Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JIC4

Protein Details
Accession S2JIC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
262-285FLDTPAKKKKPQVPRSLAKVNTKGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
269-271KKK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13.5, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040456  RNase_H2_suB  
IPR019024  RNase_H2_suB_wHTH  
Gene Ontology GO:0032299  C:ribonuclease H2 complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF09468  RNase_H2-Ydr279  
CDD cd09270  RNase_H2-B  
Amino Acid Sequences MKSQIIAFTNKLDNDVNHLTELYLPCPRSNRRSIYFHNDKGTLYEMQKVTGPGRKSAWLIDADIYKDGAVRFVTALDPLFMALPILDEAYKKDNTKFRTLDDIFSRENVKLEIVGTETLDDEGITSDEYSKPIDVHRLTNITGFTQQLAHLCDVQEIATELFVYKLSYEKTLDWLVKKVDRLMSNEAFKKSFESTKQEALLMKLEAVYTLSNYLNKDWFNRLLTKLEIEEEKEEIELGDITNYVTDASPSGFFKRAHPDEAFLDTPAKKKKPQVPRSLAKVNTKGMKSITSFFTKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.34
3 0.3
4 0.26
5 0.26
6 0.23
7 0.25
8 0.26
9 0.21
10 0.23
11 0.23
12 0.25
13 0.32
14 0.38
15 0.41
16 0.49
17 0.54
18 0.55
19 0.61
20 0.66
21 0.69
22 0.72
23 0.7
24 0.67
25 0.6
26 0.54
27 0.48
28 0.44
29 0.38
30 0.3
31 0.31
32 0.26
33 0.25
34 0.27
35 0.27
36 0.27
37 0.28
38 0.29
39 0.25
40 0.28
41 0.3
42 0.29
43 0.28
44 0.28
45 0.24
46 0.24
47 0.23
48 0.22
49 0.2
50 0.2
51 0.18
52 0.14
53 0.14
54 0.13
55 0.12
56 0.1
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.04
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.07
76 0.12
77 0.15
78 0.16
79 0.21
80 0.26
81 0.3
82 0.38
83 0.38
84 0.36
85 0.44
86 0.43
87 0.43
88 0.41
89 0.4
90 0.33
91 0.33
92 0.32
93 0.22
94 0.22
95 0.17
96 0.14
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.05
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.08
120 0.14
121 0.15
122 0.16
123 0.18
124 0.19
125 0.19
126 0.2
127 0.2
128 0.15
129 0.14
130 0.13
131 0.11
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.07
143 0.06
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.06
153 0.07
154 0.09
155 0.1
156 0.1
157 0.13
158 0.16
159 0.19
160 0.18
161 0.2
162 0.21
163 0.22
164 0.23
165 0.22
166 0.24
167 0.24
168 0.27
169 0.31
170 0.33
171 0.35
172 0.38
173 0.37
174 0.33
175 0.31
176 0.29
177 0.26
178 0.26
179 0.25
180 0.28
181 0.3
182 0.34
183 0.34
184 0.33
185 0.32
186 0.29
187 0.27
188 0.2
189 0.16
190 0.12
191 0.11
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.06
196 0.08
197 0.09
198 0.11
199 0.12
200 0.14
201 0.16
202 0.17
203 0.19
204 0.22
205 0.25
206 0.26
207 0.29
208 0.3
209 0.3
210 0.3
211 0.29
212 0.25
213 0.24
214 0.22
215 0.21
216 0.2
217 0.18
218 0.17
219 0.15
220 0.14
221 0.11
222 0.1
223 0.08
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.08
235 0.1
236 0.12
237 0.15
238 0.2
239 0.2
240 0.25
241 0.34
242 0.36
243 0.4
244 0.39
245 0.39
246 0.37
247 0.42
248 0.39
249 0.29
250 0.32
251 0.28
252 0.34
253 0.39
254 0.41
255 0.41
256 0.49
257 0.58
258 0.64
259 0.72
260 0.76
261 0.78
262 0.82
263 0.85
264 0.85
265 0.82
266 0.8
267 0.76
268 0.72
269 0.7
270 0.62
271 0.57
272 0.5
273 0.49
274 0.43
275 0.41
276 0.38