Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2J9M2

Protein Details
Accession S2J9M2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
409-429HSSSHPHPHHHQQQQQQQQQHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041588  Integrase_H2C2  
Pfam View protein in Pfam  
PF17921  Integrase_H2C2  
Amino Acid Sequences MNTAIPLYHHHPYSGYRFENTARFYSQSTPPEETFDDEDQIPSVDEFRAIIDDYLNNLSPKKRDKALVDQHRYCLIQQVLRDPRNTAISTAQFRFWVKKMFQLQPGTTDLVCHDNKPVAMKEQIYDILVKAHREAHHGGRDKTSALVRRRFSWIPKELVARFVRHCPFCITRRNSGHSPSTLVSKNSSPRSSRYSRHGCSFDSSVPSICTPTSIKQEDSDLSSGPPSSDSGYEATPNYVTMSTSSSPRRTYFSSMYDRDEPDFLDCPYDPTSFAMNNTFRTSGINTADQRQQQHNVMHPLTHHSHPQPQSPLFYHQNYSGYPFYSTGYYPNALGITPCQENSSTTTSNSTSTSSSTTTNAAAVAVAAASSTAAAAAAAVALMRSPGTTNTTDLLSHHHQDQYNTTQQHHSSSHPHPHHHQQQQQQQQQHSSNGHFTPYQPLNLPENAFSTEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.39
3 0.35
4 0.38
5 0.41
6 0.45
7 0.44
8 0.4
9 0.35
10 0.34
11 0.35
12 0.37
13 0.41
14 0.4
15 0.42
16 0.43
17 0.41
18 0.43
19 0.42
20 0.41
21 0.38
22 0.34
23 0.32
24 0.27
25 0.27
26 0.22
27 0.22
28 0.18
29 0.13
30 0.13
31 0.1
32 0.1
33 0.09
34 0.09
35 0.11
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.14
41 0.17
42 0.18
43 0.17
44 0.19
45 0.23
46 0.28
47 0.34
48 0.37
49 0.39
50 0.44
51 0.5
52 0.58
53 0.65
54 0.7
55 0.72
56 0.7
57 0.67
58 0.65
59 0.59
60 0.49
61 0.45
62 0.38
63 0.31
64 0.29
65 0.36
66 0.42
67 0.44
68 0.45
69 0.39
70 0.39
71 0.41
72 0.4
73 0.32
74 0.28
75 0.31
76 0.35
77 0.35
78 0.33
79 0.3
80 0.31
81 0.34
82 0.31
83 0.33
84 0.28
85 0.35
86 0.42
87 0.45
88 0.5
89 0.52
90 0.5
91 0.46
92 0.48
93 0.42
94 0.33
95 0.28
96 0.22
97 0.23
98 0.22
99 0.19
100 0.18
101 0.18
102 0.19
103 0.23
104 0.23
105 0.2
106 0.23
107 0.23
108 0.22
109 0.22
110 0.22
111 0.19
112 0.18
113 0.14
114 0.17
115 0.18
116 0.18
117 0.16
118 0.21
119 0.21
120 0.24
121 0.28
122 0.29
123 0.36
124 0.41
125 0.42
126 0.39
127 0.39
128 0.36
129 0.35
130 0.33
131 0.32
132 0.34
133 0.39
134 0.38
135 0.4
136 0.46
137 0.46
138 0.47
139 0.48
140 0.46
141 0.42
142 0.44
143 0.46
144 0.41
145 0.45
146 0.42
147 0.36
148 0.33
149 0.36
150 0.39
151 0.34
152 0.35
153 0.33
154 0.36
155 0.38
156 0.46
157 0.43
158 0.47
159 0.51
160 0.56
161 0.53
162 0.52
163 0.51
164 0.42
165 0.41
166 0.32
167 0.32
168 0.28
169 0.26
170 0.24
171 0.23
172 0.28
173 0.3
174 0.33
175 0.3
176 0.32
177 0.38
178 0.41
179 0.42
180 0.45
181 0.49
182 0.48
183 0.52
184 0.51
185 0.44
186 0.43
187 0.41
188 0.34
189 0.27
190 0.25
191 0.2
192 0.18
193 0.17
194 0.15
195 0.12
196 0.12
197 0.1
198 0.13
199 0.19
200 0.2
201 0.2
202 0.2
203 0.22
204 0.21
205 0.22
206 0.2
207 0.13
208 0.12
209 0.12
210 0.11
211 0.09
212 0.09
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.09
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.09
229 0.1
230 0.14
231 0.17
232 0.19
233 0.21
234 0.22
235 0.25
236 0.24
237 0.29
238 0.28
239 0.31
240 0.36
241 0.36
242 0.39
243 0.39
244 0.38
245 0.33
246 0.3
247 0.24
248 0.19
249 0.19
250 0.14
251 0.14
252 0.12
253 0.14
254 0.16
255 0.16
256 0.14
257 0.14
258 0.16
259 0.14
260 0.15
261 0.19
262 0.17
263 0.19
264 0.21
265 0.2
266 0.18
267 0.19
268 0.19
269 0.17
270 0.18
271 0.22
272 0.21
273 0.24
274 0.29
275 0.3
276 0.32
277 0.32
278 0.33
279 0.33
280 0.35
281 0.36
282 0.38
283 0.35
284 0.32
285 0.3
286 0.32
287 0.3
288 0.29
289 0.28
290 0.25
291 0.32
292 0.34
293 0.39
294 0.4
295 0.38
296 0.4
297 0.38
298 0.42
299 0.39
300 0.39
301 0.35
302 0.32
303 0.33
304 0.29
305 0.31
306 0.25
307 0.21
308 0.2
309 0.19
310 0.17
311 0.16
312 0.16
313 0.14
314 0.16
315 0.15
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.12
320 0.12
321 0.11
322 0.12
323 0.12
324 0.13
325 0.13
326 0.13
327 0.14
328 0.18
329 0.23
330 0.2
331 0.2
332 0.23
333 0.23
334 0.24
335 0.24
336 0.21
337 0.16
338 0.16
339 0.18
340 0.17
341 0.17
342 0.17
343 0.17
344 0.16
345 0.16
346 0.14
347 0.11
348 0.1
349 0.08
350 0.06
351 0.05
352 0.04
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.02
359 0.02
360 0.02
361 0.03
362 0.02
363 0.02
364 0.02
365 0.02
366 0.02
367 0.02
368 0.03
369 0.03
370 0.04
371 0.05
372 0.07
373 0.11
374 0.13
375 0.15
376 0.16
377 0.18
378 0.18
379 0.17
380 0.23
381 0.24
382 0.25
383 0.27
384 0.31
385 0.32
386 0.34
387 0.4
388 0.4
389 0.43
390 0.42
391 0.42
392 0.42
393 0.42
394 0.45
395 0.41
396 0.38
397 0.38
398 0.44
399 0.52
400 0.51
401 0.56
402 0.57
403 0.66
404 0.72
405 0.73
406 0.73
407 0.73
408 0.77
409 0.82
410 0.83
411 0.8
412 0.75
413 0.74
414 0.7
415 0.68
416 0.63
417 0.56
418 0.54
419 0.48
420 0.46
421 0.38
422 0.35
423 0.37
424 0.35
425 0.35
426 0.32
427 0.35
428 0.36
429 0.39
430 0.4
431 0.32
432 0.32