Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4R7C2

Protein Details
Accession F4R7C2    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
386-410AAKARDELRRERRKDREREMRMNNMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
216-238RFKHKKIPRGPPSPPAPILRSPP
394-401RRERRKDR
562-583KKGVKRGLEHRGGDEESKKRRG
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 7, mito 4, cyto_pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG mlr:MELLADRAFT_74019  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MASLLQSLPQPVNPSVELVEEDQGTIAQSTQQLTLENQIIIPPYGSRRGWKPRLPDHFGDGGAYPECHLAQYPLEMGRKKHASVGNTLALTVDGEGKIDYTKIAKQGHRDGRHVQAQFKDLVPLAHRADLSAEARSMERPSEEEVDATTQRTRAALEKLTNSKIKAAQPKHVPETGGTVSFVRYTPNTMEGSADGAGKQRIIKMVEVVEDPLEPPRFKHKKIPRGPPSPPAPILRSPPRKVTSLEQKEWMIPPCISNWKNNKGYTIPLDKRLAADGRGLQDTHINDRFAQLSESLYIADRHAREEVRQRSLLQQRLAQKEKEQKEENLRLLAQRAREERSGIPRVVAASGGGAMPTTLAGYGSDSDESGKEGSGSESGAEDGDEAAAKARDELRRERRKDREREMRMNNMGNEKRAQHLARTQNRDISEKIALGLAKPTMSKESMIDSRLFNQESYSGTFGDEDSYNLYDKPLFTGSSAAAAIYKRGGAQDGDDDGGERYGGGTEEGITGAMRNDRFGLGVAGRGFEGADLQEARDGPVQFERDTMATADPFAIDAFLDEAKKGVKRGLEHRGGDEESKKRRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.23
3 0.23
4 0.22
5 0.2
6 0.21
7 0.16
8 0.16
9 0.14
10 0.13
11 0.13
12 0.11
13 0.09
14 0.09
15 0.11
16 0.13
17 0.14
18 0.15
19 0.16
20 0.17
21 0.22
22 0.22
23 0.2
24 0.19
25 0.19
26 0.19
27 0.18
28 0.17
29 0.15
30 0.16
31 0.23
32 0.24
33 0.28
34 0.35
35 0.46
36 0.54
37 0.58
38 0.63
39 0.67
40 0.75
41 0.78
42 0.72
43 0.67
44 0.62
45 0.56
46 0.48
47 0.38
48 0.31
49 0.24
50 0.21
51 0.16
52 0.13
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.11
57 0.11
58 0.13
59 0.15
60 0.18
61 0.24
62 0.27
63 0.29
64 0.36
65 0.39
66 0.38
67 0.42
68 0.42
69 0.39
70 0.41
71 0.45
72 0.41
73 0.37
74 0.36
75 0.29
76 0.24
77 0.22
78 0.16
79 0.13
80 0.07
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.13
89 0.19
90 0.26
91 0.29
92 0.35
93 0.46
94 0.55
95 0.58
96 0.59
97 0.57
98 0.58
99 0.63
100 0.59
101 0.53
102 0.47
103 0.44
104 0.42
105 0.37
106 0.32
107 0.25
108 0.24
109 0.21
110 0.23
111 0.22
112 0.23
113 0.22
114 0.2
115 0.21
116 0.22
117 0.22
118 0.17
119 0.16
120 0.14
121 0.15
122 0.16
123 0.16
124 0.13
125 0.12
126 0.13
127 0.16
128 0.19
129 0.19
130 0.18
131 0.17
132 0.2
133 0.2
134 0.2
135 0.18
136 0.14
137 0.15
138 0.15
139 0.15
140 0.15
141 0.19
142 0.22
143 0.25
144 0.31
145 0.35
146 0.4
147 0.41
148 0.38
149 0.38
150 0.38
151 0.4
152 0.44
153 0.42
154 0.45
155 0.51
156 0.56
157 0.57
158 0.54
159 0.48
160 0.38
161 0.41
162 0.34
163 0.27
164 0.21
165 0.17
166 0.16
167 0.16
168 0.16
169 0.11
170 0.1
171 0.12
172 0.13
173 0.16
174 0.16
175 0.15
176 0.16
177 0.14
178 0.16
179 0.14
180 0.13
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.1
187 0.13
188 0.15
189 0.15
190 0.15
191 0.16
192 0.16
193 0.16
194 0.15
195 0.12
196 0.11
197 0.11
198 0.13
199 0.14
200 0.13
201 0.14
202 0.24
203 0.29
204 0.32
205 0.42
206 0.47
207 0.56
208 0.65
209 0.75
210 0.73
211 0.76
212 0.78
213 0.75
214 0.71
215 0.65
216 0.59
217 0.51
218 0.45
219 0.39
220 0.42
221 0.44
222 0.47
223 0.45
224 0.49
225 0.49
226 0.47
227 0.46
228 0.47
229 0.49
230 0.48
231 0.48
232 0.43
233 0.41
234 0.41
235 0.41
236 0.36
237 0.27
238 0.19
239 0.17
240 0.17
241 0.25
242 0.24
243 0.29
244 0.35
245 0.4
246 0.46
247 0.46
248 0.45
249 0.38
250 0.4
251 0.38
252 0.4
253 0.34
254 0.33
255 0.34
256 0.32
257 0.31
258 0.31
259 0.26
260 0.18
261 0.18
262 0.15
263 0.15
264 0.15
265 0.15
266 0.13
267 0.15
268 0.15
269 0.18
270 0.18
271 0.17
272 0.16
273 0.17
274 0.18
275 0.15
276 0.15
277 0.1
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.1
286 0.1
287 0.11
288 0.13
289 0.13
290 0.15
291 0.24
292 0.28
293 0.29
294 0.3
295 0.3
296 0.36
297 0.42
298 0.45
299 0.37
300 0.37
301 0.39
302 0.46
303 0.48
304 0.41
305 0.41
306 0.45
307 0.47
308 0.5
309 0.46
310 0.43
311 0.48
312 0.53
313 0.49
314 0.42
315 0.38
316 0.32
317 0.32
318 0.3
319 0.23
320 0.22
321 0.23
322 0.24
323 0.24
324 0.26
325 0.26
326 0.31
327 0.33
328 0.28
329 0.26
330 0.23
331 0.23
332 0.21
333 0.17
334 0.1
335 0.06
336 0.06
337 0.05
338 0.05
339 0.04
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.02
345 0.03
346 0.03
347 0.04
348 0.05
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.07
353 0.07
354 0.08
355 0.08
356 0.07
357 0.06
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.05
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.05
373 0.06
374 0.06
375 0.07
376 0.12
377 0.15
378 0.2
379 0.3
380 0.39
381 0.49
382 0.55
383 0.63
384 0.69
385 0.76
386 0.81
387 0.82
388 0.82
389 0.81
390 0.85
391 0.82
392 0.8
393 0.75
394 0.7
395 0.62
396 0.6
397 0.53
398 0.45
399 0.42
400 0.34
401 0.31
402 0.33
403 0.31
404 0.26
405 0.33
406 0.4
407 0.47
408 0.53
409 0.53
410 0.52
411 0.54
412 0.53
413 0.46
414 0.39
415 0.32
416 0.25
417 0.23
418 0.2
419 0.17
420 0.15
421 0.16
422 0.12
423 0.11
424 0.11
425 0.12
426 0.13
427 0.14
428 0.14
429 0.14
430 0.19
431 0.21
432 0.23
433 0.23
434 0.22
435 0.25
436 0.29
437 0.28
438 0.23
439 0.2
440 0.2
441 0.21
442 0.23
443 0.2
444 0.15
445 0.15
446 0.15
447 0.14
448 0.15
449 0.13
450 0.1
451 0.12
452 0.13
453 0.13
454 0.13
455 0.14
456 0.13
457 0.12
458 0.15
459 0.14
460 0.14
461 0.13
462 0.16
463 0.15
464 0.15
465 0.15
466 0.12
467 0.12
468 0.12
469 0.12
470 0.11
471 0.11
472 0.09
473 0.1
474 0.12
475 0.1
476 0.12
477 0.15
478 0.16
479 0.16
480 0.15
481 0.15
482 0.14
483 0.14
484 0.12
485 0.08
486 0.06
487 0.06
488 0.07
489 0.06
490 0.06
491 0.07
492 0.07
493 0.08
494 0.08
495 0.07
496 0.07
497 0.09
498 0.13
499 0.12
500 0.13
501 0.14
502 0.14
503 0.15
504 0.15
505 0.17
506 0.13
507 0.17
508 0.16
509 0.15
510 0.15
511 0.14
512 0.13
513 0.1
514 0.1
515 0.07
516 0.1
517 0.09
518 0.1
519 0.13
520 0.13
521 0.16
522 0.2
523 0.2
524 0.19
525 0.25
526 0.27
527 0.25
528 0.25
529 0.25
530 0.2
531 0.21
532 0.21
533 0.17
534 0.15
535 0.15
536 0.15
537 0.12
538 0.12
539 0.11
540 0.09
541 0.06
542 0.07
543 0.08
544 0.09
545 0.1
546 0.1
547 0.11
548 0.15
549 0.17
550 0.18
551 0.2
552 0.23
553 0.29
554 0.38
555 0.47
556 0.52
557 0.52
558 0.54
559 0.56
560 0.54
561 0.53
562 0.53
563 0.51