Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A484FDN5

Protein Details
Accession A0A484FDN5    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
273-293NRLFERRREKGEQRRPQQPNSHydrophilic
295-314RKYQGPPRNHWNQRNNWGTRHydrophilic
359-379MAKDCRSPKRQQQGQRFQPVPHydrophilic
1083-1105VYLTRRNIKTKRPSDKLDFKKLGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, cyto 3.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR023779  Chromodomain_CS  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
IPR043128  Rev_trsase/Diguanyl_cyclase  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR041373  RT_RNaseH  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0015074  P:DNA integration  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PF03732  Retrotrans_gag  
PF17917  RT_RNaseH  
PF00665  rve  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00598  CHROMO_1  
PS50013  CHROMO_2  
PS50994  INTEGRASE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00024  CD_CSD  
cd09274  RNase_HI_RT_Ty3  
Amino Acid Sequences MSAKHQTPSTSSGSQGTPPKGKQPVKPLDQEMKDVEPSSDEEDDTAELVRQLQKTNRDMAKMQEIINSNAAERLLALQQEVNTLRTAANIIQTPVESREKLRLNSPQAFDGTPGYLKGFLTQVRAYHRFHNLSFKDEAEQVIHAASFLKGRALAWFEPHLTDFLTHDWNDLKLETQTIFAGYHGFESALISLFQEPDEQRQYERDLAALKQKGAATHYAAEFRRICARLDYTDDTKIFMFYQGLKEDVKDELVKQDRPSDFITYAELAIKIDNRLFERRREKGEQRRPQQPNSGRKYQGPPRNHWNQRNNWGTRQQFTPRQSTSHGYHSGPMDLTAGAAIKDNKRRDFKCYNCDKPGHMAKDCRSPKRQQQGQRFQPVPXXXERTRQVNIAKKEIPHASLTWTACFDDTCIVHQGSKDNAGWYPKKPSGRSGYDTTSCDTPPHTKKTLAVATVKKEEDFTPVPERDWAQENEVAILQLQAAERELHRRISQTPDGQLLQKIQHRIQQRINARGNLPLTRALAQQLEASNRMPTKTLAMVKHHKLERKVKEQLDDLYQQGHIEISPGIYLRTVEGESVEYGGGIIDLETVHLPLNYHGRKEDCIFDITEIGFTITPGVIKMSTKKIQAVKDWPTPTNVKEIQAFLGFANFYRRFLKDYAKKTIPLTELTRKDTKFDWTNRQEEAFQDIKNQVVSEPVLTIPDPDKPFEVETDASDYAIGGQLGQRDAKGVLHPCAFYSRKLSGPELNYQIHDKELMAIIEAFQEWRPQLSGTKYEVQVYTDHKNLAHFTTSKNLNKRQIRWSEFLSEFNFRIIYRKGTENGRADALSRRPDYDVPVPEETQVILKTDTDGNLVPAQKLLLIARRPWESISLDFIVKLPKSQEPLTGVHYDSVLVIVERLTKYAYFIPYKESSTAEDLAYVFLRTIVSQHGLPQEIVSDRDKLFTSKFWKSLISQLGAKHRLSTAFHPQTDGQTERINQILEIYLRCYVNYQQDNWVTLLPTAQFAYNSAVGESTKESPFYLNYGFNPTAYGEPRQGEQAVKAIADVSKLRELQDELPKELEFVRQRMRKYANASRIGGPIFEEGDSVYLTRRNIKTKRPSDKLDFKKLGPFKIIRKISNINYELSLPDTMRCHPVFHISLLEPAPKGSHTKDHIEVDPEQEYEVERIIDHIDQQDNTEIQYLIKWKGYSHAENTWEPASSVRHLEELQEYWEQRAXXQTNHDIHGSGTPYPEEQEILN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.41
3 0.43
4 0.44
5 0.44
6 0.51
7 0.57
8 0.62
9 0.63
10 0.66
11 0.69
12 0.69
13 0.74
14 0.74
15 0.73
16 0.7
17 0.67
18 0.6
19 0.54
20 0.49
21 0.42
22 0.35
23 0.27
24 0.27
25 0.27
26 0.24
27 0.2
28 0.17
29 0.18
30 0.18
31 0.16
32 0.14
33 0.1
34 0.09
35 0.13
36 0.18
37 0.19
38 0.24
39 0.3
40 0.38
41 0.41
42 0.5
43 0.51
44 0.5
45 0.5
46 0.5
47 0.53
48 0.48
49 0.45
50 0.42
51 0.41
52 0.39
53 0.41
54 0.35
55 0.27
56 0.25
57 0.24
58 0.17
59 0.15
60 0.14
61 0.13
62 0.13
63 0.13
64 0.14
65 0.14
66 0.2
67 0.21
68 0.2
69 0.18
70 0.19
71 0.17
72 0.16
73 0.18
74 0.14
75 0.17
76 0.18
77 0.18
78 0.18
79 0.19
80 0.2
81 0.23
82 0.27
83 0.24
84 0.24
85 0.32
86 0.37
87 0.39
88 0.44
89 0.48
90 0.51
91 0.57
92 0.58
93 0.52
94 0.48
95 0.47
96 0.41
97 0.34
98 0.28
99 0.21
100 0.19
101 0.17
102 0.16
103 0.16
104 0.16
105 0.17
106 0.17
107 0.21
108 0.23
109 0.25
110 0.32
111 0.37
112 0.38
113 0.41
114 0.48
115 0.47
116 0.47
117 0.54
118 0.47
119 0.47
120 0.47
121 0.41
122 0.36
123 0.32
124 0.32
125 0.23
126 0.21
127 0.17
128 0.15
129 0.14
130 0.11
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.11
138 0.14
139 0.18
140 0.18
141 0.21
142 0.23
143 0.23
144 0.24
145 0.25
146 0.22
147 0.18
148 0.18
149 0.15
150 0.15
151 0.19
152 0.17
153 0.18
154 0.19
155 0.19
156 0.19
157 0.18
158 0.17
159 0.13
160 0.16
161 0.14
162 0.14
163 0.13
164 0.13
165 0.13
166 0.11
167 0.12
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.13
182 0.13
183 0.19
184 0.24
185 0.24
186 0.25
187 0.28
188 0.32
189 0.31
190 0.31
191 0.26
192 0.24
193 0.25
194 0.33
195 0.33
196 0.29
197 0.28
198 0.29
199 0.28
200 0.28
201 0.29
202 0.23
203 0.24
204 0.26
205 0.28
206 0.27
207 0.32
208 0.31
209 0.3
210 0.35
211 0.32
212 0.32
213 0.3
214 0.33
215 0.3
216 0.36
217 0.39
218 0.34
219 0.39
220 0.38
221 0.34
222 0.31
223 0.29
224 0.23
225 0.19
226 0.17
227 0.14
228 0.18
229 0.18
230 0.2
231 0.19
232 0.19
233 0.19
234 0.18
235 0.18
236 0.15
237 0.15
238 0.22
239 0.27
240 0.29
241 0.3
242 0.37
243 0.35
244 0.37
245 0.39
246 0.34
247 0.29
248 0.27
249 0.28
250 0.21
251 0.21
252 0.18
253 0.16
254 0.12
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.13
259 0.15
260 0.17
261 0.26
262 0.28
263 0.36
264 0.44
265 0.48
266 0.54
267 0.6
268 0.66
269 0.69
270 0.78
271 0.79
272 0.77
273 0.82
274 0.81
275 0.78
276 0.78
277 0.76
278 0.75
279 0.73
280 0.74
281 0.66
282 0.65
283 0.68
284 0.67
285 0.67
286 0.63
287 0.62
288 0.62
289 0.7
290 0.74
291 0.75
292 0.75
293 0.75
294 0.78
295 0.81
296 0.77
297 0.72
298 0.71
299 0.65
300 0.59
301 0.56
302 0.54
303 0.52
304 0.52
305 0.54
306 0.47
307 0.46
308 0.47
309 0.46
310 0.43
311 0.41
312 0.42
313 0.34
314 0.35
315 0.34
316 0.32
317 0.26
318 0.23
319 0.17
320 0.13
321 0.12
322 0.09
323 0.08
324 0.06
325 0.08
326 0.11
327 0.16
328 0.23
329 0.29
330 0.36
331 0.45
332 0.46
333 0.52
334 0.59
335 0.61
336 0.64
337 0.69
338 0.7
339 0.68
340 0.69
341 0.63
342 0.61
343 0.62
344 0.57
345 0.52
346 0.5
347 0.46
348 0.54
349 0.59
350 0.58
351 0.56
352 0.58
353 0.63
354 0.68
355 0.72
356 0.71
357 0.76
358 0.79
359 0.82
360 0.84
361 0.76
362 0.67
363 0.68
364 0.65
365 0.58
366 0.53
367 0.49
368 0.42
369 0.44
370 0.48
371 0.47
372 0.47
373 0.47
374 0.48
375 0.45
376 0.44
377 0.46
378 0.42
379 0.36
380 0.3
381 0.27
382 0.23
383 0.26
384 0.26
385 0.22
386 0.21
387 0.19
388 0.17
389 0.17
390 0.14
391 0.11
392 0.11
393 0.12
394 0.14
395 0.14
396 0.15
397 0.16
398 0.18
399 0.16
400 0.19
401 0.18
402 0.16
403 0.18
404 0.23
405 0.25
406 0.25
407 0.31
408 0.32
409 0.37
410 0.37
411 0.42
412 0.44
413 0.48
414 0.5
415 0.47
416 0.48
417 0.45
418 0.45
419 0.4
420 0.34
421 0.28
422 0.24
423 0.22
424 0.25
425 0.27
426 0.32
427 0.33
428 0.33
429 0.34
430 0.41
431 0.43
432 0.38
433 0.38
434 0.36
435 0.38
436 0.41
437 0.39
438 0.32
439 0.3
440 0.27
441 0.26
442 0.23
443 0.23
444 0.25
445 0.25
446 0.26
447 0.26
448 0.26
449 0.23
450 0.26
451 0.23
452 0.19
453 0.2
454 0.2
455 0.19
456 0.18
457 0.15
458 0.11
459 0.1
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.05
464 0.06
465 0.07
466 0.07
467 0.12
468 0.14
469 0.15
470 0.16
471 0.18
472 0.2
473 0.26
474 0.31
475 0.29
476 0.3
477 0.3
478 0.3
479 0.29
480 0.28
481 0.23
482 0.22
483 0.22
484 0.24
485 0.22
486 0.26
487 0.29
488 0.34
489 0.37
490 0.41
491 0.43
492 0.49
493 0.51
494 0.49
495 0.45
496 0.44
497 0.4
498 0.34
499 0.29
500 0.22
501 0.2
502 0.18
503 0.18
504 0.16
505 0.14
506 0.13
507 0.14
508 0.13
509 0.13
510 0.13
511 0.13
512 0.14
513 0.15
514 0.14
515 0.13
516 0.12
517 0.13
518 0.16
519 0.2
520 0.21
521 0.27
522 0.33
523 0.35
524 0.42
525 0.43
526 0.43
527 0.45
528 0.52
529 0.53
530 0.54
531 0.59
532 0.55
533 0.54
534 0.52
535 0.47
536 0.42
537 0.36
538 0.28
539 0.21
540 0.19
541 0.16
542 0.13
543 0.11
544 0.07
545 0.06
546 0.05
547 0.04
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.06
558 0.07
559 0.06
560 0.07
561 0.07
562 0.05
563 0.05
564 0.04
565 0.04
566 0.03
567 0.03
568 0.02
569 0.02
570 0.03
571 0.03
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.05
576 0.06
577 0.14
578 0.15
579 0.15
580 0.17
581 0.18
582 0.19
583 0.21
584 0.22
585 0.15
586 0.16
587 0.16
588 0.14
589 0.14
590 0.13
591 0.11
592 0.08
593 0.07
594 0.06
595 0.05
596 0.05
597 0.04
598 0.04
599 0.04
600 0.05
601 0.04
602 0.05
603 0.08
604 0.13
605 0.16
606 0.17
607 0.22
608 0.26
609 0.29
610 0.32
611 0.36
612 0.36
613 0.4
614 0.42
615 0.38
616 0.36
617 0.36
618 0.32
619 0.33
620 0.28
621 0.23
622 0.22
623 0.22
624 0.2
625 0.18
626 0.18
627 0.11
628 0.1
629 0.09
630 0.08
631 0.14
632 0.13
633 0.15
634 0.16
635 0.17
636 0.19
637 0.21
638 0.3
639 0.31
640 0.36
641 0.42
642 0.42
643 0.43
644 0.42
645 0.45
646 0.37
647 0.33
648 0.33
649 0.33
650 0.34
651 0.37
652 0.41
653 0.36
654 0.36
655 0.34
656 0.35
657 0.34
658 0.36
659 0.42
660 0.42
661 0.45
662 0.44
663 0.44
664 0.39
665 0.32
666 0.32
667 0.24
668 0.19
669 0.19
670 0.18
671 0.17
672 0.17
673 0.16
674 0.1
675 0.1
676 0.1
677 0.07
678 0.07
679 0.07
680 0.07
681 0.07
682 0.08
683 0.07
684 0.13
685 0.14
686 0.14
687 0.14
688 0.15
689 0.16
690 0.15
691 0.17
692 0.12
693 0.11
694 0.15
695 0.14
696 0.13
697 0.12
698 0.11
699 0.09
700 0.09
701 0.08
702 0.04
703 0.05
704 0.06
705 0.07
706 0.07
707 0.07
708 0.07
709 0.08
710 0.09
711 0.11
712 0.12
713 0.14
714 0.16
715 0.16
716 0.15
717 0.21
718 0.22
719 0.2
720 0.22
721 0.22
722 0.24
723 0.26
724 0.28
725 0.27
726 0.29
727 0.33
728 0.32
729 0.31
730 0.29
731 0.28
732 0.26
733 0.21
734 0.18
735 0.14
736 0.1
737 0.1
738 0.09
739 0.08
740 0.07
741 0.07
742 0.07
743 0.07
744 0.07
745 0.06
746 0.07
747 0.07
748 0.08
749 0.08
750 0.09
751 0.12
752 0.14
753 0.18
754 0.21
755 0.25
756 0.25
757 0.27
758 0.27
759 0.24
760 0.25
761 0.24
762 0.24
763 0.21
764 0.22
765 0.2
766 0.21
767 0.21
768 0.2
769 0.19
770 0.16
771 0.16
772 0.22
773 0.29
774 0.33
775 0.39
776 0.43
777 0.49
778 0.55
779 0.59
780 0.61
781 0.63
782 0.63
783 0.6
784 0.56
785 0.54
786 0.48
787 0.46
788 0.4
789 0.33
790 0.28
791 0.25
792 0.23
793 0.16
794 0.19
795 0.18
796 0.19
797 0.18
798 0.22
799 0.24
800 0.28
801 0.35
802 0.35
803 0.35
804 0.32
805 0.3
806 0.28
807 0.3
808 0.29
809 0.29
810 0.26
811 0.26
812 0.26
813 0.27
814 0.31
815 0.32
816 0.32
817 0.31
818 0.32
819 0.31
820 0.3
821 0.29
822 0.24
823 0.19
824 0.16
825 0.12
826 0.1
827 0.09
828 0.11
829 0.12
830 0.12
831 0.12
832 0.11
833 0.12
834 0.15
835 0.16
836 0.14
837 0.13
838 0.13
839 0.11
840 0.12
841 0.11
842 0.14
843 0.15
844 0.17
845 0.21
846 0.23
847 0.24
848 0.23
849 0.26
850 0.22
851 0.21
852 0.24
853 0.21
854 0.2
855 0.19
856 0.19
857 0.2
858 0.17
859 0.18
860 0.16
861 0.17
862 0.21
863 0.22
864 0.25
865 0.24
866 0.26
867 0.29
868 0.29
869 0.26
870 0.22
871 0.21
872 0.18
873 0.14
874 0.12
875 0.08
876 0.06
877 0.05
878 0.05
879 0.09
880 0.09
881 0.09
882 0.1
883 0.1
884 0.12
885 0.16
886 0.21
887 0.19
888 0.2
889 0.25
890 0.27
891 0.29
892 0.28
893 0.26
894 0.23
895 0.25
896 0.26
897 0.2
898 0.18
899 0.17
900 0.16
901 0.15
902 0.13
903 0.09
904 0.08
905 0.08
906 0.07
907 0.08
908 0.09
909 0.1
910 0.1
911 0.14
912 0.16
913 0.17
914 0.17
915 0.16
916 0.17
917 0.16
918 0.18
919 0.16
920 0.17
921 0.16
922 0.18
923 0.19
924 0.19
925 0.19
926 0.23
927 0.28
928 0.3
929 0.33
930 0.32
931 0.34
932 0.33
933 0.39
934 0.39
935 0.35
936 0.32
937 0.34
938 0.41
939 0.43
940 0.41
941 0.35
942 0.32
943 0.31
944 0.31
945 0.32
946 0.35
947 0.37
948 0.37
949 0.39
950 0.38
951 0.39
952 0.41
953 0.38
954 0.29
955 0.26
956 0.27
957 0.26
958 0.27
959 0.24
960 0.18
961 0.17
962 0.18
963 0.15
964 0.15
965 0.15
966 0.16
967 0.16
968 0.16
969 0.18
970 0.19
971 0.26
972 0.29
973 0.29
974 0.33
975 0.35
976 0.37
977 0.36
978 0.33
979 0.24
980 0.21
981 0.21
982 0.14
983 0.13
984 0.12
985 0.12
986 0.1
987 0.11
988 0.15
989 0.15
990 0.14
991 0.13
992 0.13
993 0.13
994 0.14
995 0.16
996 0.16
997 0.15
998 0.15
999 0.16
1000 0.16
1001 0.17
1002 0.19
1003 0.2
1004 0.18
1005 0.19
1006 0.26
1007 0.26
1008 0.24
1009 0.24
1010 0.22
1011 0.23
1012 0.23
1013 0.24
1014 0.2
1015 0.22
1016 0.22
1017 0.24
1018 0.24
1019 0.22
1020 0.2
1021 0.22
1022 0.19
1023 0.18
1024 0.17
1025 0.15
1026 0.14
1027 0.16
1028 0.16
1029 0.15
1030 0.2
1031 0.2
1032 0.21
1033 0.23
1034 0.26
1035 0.3
1036 0.38
1037 0.37
1038 0.34
1039 0.36
1040 0.35
1041 0.33
1042 0.31
1043 0.32
1044 0.27
1045 0.29
1046 0.36
1047 0.39
1048 0.41
1049 0.49
1050 0.53
1051 0.51
1052 0.56
1053 0.6
1054 0.6
1055 0.62
1056 0.63
1057 0.58
1058 0.56
1059 0.5
1060 0.42
1061 0.34
1062 0.26
1063 0.2
1064 0.17
1065 0.14
1066 0.1
1067 0.11
1068 0.11
1069 0.09
1070 0.09
1071 0.11
1072 0.13
1073 0.21
1074 0.26
1075 0.35
1076 0.41
1077 0.51
1078 0.61
1079 0.68
1080 0.77
1081 0.77
1082 0.8
1083 0.8
1084 0.85
1085 0.84
1086 0.83
1087 0.77
1088 0.69
1089 0.71
1090 0.67
1091 0.62
1092 0.58
1093 0.55
1094 0.52
1095 0.58
1096 0.62
1097 0.55
1098 0.57
1099 0.6
1100 0.59
1101 0.63
1102 0.57
1103 0.49
1104 0.44
1105 0.42
1106 0.36
1107 0.31
1108 0.27
1109 0.17
1110 0.18
1111 0.19
1112 0.2
1113 0.26
1114 0.25
1115 0.25
1116 0.24
1117 0.32
1118 0.31
1119 0.3
1120 0.33
1121 0.27
1122 0.31
1123 0.3
1124 0.32
1125 0.24
1126 0.23
1127 0.22
1128 0.19
1129 0.23
1130 0.21
1131 0.28
1132 0.3
1133 0.36
1134 0.42
1135 0.45
1136 0.47
1137 0.47
1138 0.45
1139 0.41
1140 0.39
1141 0.33
1142 0.27
1143 0.23
1144 0.21
1145 0.18
1146 0.17
1147 0.13
1148 0.1
1149 0.11
1150 0.13
1151 0.14
1152 0.14
1153 0.18
1154 0.21
1155 0.2
1156 0.23
1157 0.26
1158 0.24
1159 0.24
1160 0.24
1161 0.2
1162 0.16
1163 0.2
1164 0.22
1165 0.2
1166 0.24
1167 0.24
1168 0.22
1169 0.29
1170 0.36
1171 0.38
1172 0.4
1173 0.44
1174 0.45
1175 0.46
1176 0.49
1177 0.43
1178 0.37
1179 0.31
1180 0.29
1181 0.26
1182 0.23
1183 0.26
1184 0.23
1185 0.25
1186 0.24
1187 0.27
1188 0.28
1189 0.25
1190 0.26
1191 0.29
1192 0.28
1193 0.29
1194 0.32
1195 0.3
1196 0.28
1197 0.33
1198 0.36
1199 0.38
1200 0.41
1201 0.41
1202 0.41
1203 0.41
1204 0.39
1205 0.38
1206 0.33
1207 0.26
1208 0.24
1209 0.23
1210 0.2
1211 0.22
1212 0.22