Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JME4

Protein Details
Accession S2JME4    Localization Confidence Low Confidence Score 7.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
313-332VSIHEPKKEWKCQYEKTRFYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 10, cyto_nucl 10, nucl 8, mito 5, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019039  T4-Rnl1-like_N  
Gene Ontology GO:0016874  F:ligase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF09511  RNA_lig_T4_1  
Amino Acid Sequences MVGIDIPHFTVDQARVQHVIEQLYQVKLDTPKELRSKDFVLEDGQVWTSWTMRESVYKKKQDTFPTMSRGLFTKQLSDGQYQIMVRGYDKFFNVLETKATQWPSIMEATQGPYEVMAKENGCIIFIAALSEIKVVVTSKHSIPADKTDVKAHAGVGYNWVLRHLATVQLTEEDLAAWLFDKNITLVAELCDDEFEQHILPYVDKDRGLYLHGINYNTSELYTLPVSVVEQTAKEFGFHATDFTVFDTAEQVKEFGHVMQQTGIYNGREVEGAVVRCKRNGMDFMFKIKNEQYLMYREYREITNAMLEVKDGCVSIHEPKKEWKCQYEKTRFYIEWLRKRVADHPEWFLEFKANKGIIHVRQEFEKYWDNGRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.26
3 0.26
4 0.3
5 0.28
6 0.29
7 0.24
8 0.26
9 0.27
10 0.27
11 0.26
12 0.22
13 0.24
14 0.25
15 0.26
16 0.29
17 0.29
18 0.36
19 0.44
20 0.48
21 0.47
22 0.48
23 0.49
24 0.46
25 0.44
26 0.37
27 0.32
28 0.3
29 0.27
30 0.24
31 0.21
32 0.17
33 0.16
34 0.15
35 0.13
36 0.12
37 0.12
38 0.11
39 0.12
40 0.2
41 0.23
42 0.33
43 0.43
44 0.5
45 0.54
46 0.6
47 0.66
48 0.66
49 0.71
50 0.68
51 0.64
52 0.62
53 0.61
54 0.54
55 0.48
56 0.42
57 0.36
58 0.34
59 0.28
60 0.25
61 0.24
62 0.28
63 0.3
64 0.3
65 0.28
66 0.23
67 0.26
68 0.22
69 0.21
70 0.18
71 0.16
72 0.15
73 0.18
74 0.19
75 0.19
76 0.19
77 0.2
78 0.18
79 0.21
80 0.21
81 0.17
82 0.18
83 0.17
84 0.19
85 0.22
86 0.23
87 0.2
88 0.18
89 0.18
90 0.18
91 0.18
92 0.16
93 0.12
94 0.12
95 0.14
96 0.14
97 0.13
98 0.11
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.12
107 0.12
108 0.11
109 0.1
110 0.09
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.04
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.08
124 0.11
125 0.11
126 0.17
127 0.18
128 0.19
129 0.2
130 0.25
131 0.28
132 0.28
133 0.29
134 0.26
135 0.27
136 0.27
137 0.26
138 0.2
139 0.17
140 0.16
141 0.15
142 0.15
143 0.15
144 0.15
145 0.14
146 0.14
147 0.11
148 0.09
149 0.1
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.1
154 0.09
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.08
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.1
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.1
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.11
197 0.14
198 0.16
199 0.16
200 0.15
201 0.16
202 0.15
203 0.13
204 0.12
205 0.08
206 0.06
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.08
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.08
232 0.08
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.08
239 0.1
240 0.1
241 0.07
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.12
246 0.13
247 0.13
248 0.14
249 0.16
250 0.13
251 0.13
252 0.12
253 0.11
254 0.1
255 0.1
256 0.11
257 0.12
258 0.13
259 0.17
260 0.22
261 0.22
262 0.23
263 0.24
264 0.23
265 0.23
266 0.28
267 0.28
268 0.32
269 0.34
270 0.41
271 0.44
272 0.42
273 0.43
274 0.39
275 0.38
276 0.3
277 0.3
278 0.26
279 0.27
280 0.31
281 0.31
282 0.31
283 0.28
284 0.29
285 0.27
286 0.26
287 0.22
288 0.19
289 0.16
290 0.16
291 0.16
292 0.13
293 0.12
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.09
298 0.08
299 0.09
300 0.12
301 0.2
302 0.27
303 0.29
304 0.3
305 0.4
306 0.49
307 0.56
308 0.61
309 0.61
310 0.63
311 0.71
312 0.79
313 0.81
314 0.78
315 0.75
316 0.76
317 0.66
318 0.64
319 0.64
320 0.63
321 0.62
322 0.61
323 0.59
324 0.54
325 0.56
326 0.58
327 0.57
328 0.55
329 0.5
330 0.5
331 0.51
332 0.51
333 0.49
334 0.43
335 0.41
336 0.34
337 0.31
338 0.33
339 0.3
340 0.27
341 0.32
342 0.39
343 0.37
344 0.46
345 0.48
346 0.42
347 0.45
348 0.49
349 0.46
350 0.44
351 0.46
352 0.39