Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4RMD5

Protein Details
Accession F4RMD5    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
164-190EQPVGKKGREKKVKKERDPNAPKRPASBasic
292-311DGNPIKKKRGRPSKSDKVEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
168-187GKKGREKKVKKERDPNAPKR
295-305PIKKKRGRPSK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, cyto 7.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG mlr:MELLADRAFT_71918  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd22012  HMG-box_ABF2_IXR1-like_rpt2  
Amino Acid Sequences MVKDTHAHKALLDAKDQLLAAYASVHSSLGHLIGLVQHSDPRVIAETLGTGSGLPIPAHAARYGHTPQSAQQQVSQHLPSHHPHGRQVAQNGTTGPSFTAVTPYAPHNRTQYNPNPHLQNSGGFTAPESEDEADDDDDENEDPSEEEHAGAIHAPQHTYAPAAEQPVGKKGREKKVKKERDPNAPKRPASAYILFQNAVRQEMRAANPTADYKELARQIGDRWKSLDEEAKKPWSEAGKQAMSSWNIQNREYKSLHPEAATQTTSPHALSNGSSVAAAPPKRRRTVPTLDADGNPIKKKRGRPSKSDKVEEVAPIQPQQPQPVSVAQPKFEHRPEHAPQQVRMGITNGIGHQAVVPQQHFRPTGQAVVAGDDDEEDDAAEGDTDSDGGERIKPPSAHSQPPAIQTAEEEDEDEDAEEEEEEEEEEEEEDSESDGPAGKKMRPNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.32
4 0.23
5 0.17
6 0.15
7 0.12
8 0.11
9 0.11
10 0.09
11 0.1
12 0.1
13 0.08
14 0.09
15 0.1
16 0.08
17 0.08
18 0.07
19 0.07
20 0.09
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.13
25 0.14
26 0.15
27 0.14
28 0.14
29 0.16
30 0.15
31 0.15
32 0.13
33 0.14
34 0.13
35 0.13
36 0.11
37 0.07
38 0.07
39 0.09
40 0.09
41 0.08
42 0.08
43 0.11
44 0.12
45 0.14
46 0.15
47 0.14
48 0.14
49 0.21
50 0.24
51 0.24
52 0.24
53 0.24
54 0.26
55 0.35
56 0.39
57 0.34
58 0.35
59 0.36
60 0.38
61 0.42
62 0.41
63 0.34
64 0.33
65 0.36
66 0.34
67 0.38
68 0.41
69 0.38
70 0.4
71 0.45
72 0.47
73 0.48
74 0.5
75 0.48
76 0.43
77 0.42
78 0.39
79 0.33
80 0.27
81 0.22
82 0.18
83 0.13
84 0.12
85 0.1
86 0.13
87 0.12
88 0.12
89 0.14
90 0.18
91 0.25
92 0.26
93 0.29
94 0.3
95 0.33
96 0.35
97 0.42
98 0.47
99 0.49
100 0.53
101 0.54
102 0.54
103 0.51
104 0.52
105 0.45
106 0.38
107 0.31
108 0.28
109 0.23
110 0.18
111 0.18
112 0.16
113 0.15
114 0.13
115 0.12
116 0.11
117 0.1
118 0.11
119 0.12
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.11
150 0.13
151 0.14
152 0.15
153 0.21
154 0.24
155 0.22
156 0.27
157 0.34
158 0.42
159 0.51
160 0.56
161 0.6
162 0.69
163 0.8
164 0.83
165 0.84
166 0.82
167 0.82
168 0.87
169 0.87
170 0.86
171 0.83
172 0.74
173 0.67
174 0.62
175 0.53
176 0.47
177 0.4
178 0.31
179 0.26
180 0.28
181 0.24
182 0.22
183 0.21
184 0.16
185 0.16
186 0.14
187 0.11
188 0.11
189 0.14
190 0.16
191 0.17
192 0.17
193 0.16
194 0.17
195 0.18
196 0.17
197 0.14
198 0.13
199 0.1
200 0.14
201 0.15
202 0.14
203 0.14
204 0.13
205 0.16
206 0.23
207 0.24
208 0.2
209 0.2
210 0.2
211 0.21
212 0.21
213 0.25
214 0.21
215 0.24
216 0.27
217 0.29
218 0.29
219 0.28
220 0.29
221 0.26
222 0.24
223 0.25
224 0.28
225 0.25
226 0.25
227 0.26
228 0.27
229 0.25
230 0.25
231 0.24
232 0.23
233 0.23
234 0.24
235 0.29
236 0.28
237 0.33
238 0.31
239 0.3
240 0.31
241 0.32
242 0.33
243 0.27
244 0.27
245 0.24
246 0.26
247 0.24
248 0.18
249 0.16
250 0.15
251 0.16
252 0.14
253 0.11
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.08
263 0.12
264 0.14
265 0.19
266 0.27
267 0.33
268 0.36
269 0.39
270 0.43
271 0.46
272 0.53
273 0.54
274 0.52
275 0.51
276 0.5
277 0.48
278 0.46
279 0.42
280 0.37
281 0.34
282 0.29
283 0.3
284 0.33
285 0.42
286 0.49
287 0.56
288 0.59
289 0.65
290 0.73
291 0.78
292 0.82
293 0.79
294 0.69
295 0.61
296 0.58
297 0.49
298 0.42
299 0.34
300 0.26
301 0.23
302 0.22
303 0.24
304 0.22
305 0.25
306 0.23
307 0.22
308 0.23
309 0.25
310 0.28
311 0.31
312 0.32
313 0.3
314 0.32
315 0.35
316 0.39
317 0.39
318 0.39
319 0.36
320 0.42
321 0.44
322 0.51
323 0.54
324 0.52
325 0.49
326 0.52
327 0.5
328 0.42
329 0.39
330 0.31
331 0.25
332 0.21
333 0.22
334 0.15
335 0.14
336 0.13
337 0.12
338 0.1
339 0.11
340 0.13
341 0.14
342 0.15
343 0.17
344 0.19
345 0.25
346 0.26
347 0.25
348 0.28
349 0.27
350 0.29
351 0.25
352 0.26
353 0.21
354 0.21
355 0.21
356 0.15
357 0.13
358 0.1
359 0.1
360 0.07
361 0.07
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.06
375 0.1
376 0.11
377 0.14
378 0.2
379 0.21
380 0.25
381 0.35
382 0.41
383 0.45
384 0.46
385 0.52
386 0.5
387 0.54
388 0.53
389 0.43
390 0.36
391 0.3
392 0.32
393 0.27
394 0.23
395 0.2
396 0.16
397 0.16
398 0.16
399 0.16
400 0.11
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.07
407 0.07
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.09
417 0.09
418 0.08
419 0.08
420 0.12
421 0.12
422 0.17
423 0.2
424 0.25