Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4RWP6

Protein Details
Accession F4RWP6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MSQAPKPKKSKRSNIHESTSKSNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
459-463RKKRQ
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
KEGG mlr:MELLADRAFT_109505  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MSQAPKPKKSKRSNIHESTSKSNQISGSNQSNKSEVTVKLSGESNKGNYLGSALVKFPDVKPDIKTPFNLYAHKVDPKATKILAGETDQLEFESNRQSTADVNCNYLIGLHSIQDQTLTLFPTSFHELRPTVKQLKDAINLKKQEEKEDEEKEGHQTHKASRNMLGTTFGSKKARRAIQAAARDTIDPDSMMHVQSHLKEAITTSSITLTNSIQEANRIESEKPIPPYNINATSPKEVYKLSDVVTNLELNSIPIAHITYCSSPEQAIRNLPNSKSNFINKRIESCWNRYPEGKLNKQEEQRLRILVYISYLIKFHHHRFKIKKDKLKELLSGKRDGSESCPDSILDGLLERFTEKELGTQEFLMTTFSNRKLLSYICTLCLIHEEYTCAITELADDLKEDKKSLTEIFRSLGCKIDKLSSGELTVQMEEAKKLGKDTKEIDKQRLARLSVPLVFPEPRKKRQRN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.89
3 0.86
4 0.8
5 0.77
6 0.74
7 0.7
8 0.6
9 0.54
10 0.48
11 0.44
12 0.43
13 0.42
14 0.45
15 0.47
16 0.49
17 0.48
18 0.47
19 0.43
20 0.42
21 0.4
22 0.31
23 0.3
24 0.3
25 0.29
26 0.3
27 0.34
28 0.33
29 0.32
30 0.34
31 0.29
32 0.29
33 0.29
34 0.26
35 0.22
36 0.21
37 0.19
38 0.17
39 0.16
40 0.14
41 0.14
42 0.16
43 0.18
44 0.16
45 0.23
46 0.24
47 0.25
48 0.28
49 0.36
50 0.4
51 0.42
52 0.44
53 0.41
54 0.47
55 0.49
56 0.48
57 0.43
58 0.44
59 0.45
60 0.48
61 0.43
62 0.4
63 0.41
64 0.41
65 0.42
66 0.36
67 0.35
68 0.3
69 0.32
70 0.29
71 0.26
72 0.25
73 0.21
74 0.22
75 0.19
76 0.18
77 0.16
78 0.14
79 0.13
80 0.17
81 0.16
82 0.16
83 0.17
84 0.17
85 0.19
86 0.24
87 0.31
88 0.24
89 0.26
90 0.26
91 0.25
92 0.25
93 0.21
94 0.17
95 0.11
96 0.11
97 0.09
98 0.12
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.11
103 0.1
104 0.11
105 0.12
106 0.09
107 0.09
108 0.1
109 0.13
110 0.2
111 0.19
112 0.18
113 0.21
114 0.22
115 0.25
116 0.3
117 0.34
118 0.35
119 0.35
120 0.39
121 0.39
122 0.44
123 0.48
124 0.5
125 0.5
126 0.51
127 0.53
128 0.51
129 0.53
130 0.48
131 0.48
132 0.45
133 0.43
134 0.43
135 0.43
136 0.44
137 0.38
138 0.38
139 0.36
140 0.35
141 0.3
142 0.26
143 0.25
144 0.29
145 0.36
146 0.38
147 0.35
148 0.36
149 0.38
150 0.35
151 0.33
152 0.3
153 0.21
154 0.23
155 0.23
156 0.23
157 0.25
158 0.25
159 0.29
160 0.34
161 0.38
162 0.36
163 0.38
164 0.4
165 0.42
166 0.49
167 0.46
168 0.4
169 0.37
170 0.34
171 0.31
172 0.25
173 0.18
174 0.11
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.11
182 0.12
183 0.14
184 0.12
185 0.11
186 0.1
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.07
201 0.09
202 0.1
203 0.1
204 0.12
205 0.13
206 0.13
207 0.14
208 0.17
209 0.19
210 0.2
211 0.21
212 0.2
213 0.19
214 0.22
215 0.24
216 0.24
217 0.22
218 0.23
219 0.24
220 0.25
221 0.25
222 0.22
223 0.19
224 0.16
225 0.16
226 0.16
227 0.15
228 0.13
229 0.15
230 0.15
231 0.15
232 0.16
233 0.14
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.07
238 0.07
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.04
244 0.05
245 0.06
246 0.07
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.13
252 0.15
253 0.16
254 0.2
255 0.2
256 0.25
257 0.28
258 0.29
259 0.33
260 0.33
261 0.33
262 0.32
263 0.38
264 0.39
265 0.41
266 0.48
267 0.42
268 0.44
269 0.44
270 0.49
271 0.47
272 0.47
273 0.48
274 0.44
275 0.45
276 0.42
277 0.44
278 0.44
279 0.48
280 0.49
281 0.5
282 0.51
283 0.56
284 0.58
285 0.62
286 0.58
287 0.55
288 0.5
289 0.44
290 0.39
291 0.34
292 0.31
293 0.23
294 0.18
295 0.15
296 0.13
297 0.12
298 0.12
299 0.11
300 0.15
301 0.19
302 0.24
303 0.31
304 0.35
305 0.44
306 0.52
307 0.62
308 0.69
309 0.74
310 0.77
311 0.74
312 0.8
313 0.79
314 0.76
315 0.72
316 0.69
317 0.68
318 0.63
319 0.6
320 0.5
321 0.45
322 0.41
323 0.35
324 0.31
325 0.31
326 0.29
327 0.26
328 0.26
329 0.24
330 0.23
331 0.23
332 0.18
333 0.1
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.1
342 0.09
343 0.12
344 0.15
345 0.18
346 0.19
347 0.18
348 0.18
349 0.16
350 0.16
351 0.14
352 0.11
353 0.12
354 0.17
355 0.18
356 0.23
357 0.22
358 0.23
359 0.23
360 0.24
361 0.25
362 0.27
363 0.27
364 0.24
365 0.26
366 0.25
367 0.23
368 0.25
369 0.24
370 0.18
371 0.17
372 0.17
373 0.16
374 0.17
375 0.17
376 0.14
377 0.11
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.09
384 0.11
385 0.15
386 0.16
387 0.17
388 0.15
389 0.16
390 0.19
391 0.24
392 0.28
393 0.28
394 0.29
395 0.3
396 0.34
397 0.34
398 0.32
399 0.34
400 0.28
401 0.26
402 0.27
403 0.3
404 0.31
405 0.33
406 0.36
407 0.3
408 0.31
409 0.31
410 0.3
411 0.27
412 0.23
413 0.19
414 0.17
415 0.17
416 0.15
417 0.15
418 0.16
419 0.15
420 0.19
421 0.25
422 0.26
423 0.31
424 0.36
425 0.46
426 0.53
427 0.58
428 0.62
429 0.64
430 0.66
431 0.68
432 0.7
433 0.62
434 0.56
435 0.56
436 0.55
437 0.5
438 0.46
439 0.4
440 0.37
441 0.38
442 0.39
443 0.44
444 0.47
445 0.53