Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PDF7

Protein Details
Accession A0A1D8PDF7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
57-84LVEYLSRNRKQHRVKKRKTGDKNSYDIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-74RKQHRVKKRK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR009145  U2AF_small  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0089701  C:U2AF complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0030628  F:pre-mRNA 3'-splice site binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG cal:CAALFM_C104990CA  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSTTEQSLQSKTAVLCSFYTKIGSCRHGEECSKKHLKPTITKTILLPNLYQNPRFDLVEYLSRNRKQHRVKKRKTGDKNSYDIAEINFETKDGVKDNEEKANVDGENKEHDETKEIESEDVISKDKEEVIVDRSGIAQQDKQKESNKEGKQEGESEKEEPNKESTEEELPPQDATQEVPNHNQEESPIKQEQTAVKQEKHGLDENYPVLTDEQIQKDFDLFYQDIFVHVAKLGQINDMAVCENENHLSGHVYIKFNDYNDAIAANLQLNQEWYNGKPVYSELSPVNILADAHCKSWDHGHCDRGAKCNYLHVKQPTQGIKKSLWDSQTKTYTLKKLEMLKKEVPEEIMSGASSDNVNKVNTKDIEIRSTMALLESMF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.29
4 0.3
5 0.26
6 0.29
7 0.24
8 0.28
9 0.32
10 0.36
11 0.33
12 0.36
13 0.39
14 0.43
15 0.49
16 0.53
17 0.51
18 0.56
19 0.62
20 0.58
21 0.62
22 0.63
23 0.64
24 0.65
25 0.69
26 0.7
27 0.65
28 0.65
29 0.6
30 0.61
31 0.57
32 0.49
33 0.42
34 0.38
35 0.44
36 0.46
37 0.47
38 0.39
39 0.39
40 0.4
41 0.39
42 0.32
43 0.26
44 0.26
45 0.31
46 0.33
47 0.35
48 0.4
49 0.45
50 0.5
51 0.52
52 0.59
53 0.62
54 0.68
55 0.73
56 0.77
57 0.81
58 0.87
59 0.92
60 0.93
61 0.93
62 0.94
63 0.93
64 0.89
65 0.84
66 0.75
67 0.65
68 0.55
69 0.46
70 0.35
71 0.28
72 0.2
73 0.17
74 0.14
75 0.13
76 0.12
77 0.12
78 0.13
79 0.12
80 0.13
81 0.15
82 0.21
83 0.24
84 0.29
85 0.29
86 0.28
87 0.27
88 0.28
89 0.25
90 0.22
91 0.2
92 0.16
93 0.2
94 0.2
95 0.2
96 0.19
97 0.19
98 0.2
99 0.22
100 0.23
101 0.22
102 0.21
103 0.2
104 0.18
105 0.19
106 0.18
107 0.17
108 0.15
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.11
114 0.1
115 0.1
116 0.12
117 0.13
118 0.13
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.13
123 0.13
124 0.13
125 0.18
126 0.26
127 0.28
128 0.32
129 0.38
130 0.4
131 0.45
132 0.52
133 0.5
134 0.48
135 0.48
136 0.46
137 0.41
138 0.43
139 0.39
140 0.34
141 0.31
142 0.27
143 0.28
144 0.3
145 0.3
146 0.26
147 0.26
148 0.22
149 0.21
150 0.2
151 0.19
152 0.18
153 0.18
154 0.17
155 0.16
156 0.15
157 0.15
158 0.13
159 0.11
160 0.08
161 0.08
162 0.11
163 0.14
164 0.14
165 0.18
166 0.2
167 0.21
168 0.21
169 0.2
170 0.16
171 0.18
172 0.18
173 0.19
174 0.19
175 0.18
176 0.18
177 0.21
178 0.23
179 0.23
180 0.3
181 0.29
182 0.29
183 0.31
184 0.35
185 0.34
186 0.34
187 0.33
188 0.25
189 0.23
190 0.25
191 0.23
192 0.19
193 0.17
194 0.15
195 0.11
196 0.1
197 0.11
198 0.12
199 0.13
200 0.14
201 0.15
202 0.14
203 0.15
204 0.15
205 0.13
206 0.13
207 0.11
208 0.1
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.12
213 0.11
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.09
235 0.09
236 0.12
237 0.15
238 0.16
239 0.16
240 0.19
241 0.21
242 0.2
243 0.21
244 0.18
245 0.15
246 0.14
247 0.14
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.07
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.11
258 0.12
259 0.12
260 0.17
261 0.18
262 0.17
263 0.17
264 0.17
265 0.2
266 0.18
267 0.21
268 0.14
269 0.16
270 0.17
271 0.16
272 0.16
273 0.12
274 0.11
275 0.1
276 0.14
277 0.13
278 0.13
279 0.15
280 0.15
281 0.15
282 0.24
283 0.29
284 0.31
285 0.35
286 0.38
287 0.42
288 0.48
289 0.49
290 0.48
291 0.46
292 0.42
293 0.38
294 0.43
295 0.45
296 0.41
297 0.46
298 0.45
299 0.48
300 0.48
301 0.56
302 0.56
303 0.56
304 0.58
305 0.53
306 0.49
307 0.51
308 0.51
309 0.48
310 0.44
311 0.44
312 0.44
313 0.49
314 0.53
315 0.48
316 0.48
317 0.5
318 0.52
319 0.49
320 0.49
321 0.46
322 0.5
323 0.56
324 0.6
325 0.6
326 0.6
327 0.6
328 0.59
329 0.55
330 0.47
331 0.4
332 0.34
333 0.28
334 0.22
335 0.17
336 0.15
337 0.13
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.13
342 0.14
343 0.16
344 0.19
345 0.2
346 0.28
347 0.28
348 0.32
349 0.37
350 0.38
351 0.42
352 0.4
353 0.41
354 0.33
355 0.32
356 0.28
357 0.2