Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2K0L0

Protein Details
Accession S2K0L0    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-69ASTTTTTKNPEEKKKKRAKRKPKRHSRKPTLKTKVVVRRLBasic
285-313QQTASGEGKKKRERNRKKKDADGSTKKGGBasic
333-367ASKNRPPRDNTKTKEPRPARPPKEPKAPRPPKDGABasic
369-396NSSNSNSTSKRQNNKKQSNGNSEPKPQVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-63EKKKKRAKRKPKRHSRKPTLKTK
243-267QAAAKAKAAAKKNARKRADKAAQKK
292-311GKKKRERNRKKKDADGSTKK
335-364KNRPPRDNTKTKEPRPARPPKEPKAPRPPK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSASVANSTGPSTPVSASPKPSSKSNDAAASTTTTTKNPEEKKKKRAKRKPKRHSRKPTLKTKVVVRRLPPNLPEEIFNNSVKPWISEETVDYSVYVPGKLSKSKAKESIFSRAYFHFKTMEAVIAFHQGYDGHVFVDSRGNEFRAVVEFALYQKIPKEHKTADARQGTIDQDQDYLDFLESLKEEEKAQSELQNEPADGLTQIERLENRIAMVTAKTLAAEQANKPKTTPLLEHLRAQKAAQAAAKAKAAAKKNARKRADKAAQKKAEQQGTSKASQPSQQPGQQTASGEGKKKRERNRKKKDADGSTKKGGNGGGDTSSVSSATGSTASNASKNRPPRDNTKTKEPRPARPPKEPKAPRPPKDGANNSSNSNSTSKRQNNKKQSNGNSEPKPQVVKILGRPSSAPKKQETTG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.26
3 0.29
4 0.34
5 0.4
6 0.46
7 0.48
8 0.53
9 0.55
10 0.54
11 0.56
12 0.55
13 0.55
14 0.49
15 0.48
16 0.42
17 0.38
18 0.34
19 0.32
20 0.28
21 0.23
22 0.25
23 0.29
24 0.37
25 0.42
26 0.52
27 0.59
28 0.67
29 0.76
30 0.83
31 0.88
32 0.91
33 0.93
34 0.93
35 0.93
36 0.96
37 0.96
38 0.96
39 0.97
40 0.97
41 0.97
42 0.97
43 0.97
44 0.95
45 0.95
46 0.94
47 0.9
48 0.84
49 0.83
50 0.82
51 0.8
52 0.77
53 0.7
54 0.7
55 0.69
56 0.69
57 0.62
58 0.55
59 0.5
60 0.45
61 0.42
62 0.34
63 0.33
64 0.31
65 0.28
66 0.25
67 0.2
68 0.22
69 0.21
70 0.2
71 0.18
72 0.17
73 0.19
74 0.19
75 0.2
76 0.23
77 0.24
78 0.22
79 0.19
80 0.17
81 0.18
82 0.17
83 0.15
84 0.11
85 0.14
86 0.17
87 0.2
88 0.23
89 0.29
90 0.34
91 0.4
92 0.48
93 0.46
94 0.5
95 0.51
96 0.57
97 0.52
98 0.47
99 0.44
100 0.39
101 0.43
102 0.37
103 0.34
104 0.26
105 0.23
106 0.24
107 0.21
108 0.21
109 0.16
110 0.15
111 0.15
112 0.16
113 0.16
114 0.13
115 0.13
116 0.09
117 0.1
118 0.11
119 0.1
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.14
125 0.13
126 0.14
127 0.15
128 0.16
129 0.16
130 0.16
131 0.16
132 0.13
133 0.13
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.1
138 0.12
139 0.11
140 0.1
141 0.11
142 0.16
143 0.19
144 0.22
145 0.27
146 0.27
147 0.35
148 0.43
149 0.46
150 0.5
151 0.5
152 0.47
153 0.42
154 0.42
155 0.35
156 0.29
157 0.24
158 0.16
159 0.13
160 0.12
161 0.11
162 0.1
163 0.09
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.11
175 0.12
176 0.13
177 0.15
178 0.16
179 0.16
180 0.19
181 0.18
182 0.17
183 0.15
184 0.14
185 0.11
186 0.09
187 0.09
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.06
207 0.07
208 0.09
209 0.11
210 0.19
211 0.22
212 0.22
213 0.22
214 0.23
215 0.23
216 0.24
217 0.23
218 0.2
219 0.27
220 0.28
221 0.33
222 0.37
223 0.38
224 0.36
225 0.34
226 0.31
227 0.23
228 0.24
229 0.2
230 0.17
231 0.17
232 0.18
233 0.19
234 0.17
235 0.18
236 0.21
237 0.24
238 0.29
239 0.36
240 0.43
241 0.52
242 0.61
243 0.65
244 0.66
245 0.67
246 0.71
247 0.71
248 0.71
249 0.71
250 0.72
251 0.72
252 0.68
253 0.71
254 0.67
255 0.64
256 0.56
257 0.49
258 0.47
259 0.45
260 0.44
261 0.41
262 0.36
263 0.32
264 0.35
265 0.36
266 0.34
267 0.35
268 0.37
269 0.34
270 0.35
271 0.37
272 0.34
273 0.31
274 0.28
275 0.3
276 0.3
277 0.34
278 0.36
279 0.42
280 0.48
281 0.55
282 0.63
283 0.67
284 0.76
285 0.81
286 0.87
287 0.89
288 0.89
289 0.9
290 0.89
291 0.89
292 0.88
293 0.87
294 0.82
295 0.78
296 0.73
297 0.63
298 0.55
299 0.45
300 0.36
301 0.28
302 0.23
303 0.17
304 0.15
305 0.15
306 0.13
307 0.13
308 0.11
309 0.09
310 0.07
311 0.06
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.08
316 0.1
317 0.11
318 0.16
319 0.18
320 0.22
321 0.27
322 0.36
323 0.43
324 0.48
325 0.52
326 0.58
327 0.66
328 0.72
329 0.71
330 0.74
331 0.77
332 0.76
333 0.82
334 0.78
335 0.77
336 0.77
337 0.82
338 0.79
339 0.79
340 0.84
341 0.82
342 0.87
343 0.86
344 0.86
345 0.86
346 0.89
347 0.84
348 0.83
349 0.79
350 0.76
351 0.78
352 0.76
353 0.71
354 0.68
355 0.64
356 0.58
357 0.56
358 0.49
359 0.41
360 0.37
361 0.35
362 0.31
363 0.39
364 0.46
365 0.53
366 0.63
367 0.71
368 0.77
369 0.84
370 0.9
371 0.9
372 0.9
373 0.9
374 0.89
375 0.88
376 0.83
377 0.8
378 0.75
379 0.7
380 0.64
381 0.54
382 0.52
383 0.48
384 0.48
385 0.49
386 0.54
387 0.52
388 0.49
389 0.52
390 0.54
391 0.59
392 0.58
393 0.55
394 0.52