Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2J0V3

Protein Details
Accession S2J0V3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MSDKRFRDNNRRRDRKKNESTGKPFLQAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-17RRRDRKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10.333, mito 4.5, cyto_mito 3.833, cyto 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR039177  SMG9  
Gene Ontology GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Amino Acid Sequences MSDKRFRDNNRRRDRKKNESTGKPFLQAPIILDRRERPEQTIYSPTTASSNHDLDTPSIVNQPIKVEGTSADDSDFAAIPFLRRPNKFKADTILKNLTDYPGHFVIGIIGKQGVGKSTILSHFTQDPEHAFPNQNNEQFLYQGHKTDGIDMYITPERAILLDTEPILSWTILDNVLRNGSLGGLHPDVWLEMESLYNIIFMMSVCNIVLVVNDGPKIDMDVLKLIQRAEMLKFSIPDFPLLVGQQDMHHYPDIVFVCNKCQTNEFKYRNYSALQAILTSFFEKSQLKTRGLVSLGNVLPLYQTNQENEANLFFLPQQDDIDSLQDLVSALRDQVIAGPRRPGKKGQVSEKDWFRNAIKTFEVVRKSDYIMEYLQVVRKLRDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.91
3 0.91
4 0.92
5 0.91
6 0.9
7 0.91
8 0.9
9 0.83
10 0.75
11 0.65
12 0.56
13 0.5
14 0.4
15 0.34
16 0.35
17 0.35
18 0.33
19 0.34
20 0.37
21 0.4
22 0.46
23 0.45
24 0.4
25 0.44
26 0.46
27 0.48
28 0.52
29 0.47
30 0.42
31 0.41
32 0.36
33 0.31
34 0.28
35 0.28
36 0.25
37 0.24
38 0.22
39 0.24
40 0.24
41 0.22
42 0.26
43 0.22
44 0.18
45 0.19
46 0.21
47 0.2
48 0.2
49 0.21
50 0.2
51 0.2
52 0.19
53 0.16
54 0.15
55 0.2
56 0.21
57 0.19
58 0.16
59 0.15
60 0.15
61 0.16
62 0.15
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.13
68 0.2
69 0.26
70 0.29
71 0.35
72 0.43
73 0.52
74 0.54
75 0.53
76 0.55
77 0.58
78 0.59
79 0.61
80 0.59
81 0.5
82 0.48
83 0.46
84 0.39
85 0.31
86 0.26
87 0.24
88 0.17
89 0.17
90 0.16
91 0.15
92 0.15
93 0.16
94 0.15
95 0.1
96 0.1
97 0.09
98 0.1
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.11
105 0.13
106 0.16
107 0.16
108 0.17
109 0.18
110 0.19
111 0.19
112 0.17
113 0.18
114 0.18
115 0.19
116 0.2
117 0.19
118 0.19
119 0.27
120 0.31
121 0.3
122 0.28
123 0.28
124 0.26
125 0.24
126 0.24
127 0.21
128 0.16
129 0.16
130 0.15
131 0.16
132 0.16
133 0.18
134 0.18
135 0.13
136 0.13
137 0.11
138 0.15
139 0.14
140 0.14
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.07
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.06
166 0.05
167 0.06
168 0.05
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.05
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.1
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.11
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.13
220 0.13
221 0.16
222 0.15
223 0.14
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.12
228 0.12
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.1
233 0.1
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.16
239 0.16
240 0.16
241 0.16
242 0.15
243 0.19
244 0.24
245 0.25
246 0.2
247 0.24
248 0.27
249 0.33
250 0.44
251 0.44
252 0.44
253 0.48
254 0.5
255 0.48
256 0.44
257 0.39
258 0.3
259 0.29
260 0.23
261 0.19
262 0.16
263 0.15
264 0.14
265 0.13
266 0.11
267 0.08
268 0.12
269 0.13
270 0.16
271 0.24
272 0.29
273 0.3
274 0.32
275 0.34
276 0.34
277 0.34
278 0.33
279 0.25
280 0.27
281 0.25
282 0.23
283 0.22
284 0.17
285 0.16
286 0.16
287 0.17
288 0.13
289 0.15
290 0.16
291 0.2
292 0.21
293 0.21
294 0.22
295 0.2
296 0.16
297 0.14
298 0.14
299 0.1
300 0.12
301 0.13
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.14
306 0.14
307 0.15
308 0.13
309 0.12
310 0.11
311 0.1
312 0.1
313 0.08
314 0.09
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.12
321 0.2
322 0.23
323 0.24
324 0.33
325 0.38
326 0.43
327 0.46
328 0.49
329 0.51
330 0.57
331 0.64
332 0.67
333 0.71
334 0.72
335 0.78
336 0.8
337 0.76
338 0.68
339 0.64
340 0.56
341 0.53
342 0.49
343 0.45
344 0.38
345 0.35
346 0.38
347 0.41
348 0.44
349 0.37
350 0.39
351 0.37
352 0.37
353 0.39
354 0.35
355 0.31
356 0.27
357 0.26
358 0.25
359 0.26
360 0.28
361 0.27
362 0.28