Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N4VID0

Protein Details
Accession N4VID0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-106HSSPLPKPHLRRRRHPSALTRTQPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
91-96HLRRRR
314-326RRRSRKVSSARKK
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 8, cyto_nucl 8, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034751  Yippee  
IPR004910  Yippee/Mis18/Cereblon  
IPR039058  Yippee_fam  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03226  Yippee-Mis18  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51792  YIPPEE  
Amino Acid Sequences MAPNIIVSRPIFPTYLLPSLNLPFRRRRSSSSSSPQTPPESQVPSLSSSPTSSTTAETQSESPTTPPASPHLSQQQQPPPPPHSSPLPKPHLRRRRHPSALTRTQPDTLRCSTCSADIALASQIVSKGFTGRYGRAYLVAATSLPPTSPTLVYANSSAGPGVLANVRVGRCENRQLVTGWHVVADITCLLCSAKLGWKYVDAKELSQKYKVGKFILEVERVVPFRSWEDGADGEEFGVDVSDGEAQRDEVEGGEQEQQPIADEAGDGTVEEQGDEESGKKTAAYQEPEVVFDSEDEDDLEDLFSGTWDPEVVARRRSRKVSSARKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.31
3 0.28
4 0.26
5 0.27
6 0.3
7 0.37
8 0.38
9 0.37
10 0.42
11 0.49
12 0.57
13 0.59
14 0.62
15 0.63
16 0.65
17 0.71
18 0.72
19 0.73
20 0.7
21 0.7
22 0.68
23 0.65
24 0.59
25 0.54
26 0.49
27 0.45
28 0.4
29 0.39
30 0.36
31 0.34
32 0.33
33 0.29
34 0.24
35 0.2
36 0.22
37 0.21
38 0.22
39 0.19
40 0.2
41 0.21
42 0.23
43 0.23
44 0.23
45 0.21
46 0.21
47 0.22
48 0.2
49 0.18
50 0.18
51 0.19
52 0.18
53 0.18
54 0.19
55 0.24
56 0.24
57 0.29
58 0.35
59 0.37
60 0.39
61 0.47
62 0.51
63 0.52
64 0.56
65 0.56
66 0.51
67 0.52
68 0.51
69 0.46
70 0.46
71 0.48
72 0.51
73 0.55
74 0.59
75 0.61
76 0.67
77 0.74
78 0.75
79 0.75
80 0.77
81 0.77
82 0.79
83 0.81
84 0.81
85 0.8
86 0.81
87 0.83
88 0.78
89 0.73
90 0.65
91 0.6
92 0.56
93 0.48
94 0.43
95 0.37
96 0.34
97 0.31
98 0.31
99 0.28
100 0.25
101 0.24
102 0.19
103 0.15
104 0.12
105 0.12
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.07
115 0.07
116 0.11
117 0.13
118 0.14
119 0.17
120 0.18
121 0.18
122 0.18
123 0.18
124 0.14
125 0.12
126 0.11
127 0.08
128 0.07
129 0.08
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.1
138 0.11
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.1
144 0.08
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.05
151 0.05
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.09
156 0.11
157 0.13
158 0.18
159 0.2
160 0.19
161 0.21
162 0.21
163 0.21
164 0.22
165 0.21
166 0.15
167 0.13
168 0.12
169 0.1
170 0.09
171 0.08
172 0.06
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.1
181 0.12
182 0.14
183 0.14
184 0.18
185 0.22
186 0.23
187 0.27
188 0.23
189 0.23
190 0.29
191 0.34
192 0.32
193 0.31
194 0.33
195 0.31
196 0.35
197 0.36
198 0.3
199 0.26
200 0.25
201 0.3
202 0.33
203 0.3
204 0.26
205 0.24
206 0.25
207 0.25
208 0.25
209 0.17
210 0.13
211 0.13
212 0.15
213 0.15
214 0.12
215 0.14
216 0.14
217 0.15
218 0.15
219 0.13
220 0.1
221 0.09
222 0.08
223 0.06
224 0.05
225 0.04
226 0.03
227 0.03
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.09
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.14
245 0.14
246 0.14
247 0.13
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.05
254 0.05
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.11
268 0.18
269 0.25
270 0.29
271 0.31
272 0.37
273 0.37
274 0.39
275 0.39
276 0.32
277 0.25
278 0.2
279 0.2
280 0.13
281 0.13
282 0.12
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.1
297 0.18
298 0.22
299 0.3
300 0.38
301 0.46
302 0.54
303 0.6
304 0.63
305 0.65
306 0.72