Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4RG43

Protein Details
Accession F4RG43    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
385-428DFVNTDGNKKKKEKKFVPKPDWVIEKEKEKEKEKKENQISLKSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
393-419KKKKEKKFVPKPDWVIEKEKEKEKEKK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12.833, cyto 11.5, mito_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR002307  Tyr-tRNA-ligase  
IPR023617  Tyr-tRNA-ligase_arc/euk-type  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004831  F:tyrosine-tRNA ligase activity  
GO:0006437  P:tyrosyl-tRNA aminoacylation  
KEGG mlr:MELLADRAFT_34868  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
Amino Acid Sequences MASSSDLKSTHTTLTAIERYELITRNLGEVLGSQELMKLCEEEGRLITCYWGTATTGRPHIGYFVPLAKIADFLRAGVRVKILLADVHAFLDNLKAPLELINQRVSYYSYILRAVFTSIGVPIDRLEFITGSSYQYSTPYNQDCLKLASLVSERDARKAGSEVVKESDTPPLSGLLYPLLQALDEEYLKVDFQFGGIDQRKIFTFAELYLPKLGYCKRIHLMNKMVPGLTGTKMSSSDSKSKIDFLDSPEEVKKKIKDAVCVPGEIDGNGILAFLNSVLLPLADLKRNSDSNGKSPFASEDAPIDTLFSVQRKREKDVLHYSNYEQIIEDYQTEEPVGSGNFKLFPSDLKVSVTFAIQFLLKGIKEIYESDPKFQESNRLAYPEDFVNTDGNKKKKEKKFVPKPDWVIEKEKEKEKEKKENQISLKSVKDGLDQLKESA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.28
4 0.26
5 0.24
6 0.24
7 0.28
8 0.29
9 0.23
10 0.24
11 0.24
12 0.24
13 0.24
14 0.22
15 0.18
16 0.16
17 0.17
18 0.14
19 0.13
20 0.11
21 0.14
22 0.15
23 0.16
24 0.15
25 0.12
26 0.11
27 0.15
28 0.16
29 0.16
30 0.18
31 0.19
32 0.2
33 0.19
34 0.2
35 0.16
36 0.15
37 0.13
38 0.12
39 0.11
40 0.13
41 0.17
42 0.22
43 0.26
44 0.27
45 0.26
46 0.26
47 0.27
48 0.25
49 0.22
50 0.19
51 0.19
52 0.19
53 0.19
54 0.2
55 0.17
56 0.18
57 0.17
58 0.18
59 0.15
60 0.14
61 0.16
62 0.18
63 0.19
64 0.18
65 0.19
66 0.15
67 0.15
68 0.15
69 0.13
70 0.11
71 0.11
72 0.12
73 0.11
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.1
78 0.12
79 0.12
80 0.11
81 0.11
82 0.09
83 0.09
84 0.11
85 0.16
86 0.17
87 0.18
88 0.22
89 0.22
90 0.22
91 0.23
92 0.23
93 0.19
94 0.19
95 0.18
96 0.16
97 0.18
98 0.18
99 0.17
100 0.16
101 0.16
102 0.13
103 0.11
104 0.1
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.07
115 0.08
116 0.1
117 0.1
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.12
123 0.14
124 0.14
125 0.19
126 0.19
127 0.22
128 0.24
129 0.25
130 0.25
131 0.26
132 0.24
133 0.19
134 0.16
135 0.16
136 0.16
137 0.15
138 0.16
139 0.2
140 0.19
141 0.21
142 0.22
143 0.19
144 0.18
145 0.19
146 0.21
147 0.2
148 0.21
149 0.21
150 0.22
151 0.22
152 0.21
153 0.21
154 0.23
155 0.18
156 0.17
157 0.16
158 0.14
159 0.14
160 0.14
161 0.13
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.06
167 0.06
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.13
183 0.15
184 0.16
185 0.16
186 0.17
187 0.17
188 0.19
189 0.19
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.16
194 0.16
195 0.17
196 0.15
197 0.15
198 0.14
199 0.16
200 0.16
201 0.17
202 0.18
203 0.2
204 0.21
205 0.27
206 0.3
207 0.33
208 0.39
209 0.35
210 0.37
211 0.34
212 0.32
213 0.26
214 0.24
215 0.2
216 0.14
217 0.12
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.11
222 0.13
223 0.15
224 0.21
225 0.22
226 0.24
227 0.24
228 0.26
229 0.25
230 0.24
231 0.23
232 0.2
233 0.24
234 0.22
235 0.24
236 0.25
237 0.26
238 0.24
239 0.27
240 0.25
241 0.21
242 0.27
243 0.27
244 0.29
245 0.32
246 0.39
247 0.36
248 0.34
249 0.31
250 0.28
251 0.26
252 0.2
253 0.17
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.04
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.06
269 0.08
270 0.11
271 0.11
272 0.14
273 0.17
274 0.18
275 0.2
276 0.26
277 0.26
278 0.3
279 0.36
280 0.35
281 0.31
282 0.31
283 0.31
284 0.26
285 0.24
286 0.18
287 0.14
288 0.14
289 0.15
290 0.14
291 0.13
292 0.1
293 0.1
294 0.11
295 0.13
296 0.16
297 0.19
298 0.27
299 0.29
300 0.35
301 0.41
302 0.42
303 0.47
304 0.54
305 0.55
306 0.53
307 0.52
308 0.48
309 0.48
310 0.45
311 0.37
312 0.26
313 0.21
314 0.19
315 0.17
316 0.16
317 0.12
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.1
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.11
329 0.11
330 0.13
331 0.12
332 0.13
333 0.18
334 0.21
335 0.21
336 0.22
337 0.23
338 0.23
339 0.23
340 0.22
341 0.17
342 0.13
343 0.13
344 0.1
345 0.1
346 0.09
347 0.12
348 0.11
349 0.12
350 0.12
351 0.12
352 0.13
353 0.16
354 0.2
355 0.27
356 0.28
357 0.31
358 0.34
359 0.35
360 0.35
361 0.33
362 0.37
363 0.3
364 0.35
365 0.34
366 0.34
367 0.34
368 0.33
369 0.35
370 0.28
371 0.26
372 0.21
373 0.19
374 0.2
375 0.2
376 0.27
377 0.32
378 0.36
379 0.43
380 0.51
381 0.61
382 0.66
383 0.76
384 0.78
385 0.82
386 0.87
387 0.91
388 0.91
389 0.91
390 0.88
391 0.85
392 0.82
393 0.75
394 0.72
395 0.66
396 0.66
397 0.63
398 0.65
399 0.64
400 0.66
401 0.71
402 0.72
403 0.78
404 0.77
405 0.81
406 0.82
407 0.84
408 0.83
409 0.82
410 0.78
411 0.74
412 0.69
413 0.6
414 0.55
415 0.47
416 0.43
417 0.4
418 0.4
419 0.41