Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JMK4

Protein Details
Accession S2JMK4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-67AEPTSPKKKDTHHYQQQPSSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
149-152KKKK
180-185KKKKAA
202-207SKKKKA
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.333, nucl 13, cyto 12.5, mito_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010304  SMN_Tudor  
IPR002999  Tudor  
IPR043560  ZGPAT  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0045892  P:negative regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06003  SMN  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50304  TUDOR  
CDD cd21182  Tudor_SMN_SPF30-like  
Amino Acid Sequences MSAEEIESYKFQLEQVELALQSDPENEELKKLQHDLQELITMFEAVAEPTSPKKKDTHHYQQQPSSTPATNTTTALKTHEFSVDQEVMARWSGDGEFYKATITAIGGADQVFSVKFKGYSEAEFVKAEDIKPIQTKKRTGVFENVGEPKKKKKDTTASSASASSSAAAGGGGTVAPTGAKKKKAAEFESKKNAWLNFATGGSKKKKATPVINKKSIFKTPDNPEGKVGVIGSGKGMTSYQQRVHFAEDVITFLPALPQEKMKVSVAPLRKHIVTTRRGDKPNHWVTMKLKHSIKLKKSTGEKDDSRRMRLLNQMITNLKARSLVTKVFASASCDANQPLLARDLKKNTDMLSKITADGDMQDLLAYIGARDKICIVVIDFAGLTTNSEDLEQFLRNNPNIVKLIIDKLLYIDSIHVYDSDEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.19
4 0.18
5 0.18
6 0.18
7 0.15
8 0.14
9 0.14
10 0.14
11 0.13
12 0.16
13 0.15
14 0.18
15 0.21
16 0.23
17 0.26
18 0.28
19 0.31
20 0.33
21 0.36
22 0.35
23 0.34
24 0.37
25 0.33
26 0.31
27 0.25
28 0.2
29 0.16
30 0.14
31 0.13
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.08
36 0.15
37 0.23
38 0.24
39 0.26
40 0.32
41 0.39
42 0.48
43 0.57
44 0.62
45 0.65
46 0.74
47 0.81
48 0.82
49 0.79
50 0.73
51 0.66
52 0.6
53 0.51
54 0.42
55 0.38
56 0.36
57 0.32
58 0.29
59 0.3
60 0.27
61 0.26
62 0.28
63 0.26
64 0.22
65 0.22
66 0.24
67 0.21
68 0.21
69 0.27
70 0.24
71 0.21
72 0.22
73 0.2
74 0.18
75 0.18
76 0.16
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.11
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.1
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.13
105 0.14
106 0.15
107 0.2
108 0.21
109 0.22
110 0.22
111 0.21
112 0.2
113 0.19
114 0.18
115 0.17
116 0.15
117 0.17
118 0.22
119 0.27
120 0.32
121 0.37
122 0.41
123 0.44
124 0.5
125 0.51
126 0.49
127 0.51
128 0.48
129 0.44
130 0.46
131 0.47
132 0.42
133 0.42
134 0.41
135 0.42
136 0.47
137 0.5
138 0.48
139 0.51
140 0.58
141 0.61
142 0.68
143 0.66
144 0.6
145 0.56
146 0.52
147 0.43
148 0.33
149 0.26
150 0.17
151 0.09
152 0.07
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.02
159 0.02
160 0.02
161 0.02
162 0.03
163 0.03
164 0.09
165 0.13
166 0.17
167 0.19
168 0.25
169 0.3
170 0.37
171 0.42
172 0.48
173 0.51
174 0.56
175 0.62
176 0.57
177 0.54
178 0.5
179 0.45
180 0.37
181 0.3
182 0.24
183 0.17
184 0.17
185 0.17
186 0.16
187 0.21
188 0.22
189 0.26
190 0.26
191 0.29
192 0.35
193 0.4
194 0.47
195 0.53
196 0.61
197 0.65
198 0.72
199 0.69
200 0.66
201 0.63
202 0.58
203 0.52
204 0.44
205 0.43
206 0.4
207 0.48
208 0.47
209 0.44
210 0.41
211 0.37
212 0.33
213 0.26
214 0.2
215 0.12
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.1
225 0.14
226 0.18
227 0.21
228 0.24
229 0.25
230 0.28
231 0.27
232 0.23
233 0.22
234 0.18
235 0.16
236 0.14
237 0.13
238 0.09
239 0.08
240 0.09
241 0.07
242 0.08
243 0.07
244 0.09
245 0.1
246 0.12
247 0.14
248 0.14
249 0.15
250 0.16
251 0.22
252 0.27
253 0.28
254 0.3
255 0.31
256 0.31
257 0.31
258 0.34
259 0.35
260 0.36
261 0.4
262 0.45
263 0.5
264 0.54
265 0.56
266 0.56
267 0.59
268 0.59
269 0.57
270 0.5
271 0.46
272 0.45
273 0.52
274 0.5
275 0.47
276 0.41
277 0.41
278 0.49
279 0.54
280 0.58
281 0.58
282 0.58
283 0.58
284 0.64
285 0.66
286 0.64
287 0.63
288 0.62
289 0.6
290 0.66
291 0.64
292 0.6
293 0.56
294 0.5
295 0.47
296 0.49
297 0.47
298 0.44
299 0.41
300 0.41
301 0.4
302 0.41
303 0.4
304 0.32
305 0.26
306 0.21
307 0.2
308 0.19
309 0.21
310 0.21
311 0.21
312 0.21
313 0.22
314 0.22
315 0.22
316 0.23
317 0.22
318 0.22
319 0.2
320 0.21
321 0.2
322 0.19
323 0.19
324 0.15
325 0.15
326 0.17
327 0.2
328 0.21
329 0.27
330 0.33
331 0.35
332 0.37
333 0.37
334 0.35
335 0.39
336 0.37
337 0.34
338 0.33
339 0.31
340 0.29
341 0.28
342 0.26
343 0.18
344 0.17
345 0.15
346 0.1
347 0.09
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.08
352 0.07
353 0.05
354 0.08
355 0.11
356 0.12
357 0.12
358 0.13
359 0.13
360 0.14
361 0.15
362 0.13
363 0.13
364 0.13
365 0.14
366 0.13
367 0.12
368 0.12
369 0.11
370 0.11
371 0.08
372 0.09
373 0.08
374 0.09
375 0.09
376 0.1
377 0.13
378 0.13
379 0.14
380 0.2
381 0.27
382 0.27
383 0.33
384 0.32
385 0.35
386 0.35
387 0.34
388 0.31
389 0.27
390 0.3
391 0.28
392 0.27
393 0.21
394 0.2
395 0.21
396 0.18
397 0.16
398 0.14
399 0.13
400 0.13
401 0.13
402 0.12