FuNGI

N4V1B0

Protein Details

Accession

N4V1B0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
639-660	DVPEADKGKKKRFTPRDLGRLL	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 17, cyto 4, nucl 3, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019680 Mediator_Med1
Gene Ontology	GO:0016592 C:mediator complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity GO:0045944 P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF10744 Med1

Amino Acid Sequences

MATPTQMKHAASQQGRTPSQITAATPPVSTPFSVSQAHTAFSPRGPRSSPQQFKKSPATSSTLMGHPANGALNFDSPSAAAAMGALGISGALDIGLEHVGVGGFGGLGGLSSEDEKIKRLDAVIDILSKAKGRVSEAGLERLTLRTGLTSMWDEHRSPDGRKTKMLVMAGNALGLDIFLNNNIVENVSLSFPESAPIVTRHKDQASKILLKDLQLRPDQSPLTKTLDKFAANLERLASLDRLSIIPGLDCQEALAGIYDSLDRLHKWELSKLREEPSMSGKPERFLATTVMCTKSGRPAMHARDLVGLSVEYWTERRHVVPKTPDTGRFCERLEKVWSILVGCKALDGEMFPPVRVSDNWISQKVVVESGPDDILPGGMALDWQEPEAVNLPQTDDNKDKGVDVVHPDGTTHKIPNVKFVATLTPPVIVPQSVWNTLHSLTGAAAQPMLLPSYTFDSISFPIADGSHHDASELRVITCKRALSIPSGDDGDAKLRNHKNTLLIYKPVYGQTVTELSFSHPRQLVDVLPILRQYALISTLLARSFGSDVSGEPLQQKDDAVFKVEQVTTTKYEYEVFMANKVNTGDHDLTLDVVLTVHPSAGLHVVFPFRGATANIDMQIQPNGLVQILSQNVVPEEDEDVPEADKGKKKRFTPRDLGRLLEVMEDLCSWAEWIRRNLS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.52
3	0.51
4	0.46
5	0.37
6	0.38
7	0.35
8	0.31
9	0.28
10	0.31
11	0.3
12	0.28
13	0.27
14	0.26
15	0.25
16	0.23
17	0.22
18	0.2
19	0.23
20	0.26
21	0.27
22	0.3
23	0.29
24	0.3
25	0.27
26	0.27
27	0.25
28	0.26
29	0.34
30	0.3
31	0.33
32	0.36
33	0.39
34	0.45
35	0.55
36	0.61
37	0.61
38	0.69
39	0.68
40	0.72
41	0.78
42	0.73
43	0.67
44	0.61
45	0.58
46	0.49
47	0.48
48	0.45
49	0.36
50	0.35
51	0.31
52	0.27
53	0.21
54	0.2
55	0.19
56	0.15
57	0.15
58	0.12
59	0.14
60	0.14
61	0.14
62	0.13
63	0.1
64	0.11
65	0.1
66	0.08
67	0.06
68	0.05
69	0.05
70	0.05
71	0.05
72	0.04
73	0.03
74	0.02
75	0.02
76	0.02
77	0.02
78	0.02
79	0.02
80	0.02
81	0.03
82	0.04
83	0.04
84	0.04
85	0.04
86	0.04
87	0.04
88	0.04
89	0.03
90	0.03
91	0.03
92	0.03
93	0.02
94	0.02
95	0.03
96	0.03
97	0.04
98	0.05
99	0.06
100	0.09
101	0.1
102	0.12
103	0.13
104	0.14
105	0.14
106	0.15
107	0.16
108	0.15
109	0.18
110	0.18
111	0.18
112	0.18
113	0.18
114	0.18
115	0.16
116	0.15
117	0.14
118	0.13
119	0.15
120	0.19
121	0.21
122	0.27
123	0.29
124	0.33
125	0.31
126	0.3
127	0.28
128	0.24
129	0.22
130	0.15
131	0.13
132	0.08
133	0.09
134	0.08
135	0.1
136	0.12
137	0.13
138	0.18
139	0.2
140	0.2
141	0.22
142	0.29
143	0.29
144	0.3
145	0.37
146	0.41
147	0.41
148	0.43
149	0.44
150	0.42
151	0.44
152	0.44
153	0.35
154	0.29
155	0.3
156	0.27
157	0.24
158	0.18
159	0.13
160	0.1
161	0.09
162	0.07
163	0.03
164	0.03
165	0.04
166	0.05
167	0.05
168	0.05
169	0.06
170	0.06
171	0.06
172	0.06
173	0.07
174	0.07
175	0.07
176	0.08
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.08
181	0.07
182	0.09
183	0.13
184	0.16
185	0.17
186	0.2
187	0.24
188	0.28
189	0.32
190	0.31
191	0.36
192	0.39
193	0.42
194	0.4
195	0.41
196	0.38
197	0.36
198	0.44
199	0.38
200	0.37
201	0.35
202	0.37
203	0.32
204	0.36
205	0.35
206	0.28
207	0.28
208	0.25
209	0.29
210	0.3
211	0.29
212	0.28
213	0.31
214	0.29
215	0.27
216	0.29
217	0.29
218	0.26
219	0.26
220	0.23
221	0.19
222	0.19
223	0.2
224	0.16
225	0.09
226	0.09
227	0.09
228	0.08
229	0.08
230	0.09
231	0.08
232	0.07
233	0.07
234	0.1
235	0.09
236	0.08
237	0.08
238	0.07
239	0.07
240	0.07
241	0.06
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.05
248	0.06
249	0.06
250	0.08
251	0.1
252	0.13
253	0.14
254	0.2
255	0.26
256	0.3
257	0.35
258	0.35
259	0.36
260	0.36
261	0.36
262	0.31
263	0.31
264	0.32
265	0.29
266	0.31
267	0.29
268	0.27
269	0.28
270	0.28
271	0.21
272	0.18
273	0.19
274	0.15
275	0.17
276	0.19
277	0.19
278	0.17
279	0.17
280	0.17
281	0.2
282	0.24
283	0.22
284	0.23
285	0.29
286	0.33
287	0.38
288	0.38
289	0.32
290	0.3
291	0.3
292	0.26
293	0.18
294	0.14
295	0.08
296	0.08
297	0.07
298	0.04
299	0.05
300	0.06
301	0.07
302	0.08
303	0.1
304	0.15
305	0.17
306	0.23
307	0.3
308	0.33
309	0.36
310	0.38
311	0.42
312	0.41
313	0.43
314	0.4
315	0.35
316	0.32
317	0.34
318	0.32
319	0.3
320	0.3
321	0.26
322	0.24
323	0.23
324	0.22
325	0.16
326	0.17
327	0.14
328	0.1
329	0.09
330	0.08
331	0.07
332	0.07
333	0.06
334	0.05
335	0.05
336	0.09
337	0.09
338	0.09
339	0.09
340	0.09
341	0.11
342	0.1
343	0.16
344	0.15
345	0.21
346	0.24
347	0.25
348	0.25
349	0.24
350	0.26
351	0.2
352	0.18
353	0.11
354	0.09
355	0.09
356	0.09
357	0.09
358	0.07
359	0.07
360	0.05
361	0.05
362	0.04
363	0.04
364	0.03
365	0.02
366	0.03
367	0.03
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.05
372	0.05
373	0.06
374	0.08
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.09
379	0.12
380	0.14
381	0.17
382	0.17
383	0.18
384	0.19
385	0.19
386	0.18
387	0.15
388	0.15
389	0.14
390	0.15
391	0.16
392	0.15
393	0.15
394	0.15
395	0.16
396	0.18
397	0.18
398	0.15
399	0.15
400	0.19
401	0.19
402	0.27
403	0.28
404	0.25
405	0.24
406	0.24
407	0.25
408	0.21
409	0.22
410	0.15
411	0.13
412	0.13
413	0.13
414	0.13
415	0.08
416	0.08
417	0.12
418	0.14
419	0.16
420	0.17
421	0.17
422	0.18
423	0.19
424	0.18
425	0.13
426	0.11
427	0.09
428	0.11
429	0.11
430	0.09
431	0.08
432	0.08
433	0.08
434	0.08
435	0.08
436	0.05
437	0.04
438	0.05
439	0.09
440	0.1
441	0.1
442	0.1
443	0.12
444	0.13
445	0.15
446	0.14
447	0.1
448	0.1
449	0.1
450	0.1
451	0.11
452	0.17
453	0.16
454	0.16
455	0.16
456	0.16
457	0.17
458	0.22
459	0.19
460	0.13
461	0.16
462	0.17
463	0.2
464	0.22
465	0.21
466	0.17
467	0.19
468	0.2
469	0.21
470	0.24
471	0.22
472	0.21
473	0.22
474	0.21
475	0.19
476	0.18
477	0.17
478	0.17
479	0.17
480	0.24
481	0.28
482	0.31
483	0.34
484	0.35
485	0.37
486	0.39
487	0.45
488	0.4
489	0.38
490	0.37
491	0.36
492	0.35
493	0.31
494	0.27
495	0.21
496	0.17
497	0.16
498	0.18
499	0.16
500	0.15
501	0.14
502	0.16
503	0.23
504	0.23
505	0.26
506	0.26
507	0.26
508	0.27
509	0.28
510	0.26
511	0.22
512	0.26
513	0.21
514	0.19
515	0.19
516	0.18
517	0.16
518	0.15
519	0.12
520	0.09
521	0.09
522	0.09
523	0.09
524	0.09
525	0.12
526	0.12
527	0.12
528	0.1
529	0.1
530	0.11
531	0.1
532	0.11
533	0.08
534	0.09
535	0.12
536	0.13
537	0.12
538	0.14
539	0.15
540	0.15
541	0.15
542	0.15
543	0.13
544	0.17
545	0.17
546	0.19
547	0.18
548	0.17
549	0.22
550	0.22
551	0.23
552	0.21
553	0.24
554	0.23
555	0.25
556	0.25
557	0.2
558	0.21
559	0.2
560	0.2
561	0.21
562	0.19
563	0.21
564	0.24
565	0.23
566	0.25
567	0.24
568	0.23
569	0.19
570	0.25
571	0.23
572	0.19
573	0.2
574	0.17
575	0.17
576	0.16
577	0.15
578	0.08
579	0.07
580	0.06
581	0.07
582	0.07
583	0.06
584	0.06
585	0.06
586	0.07
587	0.1
588	0.1
589	0.09
590	0.11
591	0.13
592	0.12
593	0.13
594	0.12
595	0.1
596	0.12
597	0.12
598	0.14
599	0.17
600	0.19
601	0.19
602	0.21
603	0.21
604	0.21
605	0.22
606	0.18
607	0.14
608	0.13
609	0.13
610	0.12
611	0.11
612	0.09
613	0.13
614	0.14
615	0.14
616	0.13
617	0.13
618	0.14
619	0.14
620	0.15
621	0.1
622	0.13
623	0.14
624	0.14
625	0.15
626	0.15
627	0.15
628	0.16
629	0.17
630	0.2
631	0.26
632	0.33
633	0.41
634	0.48
635	0.55
636	0.66
637	0.73
638	0.77
639	0.81
640	0.84
641	0.85
642	0.8
643	0.75
644	0.67
645	0.59
646	0.49
647	0.39
648	0.29
649	0.19
650	0.17
651	0.14
652	0.12
653	0.1
654	0.09
655	0.08
656	0.11
657	0.15
658	0.21

N4V1B0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer