Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2K5F4

Protein Details
Accession S2K5F4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
242-263ETKKQIQQRETRSRDRKEQPDDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPKRKTAAAKKVQKEEETVVKVETTMETADTETKIENTSVKRKHSEIVKEEEEPQEKQVTNESGSSSSSSLSDRMAKLKELKRRRATEVDQGNRRDRNLEFQRSKENPKLEARDERKKAEALKLLEKQEAEDKGEDYERKQFWKYSAESAAAWEKKMAKKAKMANNGFTDHSQAAHKKYIRLMSEFKPDMGAYTEKRMLDIERAIRNGEDPSDISAMANSLDYARLDDKPSKEAVDRLAEETKKQIQQRETRSRDRKEQPDDISWINEKNRVFNQKIARFYDKYTKEIRENLERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.69
3 0.64
4 0.62
5 0.56
6 0.49
7 0.4
8 0.34
9 0.31
10 0.27
11 0.22
12 0.15
13 0.11
14 0.11
15 0.1
16 0.11
17 0.14
18 0.13
19 0.13
20 0.13
21 0.13
22 0.14
23 0.14
24 0.18
25 0.22
26 0.31
27 0.37
28 0.42
29 0.45
30 0.46
31 0.51
32 0.54
33 0.57
34 0.53
35 0.55
36 0.53
37 0.51
38 0.53
39 0.53
40 0.48
41 0.4
42 0.37
43 0.34
44 0.31
45 0.29
46 0.31
47 0.28
48 0.26
49 0.26
50 0.25
51 0.2
52 0.21
53 0.22
54 0.16
55 0.14
56 0.13
57 0.12
58 0.12
59 0.13
60 0.16
61 0.16
62 0.21
63 0.22
64 0.24
65 0.32
66 0.37
67 0.45
68 0.5
69 0.59
70 0.64
71 0.68
72 0.71
73 0.7
74 0.69
75 0.68
76 0.69
77 0.67
78 0.64
79 0.64
80 0.64
81 0.57
82 0.54
83 0.48
84 0.38
85 0.4
86 0.41
87 0.47
88 0.44
89 0.45
90 0.54
91 0.54
92 0.6
93 0.56
94 0.5
95 0.45
96 0.48
97 0.51
98 0.46
99 0.52
100 0.52
101 0.56
102 0.57
103 0.54
104 0.5
105 0.47
106 0.46
107 0.42
108 0.41
109 0.35
110 0.38
111 0.41
112 0.4
113 0.39
114 0.36
115 0.31
116 0.3
117 0.27
118 0.22
119 0.17
120 0.16
121 0.15
122 0.18
123 0.17
124 0.14
125 0.2
126 0.19
127 0.21
128 0.22
129 0.23
130 0.22
131 0.28
132 0.28
133 0.25
134 0.26
135 0.24
136 0.23
137 0.23
138 0.26
139 0.21
140 0.19
141 0.17
142 0.19
143 0.2
144 0.27
145 0.3
146 0.27
147 0.33
148 0.41
149 0.48
150 0.54
151 0.54
152 0.52
153 0.51
154 0.5
155 0.45
156 0.37
157 0.31
158 0.21
159 0.2
160 0.18
161 0.17
162 0.18
163 0.23
164 0.24
165 0.24
166 0.27
167 0.32
168 0.31
169 0.32
170 0.34
171 0.32
172 0.39
173 0.37
174 0.34
175 0.3
176 0.27
177 0.24
178 0.22
179 0.21
180 0.14
181 0.18
182 0.22
183 0.2
184 0.21
185 0.21
186 0.19
187 0.19
188 0.23
189 0.24
190 0.24
191 0.25
192 0.25
193 0.24
194 0.24
195 0.22
196 0.18
197 0.13
198 0.11
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.11
203 0.1
204 0.1
205 0.08
206 0.08
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.08
212 0.1
213 0.12
214 0.15
215 0.21
216 0.22
217 0.24
218 0.26
219 0.26
220 0.26
221 0.26
222 0.27
223 0.28
224 0.28
225 0.29
226 0.35
227 0.33
228 0.32
229 0.35
230 0.38
231 0.37
232 0.39
233 0.43
234 0.44
235 0.53
236 0.63
237 0.68
238 0.69
239 0.74
240 0.8
241 0.8
242 0.82
243 0.82
244 0.81
245 0.79
246 0.79
247 0.74
248 0.7
249 0.68
250 0.6
251 0.55
252 0.47
253 0.44
254 0.38
255 0.37
256 0.32
257 0.34
258 0.39
259 0.43
260 0.44
261 0.46
262 0.54
263 0.57
264 0.63
265 0.64
266 0.63
267 0.57
268 0.59
269 0.62
270 0.55
271 0.53
272 0.54
273 0.53
274 0.52
275 0.57
276 0.58
277 0.58
278 0.57
279 0.54