Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A484FY91

Protein Details
Accession A0A484FY91    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
598-626PAVSDKPEETRHKRTRRGRGGGKGGTNKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
207-260EKKANKAKEAAAAKSAKQARQEGTKGKGSASTAEESKKGKKDSRAEKSVDRPKE
383-393GRTRRGGGGKG
423-439KKKDEEKSREKPEKADK
607-621TRHKRTRRGRGGGKG
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF03467  Smg4_UPF3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MATSSTQSTSRKTNGALPVSSQQAATEAPKSNKSRTPVEGDKVVIRRLPPGLTEQELWAILGDEWKAGQGLVSWHNFESGKISHDPAKTSRPARVYLHVLKRESIFNLSNLIQARSWEDAKMTSNNPCLAGPPVLEAATYPKIPSGKKRTDPRQGTIDQDAEFMAFLQEMTDPGHSKEADPSDSKESEESKPEAKVTTTPLIEYLKEKKANKAKEAAAAKSAKQARQEGTKGKGSASTAEESKKGKKDSRAEKSVDRPKETVKILTKKASAEAAKAAETVAAQIAQSSAVAQEAPKSRRAGIAAAARMLQRDLGISPGSAHRRARLDAAKAEADSKPTPSKEPAAHAPEATAAIAPVAAPAQSSSNASQNSDRNASSAASKSGRTRRGGGGKGSASDVKGKSAEAGNSSNAPTPAKAPVVLLKKKDEEKSREKPEKADKVEKEPAASASQSAQARSNPPTAPKASGKSNNAKKGGGSGTVTVGATRGFVKHANPSQGVTEALLKQAMEAFGTVTFVEIDKRKGFAYVDFSDHDGLVKAVAASPVTVAQGTVQVLERKEKKPAASTANSSNANAGSSSSNAVAASSASASKDKDKEAAPAVSDKPEETRHKRTRRGRGGGKGGTNKDAQQSSASAEKTASTG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.5
3 0.47
4 0.44
5 0.44
6 0.44
7 0.42
8 0.34
9 0.26
10 0.22
11 0.23
12 0.21
13 0.22
14 0.25
15 0.28
16 0.37
17 0.42
18 0.47
19 0.51
20 0.53
21 0.54
22 0.53
23 0.58
24 0.57
25 0.58
26 0.56
27 0.53
28 0.55
29 0.51
30 0.49
31 0.43
32 0.36
33 0.35
34 0.33
35 0.32
36 0.26
37 0.29
38 0.3
39 0.31
40 0.31
41 0.28
42 0.27
43 0.26
44 0.24
45 0.18
46 0.15
47 0.11
48 0.12
49 0.11
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.11
58 0.16
59 0.19
60 0.21
61 0.21
62 0.24
63 0.24
64 0.22
65 0.23
66 0.19
67 0.21
68 0.22
69 0.24
70 0.28
71 0.3
72 0.34
73 0.33
74 0.39
75 0.43
76 0.43
77 0.47
78 0.44
79 0.47
80 0.47
81 0.49
82 0.5
83 0.52
84 0.58
85 0.59
86 0.56
87 0.54
88 0.52
89 0.49
90 0.42
91 0.38
92 0.3
93 0.24
94 0.27
95 0.25
96 0.27
97 0.25
98 0.25
99 0.19
100 0.19
101 0.21
102 0.21
103 0.21
104 0.18
105 0.18
106 0.18
107 0.21
108 0.25
109 0.24
110 0.26
111 0.29
112 0.3
113 0.3
114 0.28
115 0.26
116 0.24
117 0.23
118 0.18
119 0.16
120 0.15
121 0.14
122 0.14
123 0.12
124 0.15
125 0.16
126 0.16
127 0.14
128 0.16
129 0.2
130 0.22
131 0.32
132 0.37
133 0.43
134 0.52
135 0.62
136 0.69
137 0.76
138 0.8
139 0.75
140 0.73
141 0.66
142 0.62
143 0.56
144 0.49
145 0.39
146 0.33
147 0.28
148 0.2
149 0.17
150 0.13
151 0.08
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.07
158 0.09
159 0.09
160 0.11
161 0.15
162 0.15
163 0.15
164 0.2
165 0.21
166 0.23
167 0.24
168 0.26
169 0.28
170 0.29
171 0.29
172 0.26
173 0.27
174 0.26
175 0.28
176 0.27
177 0.24
178 0.25
179 0.25
180 0.24
181 0.21
182 0.21
183 0.22
184 0.24
185 0.22
186 0.21
187 0.22
188 0.23
189 0.23
190 0.24
191 0.25
192 0.27
193 0.33
194 0.35
195 0.41
196 0.48
197 0.53
198 0.53
199 0.54
200 0.49
201 0.5
202 0.52
203 0.45
204 0.42
205 0.38
206 0.34
207 0.35
208 0.37
209 0.32
210 0.32
211 0.35
212 0.32
213 0.37
214 0.41
215 0.39
216 0.4
217 0.43
218 0.39
219 0.35
220 0.35
221 0.28
222 0.27
223 0.24
224 0.21
225 0.18
226 0.19
227 0.22
228 0.22
229 0.28
230 0.3
231 0.32
232 0.35
233 0.41
234 0.49
235 0.57
236 0.63
237 0.64
238 0.62
239 0.63
240 0.67
241 0.68
242 0.64
243 0.57
244 0.5
245 0.46
246 0.48
247 0.44
248 0.41
249 0.4
250 0.42
251 0.42
252 0.45
253 0.44
254 0.38
255 0.38
256 0.36
257 0.29
258 0.23
259 0.22
260 0.18
261 0.17
262 0.16
263 0.14
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.03
276 0.03
277 0.04
278 0.04
279 0.08
280 0.14
281 0.16
282 0.2
283 0.21
284 0.21
285 0.23
286 0.25
287 0.21
288 0.2
289 0.23
290 0.19
291 0.19
292 0.19
293 0.18
294 0.17
295 0.16
296 0.11
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.07
304 0.11
305 0.14
306 0.16
307 0.17
308 0.18
309 0.2
310 0.21
311 0.26
312 0.25
313 0.26
314 0.24
315 0.26
316 0.24
317 0.22
318 0.23
319 0.18
320 0.18
321 0.15
322 0.16
323 0.17
324 0.17
325 0.19
326 0.19
327 0.23
328 0.21
329 0.25
330 0.28
331 0.3
332 0.3
333 0.27
334 0.26
335 0.22
336 0.2
337 0.17
338 0.1
339 0.05
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.05
349 0.05
350 0.07
351 0.08
352 0.13
353 0.14
354 0.15
355 0.19
356 0.2
357 0.23
358 0.23
359 0.22
360 0.18
361 0.19
362 0.18
363 0.16
364 0.15
365 0.15
366 0.14
367 0.16
368 0.22
369 0.28
370 0.33
371 0.33
372 0.35
373 0.39
374 0.45
375 0.47
376 0.42
377 0.4
378 0.36
379 0.34
380 0.32
381 0.27
382 0.2
383 0.22
384 0.2
385 0.17
386 0.16
387 0.16
388 0.16
389 0.17
390 0.17
391 0.14
392 0.16
393 0.15
394 0.16
395 0.17
396 0.17
397 0.16
398 0.16
399 0.13
400 0.13
401 0.15
402 0.14
403 0.13
404 0.12
405 0.18
406 0.26
407 0.3
408 0.31
409 0.32
410 0.36
411 0.41
412 0.47
413 0.49
414 0.48
415 0.54
416 0.61
417 0.67
418 0.72
419 0.68
420 0.69
421 0.7
422 0.72
423 0.7
424 0.7
425 0.62
426 0.61
427 0.67
428 0.6
429 0.52
430 0.43
431 0.38
432 0.3
433 0.27
434 0.2
435 0.14
436 0.19
437 0.18
438 0.18
439 0.19
440 0.19
441 0.22
442 0.25
443 0.28
444 0.24
445 0.27
446 0.31
447 0.31
448 0.34
449 0.35
450 0.35
451 0.38
452 0.44
453 0.48
454 0.53
455 0.59
456 0.62
457 0.6
458 0.57
459 0.49
460 0.47
461 0.42
462 0.35
463 0.27
464 0.2
465 0.19
466 0.2
467 0.19
468 0.14
469 0.12
470 0.09
471 0.09
472 0.09
473 0.08
474 0.08
475 0.1
476 0.12
477 0.21
478 0.26
479 0.3
480 0.3
481 0.31
482 0.31
483 0.3
484 0.29
485 0.21
486 0.2
487 0.16
488 0.15
489 0.15
490 0.13
491 0.12
492 0.13
493 0.13
494 0.09
495 0.08
496 0.08
497 0.07
498 0.08
499 0.08
500 0.06
501 0.07
502 0.07
503 0.11
504 0.12
505 0.17
506 0.18
507 0.19
508 0.19
509 0.21
510 0.22
511 0.21
512 0.27
513 0.25
514 0.27
515 0.26
516 0.28
517 0.27
518 0.25
519 0.22
520 0.15
521 0.12
522 0.09
523 0.09
524 0.07
525 0.07
526 0.08
527 0.08
528 0.07
529 0.08
530 0.09
531 0.09
532 0.08
533 0.07
534 0.07
535 0.1
536 0.1
537 0.11
538 0.13
539 0.16
540 0.18
541 0.27
542 0.33
543 0.32
544 0.4
545 0.44
546 0.44
547 0.48
548 0.53
549 0.53
550 0.53
551 0.55
552 0.54
553 0.57
554 0.54
555 0.48
556 0.42
557 0.34
558 0.29
559 0.24
560 0.19
561 0.13
562 0.13
563 0.14
564 0.12
565 0.13
566 0.12
567 0.12
568 0.1
569 0.09
570 0.09
571 0.08
572 0.09
573 0.1
574 0.12
575 0.14
576 0.21
577 0.25
578 0.26
579 0.29
580 0.3
581 0.34
582 0.38
583 0.39
584 0.34
585 0.36
586 0.36
587 0.36
588 0.35
589 0.31
590 0.29
591 0.35
592 0.43
593 0.45
594 0.54
595 0.6
596 0.69
597 0.79
598 0.84
599 0.87
600 0.88
601 0.9
602 0.89
603 0.89
604 0.89
605 0.86
606 0.84
607 0.82
608 0.75
609 0.68
610 0.62
611 0.54
612 0.51
613 0.45
614 0.38
615 0.32
616 0.29
617 0.29
618 0.32
619 0.3
620 0.24
621 0.23