Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JMN9

Protein Details
Accession S2JMN9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
203-226DDWLMKHRWNKGKKNENKGRLPNGHydrophilic
283-311DYSDSKNNKTKSKKVVKKKVKVETEVKQEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
291-301KTKSKKVVKKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14, nucl 13.5, cyto 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015886  DNA_glyclase/AP_lyase_DNA-bd  
IPR012319  FPG_cat  
IPR035937  MutM-like_N-ter  
IPR010979  Ribosomal_S13-like_H2TH  
Gene Ontology GO:0140078  F:class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0019104  F:DNA N-glycosylase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006284  P:base-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01149  Fapy_DNA_glyco  
PF06831  H2TH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51068  FPG_CAT  
Amino Acid Sequences MAPDEFAKTLLDKTLVDTKRWGKYFILIFDTEPHLVAHLGMTGGIRVKYAFEHEELGKGLQWPPRFHKLLVTFTDPDTKKEIHFGYKDPLRWGRLRLVSGDPLTSDPINKLGFDPVLGLPDINTFKSKVQKRSVPVKALLLDQSFSAGVGNWVADEILYQAMIHPAQYTNTLTEKELDDMYHKMKFICETAVEAEADENKFPDDWLMKHRWNKGKKNENKGRLPNGMLLQFETVGGRTSAFAPDRQVLRLSEENAKVTVKRRRTTSVKKQESDDQDEFKDEDDYSDSKNNKTKSKKVVKKKVKVETEVKQEEAEEEDDEIITKKSVRTVSSRYNFRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.29
4 0.36
5 0.4
6 0.47
7 0.49
8 0.47
9 0.39
10 0.44
11 0.48
12 0.45
13 0.42
14 0.34
15 0.33
16 0.34
17 0.36
18 0.3
19 0.24
20 0.2
21 0.16
22 0.15
23 0.14
24 0.11
25 0.08
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.09
34 0.1
35 0.11
36 0.15
37 0.17
38 0.15
39 0.19
40 0.2
41 0.22
42 0.22
43 0.22
44 0.19
45 0.18
46 0.21
47 0.22
48 0.26
49 0.29
50 0.35
51 0.43
52 0.44
53 0.43
54 0.47
55 0.48
56 0.5
57 0.49
58 0.48
59 0.41
60 0.39
61 0.48
62 0.4
63 0.37
64 0.34
65 0.31
66 0.26
67 0.31
68 0.32
69 0.3
70 0.31
71 0.32
72 0.36
73 0.39
74 0.41
75 0.41
76 0.43
77 0.41
78 0.41
79 0.42
80 0.41
81 0.4
82 0.39
83 0.37
84 0.35
85 0.34
86 0.32
87 0.29
88 0.22
89 0.19
90 0.2
91 0.17
92 0.14
93 0.11
94 0.14
95 0.14
96 0.14
97 0.13
98 0.13
99 0.12
100 0.12
101 0.13
102 0.1
103 0.11
104 0.1
105 0.09
106 0.08
107 0.11
108 0.12
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.15
113 0.24
114 0.3
115 0.34
116 0.4
117 0.45
118 0.51
119 0.59
120 0.63
121 0.58
122 0.54
123 0.49
124 0.43
125 0.38
126 0.35
127 0.25
128 0.19
129 0.14
130 0.13
131 0.1
132 0.09
133 0.07
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.07
155 0.08
156 0.09
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.1
165 0.1
166 0.12
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.12
172 0.13
173 0.12
174 0.12
175 0.1
176 0.1
177 0.11
178 0.12
179 0.11
180 0.1
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.16
193 0.21
194 0.27
195 0.33
196 0.41
197 0.48
198 0.55
199 0.63
200 0.68
201 0.73
202 0.76
203 0.82
204 0.83
205 0.83
206 0.83
207 0.81
208 0.77
209 0.7
210 0.63
211 0.55
212 0.49
213 0.42
214 0.33
215 0.26
216 0.2
217 0.16
218 0.15
219 0.11
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.11
227 0.12
228 0.13
229 0.15
230 0.2
231 0.21
232 0.22
233 0.23
234 0.2
235 0.24
236 0.27
237 0.27
238 0.29
239 0.3
240 0.3
241 0.29
242 0.29
243 0.26
244 0.31
245 0.37
246 0.38
247 0.41
248 0.44
249 0.51
250 0.6
251 0.68
252 0.72
253 0.75
254 0.76
255 0.74
256 0.74
257 0.74
258 0.72
259 0.7
260 0.62
261 0.55
262 0.46
263 0.46
264 0.42
265 0.34
266 0.28
267 0.19
268 0.16
269 0.16
270 0.17
271 0.18
272 0.25
273 0.26
274 0.29
275 0.36
276 0.4
277 0.45
278 0.53
279 0.58
280 0.62
281 0.71
282 0.76
283 0.81
284 0.87
285 0.89
286 0.9
287 0.91
288 0.91
289 0.88
290 0.86
291 0.83
292 0.8
293 0.8
294 0.74
295 0.65
296 0.56
297 0.47
298 0.4
299 0.35
300 0.28
301 0.18
302 0.15
303 0.14
304 0.14
305 0.14
306 0.14
307 0.12
308 0.11
309 0.12
310 0.13
311 0.18
312 0.22
313 0.25
314 0.31
315 0.38
316 0.48
317 0.55