Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JL18

Protein Details
Accession S2JL18    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
213-239EEDDEDKKKVKKEKKVKKEKKIKKEKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
219-239KKKVKKEKKVKKEKKIKKEKK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 10.833, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MSSSADIPSGFKPALSKFDSVFDKEILDDDDKELWLIRIPDNLSEKDLASMKIKTPTDKATKKPLAKLEKNDDKYALYKVPTASNLKTESDDEDLDDENVDLGISGHEMVSFDCLVPSREDGGKLAFAPKKFDQLLILNQIVDIPDSIALAQSILDKPVYKREQPEGLKMRFKPYGYYSGQVTDGDAEMKDTKDVAADQCDVAKKRKRVEAEEEDDEDKKKVKKEKKVKKEKKIKKEKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.28
4 0.25
5 0.33
6 0.36
7 0.36
8 0.35
9 0.29
10 0.27
11 0.25
12 0.25
13 0.21
14 0.2
15 0.17
16 0.17
17 0.18
18 0.17
19 0.17
20 0.16
21 0.13
22 0.14
23 0.15
24 0.14
25 0.17
26 0.18
27 0.24
28 0.27
29 0.28
30 0.27
31 0.26
32 0.25
33 0.23
34 0.24
35 0.21
36 0.19
37 0.2
38 0.2
39 0.27
40 0.28
41 0.28
42 0.29
43 0.35
44 0.42
45 0.47
46 0.49
47 0.52
48 0.59
49 0.61
50 0.64
51 0.65
52 0.66
53 0.66
54 0.69
55 0.69
56 0.71
57 0.7
58 0.65
59 0.57
60 0.49
61 0.44
62 0.39
63 0.31
64 0.22
65 0.21
66 0.2
67 0.21
68 0.23
69 0.25
70 0.23
71 0.24
72 0.25
73 0.24
74 0.24
75 0.22
76 0.21
77 0.19
78 0.18
79 0.15
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.11
84 0.08
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.03
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.09
112 0.14
113 0.15
114 0.15
115 0.2
116 0.2
117 0.24
118 0.24
119 0.24
120 0.21
121 0.21
122 0.23
123 0.22
124 0.22
125 0.17
126 0.16
127 0.16
128 0.13
129 0.11
130 0.08
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.1
145 0.19
146 0.23
147 0.24
148 0.28
149 0.32
150 0.41
151 0.42
152 0.51
153 0.5
154 0.51
155 0.55
156 0.52
157 0.53
158 0.48
159 0.46
160 0.41
161 0.36
162 0.39
163 0.35
164 0.35
165 0.31
166 0.29
167 0.3
168 0.25
169 0.22
170 0.15
171 0.12
172 0.11
173 0.1
174 0.1
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.12
182 0.12
183 0.14
184 0.15
185 0.15
186 0.18
187 0.24
188 0.25
189 0.32
190 0.39
191 0.41
192 0.47
193 0.54
194 0.57
195 0.59
196 0.66
197 0.68
198 0.66
199 0.66
200 0.62
201 0.58
202 0.53
203 0.48
204 0.39
205 0.35
206 0.32
207 0.34
208 0.4
209 0.47
210 0.56
211 0.66
212 0.76
213 0.82
214 0.89
215 0.92
216 0.94
217 0.95
218 0.95
219 0.95