517	0.07
518	0.08
519	0.08
520	0.09
521	0.08
522	0.09
523	0.1
524	0.12
525	0.2
526	0.2
527	0.18
528	0.18
529	0.19
530	0.21
531	0.2
532	0.19
533	0.13
534	0.14
535	0.13
536	0.13
537	0.11
538	0.1
539	0.12
540	0.12
541	0.1
542	0.11
543	0.11
544	0.11
545	0.11
546	0.13
547	0.11
548	0.12
549	0.12
550	0.1
551	0.14
552	0.14
553	0.18
554	0.18
555	0.22
556	0.23
557	0.3
558	0.39
559	0.38
560	0.44
561	0.43
562	0.42
563	0.42
564	0.46
565	0.41
566	0.34
567	0.33
568	0.28
569	0.25
570	0.23
571	0.18
572	0.12
573	0.09
574	0.05
575	0.04
576	0.03
577	0.03
578	0.04
579	0.04
580	0.05
581	0.05
582	0.06
583	0.07
584	0.09
585	0.09
586	0.11
587	0.13
588	0.12
589	0.14
590	0.12
591	0.13
592	0.12
593	0.11
594	0.08
595	0.07
596	0.07
597	0.06
598	0.06
599	0.05
600	0.04
601	0.05
602	0.05
603	0.07
604	0.08
605	0.09
606	0.11
607	0.14
608	0.22
609	0.26
610	0.35
611	0.39
612	0.4
613	0.39
614	0.41
615	0.4
616	0.35
617	0.33
618	0.29
619	0.24
620	0.23
621	0.23
622	0.21
623	0.19
624	0.17
625	0.14
626	0.1
627	0.1
628	0.11
629	0.09
630	0.09
631	0.08
632	0.08
633	0.07
634	0.06
635	0.05
636	0.03
637	0.03
638	0.03
639	0.03
640	0.03
641	0.04
642	0.04
643	0.04
644	0.04
645	0.05
646	0.07
647	0.07
648	0.09
649	0.1
650	0.12
651	0.14
652	0.17
653	0.21
654	0.24
655	0.28
656	0.28
657	0.33
658	0.38
659	0.39
660	0.38
661	0.36
662	0.4
663	0.44
664	0.44
665	0.42
666	0.41
667	0.41
668	0.4
669	0.4
670	0.35
671	0.3
672	0.29
673	0.27
674	0.24
675	0.2
676	0.18
677	0.16
678	0.13
679	0.12
680	0.09
681	0.07
682	0.05
683	0.06
684	0.07
685	0.08
686	0.08
687	0.07
688	0.08
689	0.12
690	0.14
691	0.14
692	0.17
693	0.19
694	0.19
695	0.2
696	0.21
697	0.2
698	0.18
699	0.18
700	0.14
701	0.13
702	0.13
703	0.12
704	0.11
705	0.08
706	0.08
707	0.11
708	0.12
709	0.14
710	0.16
711	0.17
712	0.17
713	0.18
714	0.19
715	0.25
716	0.28
717	0.25
718	0.24
719	0.25
720	0.26
721	0.27
722	0.28
723	0.25
724	0.27
725	0.27
726	0.32
727	0.32
728	0.36
729	0.36
730	0.35
731	0.3
732	0.24
733	0.22
734	0.16
735	0.14
736	0.1
737	0.07
738	0.06
739	0.06
740	0.06
741	0.05
742	0.05
743	0.07
744	0.06
745	0.08
746	0.08
747	0.09
748	0.11
749	0.13
750	0.13
751	0.12
752	0.15
753	0.17
754	0.19
755	0.21
756	0.19
757	0.18
758	0.18
759	0.19
760	0.2
761	0.19
762	0.18
763	0.16
764	0.16
765	0.14
766	0.14
767	0.14
768	0.1
769	0.09
770	0.07
771	0.08
772	0.07
773	0.09
774	0.1
775	0.09
776	0.09
777	0.09
778	0.08
779	0.08
780	0.09
781	0.08
782	0.07
783	0.07
784	0.07
785	0.07
786	0.07
787	0.07
788	0.06
789	0.06
790	0.06
791	0.06
792	0.06
793	0.06
794	0.06
795	0.06
796	0.06
797	0.06
798	0.06
799	0.06
800	0.06
801	0.06
802	0.06
803	0.07
804	0.07
805	0.1
806	0.13
807	0.19
808	0.2
809	0.23
810	0.24
811	0.24
812	0.24
813	0.23
814	0.21
815	0.17
816	0.17
817	0.14
818	0.14
819	0.12
820	0.13
821	0.11
822	0.1
823	0.12
824	0.11
825	0.12
826	0.14
827	0.13
828	0.14
829	0.17
830	0.17
831	0.14
832	0.22
833	0.22
834	0.22
835	0.22
836	0.21
837	0.18
838	0.18
839	0.18
840	0.1
841	0.1
842	0.14
843	0.15
844	0.17
845	0.18
846	0.17
847	0.17
848	0.17
849	0.16
850	0.12
851	0.15
852	0.19
853	0.22
854	0.24
855	0.23
856	0.25
857	0.25
858	0.25
859	0.23
860	0.16
861	0.14
862	0.14
863	0.15
864	0.13
865	0.13
866	0.12
867	0.11
868	0.13
869	0.11
870	0.11
871	0.12
872	0.11
873	0.13
874	0.21
875	0.28
876	0.33
877	0.34
878	0.36
879	0.41
880	0.49
881	0.48
882	0.45
883	0.38
884	0.35
885	0.4
886	0.36
887	0.32
888	0.27
889	0.26
890	0.22
891	0.21
892	0.19
893	0.14
894	0.17
895	0.19
896	0.27
897	0.33
898	0.4
899	0.49
900	0.56
901	0.57
902	0.61
903	0.61
904	0.55
905	0.55
906	0.57
907	0.5
908	0.46
909	0.45
910	0.39
911	0.37
912	0.35
913	0.28
914	0.2
915	0.18
916	0.15
917	0.17
918	0.23
919	0.27
920	0.34
921	0.41
922	0.46
923	0.47
924	0.51
925	0.48
926	0.44
927	0.38
928	0.31
929	0.26
930	0.21
931	0.18
932	0.13
933	0.13
934	0.1
935	0.1
936	0.07
937	0.05
938	0.05
939	0.05
940	0.05
941	0.05
942	0.04
943	0.04
944	0.04
945	0.04
946	0.06
947	0.07
948	0.07
949	0.08
950	0.11
951	0.12
952	0.14
953	0.14
954	0.12
955	0.12
956	0.13
957	0.14
958	0.12
959	0.12
960	0.11
961	0.11
962	0.1
963	0.1
964	0.1
965	0.08
966	0.1
967	0.12
968	0.11
969	0.11
970	0.14
971	0.14
972	0.16
973	0.2
974	0.27
975	0.29
976	0.31
977	0.34
978	0.34
979	0.35
980	0.35
981	0.31
982	0.22
983	0.18
984	0.19
985	0.17
986	0.15
987	0.16
988	0.16
989	0.18
990	0.18
991	0.17
992	0.15
993	0.14
994	0.15
995	0.14
996	0.11
997	0.09
998	0.09
999	0.09
1000	0.09
1001	0.13
1002	0.16
1003	0.22
1004	0.25
1005	0.28
1006	0.31
1007	0.32
1008	0.37
1009	0.37
1010	0.41
1011	0.42
1012	0.48
1013	0.53
1014	0.52
1015	0.56
1016	0.56
1017	0.55
1018	0.53
1019	0.48
1020	0.42
1021	0.39
1022	0.37
1023	0.32
1024	0.29
1025	0.25
1026	0.22
1027	0.2
1028	0.17
1029	0.11
1030	0.11
1031	0.12
1032	0.09
1033	0.08
1034	0.06
1035	0.06
1036	0.08
1037	0.09
1038	0.09
1039	0.13
1040	0.19
1041	0.28
1042	0.35
1043	0.4
1044	0.46
1045	0.54
1046	0.59
1047	0.64
1048	0.66
1049	0.62
1050	0.64
1051	0.62
1052	0.6
1053	0.58
1054	0.57
1055	0.5
1056	0.43
1057	0.38
1058	0.3
1059	0.28
1060	0.21
1061	0.17
1062	0.15
1063	0.19
1064	0.24
1065	0.31
1066	0.4
1067	0.43
1068	0.5
1069	0.54
1070	0.6
1071	0.63
1072	0.67
1073	0.71
1074	0.72
1075	0.78
1076	0.81
1077	0.83
1078	0.8
1079	0.81
1080	0.74
1081	0.67
1082	0.59
1083	0.52
1084	0.47
1085	0.47
1086	0.47
1087	0.37
1088	0.41
1089	0.4
1090	0.37
1091	0.38
1092	0.36
1093	0.3
1094	0.32
1095	0.33
1096	0.29
1097	0.34
1098	0.35
1099	0.38
1100	0.44
1101	0.47
1102	0.43
1103	0.44
1104	0.48
1105	0.47
1106	0.5
1107	0.47
1108	0.39
1109	0.35
1110	0.33
1111	0.31
1112	0.24
1113	0.16
1114	0.13
1115	0.1
1116	0.1
1117	0.08
1118	0.07
1119	0.07
1120	0.1
1121	0.11
1122	0.14
1123	0.2
1124	0.24
1125	0.34
1126	0.44
1127	0.48
1128	0.5
1129	0.57
1130	0.6
1131	0.55
1132	0.55
1133	0.51
1134	0.46
1135	0.47
1136	0.46
1137	0.39
1138	0.31
1139	0.3
1140	0.27
1141	0.21
1142	0.16
1143	0.11
1144	0.08
1145	0.08
1146	0.08
1147	0.08
1148	0.07
1149	0.07
1150	0.07
1151	0.08
1152	0.1
1153	0.11
1154	0.11
1155	0.11
1156	0.12
1157	0.13
1158	0.14
1159	0.16
1160	0.15
1161	0.18
1162	0.18
1163	0.17
1164	0.19
1165	0.24
1166	0.28
1167	0.33
1168	0.4
1169	0.41
1170	0.41
1171	0.43
1172	0.42
1173	0.38
1174	0.35
1175	0.32
1176	0.25
1177	0.23
1178	0.22
1179	0.2
1180	0.18
1181	0.15
1182	0.14
1183	0.09
1184	0.09
1185	0.07
1186	0.11
1187	0.12
1188	0.13
1189	0.14
1190	0.16
1191	0.16
1192	0.19
1193	0.25
1194	0.24
1195	0.27
1196	0.29
1197	0.3
1198	0.29
1199	0.32
1200	0.32
1201	0.28
1202	0.27
1203	0.24
1204	0.22
1205	0.21
1206	0.2
1207	0.17
1208	0.14
1209	0.11
1210	0.12
1211	0.11
1212	0.11
1213	0.1
1214	0.09
1215	0.1
1216	0.13
1217	0.17
1218	0.22
1219	0.21
1220	0.23
1221	0.26
1222	0.28
1223	0.27
1224	0.27
1225	0.29
1226	0.29
1227	0.31
1228	0.33
1229	0.33
1230	0.32
1231	0.32
1232	0.3
1233	0.25
1234	0.18
1235	0.15
1236	0.14
1237	0.11
1238	0.11
1239	0.1
1240	0.1
1241	0.08
1242	0.09
1243	0.08
1244	0.07
1245	0.06

S7WA53

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer