FuNGI

A0A484FGW4

Protein Details

Accession

A0A484FGW4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
273-292	NRLFERRREKGEQRRPQQPN	Basic
359-379	MAKDCRSPKRQQQGQRFQPVP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 10, mito 6, cyto 4, plas 2, pero 2, E.R. 1, golg 1, cysk 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR005162 Retrotrans_gag_dom IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR041373 RT_RNaseH IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0005739 C:mitochondrion GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF03732 Retrotrans_gag PF17917 RT_RNaseH PF00665 rve PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd09274 RNase_HI_RT_Ty3

Amino Acid Sequences

MSAKHQTPSTSSGSQGTPPKGKQPVKPLDQEMKDVEPSSDEEDDTAELVRQLQKTNRDMAKMQEIINSNAAERLLALQQEVNTLRTAANIIQTPVESREKLRLNSPQAFDGTPGYLKGFLTQVRAYHRFHNLSFKDEAEQVIHAASFLKGRALAWFEPHLTDFLTHDWNDLKLETQTIFAGYHGFESALISLFQEPDEQRQYERDLAALKQKGAATHYAAEFRRICARLDYTDDTKIFMFYQGLKEDVKDELVKQDRPSDFITYAELAIKIDNRLFERRREKGEQRRPQQPNSGRKYQGPPRNHWNQRNNWGTRQQFTPRQSTSHGYHSGPMDLTAGAAIKDNKRRDFKCYNCDKPGHMAKDCRSPKRQQQGQRFQPVPXXXERTRQVNIAKKEIPHASLTWTACFDDTCIVHQGSKDNAGWYPKKPSGRSGYDTTSCDTPPHTKKTLAVATVKKEEDFTPVPERDWAQENEVAILQLQAAERELHRRISQTPDGQLLQKIQHRIQQRINARGNLPLTRALAQQLEASNRMPTKTLAMVKHHKLERKVKEQLDDLYQQGHIEISPGIYLRTVEGESVEYGGGIIDLETVHLPLNYHGRKEDCIFDITEIGFTITPGVIKMSTKKIQAVKDWPTPTNVKEIQAFLGFANFYRRFLKDYAKKTIPLTELTRKDTKFDWTNRQEEAFQDIKNQVVSEPVLTIPDPDKPFEVETDASDYAIGGQLGQRDAKGVLHPCAFYSRKLSGPELNYQIHDKELMAIIEAFQEWRPQLSGTKYEVQVYTDHKNLAHFTTSKNLNKRQIRWSEFLSEFNFRIIYRKGTENGRADALSRRPDYDVPVPEETQVILKTDTDGNLVPAQKLLLIARRPWESISLDFIVKLPKSQEPLTGVHYDSVLVIVERLTKYAYFIPYKESSTAEDLAYVFLRTIVSQHGLPQEIVSDRDKLFTSKFWKSLISQLGAKHRLSTAFHPQTDGQTERINQILEIYLRCYVNYQQDNWVTLLPTAQFAYNSAKSLLPSKTSQTTQGGRQLRLQDLKSLLSLLFFLLYFLLLLKTTIH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.41
3	0.43
4	0.44
5	0.44
6	0.51
7	0.57
8	0.62
9	0.63
10	0.66
11	0.69
12	0.69
13	0.74
14	0.74
15	0.73
16	0.69
17	0.67
18	0.6
19	0.54
20	0.49
21	0.42
22	0.35
23	0.27
24	0.26
25	0.27
26	0.24
27	0.2
28	0.17
29	0.18
30	0.18
31	0.16
32	0.14
33	0.1
34	0.09
35	0.13
36	0.18
37	0.19
38	0.24
39	0.3
40	0.37
41	0.41
42	0.5
43	0.5
44	0.5
45	0.5
46	0.5
47	0.53
48	0.48
49	0.45
50	0.42
51	0.4
52	0.39
53	0.41
54	0.35
55	0.26
56	0.25
57	0.24
58	0.17
59	0.15
60	0.14
61	0.13
62	0.12
63	0.13
64	0.13
65	0.14
66	0.2
67	0.21
68	0.19
69	0.18
70	0.18
71	0.17
72	0.16
73	0.18
74	0.13
75	0.17
76	0.17
77	0.18
78	0.18
79	0.18
80	0.2
81	0.23
82	0.26
83	0.23
84	0.24
85	0.32
86	0.37
87	0.38
88	0.43
89	0.47
90	0.5
91	0.57
92	0.57
93	0.52
94	0.48
95	0.46
96	0.4
97	0.34
98	0.28
99	0.21
100	0.19
101	0.17
102	0.16
103	0.15
104	0.16
105	0.17
106	0.17
107	0.21
108	0.22
109	0.25
110	0.32
111	0.36
112	0.37
113	0.4
114	0.47
115	0.46
116	0.46
117	0.53
118	0.46
119	0.46
120	0.46
121	0.4
122	0.35
123	0.32
124	0.31
125	0.22
126	0.21
127	0.16
128	0.15
129	0.13
130	0.1
131	0.1
132	0.09
133	0.09
134	0.09
135	0.1
136	0.1
137	0.1
138	0.13
139	0.17
140	0.18
141	0.2
142	0.23
143	0.22
144	0.23
145	0.24
146	0.21
147	0.17
148	0.17
149	0.15
150	0.15
151	0.18
152	0.16
153	0.18
154	0.18
155	0.18
156	0.19
157	0.18
158	0.17
159	0.13
160	0.15
161	0.14
162	0.13
163	0.13
164	0.13
165	0.13
166	0.11
167	0.12
168	0.1
169	0.1
170	0.09
171	0.09
172	0.08
173	0.08
174	0.09
175	0.08
176	0.08
177	0.08
178	0.09
179	0.09
180	0.09
181	0.13
182	0.13
183	0.18
184	0.23
185	0.23
186	0.24
187	0.26
188	0.3
189	0.3
190	0.3
191	0.25
192	0.23
193	0.24
194	0.32
195	0.31
196	0.28
197	0.27
198	0.28
199	0.27
200	0.27
201	0.28
202	0.22
203	0.23
204	0.24
205	0.27
206	0.26
207	0.31
208	0.29
209	0.28
210	0.33
211	0.31
212	0.31
213	0.29
214	0.32
215	0.29
216	0.34
217	0.37
218	0.33
219	0.37
220	0.36
221	0.33
222	0.3
223	0.28
224	0.22
225	0.18
226	0.16
227	0.13
228	0.17
229	0.17
230	0.19
231	0.18
232	0.18
233	0.18
234	0.17
235	0.17
236	0.14
237	0.14
238	0.21
239	0.26
240	0.28
241	0.28
242	0.36
243	0.33
244	0.36
245	0.37
246	0.33
247	0.28
248	0.26
249	0.27
250	0.2
251	0.2
252	0.17
253	0.15
254	0.11
255	0.12
256	0.12
257	0.11
258	0.12
259	0.14
260	0.16
261	0.24
262	0.27
263	0.35
264	0.42
265	0.46
266	0.52
267	0.58
268	0.65
269	0.68
270	0.76
271	0.77
272	0.76
273	0.82
274	0.8
275	0.77
276	0.77
277	0.75
278	0.74
279	0.71
280	0.73
281	0.64
282	0.64
283	0.67
284	0.66
285	0.66
286	0.61
287	0.6
288	0.6
289	0.69
290	0.73
291	0.74
292	0.74
293	0.73
294	0.77
295	0.8
296	0.75
297	0.7
298	0.69
299	0.63
300	0.57
301	0.54
302	0.51
303	0.5
304	0.5
305	0.52
306	0.45
307	0.44
308	0.45
309	0.45
310	0.41
311	0.4
312	0.4
313	0.32
314	0.34
315	0.32
316	0.3
317	0.25
318	0.22
319	0.16
320	0.12
321	0.11
322	0.08
323	0.07
324	0.06
325	0.08
326	0.1
327	0.14
328	0.22
329	0.28
330	0.34
331	0.42
332	0.44
333	0.5
334	0.57
335	0.59
336	0.62
337	0.67
338	0.68
339	0.66
340	0.67
341	0.6
342	0.58
343	0.6
344	0.55
345	0.49
346	0.47
347	0.43
348	0.52
349	0.57
350	0.56
351	0.53
352	0.55
353	0.6
354	0.65
355	0.7
356	0.69
357	0.74
358	0.77
359	0.8
360	0.82
361	0.74
362	0.65
363	0.66
364	0.64
365	0.56
366	0.51
367	0.47
368	0.39
369	0.41
370	0.45
371	0.44
372	0.45
373	0.44
374	0.45
375	0.43
376	0.42
377	0.43
378	0.39
379	0.33
380	0.28
381	0.25
382	0.21
383	0.24
384	0.24
385	0.2
386	0.19
387	0.18
388	0.16
389	0.15
390	0.13
391	0.1
392	0.1
393	0.11
394	0.13
395	0.13
396	0.13
397	0.14
398	0.16
399	0.14
400	0.18
401	0.16
402	0.15
403	0.16
404	0.21
405	0.23
406	0.23
407	0.28
408	0.3
409	0.34
410	0.34
411	0.39
412	0.42
413	0.45
414	0.47
415	0.44
416	0.45
417	0.43
418	0.43
419	0.38
420	0.32
421	0.26
422	0.22
423	0.2
424	0.23
425	0.25
426	0.3
427	0.31
428	0.3
429	0.32
430	0.39
431	0.4
432	0.35
433	0.36
434	0.33
435	0.34
436	0.38
437	0.36
438	0.29
439	0.27
440	0.25
441	0.23
442	0.21
443	0.21
444	0.23
445	0.23
446	0.24
447	0.24
448	0.24
449	0.21
450	0.24
451	0.21
452	0.17
453	0.18
454	0.18
455	0.17
456	0.16
457	0.14
458	0.1
459	0.09
460	0.06
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.06
466	0.07
467	0.11
468	0.13
469	0.14
470	0.15
471	0.16
472	0.18
473	0.24
474	0.28
475	0.26
476	0.27
477	0.27
478	0.27
479	0.26
480	0.25
481	0.2
482	0.19
483	0.2
484	0.21
485	0.2
486	0.24
487	0.27
488	0.31
489	0.34
490	0.38
491	0.4
492	0.45
493	0.47
494	0.45
495	0.42
496	0.4
497	0.37
498	0.31
499	0.27
500	0.2
501	0.18
502	0.16
503	0.16
504	0.14
505	0.12
506	0.12
507	0.12
508	0.12
509	0.12
510	0.12
511	0.12
512	0.13
513	0.13
514	0.13
515	0.12
516	0.1
517	0.11
518	0.14
519	0.18
520	0.19
521	0.25
522	0.31
523	0.33
524	0.39
525	0.4
526	0.4
527	0.42
528	0.49
529	0.5
530	0.52
531	0.57
532	0.53
533	0.52
534	0.51
535	0.46
536	0.4
537	0.34
538	0.27
539	0.2
540	0.18
541	0.15
542	0.13
543	0.11
544	0.06
545	0.06
546	0.05
547	0.04
548	0.05
549	0.05
550	0.05
551	0.05
552	0.05
553	0.05
554	0.06
555	0.06
556	0.06
557	0.06
558	0.07
559	0.06
560	0.07
561	0.07
562	0.05
563	0.05
564	0.05
565	0.04
566	0.03
567	0.03
568	0.02
569	0.02
570	0.03
571	0.03
572	0.04
573	0.04
574	0.05
575	0.05
576	0.06
577	0.15
578	0.16
579	0.16
580	0.18
581	0.19
582	0.21
583	0.22
584	0.24
585	0.17
586	0.17
587	0.17
588	0.16
589	0.16
590	0.14
591	0.12
592	0.09
593	0.08
594	0.07
595	0.06
596	0.06
597	0.05
598	0.05
599	0.05
600	0.05
601	0.05
602	0.06
603	0.09
604	0.15
605	0.19
606	0.2
607	0.25
608	0.3
609	0.32
610	0.37
611	0.41
612	0.4
613	0.45
614	0.46
615	0.42
616	0.41
617	0.4
618	0.36
619	0.36
620	0.32
621	0.26
622	0.24
623	0.25
624	0.22
625	0.21
626	0.2
627	0.12
628	0.12
629	0.1
630	0.09
631	0.16
632	0.15
633	0.16
634	0.18
635	0.19
636	0.21
637	0.23
638	0.33
639	0.33
640	0.39
641	0.46
642	0.46
643	0.47
644	0.45
645	0.49
646	0.41
647	0.37
648	0.36
649	0.37
650	0.38
651	0.41
652	0.46
653	0.4
654	0.4
655	0.38
656	0.38
657	0.38
658	0.4
659	0.46
660	0.46
661	0.49
662	0.48
663	0.48
664	0.42
665	0.35
666	0.35
667	0.27
668	0.21
669	0.21
670	0.2
671	0.2
672	0.19
673	0.18
674	0.12
675	0.11
676	0.12
677	0.09
678	0.09
679	0.08
680	0.09
681	0.08
682	0.1
683	0.09
684	0.15
685	0.16
686	0.16
687	0.17
688	0.17
689	0.18
690	0.17
691	0.19
692	0.14
693	0.14
694	0.18
695	0.17
696	0.15
697	0.14
698	0.13
699	0.1
700	0.11
701	0.09
702	0.05
703	0.06
704	0.07
705	0.09
706	0.09
707	0.09
708	0.09
709	0.1
710	0.11
711	0.14
712	0.15
713	0.17
714	0.19
715	0.19
716	0.19
717	0.25
718	0.25
719	0.23
720	0.25
721	0.25
722	0.27
723	0.3
724	0.32
725	0.31
726	0.33
727	0.37
728	0.37
729	0.36
730	0.33
731	0.32
732	0.3
733	0.24
734	0.22
735	0.16
736	0.12
737	0.12
738	0.11
739	0.1
740	0.09
741	0.09
742	0.09
743	0.09
744	0.08
745	0.07
746	0.09
747	0.09
748	0.1
749	0.1
750	0.11
751	0.15
752	0.17
753	0.22
754	0.24
755	0.3
756	0.3
757	0.32
758	0.31
759	0.29
760	0.28
761	0.28
762	0.28
763	0.25
764	0.25
765	0.23
766	0.24
767	0.25
768	0.23
769	0.23
770	0.2
771	0.19
772	0.26
773	0.33
774	0.38
775	0.44
776	0.49
777	0.55
778	0.61
779	0.65
780	0.67
781	0.69
782	0.68
783	0.64
784	0.61
785	0.59
786	0.52
787	0.5
788	0.44
789	0.38
790	0.32
791	0.29
792	0.27
793	0.19
794	0.23
795	0.21
796	0.22
797	0.22
798	0.26
799	0.29
800	0.33
801	0.41
802	0.4
803	0.4
804	0.38
805	0.35
806	0.32
807	0.35
808	0.34
809	0.33
810	0.3
811	0.3
812	0.31
813	0.32
814	0.36
815	0.37
816	0.37
817	0.35
818	0.38
819	0.36
820	0.34
821	0.33
822	0.28
823	0.23
824	0.18
825	0.15
826	0.12
827	0.11
828	0.13
829	0.15
830	0.15
831	0.14
832	0.14
833	0.15
834	0.18
835	0.19
836	0.17
837	0.16
838	0.15
839	0.13
840	0.15
841	0.14
842	0.16
843	0.18
844	0.21
845	0.26
846	0.28
847	0.29
848	0.28
849	0.31
850	0.27
851	0.26
852	0.28
853	0.25
854	0.23
855	0.22
856	0.23
857	0.24
858	0.21
859	0.21
860	0.19
861	0.21
862	0.25
863	0.26
864	0.3
865	0.28
866	0.31
867	0.34
868	0.33
869	0.3
870	0.26
871	0.25
872	0.2
873	0.16
874	0.14
875	0.1
876	0.07
877	0.06
878	0.06
879	0.11
880	0.11
881	0.11
882	0.12
883	0.12
884	0.15
885	0.2
886	0.25
887	0.24
888	0.24
889	0.3
890	0.32
891	0.34
892	0.34
893	0.3
894	0.28
895	0.29
896	0.3
897	0.23
898	0.22
899	0.19
900	0.19
901	0.18
902	0.15
903	0.11
904	0.1
905	0.1
906	0.08
907	0.09
908	0.11
909	0.13
910	0.13
911	0.17
912	0.2
913	0.22
914	0.22
915	0.21
916	0.21
917	0.2
918	0.22
919	0.2
920	0.21
921	0.19
922	0.22
923	0.23
924	0.22
925	0.23
926	0.27
927	0.33
928	0.35
929	0.38
930	0.37
931	0.4
932	0.39
933	0.45
934	0.45
935	0.41
936	0.38
937	0.4
938	0.48
939	0.49
940	0.47
941	0.41
942	0.37
943	0.37
944	0.37
945	0.38
946	0.39
947	0.43
948	0.43
949	0.44
950	0.44
951	0.45
952	0.47
953	0.43
954	0.35
955	0.32
956	0.33
957	0.32
958	0.33
959	0.29
960	0.22
961	0.22
962	0.23
963	0.2
964	0.19
965	0.19
966	0.21
967	0.21
968	0.21
969	0.22
970	0.23
971	0.31
972	0.34
973	0.34
974	0.38
975	0.41
976	0.43
977	0.42
978	0.39
979	0.3
980	0.25
981	0.26
982	0.18
983	0.17
984	0.15
985	0.15
986	0.14
987	0.15
988	0.22
989	0.22
990	0.23
991	0.23
992	0.23
993	0.24
994	0.3
995	0.31
996	0.28
997	0.28
998	0.32
999	0.37
1000	0.38
1001	0.43
1002	0.44
1003	0.45
1004	0.47
1005	0.54
1006	0.55
1007	0.5
1008	0.55
1009	0.54
1010	0.55
1011	0.57
1012	0.52
1013	0.5
1014	0.46
1015	0.45
1016	0.39
1017	0.35
1018	0.27
1019	0.21
1020	0.2
1021	0.13
1022	0.12
1023	0.1
1024	0.09
1025	0.08
1026	0.08
1027	0.07
1028	0.07
1029	0.08
1030	0.07

A0A484FGW4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer