FuNGI

S2JN29

Protein Details

Accession

S2JN29

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
462-482	NEKEKEKEKKIPVPPKKKATA	Basic
613-635	KEFLLSFRKRIKKDSRNRDIITT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-24	GKGRAVPRRGGG
464-521	KEKEKEKKIPVPPKKKATAASKPMMPKKAHTTKLKKEGMSKPIGRPGSPSLYMKKKER

Subcellular Location(s)

nucl 26.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSSIYNTSRTDKGKGRAVPRRGGGGPMRPGVGPQRMLQQHQLQMQQQQQQTEDITYSEFQLVSTSKRGKNHLMDFKGGSKHVEPKNFARPVKLHRKETNFLPYRQYIQNLNEQNAAAAAAKEAAAANAAAIMAGTPLPHPATKPAASDVEDLGGDAPTPNTQNQHGPKTGADTSLIAPLGGATRNKQMLFKKRTKQIYLAKEDTRELKEQEQRPWILEDYDGQNSFTGTYEGGQRSDYMFFVLTVSKLVLLVLNWMIYLGFILQESGFKVMPVDRWYKFQPKRNFKTLSLEEAEEQLKKQQKRESSRWLMLKRQNEMNEAEEAARPSKLKLVDHDDQTKPDPDEDSGNRQDSDMDDLDFDDVFQDDDEATAEHEVEDEDVKDSKDRVKKEIKDYSISGAQEDADDAYDDMGKLTSEGKQMRKLVRDLEKNRAYESDDEEGDPYASSAEELDSDNDDDETSENEKEKEKEKKIPVPPKKKATAASKPMMPKKAHTTKLKKEGMSKPIGRPGSPSLYMKKKEREGSSSPTPTPRPSSPLSNGRSSPLRPGSSPQHRPALSPPSPSSSQGFKEPTKKRKLEDSSSGESKHRKLGDDDLITEQEVIDTLRGKVMTTKEFLLSFRKRIKKDSRNRDIITTLLRKVAKSNRSSDPNTRTLELKPEYN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.65
3	0.68
4	0.71
5	0.72
6	0.67
7	0.67
8	0.59
9	0.59
10	0.55
11	0.53
12	0.52
13	0.46
14	0.45
15	0.37
16	0.39
17	0.39
18	0.39
19	0.34
20	0.29
21	0.37
22	0.39
23	0.43
24	0.48
25	0.48
26	0.48
27	0.51
28	0.55
29	0.49
30	0.52
31	0.55
32	0.55
33	0.51
34	0.47
35	0.43
36	0.4
37	0.38
38	0.33
39	0.27
40	0.19
41	0.19
42	0.17
43	0.17
44	0.16
45	0.15
46	0.13
47	0.15
48	0.16
49	0.17
50	0.25
51	0.31
52	0.34
53	0.39
54	0.45
55	0.5
56	0.57
57	0.64
58	0.66
59	0.61
60	0.61
61	0.59
62	0.59
63	0.55
64	0.47
65	0.41
66	0.35
67	0.4
68	0.42
69	0.47
70	0.46
71	0.48
72	0.57
73	0.62
74	0.59
75	0.57
76	0.56
77	0.59
78	0.65
79	0.67
80	0.66
81	0.67
82	0.74
83	0.71
84	0.72
85	0.73
86	0.68
87	0.62
88	0.59
89	0.54
90	0.51
91	0.5
92	0.47
93	0.41
94	0.38
95	0.45
96	0.42
97	0.42
98	0.39
99	0.35
100	0.32
101	0.26
102	0.23
103	0.15
104	0.11
105	0.09
106	0.07
107	0.07
108	0.07
109	0.07
110	0.06
111	0.06
112	0.06
113	0.05
114	0.05
115	0.05
116	0.04
117	0.04
118	0.04
119	0.03
120	0.04
121	0.04
122	0.04
123	0.06
124	0.08
125	0.09
126	0.1
127	0.14
128	0.2
129	0.21
130	0.23
131	0.24
132	0.26
133	0.27
134	0.28
135	0.24
136	0.2
137	0.18
138	0.16
139	0.13
140	0.1
141	0.08
142	0.06
143	0.07
144	0.07
145	0.09
146	0.1
147	0.12
148	0.14
149	0.23
150	0.28
151	0.33
152	0.34
153	0.34
154	0.33
155	0.36
156	0.35
157	0.28
158	0.23
159	0.19
160	0.18
161	0.19
162	0.19
163	0.13
164	0.11
165	0.1
166	0.11
167	0.12
168	0.12
169	0.1
170	0.15
171	0.19
172	0.2
173	0.25
174	0.31
175	0.4
176	0.48
177	0.55
178	0.59
179	0.64
180	0.71
181	0.7
182	0.71
183	0.69
184	0.7
185	0.69
186	0.67
187	0.61
188	0.55
189	0.53
190	0.49
191	0.44
192	0.37
193	0.31
194	0.33
195	0.38
196	0.41
197	0.45
198	0.47
199	0.44
200	0.43
201	0.43
202	0.36
203	0.28
204	0.24
205	0.21
206	0.18
207	0.21
208	0.19
209	0.17
210	0.16
211	0.16
212	0.16
213	0.13
214	0.1
215	0.06
216	0.07
217	0.12
218	0.13
219	0.13
220	0.13
221	0.13
222	0.14
223	0.15
224	0.14
225	0.1
226	0.09
227	0.09
228	0.09
229	0.09
230	0.08
231	0.07
232	0.07
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.05
237	0.05
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.05
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.07
257	0.08
258	0.1
259	0.14
260	0.18
261	0.18
262	0.21
263	0.26
264	0.36
265	0.41
266	0.48
267	0.54
268	0.6
269	0.66
270	0.71
271	0.72
272	0.63
273	0.66
274	0.59
275	0.54
276	0.45
277	0.39
278	0.31
279	0.28
280	0.27
281	0.18
282	0.17
283	0.16
284	0.21
285	0.22
286	0.27
287	0.29
288	0.37
289	0.45
290	0.52
291	0.57
292	0.57
293	0.61
294	0.64
295	0.62
296	0.62
297	0.59
298	0.57
299	0.5
300	0.48
301	0.44
302	0.39
303	0.37
304	0.31
305	0.25
306	0.21
307	0.19
308	0.14
309	0.13
310	0.12
311	0.11
312	0.09
313	0.09
314	0.12
315	0.13
316	0.13
317	0.16
318	0.22
319	0.26
320	0.29
321	0.35
322	0.32
323	0.31
324	0.33
325	0.32
326	0.25
327	0.22
328	0.19
329	0.14
330	0.18
331	0.18
332	0.23
333	0.23
334	0.24
335	0.24
336	0.23
337	0.22
338	0.18
339	0.2
340	0.14
341	0.11
342	0.1
343	0.1
344	0.1
345	0.1
346	0.09
347	0.05
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.03
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.07
367	0.07
368	0.08
369	0.09
370	0.16
371	0.2
372	0.22
373	0.28
374	0.36
375	0.42
376	0.5
377	0.57
378	0.54
379	0.52
380	0.51
381	0.48
382	0.42
383	0.36
384	0.28
385	0.2
386	0.17
387	0.13
388	0.12
389	0.09
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.04
399	0.05
400	0.06
401	0.08
402	0.13
403	0.18
404	0.21
405	0.27
406	0.32
407	0.36
408	0.39
409	0.39
410	0.41
411	0.45
412	0.52
413	0.5
414	0.55
415	0.56
416	0.53
417	0.52
418	0.46
419	0.4
420	0.32
421	0.33
422	0.26
423	0.21
424	0.2
425	0.2
426	0.19
427	0.16
428	0.14
429	0.09
430	0.06
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.04
435	0.05
436	0.06
437	0.07
438	0.08
439	0.09
440	0.09
441	0.09
442	0.09
443	0.08
444	0.08
445	0.09
446	0.1
447	0.11
448	0.12
449	0.13
450	0.17
451	0.19
452	0.26
453	0.34
454	0.37
455	0.45
456	0.52
457	0.6
458	0.67
459	0.75
460	0.79
461	0.8
462	0.83
463	0.82
464	0.8
465	0.75
466	0.72
467	0.71
468	0.7
469	0.67
470	0.63
471	0.6
472	0.62
473	0.64
474	0.63
475	0.55
476	0.49
477	0.52
478	0.57
479	0.59
480	0.62
481	0.65
482	0.68
483	0.77
484	0.79
485	0.72
486	0.72
487	0.72
488	0.69
489	0.68
490	0.64
491	0.58
492	0.6
493	0.58
494	0.49
495	0.45
496	0.43
497	0.4
498	0.38
499	0.37
500	0.36
501	0.43
502	0.49
503	0.52
504	0.55
505	0.56
506	0.6
507	0.62
508	0.62
509	0.59
510	0.61
511	0.63
512	0.61
513	0.56
514	0.54
515	0.52
516	0.49
517	0.49
518	0.44
519	0.4
520	0.38
521	0.43
522	0.45
523	0.51
524	0.51
525	0.51
526	0.5
527	0.48
528	0.5
529	0.43
530	0.45
531	0.43
532	0.41
533	0.36
534	0.41
535	0.47
536	0.53
537	0.6
538	0.56
539	0.57
540	0.55
541	0.56
542	0.57
543	0.57
544	0.5
545	0.49
546	0.46
547	0.44
548	0.45
549	0.45
550	0.42
551	0.37
552	0.36
553	0.36
554	0.4
555	0.39
556	0.48
557	0.55
558	0.62
559	0.67
560	0.69
561	0.66
562	0.71
563	0.74
564	0.72
565	0.73
566	0.7
567	0.68
568	0.67
569	0.66
570	0.61
571	0.57
572	0.52
573	0.5
574	0.45
575	0.4
576	0.39
577	0.44
578	0.48
579	0.46
580	0.45
581	0.42
582	0.4
583	0.37
584	0.33
585	0.25
586	0.16
587	0.13
588	0.11
589	0.08
590	0.09
591	0.09
592	0.13
593	0.13
594	0.13
595	0.18
596	0.23
597	0.26
598	0.27
599	0.29
600	0.29
601	0.3
602	0.32
603	0.36
604	0.37
605	0.41
606	0.48
607	0.55
608	0.55
609	0.64
610	0.73
611	0.75
612	0.8
613	0.83
614	0.83
615	0.84
616	0.84
617	0.79
618	0.7
619	0.63
620	0.61
621	0.55
622	0.47
623	0.43
624	0.42
625	0.38
626	0.44
627	0.49
628	0.49
629	0.49
630	0.54
631	0.56
632	0.62
633	0.68
634	0.7
635	0.69
636	0.67
637	0.66
638	0.61
639	0.55
640	0.49
641	0.52

S2JN29

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer