Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A484FXR6

Protein Details
Accession A0A484FXR6    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
289-309TTTTMGGRRKKRKGALTNPSAHydrophilic
372-397FLGSYTKPGKRTNKKNKAQTGLEQLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
296-301RRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MAKGKRFDKKNAQHFTLVHRPQNDPLIHDENAPSMVLNPVGPKKGGSSKGKHLSDLASELGSDAASIRENEGEAAEYGVYFDDTEYDYMQHLRDLNSGGGEAVWVEAESTANKGKGKQQQSLEDALRQMDLEHQSEALLDESVLPSKNLQKATYQSQQDVPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVDEDDDIFQQLAKDSEVDQYEFEDQFDYDDEDDGWESDATAKPNKEYRGEAVPQLVPTGGEALPEHQNEDWLEDFKQFKKDQKGDKPQDKATPSEMQQSIWTTTTMGGRRKKRKGALTNPSAYSMTSSSMVRTEQLTLLDARFDRIEEEYTNEMGDDMASVSEVSTMSSVTGPTRGDFDSIMDDFLGSYTKPGKRTNKKNKAQTGLEQLDEIRQGLGPARFRTKSTAKSTAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.69
3 0.68
4 0.65
5 0.61
6 0.55
7 0.54
8 0.52
9 0.58
10 0.51
11 0.42
12 0.43
13 0.42
14 0.39
15 0.38
16 0.34
17 0.27
18 0.27
19 0.24
20 0.17
21 0.12
22 0.12
23 0.11
24 0.11
25 0.15
26 0.18
27 0.21
28 0.21
29 0.21
30 0.25
31 0.32
32 0.4
33 0.43
34 0.46
35 0.54
36 0.63
37 0.64
38 0.6
39 0.54
40 0.48
41 0.42
42 0.38
43 0.29
44 0.19
45 0.18
46 0.16
47 0.14
48 0.11
49 0.08
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.09
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.1
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.05
69 0.06
70 0.07
71 0.08
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.12
76 0.12
77 0.13
78 0.14
79 0.14
80 0.15
81 0.17
82 0.16
83 0.15
84 0.15
85 0.13
86 0.1
87 0.09
88 0.07
89 0.05
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.05
96 0.08
97 0.1
98 0.12
99 0.13
100 0.15
101 0.23
102 0.32
103 0.37
104 0.42
105 0.44
106 0.49
107 0.52
108 0.56
109 0.49
110 0.43
111 0.38
112 0.31
113 0.26
114 0.19
115 0.16
116 0.15
117 0.16
118 0.15
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.1
125 0.07
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.08
133 0.14
134 0.18
135 0.2
136 0.2
137 0.22
138 0.26
139 0.33
140 0.38
141 0.35
142 0.33
143 0.35
144 0.36
145 0.33
146 0.3
147 0.23
148 0.18
149 0.16
150 0.14
151 0.11
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.13
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.11
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.08
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.07
212 0.08
213 0.1
214 0.13
215 0.14
216 0.15
217 0.2
218 0.22
219 0.23
220 0.23
221 0.24
222 0.27
223 0.28
224 0.27
225 0.25
226 0.24
227 0.21
228 0.2
229 0.17
230 0.1
231 0.09
232 0.1
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.09
237 0.13
238 0.13
239 0.14
240 0.12
241 0.14
242 0.13
243 0.15
244 0.14
245 0.11
246 0.12
247 0.14
248 0.17
249 0.17
250 0.24
251 0.24
252 0.3
253 0.38
254 0.45
255 0.52
256 0.6
257 0.69
258 0.72
259 0.78
260 0.77
261 0.72
262 0.72
263 0.64
264 0.56
265 0.49
266 0.45
267 0.38
268 0.41
269 0.37
270 0.3
271 0.3
272 0.3
273 0.27
274 0.22
275 0.21
276 0.13
277 0.14
278 0.19
279 0.22
280 0.27
281 0.34
282 0.43
283 0.53
284 0.6
285 0.67
286 0.7
287 0.75
288 0.78
289 0.81
290 0.81
291 0.8
292 0.77
293 0.7
294 0.65
295 0.55
296 0.44
297 0.35
298 0.26
299 0.19
300 0.15
301 0.14
302 0.12
303 0.13
304 0.14
305 0.13
306 0.13
307 0.13
308 0.13
309 0.14
310 0.14
311 0.14
312 0.14
313 0.16
314 0.15
315 0.15
316 0.14
317 0.13
318 0.13
319 0.14
320 0.16
321 0.13
322 0.18
323 0.18
324 0.18
325 0.18
326 0.16
327 0.15
328 0.12
329 0.11
330 0.07
331 0.05
332 0.04
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.11
346 0.12
347 0.12
348 0.15
349 0.15
350 0.16
351 0.15
352 0.16
353 0.18
354 0.18
355 0.18
356 0.14
357 0.14
358 0.12
359 0.12
360 0.12
361 0.07
362 0.09
363 0.16
364 0.21
365 0.26
366 0.35
367 0.46
368 0.55
369 0.67
370 0.76
371 0.79
372 0.85
373 0.91
374 0.92
375 0.89
376 0.85
377 0.81
378 0.8
379 0.73
380 0.64
381 0.54
382 0.45
383 0.39
384 0.34
385 0.27
386 0.17
387 0.13
388 0.13
389 0.18
390 0.22
391 0.25
392 0.3
393 0.37
394 0.38
395 0.4
396 0.48
397 0.51
398 0.55
399 0.57