FuNGI

Q59U11

Protein Details

Accession

Q59U11

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
634-653	DYLKSIKKRKAATTSRKLVD	Hydrophilic
665-686	SKVGGIWKVRKNIKRRGHHQKG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
670-686	IWKVRKNIKRRGHHQKG

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045116 Clp1/Grc3 IPR032319 CLP1_P IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005634 C:nucleus GO:0005524 F:ATP binding GO:0051731 F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity GO:0000448 P:cleavage in ITS2 between 5.8S rRNA and LSU-rRNA of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0016310 P:phosphorylation GO:0006396 P:RNA processing GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	cal:CAALFM_CR06450WA -
Pfam	View protein in Pfam PF16575 CLP1_P

Amino Acid Sequences

MSAFAALKNNPFGESIFNNTSNGDNHSRDDVEEDEVVQYIANSSDEDDDDDNDDNDNDQGNEDNNLFPLEISAPVDTSISSTPAPILNSRITQSNYTPNESNLKFSDNHVTITLNPSEYIIISGQCNLKIIKGSIKINQCHCLTSEDNKSYNIIALQSQSLPIISHYTTPEMEEDGVTSVSIIQLENSFSGIENISQIEPAFKNLISGQPNVEEPSLFKNYSFDIVLTETNGGYGLDINSYWINELNLLKSNKDDPTPKIIMIIGNKNTGKSTFCKSLINELLLTNPNRPVSYLEIDPGQSEYSTPCALSLSEIVQAQFGLAALPHKNNNIVKSRVEHYFGFTSAVNAPTRYVEIIEELFNHHQTKFSQRNHLIINTPGWVKGYGKELLNQITKIINPDKLILLSNNLNQEYPDNANILQDLTYQSLSIIPGVYQLSKYSAPQIRTINKLLYFHQTTTTGTFNFNDHLLDSSPLKISYACGNSPNNPGIYSTTIINHNIDNEFSHRDLCSLVEVSIYGIYSIKSNGNTKFDEMSCFRRDDGNSPFYLNPDDFDNLLSNETITSKFIGLIMVHSINPNDHYMNIYAPDIIINRLRKVLSTNSNQTNDYKLIMIRGEGDIPNCEMLYPEFINKKIDYLKSIKKRKAATTSRKLVDLKLPYISFETKSKVGGIWKVRKNIKRRGHHQKG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.29
3	0.3
4	0.3
5	0.3
6	0.3
7	0.32
8	0.28
9	0.31
10	0.3
11	0.27
12	0.28
13	0.32
14	0.32
15	0.3
16	0.31
17	0.27
18	0.24
19	0.23
20	0.21
21	0.17
22	0.16
23	0.15
24	0.12
25	0.1
26	0.07
27	0.08
28	0.08
29	0.07
30	0.09
31	0.11
32	0.11
33	0.14
34	0.15
35	0.15
36	0.17
37	0.18
38	0.17
39	0.16
40	0.16
41	0.13
42	0.13
43	0.13
44	0.11
45	0.1
46	0.12
47	0.12
48	0.14
49	0.14
50	0.14
51	0.13
52	0.14
53	0.13
54	0.11
55	0.12
56	0.1
57	0.11
58	0.12
59	0.11
60	0.11
61	0.11
62	0.12
63	0.1
64	0.11
65	0.11
66	0.11
67	0.11
68	0.11
69	0.12
70	0.14
71	0.17
72	0.16
73	0.19
74	0.2
75	0.23
76	0.24
77	0.28
78	0.28
79	0.3
80	0.31
81	0.37
82	0.37
83	0.4
84	0.4
85	0.37
86	0.43
87	0.41
88	0.41
89	0.33
90	0.33
91	0.29
92	0.3
93	0.37
94	0.29
95	0.3
96	0.27
97	0.27
98	0.24
99	0.28
100	0.27
101	0.18
102	0.17
103	0.16
104	0.16
105	0.14
106	0.15
107	0.11
108	0.1
109	0.1
110	0.14
111	0.15
112	0.15
113	0.17
114	0.15
115	0.16
116	0.18
117	0.19
118	0.22
119	0.26
120	0.29
121	0.34
122	0.41
123	0.45
124	0.47
125	0.52
126	0.46
127	0.41
128	0.39
129	0.38
130	0.33
131	0.35
132	0.39
133	0.38
134	0.38
135	0.37
136	0.37
137	0.32
138	0.3
139	0.24
140	0.16
141	0.13
142	0.13
143	0.14
144	0.13
145	0.13
146	0.12
147	0.11
148	0.1
149	0.09
150	0.11
151	0.1
152	0.13
153	0.14
154	0.16
155	0.16
156	0.17
157	0.17
158	0.15
159	0.15
160	0.12
161	0.11
162	0.1
163	0.1
164	0.08
165	0.07
166	0.06
167	0.06
168	0.06
169	0.06
170	0.05
171	0.06
172	0.07
173	0.07
174	0.08
175	0.07
176	0.07
177	0.08
178	0.08
179	0.07
180	0.07
181	0.09
182	0.08
183	0.08
184	0.08
185	0.11
186	0.11
187	0.12
188	0.13
189	0.12
190	0.13
191	0.13
192	0.19
193	0.18
194	0.19
195	0.18
196	0.18
197	0.19
198	0.19
199	0.19
200	0.13
201	0.12
202	0.16
203	0.19
204	0.18
205	0.17
206	0.17
207	0.17
208	0.19
209	0.18
210	0.13
211	0.1
212	0.12
213	0.12
214	0.11
215	0.11
216	0.09
217	0.08
218	0.08
219	0.07
220	0.05
221	0.06
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.06
226	0.06
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.09
232	0.1
233	0.1
234	0.16
235	0.17
236	0.17
237	0.18
238	0.21
239	0.2
240	0.23
241	0.25
242	0.22
243	0.29
244	0.31
245	0.29
246	0.27
247	0.26
248	0.25
249	0.25
250	0.29
251	0.22
252	0.26
253	0.26
254	0.26
255	0.26
256	0.24
257	0.22
258	0.19
259	0.22
260	0.22
261	0.23
262	0.26
263	0.26
264	0.34
265	0.34
266	0.32
267	0.28
268	0.22
269	0.24
270	0.24
271	0.24
272	0.17
273	0.17
274	0.17
275	0.16
276	0.17
277	0.16
278	0.17
279	0.18
280	0.17
281	0.16
282	0.16
283	0.16
284	0.15
285	0.14
286	0.1
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.08
291	0.08
292	0.08
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.08
297	0.08
298	0.07
299	0.08
300	0.09
301	0.09
302	0.08
303	0.08
304	0.07
305	0.06
306	0.05
307	0.03
308	0.03
309	0.05
310	0.06
311	0.07
312	0.08
313	0.09
314	0.13
315	0.15
316	0.19
317	0.23
318	0.24
319	0.24
320	0.26
321	0.29
322	0.26
323	0.28
324	0.24
325	0.22
326	0.21
327	0.19
328	0.18
329	0.15
330	0.15
331	0.12
332	0.14
333	0.11
334	0.1
335	0.11
336	0.09
337	0.1
338	0.09
339	0.08
340	0.06
341	0.07
342	0.08
343	0.07
344	0.07
345	0.09
346	0.1
347	0.11
348	0.12
349	0.11
350	0.12
351	0.13
352	0.22
353	0.28
354	0.31
355	0.39
356	0.39
357	0.43
358	0.43
359	0.44
360	0.37
361	0.29
362	0.27
363	0.19
364	0.18
365	0.15
366	0.13
367	0.12
368	0.11
369	0.12
370	0.14
371	0.15
372	0.15
373	0.17
374	0.18
375	0.22
376	0.23
377	0.21
378	0.19
379	0.17
380	0.17
381	0.18
382	0.19
383	0.16
384	0.15
385	0.16
386	0.16
387	0.16
388	0.16
389	0.13
390	0.13
391	0.13
392	0.15
393	0.17
394	0.17
395	0.16
396	0.15
397	0.16
398	0.16
399	0.16
400	0.14
401	0.12
402	0.11
403	0.11
404	0.11
405	0.11
406	0.08
407	0.07
408	0.08
409	0.08
410	0.08
411	0.08
412	0.08
413	0.08
414	0.08
415	0.08
416	0.07
417	0.05
418	0.07
419	0.08
420	0.08
421	0.08
422	0.08
423	0.11
424	0.11
425	0.12
426	0.18
427	0.21
428	0.23
429	0.27
430	0.34
431	0.35
432	0.38
433	0.4
434	0.36
435	0.34
436	0.35
437	0.31
438	0.32
439	0.31
440	0.27
441	0.27
442	0.24
443	0.23
444	0.24
445	0.24
446	0.17
447	0.16
448	0.16
449	0.15
450	0.15
451	0.14
452	0.12
453	0.1
454	0.11
455	0.11
456	0.11
457	0.11
458	0.12
459	0.13
460	0.12
461	0.12
462	0.11
463	0.11
464	0.16
465	0.18
466	0.18
467	0.21
468	0.24
469	0.26
470	0.3
471	0.31
472	0.25
473	0.23
474	0.22
475	0.2
476	0.21
477	0.19
478	0.15
479	0.16
480	0.17
481	0.19
482	0.19
483	0.16
484	0.16
485	0.15
486	0.15
487	0.14
488	0.15
489	0.17
490	0.16
491	0.17
492	0.15
493	0.15
494	0.15
495	0.14
496	0.14
497	0.11
498	0.11
499	0.09
500	0.09
501	0.1
502	0.1
503	0.09
504	0.07
505	0.06
506	0.06
507	0.07
508	0.09
509	0.11
510	0.13
511	0.18
512	0.22
513	0.26
514	0.27
515	0.29
516	0.31
517	0.29
518	0.32
519	0.31
520	0.33
521	0.32
522	0.32
523	0.3
524	0.32
525	0.33
526	0.33
527	0.37
528	0.35
529	0.33
530	0.35
531	0.34
532	0.3
533	0.32
534	0.26
535	0.2
536	0.19
537	0.19
538	0.16
539	0.17
540	0.17
541	0.14
542	0.15
543	0.14
544	0.11
545	0.1
546	0.11
547	0.11
548	0.1
549	0.11
550	0.1
551	0.1
552	0.1
553	0.11
554	0.1
555	0.11
556	0.13
557	0.13
558	0.13
559	0.14
560	0.15
561	0.14
562	0.16
563	0.17
564	0.14
565	0.13
566	0.15
567	0.15
568	0.16
569	0.17
570	0.15
571	0.13
572	0.12
573	0.13
574	0.12
575	0.14
576	0.18
577	0.2
578	0.21
579	0.24
580	0.25
581	0.24
582	0.27
583	0.33
584	0.35
585	0.41
586	0.48
587	0.52
588	0.55
589	0.56
590	0.53
591	0.5
592	0.42
593	0.35
594	0.29
595	0.21
596	0.21
597	0.2
598	0.19
599	0.16
600	0.16
601	0.18
602	0.18
603	0.18
604	0.17
605	0.18
606	0.19
607	0.16
608	0.15
609	0.13
610	0.13
611	0.17
612	0.16
613	0.21
614	0.24
615	0.25
616	0.3
617	0.29
618	0.33
619	0.34
620	0.35
621	0.36
622	0.4
623	0.49
624	0.55
625	0.65
626	0.67
627	0.68
628	0.72
629	0.75
630	0.77
631	0.78
632	0.79
633	0.79
634	0.82
635	0.78
636	0.77
637	0.7
638	0.63
639	0.6
640	0.56
641	0.48
642	0.45
643	0.42
644	0.38
645	0.41
646	0.4
647	0.34
648	0.32
649	0.34
650	0.29
651	0.3
652	0.29
653	0.28
654	0.31
655	0.36
656	0.42
657	0.47
658	0.53
659	0.61
660	0.69
661	0.74
662	0.77
663	0.79
664	0.79
665	0.8
666	0.83

Q59U11

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer