FuNGI

F4RK88

Protein Details

Accession

F4RK88

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
635-654	AMIPRPMRKWRKVEGTGDKE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 11.333, cyto 9, cyto_mito 7.333, mito 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR045075 Syf1-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	mlr:MELLADRAFT_43256 -
Pfam	View protein in Pfam PF02184 HAT
PROSITE	View protein in PROSITE PS50005 TPR

Amino Acid Sequences

MADARAPKVKNRAPAPVQITAEQLLREAQERQETGVAAPRQKVEDFEELHEYRGRKRKEFEEVIRRTRQDLRAWTKYGTWEASQSEFARARSVFERALDVAPTSEKLWLSYCEMELKARNIQHARNLFDRAVTLLPRINQIWYKYVYLEELLGNISGARQVFERWMSWEPDEKAWSAYIKMEVRYQELDRASTLYERMIACHPDPKNWIKWAKFEEERQKIERSREIFQMAFEYFGEEEDDLERAQSIYTSFAKMESRHKEYDRARMIYKYALDRLPRSKSVGLYASYTNFEKQFGDRAGIEATVLGKRRIQYEEELANGGQLNYDVWFEYARLEENALKSCDHDDPQQAITRIREVYERAIAQVPPSDDKRYWRRYIFLWLGYATFEETETKDAERVRQVYEACLKLIPHKRFTFAKVWDMYAHFELRQLNLDKARKIMGTAIGLAPKPKSFKVYLDMELQLREFDRCRKLYEKFLEFDPTYPSAWIQFAGLERGLMEVDRARAIYEMAISQNDLYDPECVWKAYIDFEEEEEEWDRARKLFERLALASGHVKVWTSWAKVNREKVPVEKDEKAAEEARLEGIRLAREVLKRGYEDIRKRWKNEIEGPRSIILDHWKLLELEIGDPGSMAKVEAMIPRPMRKWRKVEGTGDKEEYWDLVFPDDEKERNPGTFKLVEMAHAWKAKQLELQQVKETEQQKMMPTITITADSPVSDP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.65
3	0.62
4	0.59
5	0.52
6	0.49
7	0.41
8	0.38
9	0.29
10	0.24
11	0.19
12	0.17
13	0.18
14	0.18
15	0.2
16	0.26
17	0.26
18	0.28
19	0.29
20	0.28
21	0.27
22	0.33
23	0.34
24	0.31
25	0.33
26	0.33
27	0.34
28	0.34
29	0.35
30	0.32
31	0.35
32	0.34
33	0.34
34	0.4
35	0.37
36	0.39
37	0.41
38	0.37
39	0.39
40	0.45
41	0.48
42	0.46
43	0.52
44	0.57
45	0.63
46	0.71
47	0.72
48	0.74
49	0.76
50	0.78
51	0.79
52	0.73
53	0.67
54	0.66
55	0.62
56	0.59
57	0.61
58	0.62
59	0.62
60	0.63
61	0.61
62	0.55
63	0.53
64	0.5
65	0.43
66	0.35
67	0.31
68	0.31
69	0.31
70	0.33
71	0.3
72	0.32
73	0.31
74	0.3
75	0.32
76	0.29
77	0.3
78	0.29
79	0.31
80	0.26
81	0.24
82	0.27
83	0.24
84	0.25
85	0.22
86	0.19
87	0.17
88	0.16
89	0.17
90	0.14
91	0.15
92	0.14
93	0.14
94	0.16
95	0.17
96	0.21
97	0.21
98	0.22
99	0.23
100	0.24
101	0.26
102	0.27
103	0.28
104	0.3
105	0.29
106	0.36
107	0.36
108	0.39
109	0.44
110	0.46
111	0.47
112	0.44
113	0.47
114	0.4
115	0.35
116	0.33
117	0.27
118	0.23
119	0.2
120	0.18
121	0.17
122	0.18
123	0.21
124	0.21
125	0.22
126	0.23
127	0.25
128	0.28
129	0.27
130	0.28
131	0.25
132	0.25
133	0.23
134	0.19
135	0.18
136	0.14
137	0.11
138	0.11
139	0.1
140	0.09
141	0.07
142	0.07
143	0.07
144	0.07
145	0.07
146	0.07
147	0.08
148	0.11
149	0.13
150	0.14
151	0.16
152	0.2
153	0.22
154	0.23
155	0.3
156	0.29
157	0.31
158	0.32
159	0.29
160	0.26
161	0.25
162	0.24
163	0.17
164	0.17
165	0.19
166	0.2
167	0.21
168	0.23
169	0.23
170	0.26
171	0.28
172	0.27
173	0.27
174	0.25
175	0.25
176	0.22
177	0.21
178	0.19
179	0.17
180	0.16
181	0.11
182	0.14
183	0.13
184	0.14
185	0.16
186	0.18
187	0.18
188	0.25
189	0.25
190	0.25
191	0.31
192	0.34
193	0.36
194	0.41
195	0.47
196	0.42
197	0.48
198	0.48
199	0.5
200	0.5
201	0.53
202	0.56
203	0.56
204	0.59
205	0.56
206	0.58
207	0.54
208	0.55
209	0.54
210	0.47
211	0.43
212	0.42
213	0.42
214	0.35
215	0.31
216	0.3
217	0.23
218	0.2
219	0.17
220	0.14
221	0.11
222	0.11
223	0.11
224	0.08
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.05
235	0.08
236	0.1
237	0.11
238	0.11
239	0.12
240	0.15
241	0.17
242	0.25
243	0.29
244	0.33
245	0.37
246	0.39
247	0.46
248	0.47
249	0.54
250	0.52
251	0.49
252	0.45
253	0.41
254	0.41
255	0.36
256	0.35
257	0.28
258	0.24
259	0.25
260	0.25
261	0.28
262	0.32
263	0.34
264	0.33
265	0.34
266	0.32
267	0.3
268	0.31
269	0.3
270	0.25
271	0.22
272	0.22
273	0.19
274	0.19
275	0.19
276	0.17
277	0.14
278	0.14
279	0.13
280	0.12
281	0.16
282	0.15
283	0.16
284	0.14
285	0.15
286	0.15
287	0.13
288	0.12
289	0.08
290	0.09
291	0.09
292	0.1
293	0.1
294	0.11
295	0.12
296	0.15
297	0.17
298	0.18
299	0.18
300	0.22
301	0.22
302	0.21
303	0.21
304	0.18
305	0.17
306	0.15
307	0.12
308	0.07
309	0.06
310	0.05
311	0.04
312	0.05
313	0.04
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.06
318	0.06
319	0.07
320	0.07
321	0.08
322	0.09
323	0.11
324	0.13
325	0.14
326	0.13
327	0.13
328	0.15
329	0.16
330	0.15
331	0.16
332	0.16
333	0.17
334	0.19
335	0.22
336	0.21
337	0.2
338	0.19
339	0.19
340	0.17
341	0.15
342	0.15
343	0.13
344	0.14
345	0.15
346	0.15
347	0.14
348	0.15
349	0.15
350	0.14
351	0.15
352	0.13
353	0.13
354	0.15
355	0.17
356	0.16
357	0.22
358	0.3
359	0.35
360	0.39
361	0.38
362	0.38
363	0.37
364	0.44
365	0.41
366	0.34
367	0.28
368	0.23
369	0.22
370	0.2
371	0.18
372	0.11
373	0.07
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.1
381	0.11
382	0.13
383	0.17
384	0.18
385	0.18
386	0.2
387	0.2
388	0.21
389	0.26
390	0.24
391	0.2
392	0.2
393	0.18
394	0.23
395	0.32
396	0.32
397	0.34
398	0.34
399	0.37
400	0.38
401	0.43
402	0.42
403	0.36
404	0.39
405	0.33
406	0.34
407	0.32
408	0.31
409	0.28
410	0.23
411	0.21
412	0.14
413	0.16
414	0.15
415	0.14
416	0.18
417	0.17
418	0.18
419	0.24
420	0.27
421	0.25
422	0.26
423	0.26
424	0.21
425	0.2
426	0.2
427	0.16
428	0.14
429	0.14
430	0.14
431	0.14
432	0.15
433	0.15
434	0.14
435	0.13
436	0.15
437	0.15
438	0.17
439	0.17
440	0.2
441	0.24
442	0.28
443	0.28
444	0.29
445	0.31
446	0.27
447	0.26
448	0.24
449	0.19
450	0.15
451	0.14
452	0.12
453	0.17
454	0.23
455	0.24
456	0.28
457	0.33
458	0.35
459	0.43
460	0.49
461	0.47
462	0.42
463	0.42
464	0.44
465	0.39
466	0.37
467	0.32
468	0.26
469	0.22
470	0.2
471	0.19
472	0.14
473	0.14
474	0.13
475	0.09
476	0.09
477	0.09
478	0.11
479	0.1
480	0.09
481	0.08
482	0.08
483	0.08
484	0.07
485	0.07
486	0.07
487	0.08
488	0.08
489	0.08
490	0.08
491	0.09
492	0.09
493	0.09
494	0.08
495	0.08
496	0.08
497	0.09
498	0.09
499	0.08
500	0.08
501	0.08
502	0.08
503	0.07
504	0.08
505	0.08
506	0.1
507	0.11
508	0.11
509	0.11
510	0.11
511	0.11
512	0.12
513	0.13
514	0.13
515	0.13
516	0.14
517	0.16
518	0.16
519	0.17
520	0.16
521	0.15
522	0.13
523	0.15
524	0.15
525	0.13
526	0.16
527	0.17
528	0.2
529	0.24
530	0.27
531	0.3
532	0.31
533	0.32
534	0.29
535	0.28
536	0.25
537	0.22
538	0.19
539	0.14
540	0.13
541	0.11
542	0.16
543	0.2
544	0.2
545	0.24
546	0.31
547	0.39
548	0.45
549	0.52
550	0.53
551	0.54
552	0.54
553	0.56
554	0.56
555	0.55
556	0.55
557	0.51
558	0.47
559	0.44
560	0.43
561	0.4
562	0.35
563	0.29
564	0.23
565	0.2
566	0.2
567	0.18
568	0.16
569	0.15
570	0.15
571	0.15
572	0.14
573	0.15
574	0.18
575	0.2
576	0.24
577	0.25
578	0.26
579	0.26
580	0.3
581	0.36
582	0.4
583	0.45
584	0.51
585	0.59
586	0.62
587	0.65
588	0.7
589	0.7
590	0.69
591	0.71
592	0.72
593	0.69
594	0.67
595	0.66
596	0.59
597	0.52
598	0.44
599	0.36
600	0.32
601	0.28
602	0.24
603	0.22
604	0.22
605	0.22
606	0.22
607	0.22
608	0.16
609	0.13
610	0.14
611	0.13
612	0.12
613	0.11
614	0.11
615	0.09
616	0.08
617	0.07
618	0.05
619	0.06
620	0.08
621	0.13
622	0.16
623	0.22
624	0.26
625	0.31
626	0.36
627	0.45
628	0.53
629	0.57
630	0.62
631	0.65
632	0.72
633	0.74
634	0.79
635	0.8
636	0.79
637	0.76
638	0.72
639	0.63
640	0.54
641	0.47
642	0.38
643	0.28
644	0.21
645	0.15
646	0.13
647	0.13
648	0.13
649	0.17
650	0.2
651	0.2
652	0.2
653	0.25
654	0.26
655	0.29
656	0.32
657	0.29
658	0.31
659	0.32
660	0.31
661	0.3
662	0.28
663	0.27
664	0.26
665	0.28
666	0.28
667	0.29
668	0.28
669	0.27
670	0.29
671	0.29
672	0.32
673	0.33
674	0.38
675	0.43
676	0.47
677	0.49
678	0.5
679	0.51
680	0.52
681	0.51
682	0.45
683	0.41
684	0.4
685	0.38
686	0.41
687	0.39
688	0.34
689	0.32
690	0.29
691	0.27
692	0.25
693	0.22
694	0.19
695	0.19

F4RK88

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer