Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2K1A8

Protein Details
Accession S2K1A8    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
223-244MSGKRSRKRLDEGNTSNRKKKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
226-246KRSRKRLDEGNTSNRKKKAAK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MVLDYFALSPFWDRHCNNQVLSMQTQYNDLRQPYEATIEALRKMTGIEFAVVHDQPPVWIIQKRYRRGPAPDDVNPIATYYIMGANVYQSPTIYSVIANRLLTSLFHVNSAFKETQSMMDFHPAKGYSWKTSTDTNKKSTSSSEKSPLTAKSATTNTANTSNTVKSNLRAQETQVFRHWMDRAIETASIKVTQARQVVDTPESEKINTTGAIDSPSSQLRDDMSGKRSRKRLDEGNTSNRKKKAAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.44
3 0.48
4 0.45
5 0.49
6 0.48
7 0.44
8 0.45
9 0.4
10 0.32
11 0.29
12 0.33
13 0.27
14 0.28
15 0.28
16 0.27
17 0.25
18 0.25
19 0.27
20 0.24
21 0.26
22 0.22
23 0.2
24 0.22
25 0.22
26 0.22
27 0.21
28 0.19
29 0.16
30 0.16
31 0.14
32 0.13
33 0.11
34 0.11
35 0.1
36 0.11
37 0.16
38 0.15
39 0.15
40 0.13
41 0.12
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.14
47 0.19
48 0.27
49 0.36
50 0.41
51 0.48
52 0.54
53 0.57
54 0.6
55 0.61
56 0.61
57 0.59
58 0.57
59 0.56
60 0.5
61 0.45
62 0.39
63 0.33
64 0.25
65 0.17
66 0.13
67 0.08
68 0.08
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.06
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.07
78 0.08
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.12
84 0.14
85 0.13
86 0.12
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.12
91 0.13
92 0.11
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.17
98 0.14
99 0.11
100 0.12
101 0.12
102 0.14
103 0.15
104 0.15
105 0.11
106 0.18
107 0.19
108 0.18
109 0.2
110 0.18
111 0.17
112 0.21
113 0.22
114 0.17
115 0.18
116 0.2
117 0.2
118 0.26
119 0.34
120 0.39
121 0.41
122 0.43
123 0.45
124 0.44
125 0.43
126 0.41
127 0.42
128 0.36
129 0.36
130 0.38
131 0.36
132 0.36
133 0.38
134 0.35
135 0.3
136 0.27
137 0.23
138 0.21
139 0.22
140 0.23
141 0.21
142 0.21
143 0.19
144 0.22
145 0.22
146 0.18
147 0.2
148 0.19
149 0.19
150 0.22
151 0.21
152 0.18
153 0.25
154 0.27
155 0.28
156 0.27
157 0.29
158 0.33
159 0.35
160 0.36
161 0.33
162 0.33
163 0.29
164 0.33
165 0.31
166 0.27
167 0.27
168 0.25
169 0.23
170 0.21
171 0.23
172 0.19
173 0.19
174 0.15
175 0.14
176 0.13
177 0.14
178 0.15
179 0.18
180 0.21
181 0.21
182 0.22
183 0.23
184 0.26
185 0.25
186 0.24
187 0.22
188 0.23
189 0.24
190 0.22
191 0.21
192 0.19
193 0.19
194 0.18
195 0.17
196 0.13
197 0.13
198 0.15
199 0.14
200 0.14
201 0.16
202 0.18
203 0.18
204 0.17
205 0.18
206 0.17
207 0.21
208 0.25
209 0.28
210 0.31
211 0.39
212 0.44
213 0.5
214 0.57
215 0.58
216 0.61
217 0.63
218 0.67
219 0.67
220 0.73
221 0.74
222 0.77
223 0.82
224 0.81
225 0.81
226 0.75