Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JSZ3

Protein Details
Accession S2JSZ3    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
121-140MPQQQQYNKPRQQQQYRQSNHydrophilic
316-335EVKKAMPKGKQNRQHNTPVFHydrophilic
403-430SNSNNMRQQHHHRQDDNRRNSRDRHQSSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.333, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034156  Hrp1_RRM1  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12577  RRM1_Hrp1p  
Amino Acid Sequences MSDDFDDDLYNVYNGAGKEDTYNDEDLYGEDPVEFKEEDVEVKVEATPEPEDAHDDDHQNQQQYNDSPQKQQQQQQQGNWGYQQNAYQQYMAAYQRSFQQQMAANPYQMQQMIQRQMRQQMPQQQQYNKPRQQQQYRQSNDGDDNDGQSDKPSTTNSEEGKMFIGGLNWETTDENLRQYFSQFGEVLDCVVMRDPATQRSRGFGFLTMKENSAIDKIVSQEHHNLDGKRIDPKRAIPRDEQDKTEKIFVGGISPEVNEEEFREFFTQFGKVLDATLMMERDTGRPRGFGFVTFEDSKGVEEALKNPNLSIKDKTIEVKKAMPKGKQNRQHNTPVFNPNFRPPYMPNSRYNGAGNFNNMRGNFNMYNNMYPAGNYNMAAAAAAAAAYYGQQQQGGGYNNMYNNSNSNNMRQQHHHRQDDNRRNSRDRHQSSSGGSGGGAMHASQSRNQQHYRPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.15
3 0.14
4 0.13
5 0.16
6 0.18
7 0.22
8 0.22
9 0.23
10 0.2
11 0.2
12 0.19
13 0.18
14 0.17
15 0.14
16 0.1
17 0.09
18 0.1
19 0.1
20 0.13
21 0.12
22 0.1
23 0.12
24 0.13
25 0.14
26 0.16
27 0.17
28 0.13
29 0.14
30 0.15
31 0.13
32 0.13
33 0.14
34 0.13
35 0.13
36 0.14
37 0.14
38 0.16
39 0.16
40 0.2
41 0.21
42 0.22
43 0.24
44 0.31
45 0.34
46 0.34
47 0.34
48 0.31
49 0.35
50 0.34
51 0.4
52 0.42
53 0.41
54 0.45
55 0.51
56 0.59
57 0.6
58 0.64
59 0.65
60 0.66
61 0.71
62 0.68
63 0.71
64 0.64
65 0.59
66 0.56
67 0.49
68 0.4
69 0.34
70 0.33
71 0.3
72 0.32
73 0.31
74 0.27
75 0.25
76 0.24
77 0.27
78 0.26
79 0.22
80 0.17
81 0.16
82 0.21
83 0.26
84 0.27
85 0.22
86 0.26
87 0.28
88 0.32
89 0.4
90 0.36
91 0.31
92 0.31
93 0.32
94 0.28
95 0.24
96 0.2
97 0.17
98 0.23
99 0.31
100 0.33
101 0.36
102 0.37
103 0.44
104 0.48
105 0.47
106 0.46
107 0.48
108 0.53
109 0.58
110 0.62
111 0.61
112 0.66
113 0.72
114 0.76
115 0.73
116 0.72
117 0.73
118 0.75
119 0.79
120 0.8
121 0.8
122 0.8
123 0.78
124 0.74
125 0.66
126 0.6
127 0.53
128 0.45
129 0.39
130 0.29
131 0.25
132 0.22
133 0.21
134 0.18
135 0.15
136 0.14
137 0.1
138 0.11
139 0.11
140 0.14
141 0.17
142 0.23
143 0.23
144 0.25
145 0.25
146 0.24
147 0.24
148 0.2
149 0.17
150 0.11
151 0.11
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.07
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.1
160 0.11
161 0.12
162 0.12
163 0.13
164 0.13
165 0.14
166 0.16
167 0.13
168 0.15
169 0.13
170 0.12
171 0.13
172 0.13
173 0.12
174 0.1
175 0.09
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.08
181 0.09
182 0.17
183 0.2
184 0.23
185 0.23
186 0.25
187 0.26
188 0.25
189 0.24
190 0.21
191 0.22
192 0.22
193 0.25
194 0.23
195 0.23
196 0.21
197 0.2
198 0.16
199 0.13
200 0.11
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.1
205 0.11
206 0.12
207 0.16
208 0.17
209 0.21
210 0.23
211 0.22
212 0.22
213 0.24
214 0.23
215 0.26
216 0.27
217 0.26
218 0.25
219 0.32
220 0.4
221 0.43
222 0.46
223 0.42
224 0.47
225 0.54
226 0.54
227 0.5
228 0.44
229 0.41
230 0.39
231 0.38
232 0.31
233 0.22
234 0.21
235 0.17
236 0.14
237 0.11
238 0.1
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.07
246 0.09
247 0.08
248 0.1
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.12
253 0.12
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.07
266 0.08
267 0.11
268 0.14
269 0.17
270 0.16
271 0.17
272 0.18
273 0.21
274 0.21
275 0.19
276 0.21
277 0.19
278 0.24
279 0.24
280 0.23
281 0.2
282 0.2
283 0.18
284 0.14
285 0.12
286 0.08
287 0.08
288 0.12
289 0.17
290 0.19
291 0.18
292 0.18
293 0.22
294 0.24
295 0.26
296 0.25
297 0.23
298 0.23
299 0.24
300 0.29
301 0.32
302 0.33
303 0.33
304 0.37
305 0.39
306 0.46
307 0.5
308 0.51
309 0.55
310 0.61
311 0.68
312 0.7
313 0.75
314 0.76
315 0.77
316 0.81
317 0.76
318 0.71
319 0.68
320 0.69
321 0.63
322 0.58
323 0.55
324 0.52
325 0.51
326 0.46
327 0.44
328 0.36
329 0.41
330 0.47
331 0.49
332 0.47
333 0.49
334 0.5
335 0.48
336 0.48
337 0.41
338 0.36
339 0.33
340 0.33
341 0.29
342 0.29
343 0.3
344 0.29
345 0.28
346 0.24
347 0.29
348 0.26
349 0.26
350 0.31
351 0.29
352 0.3
353 0.29
354 0.29
355 0.22
356 0.19
357 0.2
358 0.17
359 0.17
360 0.15
361 0.14
362 0.14
363 0.13
364 0.13
365 0.1
366 0.06
367 0.05
368 0.04
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.03
373 0.05
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.08
378 0.1
379 0.15
380 0.19
381 0.18
382 0.18
383 0.21
384 0.23
385 0.25
386 0.25
387 0.21
388 0.2
389 0.22
390 0.27
391 0.26
392 0.31
393 0.37
394 0.4
395 0.44
396 0.5
397 0.57
398 0.61
399 0.69
400 0.72
401 0.71
402 0.77
403 0.84
404 0.86
405 0.87
406 0.86
407 0.84
408 0.81
409 0.81
410 0.8
411 0.8
412 0.76
413 0.73
414 0.69
415 0.66
416 0.64
417 0.63
418 0.54
419 0.43
420 0.35
421 0.28
422 0.22
423 0.18
424 0.15
425 0.08
426 0.1
427 0.13
428 0.15
429 0.17
430 0.27
431 0.34
432 0.41
433 0.45