Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JUP4

Protein Details
Accession S2JUP4    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-34QTTPQRPDVKKSKTIDKKDTCPPPAHydrophilic
46-65GNKLVLPKRRAKPLEKKEVIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-59PKRRAKPL
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MESSNKRPAQTTPQRPDVKKSKTIDKKDTCPPPAKKEPVSVNSTRGNKLVLPKRRAKPLEKKEVISEAIIQEVKEGKLPDKKECFDCPDCGESIFPPYPPKLHRLIKKLKQNQIQYEKEQRAAYELEVIECKRNNMFIKPFILQDVGLSKNDKRVICRTHQIELKFKPMAKEKGYPEHIDFDAIADRIDLFQDELLGIIERKVSSTYLDAAYCRFEKMGVKARSAKEMLAVFEDFKPGYYGVKGTDAIMQALFSLFLETSLITINNVKPLTPIEFIQQILVPEAGLRLIRQDRGGKVDLEEAKRIMKESEEYGSIVYYKVKKDKNMPDEKEIAKIQQQDEHGEEQPNEYISFPMPSNTEEEEDDENESEDILSSQLSMVSQVDEFDDQVSSQTPELQD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.75
3 0.79
4 0.78
5 0.76
6 0.73
7 0.71
8 0.72
9 0.73
10 0.8
11 0.81
12 0.79
13 0.78
14 0.79
15 0.83
16 0.79
17 0.79
18 0.77
19 0.75
20 0.77
21 0.78
22 0.73
23 0.71
24 0.73
25 0.7
26 0.7
27 0.63
28 0.58
29 0.58
30 0.59
31 0.53
32 0.44
33 0.4
34 0.36
35 0.42
36 0.46
37 0.48
38 0.52
39 0.59
40 0.65
41 0.73
42 0.77
43 0.77
44 0.78
45 0.79
46 0.82
47 0.77
48 0.74
49 0.67
50 0.65
51 0.57
52 0.47
53 0.39
54 0.28
55 0.27
56 0.25
57 0.2
58 0.18
59 0.19
60 0.18
61 0.18
62 0.19
63 0.2
64 0.27
65 0.3
66 0.37
67 0.42
68 0.45
69 0.47
70 0.51
71 0.54
72 0.51
73 0.51
74 0.46
75 0.41
76 0.38
77 0.33
78 0.29
79 0.22
80 0.25
81 0.22
82 0.19
83 0.2
84 0.21
85 0.25
86 0.26
87 0.3
88 0.32
89 0.39
90 0.46
91 0.52
92 0.61
93 0.64
94 0.73
95 0.78
96 0.78
97 0.79
98 0.79
99 0.79
100 0.78
101 0.75
102 0.7
103 0.71
104 0.64
105 0.6
106 0.53
107 0.43
108 0.36
109 0.32
110 0.26
111 0.22
112 0.19
113 0.16
114 0.18
115 0.19
116 0.19
117 0.19
118 0.2
119 0.15
120 0.2
121 0.21
122 0.24
123 0.28
124 0.27
125 0.31
126 0.31
127 0.3
128 0.27
129 0.25
130 0.19
131 0.16
132 0.16
133 0.14
134 0.14
135 0.16
136 0.15
137 0.2
138 0.25
139 0.25
140 0.25
141 0.31
142 0.35
143 0.38
144 0.45
145 0.43
146 0.44
147 0.47
148 0.46
149 0.46
150 0.43
151 0.44
152 0.39
153 0.37
154 0.35
155 0.38
156 0.41
157 0.37
158 0.41
159 0.39
160 0.45
161 0.47
162 0.45
163 0.39
164 0.37
165 0.33
166 0.27
167 0.23
168 0.16
169 0.14
170 0.12
171 0.1
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.08
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.09
202 0.09
203 0.11
204 0.16
205 0.25
206 0.25
207 0.28
208 0.35
209 0.36
210 0.39
211 0.37
212 0.32
213 0.26
214 0.25
215 0.22
216 0.17
217 0.17
218 0.14
219 0.13
220 0.15
221 0.11
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.08
227 0.09
228 0.09
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.14
233 0.13
234 0.13
235 0.12
236 0.11
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.04
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.04
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.08
251 0.09
252 0.14
253 0.14
254 0.13
255 0.13
256 0.15
257 0.19
258 0.17
259 0.17
260 0.15
261 0.17
262 0.17
263 0.18
264 0.17
265 0.14
266 0.13
267 0.12
268 0.1
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.1
275 0.13
276 0.14
277 0.18
278 0.23
279 0.24
280 0.29
281 0.31
282 0.27
283 0.25
284 0.31
285 0.33
286 0.32
287 0.32
288 0.27
289 0.28
290 0.28
291 0.28
292 0.21
293 0.17
294 0.17
295 0.17
296 0.19
297 0.18
298 0.18
299 0.17
300 0.16
301 0.15
302 0.13
303 0.16
304 0.17
305 0.21
306 0.29
307 0.33
308 0.38
309 0.48
310 0.57
311 0.63
312 0.7
313 0.7
314 0.68
315 0.71
316 0.66
317 0.62
318 0.53
319 0.46
320 0.4
321 0.41
322 0.36
323 0.34
324 0.35
325 0.33
326 0.35
327 0.36
328 0.34
329 0.32
330 0.31
331 0.28
332 0.28
333 0.25
334 0.22
335 0.19
336 0.17
337 0.14
338 0.16
339 0.14
340 0.15
341 0.15
342 0.15
343 0.19
344 0.2
345 0.21
346 0.19
347 0.23
348 0.23
349 0.23
350 0.24
351 0.21
352 0.19
353 0.17
354 0.16
355 0.13
356 0.1
357 0.09
358 0.07
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.1
368 0.1
369 0.12
370 0.12
371 0.12
372 0.12
373 0.12
374 0.1
375 0.11
376 0.13
377 0.13
378 0.12