FuNGI

S2J0N2

Protein Details

Accession

S2J0N2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
594-620	QTPPTRQLFDTRRKKHHRSRDRIQGLI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
607-609	KKH

Subcellular Location(s)

plas 18, mito 3, nucl 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR028802 SMG8 IPR019354 SMG8/SMG9
Gene Ontology	GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF10220 Smg8_Smg9

Amino Acid Sequences

MHTHLAQYQSSCWKHWDIAVPNSLFEKKDNERMNPALMGWWGPAKGVPIVVFVIADVGFSSIVPATIKKMQDTLQSRMKNIFRALHLIPMKPEGNSSHPPVEVRSLFILPSTSQPVIHIVPSTPRDTASRIKADFSFDEPISLSSYISSKESPATLLYHDYSDRLLKNYVNIWIKTATSRHPLHNNFNNRKSDIPKVAPLPTGLQFTSAIVPLMSFIFNQPITEDGVEFKKVISAQFPSTKGMIQQIEVILRKKIRDNIEIERVFSKSHSMDVMQKCHEVYLQDSPPFYTEKYHAWKKNNVMRMYRSLARGPCMEEYAARLERECDNVWKGGRQSCEHISLTGRACRLKVGHEKEVISPKQLRDERAVIVDPAKHNSGYNFFHACDCGKTQRVREDPFDIQDANIKFYNKFSCCLGVGRAALDIKQSTFGEKQDLVLNCDEIPAHDAALLYLGSSNMYKNNVGLDKVEGFMNNTNFLIPWSITTMNELKLRQQEAASTVANTAINDPPPKAINDAFLRSNVSNQPATRETEWPVLGRAVSMQKTNTHVIAAAPVVASLEAFPALGSNPTPSAGTTSSSSPAPSNTSVSTATTPQTPPTRQLFDTRRKKHHRSRDRIQGLIRGYVGAEYECPHGHRFLSCGEGRVCKLGHAGHPKEHGNYFVHQDLPIYVVCPCSYANNVSGTGNASNSNVNKSATNANHNMEITAQLQRLYVVTPEEAITISIEPKIKIHIPGTDQHVIVNVDIDCLSFGPGGLYVLRLPFIYSDSNGTPIPVEADVQKRLKSAVLQRDCIKFHYRETDKWIAP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.4
3	0.44
4	0.41
5	0.46
6	0.52
7	0.48
8	0.46
9	0.48
10	0.45
11	0.37
12	0.32
13	0.33
14	0.3
15	0.39
16	0.45
17	0.45
18	0.5
19	0.52
20	0.53
21	0.46
22	0.41
23	0.34
24	0.28
25	0.24
26	0.18
27	0.18
28	0.15
29	0.14
30	0.14
31	0.14
32	0.14
33	0.15
34	0.15
35	0.14
36	0.14
37	0.14
38	0.13
39	0.11
40	0.11
41	0.09
42	0.08
43	0.06
44	0.06
45	0.06
46	0.06
47	0.07
48	0.06
49	0.07
50	0.08
51	0.09
52	0.13
53	0.19
54	0.21
55	0.21
56	0.24
57	0.26
58	0.35
59	0.4
60	0.42
61	0.46
62	0.47
63	0.48
64	0.53
65	0.53
66	0.49
67	0.48
68	0.46
69	0.39
70	0.42
71	0.41
72	0.42
73	0.42
74	0.39
75	0.35
76	0.36
77	0.34
78	0.29
79	0.31
80	0.25
81	0.29
82	0.32
83	0.35
84	0.33
85	0.34
86	0.34
87	0.34
88	0.38
89	0.32
90	0.3
91	0.27
92	0.24
93	0.23
94	0.22
95	0.22
96	0.15
97	0.18
98	0.21
99	0.18
100	0.18
101	0.19
102	0.22
103	0.21
104	0.22
105	0.19
106	0.15
107	0.21
108	0.24
109	0.26
110	0.23
111	0.23
112	0.24
113	0.27
114	0.33
115	0.35
116	0.39
117	0.37
118	0.4
119	0.4
120	0.42
121	0.4
122	0.36
123	0.34
124	0.26
125	0.26
126	0.24
127	0.23
128	0.21
129	0.2
130	0.16
131	0.11
132	0.13
133	0.13
134	0.14
135	0.14
136	0.12
137	0.14
138	0.14
139	0.14
140	0.15
141	0.15
142	0.15
143	0.18
144	0.17
145	0.18
146	0.18
147	0.17
148	0.17
149	0.21
150	0.2
151	0.19
152	0.21
153	0.19
154	0.22
155	0.24
156	0.3
157	0.31
158	0.3
159	0.3
160	0.29
161	0.29
162	0.29
163	0.29
164	0.27
165	0.29
166	0.32
167	0.36
168	0.44
169	0.48
170	0.55
171	0.61
172	0.67
173	0.68
174	0.72
175	0.71
176	0.64
177	0.63
178	0.58
179	0.57
180	0.53
181	0.48
182	0.46
183	0.44
184	0.45
185	0.42
186	0.38
187	0.34
188	0.28
189	0.27
190	0.22
191	0.2
192	0.17
193	0.17
194	0.17
195	0.14
196	0.12
197	0.08
198	0.08
199	0.07
200	0.08
201	0.07
202	0.06
203	0.07
204	0.1
205	0.1
206	0.1
207	0.1
208	0.1
209	0.12
210	0.12
211	0.12
212	0.1
213	0.12
214	0.13
215	0.13
216	0.12
217	0.12
218	0.13
219	0.13
220	0.14
221	0.15
222	0.19
223	0.24
224	0.26
225	0.25
226	0.25
227	0.25
228	0.23
229	0.26
230	0.22
231	0.17
232	0.18
233	0.17
234	0.2
235	0.22
236	0.22
237	0.2
238	0.21
239	0.22
240	0.25
241	0.3
242	0.32
243	0.35
244	0.39
245	0.41
246	0.49
247	0.48
248	0.45
249	0.4
250	0.36
251	0.3
252	0.26
253	0.23
254	0.14
255	0.14
256	0.14
257	0.14
258	0.21
259	0.25
260	0.3
261	0.27
262	0.28
263	0.27
264	0.26
265	0.25
266	0.18
267	0.16
268	0.19
269	0.21
270	0.22
271	0.22
272	0.22
273	0.22
274	0.22
275	0.2
276	0.15
277	0.14
278	0.19
279	0.27
280	0.35
281	0.41
282	0.45
283	0.5
284	0.56
285	0.61
286	0.63
287	0.6
288	0.55
289	0.53
290	0.53
291	0.51
292	0.46
293	0.42
294	0.38
295	0.35
296	0.33
297	0.3
298	0.27
299	0.23
300	0.21
301	0.19
302	0.14
303	0.15
304	0.18
305	0.19
306	0.16
307	0.16
308	0.16
309	0.17
310	0.21
311	0.2
312	0.18
313	0.17
314	0.2
315	0.2
316	0.21
317	0.23
318	0.23
319	0.25
320	0.23
321	0.26
322	0.26
323	0.3
324	0.27
325	0.26
326	0.23
327	0.24
328	0.25
329	0.23
330	0.22
331	0.18
332	0.18
333	0.19
334	0.19
335	0.21
336	0.28
337	0.31
338	0.34
339	0.36
340	0.37
341	0.39
342	0.46
343	0.41
344	0.35
345	0.33
346	0.28
347	0.35
348	0.36
349	0.34
350	0.3
351	0.32
352	0.29
353	0.28
354	0.27
355	0.19
356	0.18
357	0.19
358	0.15
359	0.15
360	0.15
361	0.13
362	0.13
363	0.14
364	0.17
365	0.16
366	0.19
367	0.18
368	0.17
369	0.17
370	0.18
371	0.18
372	0.14
373	0.14
374	0.15
375	0.18
376	0.2
377	0.23
378	0.3
379	0.34
380	0.36
381	0.37
382	0.39
383	0.35
384	0.34
385	0.33
386	0.25
387	0.2
388	0.22
389	0.19
390	0.16
391	0.17
392	0.16
393	0.15
394	0.17
395	0.23
396	0.19
397	0.19
398	0.18
399	0.18
400	0.18
401	0.18
402	0.17
403	0.13
404	0.13
405	0.12
406	0.12
407	0.1
408	0.1
409	0.1
410	0.09
411	0.07
412	0.09
413	0.09
414	0.1
415	0.12
416	0.12
417	0.14
418	0.14
419	0.15
420	0.18
421	0.18
422	0.18
423	0.17
424	0.17
425	0.14
426	0.14
427	0.13
428	0.08
429	0.09
430	0.07
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.07
436	0.06
437	0.04
438	0.05
439	0.05
440	0.04
441	0.05
442	0.05
443	0.06
444	0.08
445	0.08
446	0.08
447	0.11
448	0.12
449	0.12
450	0.12
451	0.13
452	0.12
453	0.12
454	0.13
455	0.09
456	0.1
457	0.13
458	0.13
459	0.12
460	0.12
461	0.11
462	0.11
463	0.11
464	0.11
465	0.07
466	0.07
467	0.09
468	0.1
469	0.1
470	0.13
471	0.14
472	0.16
473	0.19
474	0.19
475	0.19
476	0.23
477	0.24
478	0.23
479	0.21
480	0.19
481	0.18
482	0.21
483	0.18
484	0.13
485	0.12
486	0.13
487	0.13
488	0.12
489	0.12
490	0.1
491	0.12
492	0.13
493	0.13
494	0.13
495	0.14
496	0.15
497	0.15
498	0.14
499	0.18
500	0.2
501	0.22
502	0.22
503	0.21
504	0.24
505	0.21
506	0.24
507	0.21
508	0.21
509	0.21
510	0.2
511	0.24
512	0.23
513	0.27
514	0.26
515	0.26
516	0.26
517	0.27
518	0.28
519	0.24
520	0.23
521	0.2
522	0.17
523	0.15
524	0.14
525	0.14
526	0.15
527	0.16
528	0.16
529	0.18
530	0.22
531	0.23
532	0.21
533	0.17
534	0.16
535	0.14
536	0.15
537	0.12
538	0.09
539	0.07
540	0.06
541	0.06
542	0.05
543	0.05
544	0.04
545	0.04
546	0.04
547	0.04
548	0.03
549	0.04
550	0.04
551	0.05
552	0.05
553	0.06
554	0.07
555	0.08
556	0.08
557	0.08
558	0.11
559	0.11
560	0.13
561	0.13
562	0.14
563	0.15
564	0.16
565	0.17
566	0.14
567	0.15
568	0.17
569	0.16
570	0.17
571	0.16
572	0.18
573	0.18
574	0.19
575	0.2
576	0.18
577	0.17
578	0.18
579	0.18
580	0.2
581	0.26
582	0.26
583	0.3
584	0.34
585	0.38
586	0.36
587	0.45
588	0.49
589	0.53
590	0.62
591	0.66
592	0.7
593	0.75
594	0.84
595	0.85
596	0.88
597	0.88
598	0.87
599	0.88
600	0.88
601	0.85
602	0.8
603	0.72
604	0.67
605	0.58
606	0.5
607	0.41
608	0.3
609	0.24
610	0.19
611	0.17
612	0.1
613	0.09
614	0.08
615	0.11
616	0.11
617	0.13
618	0.14
619	0.15
620	0.16
621	0.16
622	0.16
623	0.15
624	0.21
625	0.2
626	0.23
627	0.24
628	0.27
629	0.27
630	0.29
631	0.27
632	0.21
633	0.24
634	0.23
635	0.28
636	0.34
637	0.37
638	0.38
639	0.43
640	0.45
641	0.45
642	0.43
643	0.39
644	0.32
645	0.31
646	0.31
647	0.28
648	0.27
649	0.23
650	0.23
651	0.19
652	0.18
653	0.16
654	0.12
655	0.1
656	0.1
657	0.1
658	0.11
659	0.11
660	0.12
661	0.15
662	0.16
663	0.18
664	0.19
665	0.21
666	0.2
667	0.2
668	0.2
669	0.18
670	0.16
671	0.15
672	0.13
673	0.17
674	0.18
675	0.21
676	0.21
677	0.21
678	0.21
679	0.23
680	0.3
681	0.29
682	0.35
683	0.36
684	0.36
685	0.38
686	0.38
687	0.35
688	0.28
689	0.26
690	0.21
691	0.21
692	0.19
693	0.16
694	0.16
695	0.16
696	0.16
697	0.14
698	0.14
699	0.11
700	0.11
701	0.12
702	0.12
703	0.12
704	0.12
705	0.11
706	0.11
707	0.1
708	0.11
709	0.13
710	0.15
711	0.15
712	0.15
713	0.2
714	0.22
715	0.25
716	0.27
717	0.29
718	0.3
719	0.35
720	0.42
721	0.42
722	0.38
723	0.34
724	0.35
725	0.3
726	0.27
727	0.25
728	0.17
729	0.14
730	0.14
731	0.14
732	0.1
733	0.1
734	0.11
735	0.08
736	0.08
737	0.07
738	0.08
739	0.09
740	0.09
741	0.1
742	0.09
743	0.1
744	0.11
745	0.1
746	0.11
747	0.11
748	0.13
749	0.15
750	0.15
751	0.19
752	0.2
753	0.23
754	0.22
755	0.22
756	0.19
757	0.17
758	0.18
759	0.14
760	0.14
761	0.16
762	0.22
763	0.29
764	0.32
765	0.33
766	0.32
767	0.32
768	0.34
769	0.36
770	0.4
771	0.44
772	0.47
773	0.52
774	0.57
775	0.62
776	0.61
777	0.59
778	0.57
779	0.49
780	0.48
781	0.53
782	0.52
783	0.51
784	0.58

S2J0N2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer