Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S7XKV0

Protein Details
Accession S7XKV0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-98LTIQTGNDKRKKKQHSGSVKTESHHydrophilic
109-130LCTSCIKPTKFNTKKSHPIKYIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045055  DNA2/NAM7-like  
IPR041679  DNA2/NAM7-like_C  
IPR041677  DNA2/NAM7_AAA_11  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR047187  SF1_C_Upf1  
IPR018999  UPF1_CH/ZBD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF13086  AAA_11  
PF13087  AAA_12  
PF09416  UPF1_Zn_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
CDD cd18808  SF1_C_Upf1  
Amino Acid Sequences MYCMKCPSQTNIKCLDCITEGDNTGKYYCNSISCTNTLSASHILSHLIACSHKQIMVNDVKVECVQCKNNNVFALTIQTGNDKRKKKQHSGSVKTESHASINYNENFYLCTSCIKPTKFNTKKSHPIKYIVSNKQLLLFDTLVTRLRYNYGSYCRIYSELIDREMEAEKKKKEDQKICAPSIRFNIKTDNADHKKGKEHNRGNTSISNIIFLKVNLDRYKVNIGDEVEIYKYSGKKKKSICKGIIAGLNLAEEELKIKVQHLDVLYEYYTKNPIDTLVEFNFKSVCYDRMKRSIKRINKNVDSDIQQIIYNGIKQNDIDYKDSYELIYENNTEDSTKQTIIEKADDSSISYKYESDSDSIGSLSENSKDDSENNAAESLSTLTLDNYIKNKIYLKKMNYKLNKSQIEAISLVLRNKISIIQGPPGSGKTLTCANIVYNLYKLILEERFEESLQYSKGQNKSLKKKILIVSPSNVAVDNIVKELIKLNVKVLRVYSKNRENIENENDNISLHKLVEQKLDKEKKNNNHNNEMDRYLFYQKEIIKEYDVICSTCVTAGTKFFKDFNFPYVLIDEAVQAVEPLCIIPISYGVKKLILVGDHKQLGPTILSHEAKNRGYNMSLFERLIKIGVQPHILYTQYRMDPMISEFISNRFYNGCLISDNNYSNTIKEKMIEKSKNNNIKNKSKICISPILTNLISLMPTFFYHTPGIENKLSTTYYNINEIDIILSLVKYLLSLNIQQSDIGIITMYDGQRSAITKIFNNNNLNTIDIFNIDGFQGREKNIIIISLVRAQNEHNEEDNINTDNSKNLGFIGNNRRMNVAMSRGKDMLVLVGDCDRLNKSSSNWKKTLEYYHKHNLIVQGNINNLKKYRSKDLDSEIKFDLKNILKEIQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.47
3 0.38
4 0.34
5 0.3
6 0.25
7 0.25
8 0.26
9 0.27
10 0.24
11 0.24
12 0.24
13 0.23
14 0.23
15 0.24
16 0.25
17 0.27
18 0.3
19 0.34
20 0.33
21 0.36
22 0.32
23 0.31
24 0.28
25 0.27
26 0.25
27 0.21
28 0.2
29 0.18
30 0.18
31 0.17
32 0.16
33 0.13
34 0.13
35 0.13
36 0.14
37 0.17
38 0.18
39 0.2
40 0.23
41 0.23
42 0.3
43 0.36
44 0.37
45 0.38
46 0.36
47 0.35
48 0.33
49 0.34
50 0.29
51 0.28
52 0.32
53 0.33
54 0.41
55 0.44
56 0.48
57 0.49
58 0.47
59 0.41
60 0.35
61 0.35
62 0.28
63 0.24
64 0.19
65 0.23
66 0.27
67 0.35
68 0.43
69 0.44
70 0.51
71 0.6
72 0.7
73 0.74
74 0.79
75 0.8
76 0.84
77 0.85
78 0.87
79 0.86
80 0.79
81 0.69
82 0.63
83 0.54
84 0.45
85 0.38
86 0.31
87 0.25
88 0.31
89 0.32
90 0.3
91 0.29
92 0.26
93 0.25
94 0.24
95 0.22
96 0.15
97 0.17
98 0.16
99 0.23
100 0.3
101 0.32
102 0.38
103 0.43
104 0.54
105 0.58
106 0.67
107 0.7
108 0.72
109 0.8
110 0.82
111 0.84
112 0.78
113 0.76
114 0.72
115 0.73
116 0.74
117 0.71
118 0.69
119 0.62
120 0.57
121 0.56
122 0.51
123 0.42
124 0.36
125 0.28
126 0.22
127 0.2
128 0.21
129 0.19
130 0.2
131 0.19
132 0.16
133 0.18
134 0.19
135 0.21
136 0.26
137 0.29
138 0.33
139 0.34
140 0.34
141 0.33
142 0.33
143 0.31
144 0.26
145 0.27
146 0.26
147 0.26
148 0.25
149 0.23
150 0.24
151 0.26
152 0.28
153 0.26
154 0.3
155 0.31
156 0.35
157 0.43
158 0.49
159 0.56
160 0.62
161 0.64
162 0.68
163 0.74
164 0.73
165 0.71
166 0.65
167 0.59
168 0.59
169 0.58
170 0.49
171 0.42
172 0.45
173 0.43
174 0.45
175 0.44
176 0.47
177 0.45
178 0.5
179 0.52
180 0.48
181 0.52
182 0.57
183 0.63
184 0.63
185 0.66
186 0.68
187 0.72
188 0.72
189 0.68
190 0.63
191 0.56
192 0.5
193 0.41
194 0.34
195 0.27
196 0.25
197 0.21
198 0.18
199 0.19
200 0.16
201 0.22
202 0.21
203 0.23
204 0.23
205 0.25
206 0.31
207 0.28
208 0.27
209 0.24
210 0.23
211 0.23
212 0.23
213 0.21
214 0.16
215 0.15
216 0.14
217 0.14
218 0.16
219 0.23
220 0.29
221 0.32
222 0.38
223 0.47
224 0.57
225 0.64
226 0.71
227 0.67
228 0.69
229 0.68
230 0.66
231 0.6
232 0.51
233 0.41
234 0.31
235 0.26
236 0.18
237 0.14
238 0.09
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.1
246 0.11
247 0.15
248 0.14
249 0.15
250 0.15
251 0.17
252 0.16
253 0.15
254 0.15
255 0.12
256 0.15
257 0.13
258 0.13
259 0.11
260 0.11
261 0.13
262 0.14
263 0.18
264 0.18
265 0.21
266 0.21
267 0.21
268 0.2
269 0.17
270 0.19
271 0.15
272 0.18
273 0.21
274 0.27
275 0.32
276 0.41
277 0.49
278 0.51
279 0.59
280 0.65
281 0.68
282 0.72
283 0.77
284 0.76
285 0.75
286 0.75
287 0.68
288 0.62
289 0.56
290 0.48
291 0.4
292 0.31
293 0.24
294 0.2
295 0.18
296 0.15
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.12
301 0.12
302 0.15
303 0.19
304 0.21
305 0.21
306 0.2
307 0.21
308 0.22
309 0.22
310 0.19
311 0.14
312 0.12
313 0.1
314 0.11
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.12
322 0.13
323 0.12
324 0.13
325 0.14
326 0.17
327 0.18
328 0.2
329 0.18
330 0.16
331 0.17
332 0.16
333 0.15
334 0.14
335 0.13
336 0.12
337 0.12
338 0.11
339 0.11
340 0.13
341 0.12
342 0.11
343 0.11
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.09
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.08
352 0.09
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.11
357 0.14
358 0.16
359 0.14
360 0.14
361 0.14
362 0.13
363 0.12
364 0.12
365 0.09
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.05
370 0.08
371 0.09
372 0.1
373 0.11
374 0.13
375 0.13
376 0.14
377 0.19
378 0.22
379 0.29
380 0.34
381 0.38
382 0.46
383 0.52
384 0.6
385 0.63
386 0.64
387 0.64
388 0.66
389 0.64
390 0.55
391 0.54
392 0.46
393 0.41
394 0.34
395 0.27
396 0.21
397 0.19
398 0.18
399 0.14
400 0.13
401 0.11
402 0.11
403 0.11
404 0.09
405 0.11
406 0.12
407 0.14
408 0.14
409 0.15
410 0.15
411 0.15
412 0.15
413 0.12
414 0.1
415 0.09
416 0.11
417 0.12
418 0.12
419 0.11
420 0.11
421 0.14
422 0.15
423 0.14
424 0.11
425 0.1
426 0.1
427 0.1
428 0.1
429 0.08
430 0.08
431 0.09
432 0.1
433 0.12
434 0.13
435 0.13
436 0.13
437 0.11
438 0.13
439 0.12
440 0.12
441 0.12
442 0.16
443 0.19
444 0.24
445 0.3
446 0.36
447 0.45
448 0.52
449 0.56
450 0.52
451 0.55
452 0.54
453 0.54
454 0.51
455 0.44
456 0.37
457 0.33
458 0.32
459 0.26
460 0.22
461 0.15
462 0.11
463 0.09
464 0.08
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.07
470 0.1
471 0.11
472 0.11
473 0.13
474 0.16
475 0.17
476 0.18
477 0.18
478 0.21
479 0.22
480 0.27
481 0.32
482 0.36
483 0.41
484 0.42
485 0.44
486 0.41
487 0.44
488 0.46
489 0.41
490 0.34
491 0.3
492 0.28
493 0.25
494 0.22
495 0.18
496 0.11
497 0.08
498 0.12
499 0.13
500 0.15
501 0.22
502 0.23
503 0.26
504 0.36
505 0.43
506 0.42
507 0.48
508 0.54
509 0.56
510 0.65
511 0.7
512 0.66
513 0.68
514 0.69
515 0.65
516 0.61
517 0.54
518 0.44
519 0.36
520 0.33
521 0.27
522 0.23
523 0.18
524 0.21
525 0.2
526 0.22
527 0.24
528 0.23
529 0.21
530 0.23
531 0.23
532 0.22
533 0.21
534 0.18
535 0.15
536 0.14
537 0.13
538 0.11
539 0.11
540 0.08
541 0.08
542 0.13
543 0.17
544 0.18
545 0.19
546 0.2
547 0.2
548 0.24
549 0.24
550 0.23
551 0.23
552 0.22
553 0.22
554 0.21
555 0.21
556 0.15
557 0.14
558 0.11
559 0.07
560 0.07
561 0.06
562 0.05
563 0.05
564 0.04
565 0.04
566 0.03
567 0.03
568 0.03
569 0.03
570 0.03
571 0.06
572 0.09
573 0.1
574 0.12
575 0.13
576 0.13
577 0.13
578 0.14
579 0.14
580 0.12
581 0.15
582 0.16
583 0.21
584 0.22
585 0.22
586 0.21
587 0.2
588 0.19
589 0.16
590 0.13
591 0.11
592 0.16
593 0.17
594 0.18
595 0.23
596 0.28
597 0.29
598 0.31
599 0.29
600 0.25
601 0.25
602 0.25
603 0.25
604 0.24
605 0.24
606 0.22
607 0.22
608 0.21
609 0.2
610 0.19
611 0.15
612 0.12
613 0.15
614 0.16
615 0.17
616 0.16
617 0.17
618 0.18
619 0.19
620 0.17
621 0.16
622 0.2
623 0.18
624 0.19
625 0.18
626 0.17
627 0.17
628 0.18
629 0.2
630 0.14
631 0.14
632 0.14
633 0.16
634 0.19
635 0.18
636 0.17
637 0.14
638 0.14
639 0.16
640 0.16
641 0.15
642 0.12
643 0.14
644 0.16
645 0.19
646 0.2
647 0.19
648 0.22
649 0.21
650 0.2
651 0.23
652 0.22
653 0.19
654 0.2
655 0.23
656 0.27
657 0.37
658 0.44
659 0.45
660 0.53
661 0.62
662 0.69
663 0.71
664 0.73
665 0.71
666 0.73
667 0.77
668 0.73
669 0.67
670 0.62
671 0.6
672 0.56
673 0.56
674 0.5
675 0.46
676 0.42
677 0.44
678 0.38
679 0.34
680 0.3
681 0.22
682 0.19
683 0.12
684 0.11
685 0.07
686 0.08
687 0.12
688 0.11
689 0.14
690 0.15
691 0.15
692 0.19
693 0.2
694 0.25
695 0.23
696 0.23
697 0.21
698 0.23
699 0.24
700 0.2
701 0.22
702 0.21
703 0.21
704 0.26
705 0.24
706 0.22
707 0.21
708 0.21
709 0.17
710 0.12
711 0.11
712 0.07
713 0.06
714 0.06
715 0.06
716 0.05
717 0.05
718 0.05
719 0.06
720 0.08
721 0.11
722 0.14
723 0.17
724 0.17
725 0.17
726 0.17
727 0.16
728 0.14
729 0.11
730 0.08
731 0.05
732 0.06
733 0.1
734 0.1
735 0.1
736 0.1
737 0.1
738 0.12
739 0.14
740 0.16
741 0.15
742 0.18
743 0.2
744 0.28
745 0.35
746 0.41
747 0.44
748 0.43
749 0.43
750 0.42
751 0.4
752 0.33
753 0.27
754 0.2
755 0.16
756 0.16
757 0.11
758 0.11
759 0.1
760 0.11
761 0.11
762 0.14
763 0.16
764 0.16
765 0.19
766 0.19
767 0.21
768 0.19
769 0.19
770 0.15
771 0.15
772 0.16
773 0.21
774 0.22
775 0.2
776 0.21
777 0.21
778 0.28
779 0.3
780 0.31
781 0.26
782 0.27
783 0.27
784 0.28
785 0.3
786 0.24
787 0.21
788 0.18
789 0.16
790 0.16
791 0.17
792 0.16
793 0.13
794 0.13
795 0.16
796 0.16
797 0.25
798 0.33
799 0.41
800 0.44
801 0.44
802 0.44
803 0.41
804 0.43
805 0.38
806 0.37
807 0.35
808 0.34
809 0.38
810 0.37
811 0.36
812 0.34
813 0.3
814 0.23
815 0.18
816 0.16
817 0.13
818 0.14
819 0.15
820 0.14
821 0.16
822 0.15
823 0.15
824 0.17
825 0.19
826 0.21
827 0.31
828 0.42
829 0.48
830 0.5
831 0.53
832 0.55
833 0.59
834 0.66
835 0.65
836 0.61
837 0.61
838 0.68
839 0.68
840 0.64
841 0.62
842 0.59
843 0.53
844 0.51
845 0.48
846 0.41
847 0.42
848 0.49
849 0.48
850 0.44
851 0.41
852 0.42
853 0.43
854 0.45
855 0.5
856 0.51
857 0.55
858 0.58
859 0.65
860 0.7
861 0.66
862 0.65
863 0.57
864 0.54
865 0.48
866 0.42
867 0.42
868 0.37
869 0.38