Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JCW3

Protein Details
Accession S2JCW3    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
401-421IQPKHVKKGRKPLPKPLPKIQBasic
504-531DIHFSRMKASKKKKKDKKKGHVDDIRSTBasic
1031-1066EEKNARMKKRIQDQLAKLKRNAERRRQRQLAKQAALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
404-416KHVKKGRKPLPKP
510-523MKASKKKKKDKKKG
1038-1040KKR
1045-1058LAKLKRNAERRRQR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040240  TAF1  
IPR022591  TAF1_HAT_dom  
IPR009067  TAF_II_230-bd  
IPR036741  TAFII-230_TBP-bd_sf  
IPR041670  Znf-CCHC_6  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0004402  F:histone acetyltransferase activity  
GO:0001091  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor binding  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF12157  DUF3591  
PF09247  TBP-binding  
PF15288  zf-CCHC_6  
Amino Acid Sequences MSLAGYFFGNVDEQGRLESDLDDDLKETLSSVDANVFTRIFSNEDTFGLENARRKQPGDGDSDEDDEDDEDTSARIPVIPTVHAKDAVDYSDFDDAVPDDLSEKYYRRGMGMVQKNMPKSRLALVTDNYDDSEEEDETESKPVQQQQQQQPAMATSADTAQSMLSTETATSSSMAEGDNKASKDIDIKQLYPGFERDKILKFSELFMAKIKRPPKLVPHKRVVYGDGYEYEVERDERAAFLRASKLDRFRIEQAKQPVKKRRLEVSHEDSASSSNESEDDEYMEELAERGYTTEPPKEILESEKLYHSIMLDTWEDDIIWDDKDVDNQDQQMIVSTDKEQDNDKVVVKHLNMQLEEGDWLDAIIWDKEKPSPDTMKISLDLNDPNMLFDVEEVEATKELLIQPKHVKKGRKPLPKPLPKIQIFHTDTEPHNKLPLNRFNLSNDKHYESHLAGRLIRVRQTFGQLVVQHALPALKLHPQLYKTKLSKQELRSFHRPLMQIPPNTDIHFSRMKASKKKKKDKKKGHVDDIRSTKDLTLKDSSQFVLMEYSEEHPPIISNIGMGTLIINYYRKTEPKDEFVPNADIGEPFVLDIGDTSPFMTFGNVEPGQTISVYYNNLIRAPLFRHDVRHTDFLLLKSTYKDHTKYYLREIPAIFTIGQSYPVQEVPGPHSRKVTTTIKNRLQVVAYRLIKRNVLHRLKMGKLAQKFPEYSDIQIRQRLKEFLEFHRRSKDGGGGYWKTRGGGDPPTEEDLRKMVTPEMVCLYESMLVGERHLQDLGYGDVNDDDETGEGDSKLEVEQQLAPWFSTRNFINATQGKAMLKLYGAGDPTGRGEGFSFIRVSMKDIFLRAGESAEEKLAQIEARPKSAHRYNVAEQQQIYREEIARIWKAQLDSLGNKVEPVLSDHEGEDDEDREDQVDSPSASEFDWGHHRNSRGMSPSPATPSYGGRSRYDRAISEIDDDDVSVTGSMSSNYHVNSQNKYLVIKRLITQKNGEKIWQQEVVRDPVVMKSYLRQRQMIEEEATSAEALEPTDDEEKNARMKKRIQDQLAKLKRNAERRRQRQLAKQAALAENPVLGLIRGKREGAMRRCGNCGQLGHMKTNKNCPKFYLNNVDNATATAAAGGGAEGSTPSNLPEPGTPSGDLNI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.13
4 0.13
5 0.13
6 0.13
7 0.15
8 0.16
9 0.15
10 0.15
11 0.14
12 0.14
13 0.13
14 0.12
15 0.09
16 0.1
17 0.1
18 0.1
19 0.13
20 0.14
21 0.15
22 0.17
23 0.17
24 0.16
25 0.17
26 0.18
27 0.17
28 0.18
29 0.2
30 0.19
31 0.2
32 0.23
33 0.22
34 0.21
35 0.23
36 0.24
37 0.28
38 0.33
39 0.4
40 0.39
41 0.4
42 0.45
43 0.49
44 0.51
45 0.51
46 0.48
47 0.46
48 0.46
49 0.47
50 0.41
51 0.33
52 0.27
53 0.2
54 0.17
55 0.12
56 0.1
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.12
65 0.14
66 0.17
67 0.22
68 0.26
69 0.29
70 0.29
71 0.29
72 0.28
73 0.27
74 0.26
75 0.22
76 0.19
77 0.18
78 0.19
79 0.19
80 0.16
81 0.15
82 0.14
83 0.14
84 0.13
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.13
89 0.15
90 0.16
91 0.18
92 0.22
93 0.23
94 0.23
95 0.24
96 0.28
97 0.35
98 0.42
99 0.46
100 0.48
101 0.52
102 0.57
103 0.6
104 0.55
105 0.47
106 0.4
107 0.39
108 0.39
109 0.38
110 0.37
111 0.36
112 0.4
113 0.4
114 0.38
115 0.33
116 0.27
117 0.23
118 0.19
119 0.19
120 0.13
121 0.13
122 0.14
123 0.14
124 0.14
125 0.17
126 0.16
127 0.15
128 0.19
129 0.24
130 0.3
131 0.37
132 0.46
133 0.54
134 0.64
135 0.63
136 0.6
137 0.55
138 0.48
139 0.42
140 0.31
141 0.22
142 0.12
143 0.13
144 0.12
145 0.11
146 0.1
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.11
163 0.11
164 0.15
165 0.19
166 0.19
167 0.2
168 0.19
169 0.19
170 0.22
171 0.25
172 0.31
173 0.3
174 0.3
175 0.35
176 0.39
177 0.39
178 0.36
179 0.37
180 0.32
181 0.32
182 0.34
183 0.32
184 0.34
185 0.36
186 0.37
187 0.36
188 0.32
189 0.31
190 0.35
191 0.32
192 0.28
193 0.3
194 0.33
195 0.32
196 0.38
197 0.4
198 0.38
199 0.42
200 0.46
201 0.51
202 0.57
203 0.65
204 0.68
205 0.73
206 0.73
207 0.73
208 0.7
209 0.62
210 0.55
211 0.46
212 0.39
213 0.3
214 0.26
215 0.22
216 0.2
217 0.18
218 0.15
219 0.14
220 0.12
221 0.12
222 0.1
223 0.11
224 0.12
225 0.15
226 0.13
227 0.15
228 0.19
229 0.21
230 0.25
231 0.29
232 0.33
233 0.36
234 0.39
235 0.42
236 0.45
237 0.51
238 0.49
239 0.51
240 0.56
241 0.6
242 0.63
243 0.68
244 0.71
245 0.7
246 0.75
247 0.73
248 0.73
249 0.71
250 0.72
251 0.72
252 0.69
253 0.68
254 0.61
255 0.56
256 0.46
257 0.39
258 0.32
259 0.24
260 0.17
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.12
265 0.11
266 0.11
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.08
272 0.07
273 0.06
274 0.05
275 0.04
276 0.05
277 0.06
278 0.1
279 0.13
280 0.16
281 0.17
282 0.19
283 0.2
284 0.2
285 0.2
286 0.2
287 0.23
288 0.22
289 0.23
290 0.23
291 0.23
292 0.22
293 0.21
294 0.18
295 0.13
296 0.11
297 0.12
298 0.11
299 0.1
300 0.11
301 0.1
302 0.09
303 0.09
304 0.1
305 0.09
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.09
310 0.12
311 0.14
312 0.14
313 0.15
314 0.15
315 0.16
316 0.15
317 0.15
318 0.14
319 0.13
320 0.11
321 0.1
322 0.11
323 0.15
324 0.16
325 0.17
326 0.17
327 0.18
328 0.21
329 0.23
330 0.24
331 0.21
332 0.22
333 0.25
334 0.24
335 0.29
336 0.28
337 0.29
338 0.26
339 0.26
340 0.24
341 0.2
342 0.2
343 0.13
344 0.1
345 0.06
346 0.06
347 0.05
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.09
354 0.12
355 0.15
356 0.17
357 0.21
358 0.25
359 0.28
360 0.33
361 0.34
362 0.33
363 0.31
364 0.29
365 0.26
366 0.23
367 0.21
368 0.17
369 0.17
370 0.15
371 0.14
372 0.13
373 0.11
374 0.09
375 0.08
376 0.08
377 0.06
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.06
385 0.07
386 0.13
387 0.13
388 0.17
389 0.26
390 0.32
391 0.4
392 0.44
393 0.51
394 0.52
395 0.63
396 0.68
397 0.71
398 0.7
399 0.73
400 0.79
401 0.81
402 0.81
403 0.78
404 0.79
405 0.71
406 0.68
407 0.6
408 0.6
409 0.53
410 0.48
411 0.42
412 0.36
413 0.34
414 0.39
415 0.38
416 0.28
417 0.28
418 0.28
419 0.3
420 0.34
421 0.4
422 0.39
423 0.39
424 0.4
425 0.41
426 0.47
427 0.45
428 0.42
429 0.38
430 0.36
431 0.34
432 0.34
433 0.33
434 0.26
435 0.28
436 0.26
437 0.24
438 0.21
439 0.22
440 0.26
441 0.24
442 0.27
443 0.23
444 0.22
445 0.21
446 0.25
447 0.23
448 0.2
449 0.23
450 0.19
451 0.2
452 0.19
453 0.17
454 0.13
455 0.13
456 0.12
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.09
461 0.11
462 0.13
463 0.15
464 0.18
465 0.23
466 0.27
467 0.35
468 0.33
469 0.39
470 0.46
471 0.49
472 0.54
473 0.56
474 0.61
475 0.59
476 0.64
477 0.64
478 0.59
479 0.56
480 0.53
481 0.47
482 0.4
483 0.42
484 0.4
485 0.35
486 0.34
487 0.35
488 0.31
489 0.31
490 0.31
491 0.22
492 0.2
493 0.21
494 0.2
495 0.22
496 0.27
497 0.32
498 0.4
499 0.51
500 0.57
501 0.64
502 0.75
503 0.8
504 0.85
505 0.9
506 0.92
507 0.92
508 0.94
509 0.92
510 0.91
511 0.89
512 0.82
513 0.79
514 0.74
515 0.66
516 0.55
517 0.46
518 0.37
519 0.33
520 0.29
521 0.25
522 0.22
523 0.2
524 0.21
525 0.22
526 0.21
527 0.17
528 0.17
529 0.13
530 0.1
531 0.09
532 0.08
533 0.08
534 0.1
535 0.09
536 0.09
537 0.09
538 0.07
539 0.08
540 0.07
541 0.07
542 0.05
543 0.04
544 0.04
545 0.05
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.03
550 0.03
551 0.04
552 0.05
553 0.05
554 0.08
555 0.1
556 0.12
557 0.15
558 0.22
559 0.24
560 0.28
561 0.33
562 0.32
563 0.32
564 0.33
565 0.31
566 0.25
567 0.23
568 0.18
569 0.12
570 0.1
571 0.09
572 0.06
573 0.04
574 0.04
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.04
579 0.04
580 0.04
581 0.05
582 0.04
583 0.05
584 0.05
585 0.05
586 0.05
587 0.05
588 0.12
589 0.11
590 0.11
591 0.11
592 0.12
593 0.12
594 0.11
595 0.11
596 0.05
597 0.07
598 0.07
599 0.08
600 0.09
601 0.1
602 0.1
603 0.1
604 0.09
605 0.1
606 0.11
607 0.14
608 0.16
609 0.16
610 0.2
611 0.23
612 0.27
613 0.29
614 0.3
615 0.28
616 0.27
617 0.28
618 0.25
619 0.26
620 0.21
621 0.18
622 0.16
623 0.17
624 0.18
625 0.2
626 0.2
627 0.19
628 0.26
629 0.3
630 0.32
631 0.38
632 0.41
633 0.38
634 0.4
635 0.38
636 0.32
637 0.27
638 0.26
639 0.19
640 0.13
641 0.13
642 0.09
643 0.11
644 0.1
645 0.1
646 0.1
647 0.1
648 0.1
649 0.09
650 0.1
651 0.14
652 0.22
653 0.24
654 0.24
655 0.27
656 0.27
657 0.28
658 0.33
659 0.36
660 0.36
661 0.42
662 0.5
663 0.54
664 0.57
665 0.57
666 0.52
667 0.45
668 0.4
669 0.35
670 0.34
671 0.32
672 0.32
673 0.34
674 0.34
675 0.36
676 0.34
677 0.37
678 0.38
679 0.4
680 0.38
681 0.4
682 0.44
683 0.42
684 0.48
685 0.45
686 0.41
687 0.39
688 0.43
689 0.41
690 0.39
691 0.38
692 0.33
693 0.36
694 0.3
695 0.29
696 0.31
697 0.32
698 0.31
699 0.37
700 0.37
701 0.33
702 0.35
703 0.35
704 0.29
705 0.32
706 0.33
707 0.35
708 0.44
709 0.44
710 0.44
711 0.5
712 0.48
713 0.42
714 0.4
715 0.37
716 0.27
717 0.28
718 0.32
719 0.28
720 0.29
721 0.31
722 0.29
723 0.24
724 0.23
725 0.21
726 0.17
727 0.2
728 0.21
729 0.2
730 0.23
731 0.26
732 0.26
733 0.25
734 0.23
735 0.18
736 0.17
737 0.15
738 0.14
739 0.11
740 0.14
741 0.14
742 0.15
743 0.16
744 0.15
745 0.14
746 0.13
747 0.13
748 0.11
749 0.11
750 0.1
751 0.11
752 0.1
753 0.1
754 0.14
755 0.14
756 0.13
757 0.13
758 0.12
759 0.1
760 0.11
761 0.12
762 0.09
763 0.08
764 0.08
765 0.08
766 0.09
767 0.08
768 0.07
769 0.06
770 0.05
771 0.05
772 0.06
773 0.06
774 0.06
775 0.06
776 0.06
777 0.06
778 0.06
779 0.07
780 0.07
781 0.08
782 0.09
783 0.11
784 0.13
785 0.14
786 0.14
787 0.13
788 0.14
789 0.13
790 0.16
791 0.15
792 0.15
793 0.18
794 0.18
795 0.26
796 0.28
797 0.3
798 0.27
799 0.29
800 0.26
801 0.24
802 0.24
803 0.16
804 0.13
805 0.12
806 0.11
807 0.11
808 0.12
809 0.11
810 0.11
811 0.11
812 0.12
813 0.12
814 0.11
815 0.09
816 0.09
817 0.11
818 0.12
819 0.13
820 0.12
821 0.11
822 0.14
823 0.14
824 0.16
825 0.16
826 0.18
827 0.17
828 0.18
829 0.18
830 0.16
831 0.17
832 0.14
833 0.12
834 0.1
835 0.11
836 0.11
837 0.1
838 0.1
839 0.09
840 0.09
841 0.09
842 0.09
843 0.1
844 0.17
845 0.17
846 0.2
847 0.22
848 0.22
849 0.3
850 0.36
851 0.4
852 0.37
853 0.42
854 0.43
855 0.51
856 0.54
857 0.49
858 0.44
859 0.42
860 0.42
861 0.37
862 0.34
863 0.27
864 0.24
865 0.22
866 0.24
867 0.26
868 0.24
869 0.23
870 0.23
871 0.23
872 0.23
873 0.23
874 0.24
875 0.22
876 0.22
877 0.24
878 0.26
879 0.22
880 0.22
881 0.21
882 0.18
883 0.14
884 0.15
885 0.17
886 0.15
887 0.17
888 0.17
889 0.17
890 0.17
891 0.18
892 0.16
893 0.12
894 0.11
895 0.11
896 0.11
897 0.11
898 0.11
899 0.11
900 0.11
901 0.12
902 0.11
903 0.12
904 0.12
905 0.12
906 0.12
907 0.13
908 0.11
909 0.12
910 0.21
911 0.22
912 0.26
913 0.3
914 0.32
915 0.34
916 0.37
917 0.39
918 0.36
919 0.37
920 0.37
921 0.35
922 0.36
923 0.38
924 0.35
925 0.32
926 0.28
927 0.28
928 0.29
929 0.33
930 0.33
931 0.31
932 0.35
933 0.36
934 0.41
935 0.41
936 0.37
937 0.35
938 0.36
939 0.33
940 0.32
941 0.3
942 0.25
943 0.22
944 0.2
945 0.16
946 0.12
947 0.11
948 0.07
949 0.06
950 0.06
951 0.06
952 0.07
953 0.07
954 0.08
955 0.1
956 0.11
957 0.16
958 0.23
959 0.27
960 0.3
961 0.34
962 0.37
963 0.36
964 0.38
965 0.37
966 0.37
967 0.38
968 0.37
969 0.36
970 0.43
971 0.46
972 0.48
973 0.52
974 0.52
975 0.56
976 0.55
977 0.54
978 0.48
979 0.47
980 0.49
981 0.47
982 0.39
983 0.37
984 0.4
985 0.43
986 0.38
987 0.34
988 0.29
989 0.26
990 0.29
991 0.24
992 0.2
993 0.22
994 0.31
995 0.38
996 0.41
997 0.41
998 0.4
999 0.48
1000 0.52
1001 0.5
1002 0.43
1003 0.36
1004 0.34
1005 0.31
1006 0.29
1007 0.21
1008 0.16
1009 0.11
1010 0.09
1011 0.08
1012 0.07
1013 0.07
1014 0.09
1015 0.14
1016 0.14
1017 0.16
1018 0.18
1019 0.21
1020 0.29
1021 0.36
1022 0.38
1023 0.41
1024 0.49
1025 0.56
1026 0.63
1027 0.69
1028 0.7
1029 0.73
1030 0.77
1031 0.81
1032 0.83
1033 0.8
1034 0.73
1035 0.72
1036 0.7
1037 0.71
1038 0.72
1039 0.72
1040 0.73
1041 0.77
1042 0.85
1043 0.86
1044 0.88
1045 0.87
1046 0.88
1047 0.87
1048 0.8
1049 0.74
1050 0.69
1051 0.63
1052 0.56
1053 0.47
1054 0.36
1055 0.26
1056 0.22
1057 0.18
1058 0.11
1059 0.08
1060 0.12
1061 0.14
1062 0.19
1063 0.21
1064 0.22
1065 0.24
1066 0.31
1067 0.41
1068 0.43
1069 0.5
1070 0.53
1071 0.54
1072 0.59
1073 0.59
1074 0.55
1075 0.5
1076 0.44
1077 0.41
1078 0.41
1079 0.41
1080 0.44
1081 0.48
1082 0.52
1083 0.52
1084 0.62
1085 0.65
1086 0.62
1087 0.61
1088 0.59
1089 0.62
1090 0.61
1091 0.66
1092 0.66
1093 0.58
1094 0.6
1095 0.61
1096 0.57
1097 0.48
1098 0.42
1099 0.34
1100 0.23
1101 0.2
1102 0.12
1103 0.09
1104 0.07
1105 0.07
1106 0.05
1107 0.04
1108 0.04
1109 0.04
1110 0.04
1111 0.05
1112 0.06
1113 0.07
1114 0.08
1115 0.11
1116 0.12
1117 0.14
1118 0.17
1119 0.21
1120 0.24
1121 0.28
1122 0.27