Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JDI3

Protein Details
Accession S2JDI3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-49ESMMKQAKKLEAKKQRESNRKREEKDKKASYAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-45AKKLEAKKQRESNRKREEKDKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000195  Rab-GAP-TBC_dom  
IPR035969  Rab-GAP_TBC_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00566  RabGAP-TBC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50086  TBC_RABGAP  
Amino Acid Sequences MLPPKDPHEEKKHLQEYESMMKQAKKLEAKKQRESNRKREEKDKKASYAIYTWENDIIPHWKSRIKDKRTMVLWDQGIPPRCRKKVWCLKIGNQLNITKNTFSECTRRVPQAVRNNSKNGDSHGAPMPIVTASHHTTYDPYNTTAATASSEQVYMRNRRRRTSSLDVLRERKEDHDEDEDVAGFSNFTNMPTKHASSSTYSFTSHDESFDHYSQSEGATSALELGSRQSHDDEEDYNDGDSIGLEDDDDDGDNDQEDEPNDEETDDDKVLKDPTAINFLNKAIDEDILRTLPSLCVFQPDGPLFMSLRKVLHAYVGYRPNMTYSRGASFLAGVLLLNMGAQEAFSALINMISTSQVLSALYNSDEKKIQGFFKVFNVIFAENLPKLYLHFKNLTLTPENYLPDWFMTVFASIIPLELSSRLWDIYLLHGDIILFRTGLVVLKYLEPLLWGGGFSETVKILNMGFVGEHRGEEVKAALAVSGHITDGDEDPFFDEILGRKGVHLSETRFKELLGAHMPRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.59
3 0.56
4 0.57
5 0.54
6 0.46
7 0.43
8 0.44
9 0.45
10 0.45
11 0.47
12 0.47
13 0.51
14 0.58
15 0.64
16 0.71
17 0.78
18 0.82
19 0.84
20 0.86
21 0.88
22 0.88
23 0.89
24 0.9
25 0.86
26 0.87
27 0.87
28 0.87
29 0.88
30 0.85
31 0.79
32 0.75
33 0.72
34 0.65
35 0.58
36 0.52
37 0.47
38 0.4
39 0.36
40 0.32
41 0.29
42 0.25
43 0.24
44 0.24
45 0.21
46 0.23
47 0.24
48 0.26
49 0.28
50 0.39
51 0.47
52 0.5
53 0.57
54 0.6
55 0.66
56 0.66
57 0.71
58 0.64
59 0.61
60 0.55
61 0.49
62 0.47
63 0.45
64 0.48
65 0.44
66 0.5
67 0.51
68 0.53
69 0.56
70 0.57
71 0.62
72 0.66
73 0.71
74 0.72
75 0.69
76 0.74
77 0.78
78 0.79
79 0.73
80 0.67
81 0.64
82 0.59
83 0.56
84 0.51
85 0.41
86 0.35
87 0.33
88 0.3
89 0.27
90 0.3
91 0.28
92 0.33
93 0.37
94 0.4
95 0.41
96 0.44
97 0.5
98 0.53
99 0.61
100 0.62
101 0.63
102 0.65
103 0.62
104 0.6
105 0.52
106 0.46
107 0.41
108 0.32
109 0.31
110 0.3
111 0.29
112 0.25
113 0.24
114 0.2
115 0.15
116 0.14
117 0.11
118 0.11
119 0.13
120 0.14
121 0.15
122 0.14
123 0.16
124 0.18
125 0.22
126 0.2
127 0.19
128 0.18
129 0.18
130 0.18
131 0.17
132 0.15
133 0.13
134 0.11
135 0.1
136 0.1
137 0.11
138 0.1
139 0.14
140 0.19
141 0.26
142 0.35
143 0.43
144 0.46
145 0.52
146 0.59
147 0.6
148 0.63
149 0.64
150 0.64
151 0.64
152 0.69
153 0.7
154 0.68
155 0.65
156 0.58
157 0.5
158 0.43
159 0.4
160 0.33
161 0.3
162 0.3
163 0.28
164 0.27
165 0.26
166 0.23
167 0.17
168 0.16
169 0.12
170 0.07
171 0.06
172 0.07
173 0.06
174 0.07
175 0.13
176 0.13
177 0.17
178 0.2
179 0.22
180 0.21
181 0.22
182 0.23
183 0.22
184 0.25
185 0.24
186 0.22
187 0.21
188 0.21
189 0.21
190 0.23
191 0.19
192 0.17
193 0.15
194 0.17
195 0.21
196 0.21
197 0.2
198 0.15
199 0.16
200 0.15
201 0.15
202 0.11
203 0.07
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.05
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.11
219 0.11
220 0.12
221 0.13
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.1
226 0.09
227 0.07
228 0.05
229 0.04
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.09
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.16
262 0.16
263 0.16
264 0.16
265 0.17
266 0.17
267 0.15
268 0.15
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.15
286 0.15
287 0.15
288 0.14
289 0.15
290 0.12
291 0.13
292 0.14
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.1
298 0.13
299 0.13
300 0.14
301 0.18
302 0.24
303 0.24
304 0.23
305 0.23
306 0.23
307 0.23
308 0.24
309 0.2
310 0.17
311 0.18
312 0.19
313 0.19
314 0.16
315 0.15
316 0.12
317 0.1
318 0.07
319 0.05
320 0.04
321 0.04
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.02
327 0.02
328 0.02
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.07
348 0.11
349 0.12
350 0.13
351 0.15
352 0.15
353 0.17
354 0.19
355 0.2
356 0.22
357 0.23
358 0.23
359 0.25
360 0.31
361 0.29
362 0.27
363 0.28
364 0.23
365 0.21
366 0.2
367 0.21
368 0.14
369 0.14
370 0.13
371 0.1
372 0.12
373 0.18
374 0.2
375 0.21
376 0.24
377 0.25
378 0.28
379 0.3
380 0.33
381 0.31
382 0.29
383 0.27
384 0.28
385 0.28
386 0.24
387 0.23
388 0.19
389 0.16
390 0.16
391 0.13
392 0.1
393 0.1
394 0.09
395 0.09
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.07
404 0.08
405 0.08
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.1
410 0.1
411 0.13
412 0.16
413 0.15
414 0.13
415 0.14
416 0.13
417 0.14
418 0.15
419 0.11
420 0.08
421 0.07
422 0.08
423 0.08
424 0.1
425 0.09
426 0.09
427 0.1
428 0.11
429 0.12
430 0.12
431 0.11
432 0.1
433 0.1
434 0.1
435 0.09
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.09
440 0.09
441 0.1
442 0.09
443 0.09
444 0.1
445 0.1
446 0.09
447 0.09
448 0.09
449 0.08
450 0.07
451 0.08
452 0.12
453 0.12
454 0.12
455 0.12
456 0.14
457 0.13
458 0.14
459 0.15
460 0.11
461 0.11
462 0.11
463 0.1
464 0.09
465 0.09
466 0.1
467 0.09
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.09
472 0.11
473 0.12
474 0.11
475 0.11
476 0.13
477 0.13
478 0.13
479 0.11
480 0.12
481 0.12
482 0.16
483 0.18
484 0.16
485 0.16
486 0.19
487 0.2
488 0.23
489 0.26
490 0.29
491 0.36
492 0.41
493 0.46
494 0.43
495 0.42
496 0.42
497 0.38
498 0.38
499 0.37