Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2J6K6

Protein Details
Accession S2J6K6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
533-552VPSPPKSPLKKRKSLSPPLIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
519-545KKENRGVEIKARAFVPSPPKSPLKKRK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, mito_nucl 14, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR036053  PABP-dom  
IPR002004  PABP_HYD  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006417  P:regulation of translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00658  PABP  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51309  PABC  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MTTVKPIIKLPPRSKSCSTRSTYQDVMSSYDPQTIVSNELYFEDKENRLQDYDIQHLLQEYSLYQIKRERGGGYLSFPDSKMADRVYSLFNGYMFANQTVLKFRLSFNDLSDPQPEGHILEIRHLPTHIDHNSLYDIFRPFGPLSICKPIAEDGTLKGKALVQFFYKEDSDVAVNSLTQSMSTPTSGTTTVVTEPTKETTGFIDYMNLYVKNLDPTVDNTDLFNIFRKYGRIVSARVMSNPQTGLSKGYGFVSFGKPEEAALALKETDGMQYRTKPMIVAYHEPKKPRQEKSTSTTTSSFHSPPPTAPIDYATTPYFETRHPHEVGPINGLGIDNVDQISMNNVKDLSVGGTAPPPLQRHISMDNNSFSPPPIRTSPQFASRPSLASLASGASIQQAPVSAMYEKIEQEKILEEKPRTLRRKGSLESVGSVMTESSAQVQRQRMTEAVKRCGSYGNDLPDIVDMLLTLKKKERSICLFNPDFLKDKISAAVEALEICEDDDDEEDEDEIHRQMMIAERKKENRGVEIKARAFVPSPPKSPLKKRKSLSPPLIVSPVVDNVVIPPRKSKAIPIIAPPILDTPKAAEIKAMLASFEGKAIHEKKQLLGDQLFPLVKATGIKHAPKVTIRLLDTIELETLAKIMFDKEALKTQVDKASASL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.76
3 0.75
4 0.74
5 0.72
6 0.7
7 0.69
8 0.69
9 0.64
10 0.58
11 0.54
12 0.46
13 0.44
14 0.38
15 0.36
16 0.3
17 0.3
18 0.27
19 0.24
20 0.25
21 0.22
22 0.22
23 0.2
24 0.2
25 0.16
26 0.18
27 0.19
28 0.17
29 0.2
30 0.23
31 0.23
32 0.28
33 0.3
34 0.31
35 0.3
36 0.31
37 0.33
38 0.32
39 0.35
40 0.32
41 0.3
42 0.27
43 0.27
44 0.26
45 0.21
46 0.16
47 0.11
48 0.13
49 0.18
50 0.17
51 0.19
52 0.25
53 0.28
54 0.32
55 0.35
56 0.32
57 0.29
58 0.34
59 0.33
60 0.31
61 0.32
62 0.31
63 0.29
64 0.28
65 0.28
66 0.23
67 0.23
68 0.23
69 0.2
70 0.18
71 0.18
72 0.2
73 0.21
74 0.21
75 0.21
76 0.18
77 0.17
78 0.17
79 0.16
80 0.16
81 0.15
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.15
86 0.19
87 0.2
88 0.19
89 0.18
90 0.19
91 0.24
92 0.27
93 0.27
94 0.25
95 0.33
96 0.33
97 0.34
98 0.35
99 0.3
100 0.26
101 0.26
102 0.23
103 0.15
104 0.15
105 0.17
106 0.15
107 0.17
108 0.21
109 0.21
110 0.22
111 0.21
112 0.21
113 0.19
114 0.26
115 0.24
116 0.24
117 0.23
118 0.23
119 0.26
120 0.25
121 0.24
122 0.2
123 0.2
124 0.17
125 0.17
126 0.19
127 0.16
128 0.19
129 0.21
130 0.21
131 0.24
132 0.3
133 0.31
134 0.27
135 0.28
136 0.27
137 0.26
138 0.24
139 0.21
140 0.16
141 0.22
142 0.23
143 0.21
144 0.2
145 0.22
146 0.23
147 0.24
148 0.23
149 0.18
150 0.21
151 0.21
152 0.24
153 0.22
154 0.19
155 0.17
156 0.17
157 0.15
158 0.12
159 0.13
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.1
176 0.1
177 0.11
178 0.14
179 0.14
180 0.13
181 0.15
182 0.16
183 0.17
184 0.16
185 0.15
186 0.14
187 0.16
188 0.16
189 0.14
190 0.14
191 0.13
192 0.14
193 0.15
194 0.14
195 0.11
196 0.11
197 0.12
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.1
202 0.13
203 0.19
204 0.19
205 0.19
206 0.17
207 0.18
208 0.18
209 0.18
210 0.18
211 0.14
212 0.13
213 0.14
214 0.16
215 0.16
216 0.18
217 0.23
218 0.23
219 0.23
220 0.26
221 0.3
222 0.3
223 0.28
224 0.28
225 0.25
226 0.24
227 0.22
228 0.19
229 0.15
230 0.14
231 0.15
232 0.14
233 0.12
234 0.11
235 0.12
236 0.11
237 0.11
238 0.13
239 0.14
240 0.13
241 0.13
242 0.14
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.1
247 0.08
248 0.07
249 0.08
250 0.07
251 0.06
252 0.07
253 0.06
254 0.07
255 0.1
256 0.12
257 0.13
258 0.15
259 0.18
260 0.19
261 0.19
262 0.17
263 0.15
264 0.18
265 0.2
266 0.24
267 0.27
268 0.34
269 0.37
270 0.39
271 0.43
272 0.48
273 0.52
274 0.52
275 0.54
276 0.53
277 0.57
278 0.6
279 0.65
280 0.57
281 0.53
282 0.48
283 0.41
284 0.36
285 0.33
286 0.29
287 0.22
288 0.23
289 0.2
290 0.18
291 0.22
292 0.22
293 0.19
294 0.18
295 0.17
296 0.17
297 0.17
298 0.18
299 0.14
300 0.13
301 0.13
302 0.13
303 0.12
304 0.11
305 0.14
306 0.16
307 0.22
308 0.23
309 0.22
310 0.26
311 0.28
312 0.27
313 0.26
314 0.21
315 0.15
316 0.14
317 0.14
318 0.09
319 0.06
320 0.06
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.07
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.1
342 0.1
343 0.11
344 0.13
345 0.14
346 0.16
347 0.21
348 0.26
349 0.26
350 0.29
351 0.28
352 0.27
353 0.27
354 0.24
355 0.19
356 0.16
357 0.14
358 0.14
359 0.16
360 0.19
361 0.2
362 0.26
363 0.29
364 0.34
365 0.37
366 0.35
367 0.36
368 0.34
369 0.34
370 0.28
371 0.26
372 0.18
373 0.15
374 0.14
375 0.09
376 0.09
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.07
387 0.06
388 0.07
389 0.08
390 0.1
391 0.1
392 0.12
393 0.13
394 0.11
395 0.12
396 0.14
397 0.15
398 0.17
399 0.22
400 0.2
401 0.26
402 0.35
403 0.44
404 0.46
405 0.48
406 0.52
407 0.53
408 0.61
409 0.56
410 0.55
411 0.51
412 0.47
413 0.43
414 0.37
415 0.3
416 0.22
417 0.2
418 0.13
419 0.07
420 0.06
421 0.05
422 0.08
423 0.11
424 0.12
425 0.16
426 0.2
427 0.23
428 0.24
429 0.26
430 0.24
431 0.27
432 0.32
433 0.34
434 0.37
435 0.37
436 0.36
437 0.35
438 0.38
439 0.34
440 0.34
441 0.32
442 0.3
443 0.28
444 0.28
445 0.27
446 0.22
447 0.22
448 0.15
449 0.1
450 0.05
451 0.06
452 0.09
453 0.09
454 0.11
455 0.15
456 0.19
457 0.23
458 0.28
459 0.34
460 0.39
461 0.47
462 0.51
463 0.54
464 0.52
465 0.51
466 0.5
467 0.44
468 0.4
469 0.32
470 0.3
471 0.22
472 0.21
473 0.22
474 0.19
475 0.17
476 0.14
477 0.14
478 0.12
479 0.11
480 0.1
481 0.07
482 0.06
483 0.06
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.08
493 0.08
494 0.09
495 0.08
496 0.08
497 0.07
498 0.06
499 0.07
500 0.15
501 0.24
502 0.29
503 0.35
504 0.42
505 0.47
506 0.52
507 0.56
508 0.51
509 0.51
510 0.5
511 0.5
512 0.51
513 0.55
514 0.52
515 0.49
516 0.47
517 0.39
518 0.35
519 0.34
520 0.36
521 0.33
522 0.34
523 0.38
524 0.45
525 0.51
526 0.61
527 0.67
528 0.67
529 0.71
530 0.71
531 0.76
532 0.79
533 0.82
534 0.8
535 0.78
536 0.72
537 0.66
538 0.65
539 0.54
540 0.45
541 0.36
542 0.28
543 0.2
544 0.16
545 0.12
546 0.12
547 0.21
548 0.22
549 0.21
550 0.24
551 0.26
552 0.3
553 0.31
554 0.35
555 0.36
556 0.43
557 0.46
558 0.47
559 0.52
560 0.49
561 0.48
562 0.43
563 0.37
564 0.3
565 0.27
566 0.21
567 0.17
568 0.23
569 0.24
570 0.23
571 0.2
572 0.19
573 0.21
574 0.24
575 0.2
576 0.13
577 0.13
578 0.15
579 0.14
580 0.15
581 0.13
582 0.1
583 0.18
584 0.22
585 0.27
586 0.32
587 0.34
588 0.35
589 0.42
590 0.45
591 0.44
592 0.43
593 0.4
594 0.35
595 0.39
596 0.36
597 0.28
598 0.26
599 0.2
600 0.19
601 0.18
602 0.18
603 0.21
604 0.28
605 0.32
606 0.36
607 0.4
608 0.44
609 0.44
610 0.48
611 0.46
612 0.46
613 0.45
614 0.42
615 0.4
616 0.37
617 0.35
618 0.3
619 0.25
620 0.18
621 0.17
622 0.13
623 0.12
624 0.09
625 0.08
626 0.07
627 0.08
628 0.08
629 0.1
630 0.13
631 0.15
632 0.23
633 0.26
634 0.28
635 0.3
636 0.35
637 0.39
638 0.38