Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N4VD00

Protein Details
Accession N4VD00    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
132-152ESEKWDKRVKKREAHRDNNAFBasic
242-262RRAEENRLKKRKDRMAQNGDDBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 1, cyto 1, vacu 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPQKKRKTETSAVADEAVKPSQSTGSASAASEENTPADTTPPREAPANDAASKAQDRMARFKALKARAKMSSDQNFKEATLESQRLATDPSQLTAIHRKQAIASQKLLKADIEDAGGDFERKRAWDWTIDESEKWDKRVKKREAHRDNNAFQDYTAESNKVYKRQLKNMAPDMAKYEKDKMAAIERAAASGGLDIVETEDGELIAVDKDGSFYSTADSTTFAFAQNKPDKAAVDRLVEDLRRAEENRLKKRKDRMAQNGDDGDVTYINEKNKQFNQKLARFYNKYTAEIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.51
3 0.44
4 0.38
5 0.29
6 0.21
7 0.16
8 0.16
9 0.15
10 0.16
11 0.17
12 0.17
13 0.18
14 0.19
15 0.19
16 0.2
17 0.19
18 0.18
19 0.17
20 0.15
21 0.12
22 0.12
23 0.12
24 0.11
25 0.14
26 0.15
27 0.18
28 0.23
29 0.24
30 0.25
31 0.28
32 0.28
33 0.3
34 0.35
35 0.36
36 0.31
37 0.31
38 0.29
39 0.3
40 0.3
41 0.26
42 0.22
43 0.21
44 0.23
45 0.3
46 0.33
47 0.36
48 0.36
49 0.41
50 0.45
51 0.51
52 0.56
53 0.53
54 0.55
55 0.52
56 0.56
57 0.56
58 0.56
59 0.56
60 0.55
61 0.52
62 0.49
63 0.44
64 0.4
65 0.37
66 0.28
67 0.22
68 0.22
69 0.22
70 0.19
71 0.2
72 0.2
73 0.19
74 0.2
75 0.17
76 0.17
77 0.16
78 0.16
79 0.16
80 0.16
81 0.19
82 0.26
83 0.27
84 0.25
85 0.25
86 0.25
87 0.25
88 0.3
89 0.35
90 0.29
91 0.31
92 0.32
93 0.34
94 0.34
95 0.34
96 0.29
97 0.22
98 0.19
99 0.16
100 0.11
101 0.09
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.09
111 0.11
112 0.12
113 0.17
114 0.2
115 0.24
116 0.28
117 0.28
118 0.26
119 0.27
120 0.33
121 0.29
122 0.29
123 0.3
124 0.32
125 0.4
126 0.51
127 0.55
128 0.57
129 0.65
130 0.74
131 0.78
132 0.8
133 0.81
134 0.78
135 0.72
136 0.69
137 0.6
138 0.49
139 0.38
140 0.32
141 0.23
142 0.18
143 0.17
144 0.11
145 0.1
146 0.15
147 0.18
148 0.19
149 0.23
150 0.29
151 0.33
152 0.41
153 0.5
154 0.5
155 0.55
156 0.57
157 0.59
158 0.51
159 0.47
160 0.43
161 0.36
162 0.32
163 0.27
164 0.25
165 0.21
166 0.21
167 0.21
168 0.19
169 0.21
170 0.22
171 0.2
172 0.21
173 0.19
174 0.18
175 0.17
176 0.15
177 0.1
178 0.08
179 0.08
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.11
209 0.12
210 0.14
211 0.15
212 0.25
213 0.3
214 0.3
215 0.3
216 0.32
217 0.31
218 0.31
219 0.37
220 0.31
221 0.29
222 0.28
223 0.29
224 0.3
225 0.29
226 0.27
227 0.22
228 0.2
229 0.2
230 0.21
231 0.26
232 0.3
233 0.4
234 0.5
235 0.58
236 0.62
237 0.65
238 0.74
239 0.77
240 0.79
241 0.8
242 0.8
243 0.81
244 0.8
245 0.79
246 0.7
247 0.6
248 0.51
249 0.41
250 0.31
251 0.21
252 0.16
253 0.12
254 0.14
255 0.16
256 0.22
257 0.23
258 0.3
259 0.38
260 0.48
261 0.48
262 0.54
263 0.63
264 0.63
265 0.7
266 0.71
267 0.73
268 0.67
269 0.68
270 0.69
271 0.62
272 0.59
273 0.54
274 0.51
275 0.47
276 0.45
277 0.45
278 0.41
279 0.4
280 0.37