Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JNK6

Protein Details
Accession S2JNK6    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
167-201IKQQEEEERQKRREKKKQKKDHKKKPADKDDGQDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-56KAKARENRDRLAEKNDERKKLGLPPLKPKRR
175-193RQKRREKKKQKKDHKKKPA
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR040107  Snu23  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12874  zf-met  
Amino Acid Sequences MSAYGAGKAKDTDFRRTWNKEEYAAKAKARENRDRLAEKNDERKKLGLPPLKPKRRYDDDDESKEALKAREEKVDIESNVGKVQVVQAADSRKQPGFYCKACDITIKDSVTWIDHLNGRKHLNNVGVSSKVEKADLNSVKERLAMLKRKKENPQNEEYNLDERLAAIKQQEEEERQKRREKKKQKKDHKKKPADKDDGQDEMAKMMGFSGFGSSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.51
3 0.56
4 0.59
5 0.59
6 0.59
7 0.57
8 0.58
9 0.58
10 0.56
11 0.56
12 0.52
13 0.5
14 0.52
15 0.52
16 0.55
17 0.58
18 0.55
19 0.56
20 0.62
21 0.61
22 0.59
23 0.59
24 0.6
25 0.57
26 0.62
27 0.63
28 0.6
29 0.57
30 0.56
31 0.51
32 0.5
33 0.53
34 0.5
35 0.49
36 0.55
37 0.64
38 0.71
39 0.74
40 0.71
41 0.71
42 0.71
43 0.72
44 0.69
45 0.69
46 0.69
47 0.69
48 0.68
49 0.6
50 0.52
51 0.47
52 0.41
53 0.3
54 0.25
55 0.24
56 0.23
57 0.27
58 0.27
59 0.27
60 0.29
61 0.33
62 0.28
63 0.27
64 0.26
65 0.21
66 0.2
67 0.19
68 0.15
69 0.1
70 0.1
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.1
75 0.13
76 0.15
77 0.17
78 0.19
79 0.17
80 0.18
81 0.19
82 0.23
83 0.26
84 0.25
85 0.29
86 0.27
87 0.29
88 0.28
89 0.3
90 0.25
91 0.23
92 0.26
93 0.22
94 0.2
95 0.18
96 0.18
97 0.16
98 0.15
99 0.12
100 0.09
101 0.12
102 0.16
103 0.18
104 0.22
105 0.24
106 0.25
107 0.25
108 0.27
109 0.27
110 0.25
111 0.24
112 0.22
113 0.2
114 0.19
115 0.2
116 0.18
117 0.15
118 0.14
119 0.13
120 0.13
121 0.2
122 0.23
123 0.26
124 0.26
125 0.27
126 0.26
127 0.27
128 0.25
129 0.21
130 0.25
131 0.31
132 0.36
133 0.45
134 0.52
135 0.58
136 0.67
137 0.72
138 0.75
139 0.72
140 0.72
141 0.7
142 0.65
143 0.61
144 0.55
145 0.48
146 0.39
147 0.32
148 0.23
149 0.16
150 0.16
151 0.13
152 0.12
153 0.1
154 0.12
155 0.13
156 0.16
157 0.19
158 0.23
159 0.32
160 0.39
161 0.46
162 0.5
163 0.59
164 0.66
165 0.73
166 0.79
167 0.81
168 0.84
169 0.87
170 0.92
171 0.95
172 0.96
173 0.97
174 0.97
175 0.97
176 0.97
177 0.96
178 0.96
179 0.95
180 0.93
181 0.87
182 0.84
183 0.79
184 0.71
185 0.63
186 0.55
187 0.44
188 0.35
189 0.3
190 0.22
191 0.15
192 0.12
193 0.1
194 0.07
195 0.07
196 0.11