FuNGI

S2IZV5

Protein Details

Accession

S2IZV5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
36-59	RTNAPPSFDKQPEKKKRSLFAERL	Hydrophilic
168-187	PKPVHRSEFKKRLEAQRNKS	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 11, nucl 7.5, cyto_nucl 6, mito 4, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MSKFTRPTFNVDDDDLERLQREFFEKETMPSARVYRTNAPPSFDKQPEKKKRSLFAERLASENSSSNSSNQIESAMPDLEMPSLEDTTPALESTKTVVQDDLEEEFEPVMDPHPEPHVPVSKKMIDLTSLLGQVLGEIKEHDVKEVVAPTLPSVVENKPARGQANGFPKPVHRSEFKKRLEAQRNKSASGATKAPRPEAPPQVMSEEPVDENDRRIQEMSVQELEDARQEIMNTLSPESIAMLMKGLKHKGSTASTTREKKKVSFEVQAEDKESHMDDDKEDLLQIKKEYFANVPMENEKLAWMDNRFLTPEIRKQEAQRLKELQEVNSESQASEAEKVYRKVRFDLQGRIIDQTKNIPRHQGLHHHGDEPDKAGYTLAELFYLVRSQVPSQRSMVLTTLARIITLAKKAAPTEPVWHHVLSVFTGKEHAATIYLRSALDDRNLIVLVSAIKALAALVLDDYQVWEEALIDSTEEFNRFLGHIARPTLPPGVTEIKRKGLNDKLTELVDRVRQTSGQPSLKEQQDDAELAERDLVRGLVKMDLLARIRYLLASDSSELIQYDAASVDRLVRIVVRMAEAGQDVCESIEEEELLEPIVHWGVANTQWPMTEDDAHINYPSLAAVRLLTVLAQGSKQIAESIVEKATITLRFLVTSPDTACDNLKRRAYALQLETLKLVRVLACYGFIVPTLEDLQEPLMGWLRSVLGNDSSDMNCTIASTAIGLLEVLLYAAADPHKTVPAHAIDWHQPTAYLPAITAVLRSSRDKHQALYESALGYLGTWASHIALFPPEVETVKQVWKAVIQEDNNFESGNSVALGYTTSTHHVLRYIQFIAAFTRLGSPNHEVYSDIVQDAQCRLRSAQVVHLLKECYSKDMLGRYALYIWLDQCKEREKCWGMSLRLTELESGIRSKHIGIIETWLAQELLHLCLSSKQQQQALGDLEPFYLDFDQHNVHLSKSLFDHDGRSIKTLMYVSHDEAESNSLETTAFILSPIDALYHLDKSTVAQKSQADAASIVCNTIELANKLFYTSDINHDVAIVTLMKIFLIGDREGRQADMVSDREIFRDDRVSQSMDQWLNYLCRTRTNLAALENAWRRSSEHIRQAQVPFFQFYQGFVAQYAAVSFGHHGFARLLVYLVTQIDTIDYRHLVLSDYRDILTTLKVGVNQVPQLDSAEKQELDNAGLKLLDS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.34
3	0.28
4	0.24
5	0.21
6	0.2
7	0.18
8	0.21
9	0.19
10	0.21
11	0.27
12	0.27
13	0.29
14	0.35
15	0.35
16	0.31
17	0.33
18	0.34
19	0.33
20	0.36
21	0.39
22	0.41
23	0.48
24	0.57
25	0.56
26	0.57
27	0.56
28	0.57
29	0.6
30	0.59
31	0.6
32	0.6
33	0.69
34	0.75
35	0.78
36	0.8
37	0.79
38	0.81
39	0.81
40	0.82
41	0.79
42	0.77
43	0.8
44	0.73
45	0.68
46	0.61
47	0.52
48	0.43
49	0.38
50	0.31
51	0.25
52	0.25
53	0.23
54	0.27
55	0.27
56	0.26
57	0.22
58	0.23
59	0.19
60	0.19
61	0.21
62	0.15
63	0.14
64	0.13
65	0.13
66	0.12
67	0.11
68	0.12
69	0.11
70	0.11
71	0.11
72	0.11
73	0.11
74	0.12
75	0.13
76	0.12
77	0.1
78	0.09
79	0.1
80	0.14
81	0.18
82	0.17
83	0.17
84	0.18
85	0.18
86	0.2
87	0.21
88	0.19
89	0.17
90	0.16
91	0.16
92	0.15
93	0.14
94	0.12
95	0.11
96	0.1
97	0.11
98	0.11
99	0.13
100	0.18
101	0.18
102	0.2
103	0.26
104	0.33
105	0.33
106	0.38
107	0.43
108	0.41
109	0.43
110	0.43
111	0.38
112	0.3
113	0.29
114	0.28
115	0.24
116	0.21
117	0.19
118	0.17
119	0.15
120	0.14
121	0.16
122	0.12
123	0.09
124	0.09
125	0.12
126	0.17
127	0.17
128	0.18
129	0.16
130	0.16
131	0.19
132	0.21
133	0.2
134	0.15
135	0.16
136	0.15
137	0.17
138	0.16
139	0.13
140	0.14
141	0.15
142	0.23
143	0.25
144	0.27
145	0.29
146	0.33
147	0.33
148	0.33
149	0.35
150	0.33
151	0.42
152	0.43
153	0.41
154	0.38
155	0.41
156	0.45
157	0.46
158	0.44
159	0.4
160	0.44
161	0.53
162	0.62
163	0.63
164	0.65
165	0.68
166	0.74
167	0.78
168	0.8
169	0.78
170	0.78
171	0.77
172	0.69
173	0.62
174	0.55
175	0.49
176	0.43
177	0.42
178	0.34
179	0.36
180	0.37
181	0.39
182	0.4
183	0.39
184	0.42
185	0.43
186	0.46
187	0.43
188	0.42
189	0.44
190	0.4
191	0.37
192	0.31
193	0.24
194	0.19
195	0.19
196	0.22
197	0.18
198	0.2
199	0.24
200	0.23
201	0.23
202	0.24
203	0.22
204	0.24
205	0.26
206	0.28
207	0.25
208	0.24
209	0.22
210	0.22
211	0.22
212	0.18
213	0.16
214	0.12
215	0.11
216	0.11
217	0.11
218	0.12
219	0.16
220	0.15
221	0.15
222	0.14
223	0.13
224	0.13
225	0.13
226	0.13
227	0.09
228	0.08
229	0.08
230	0.1
231	0.12
232	0.17
233	0.19
234	0.18
235	0.19
236	0.21
237	0.25
238	0.27
239	0.31
240	0.32
241	0.37
242	0.44
243	0.52
244	0.58
245	0.59
246	0.58
247	0.57
248	0.6
249	0.62
250	0.59
251	0.59
252	0.55
253	0.55
254	0.56
255	0.53
256	0.47
257	0.38
258	0.32
259	0.25
260	0.23
261	0.18
262	0.17
263	0.16
264	0.13
265	0.16
266	0.16
267	0.15
268	0.15
269	0.16
270	0.15
271	0.17
272	0.18
273	0.16
274	0.18
275	0.18
276	0.2
277	0.19
278	0.22
279	0.23
280	0.23
281	0.25
282	0.24
283	0.24
284	0.22
285	0.2
286	0.16
287	0.12
288	0.12
289	0.13
290	0.12
291	0.14
292	0.15
293	0.16
294	0.17
295	0.18
296	0.21
297	0.22
298	0.28
299	0.29
300	0.32
301	0.34
302	0.35
303	0.45
304	0.49
305	0.48
306	0.48
307	0.48
308	0.45
309	0.5
310	0.49
311	0.4
312	0.39
313	0.4
314	0.34
315	0.31
316	0.3
317	0.23
318	0.21
319	0.2
320	0.14
321	0.12
322	0.12
323	0.14
324	0.18
325	0.21
326	0.26
327	0.29
328	0.3
329	0.32
330	0.37
331	0.4
332	0.41
333	0.46
334	0.47
335	0.49
336	0.48
337	0.47
338	0.43
339	0.36
340	0.32
341	0.32
342	0.34
343	0.34
344	0.34
345	0.36
346	0.36
347	0.4
348	0.43
349	0.45
350	0.43
351	0.45
352	0.46
353	0.42
354	0.42
355	0.39
356	0.36
357	0.28
358	0.24
359	0.16
360	0.14
361	0.12
362	0.11
363	0.1
364	0.11
365	0.08
366	0.08
367	0.07
368	0.07
369	0.08
370	0.08
371	0.07
372	0.06
373	0.07
374	0.09
375	0.15
376	0.17
377	0.19
378	0.2
379	0.23
380	0.23
381	0.23
382	0.22
383	0.19
384	0.17
385	0.16
386	0.17
387	0.13
388	0.12
389	0.11
390	0.12
391	0.12
392	0.14
393	0.14
394	0.12
395	0.14
396	0.15
397	0.17
398	0.18
399	0.16
400	0.21
401	0.23
402	0.26
403	0.27
404	0.25
405	0.24
406	0.22
407	0.21
408	0.16
409	0.16
410	0.12
411	0.1
412	0.11
413	0.11
414	0.11
415	0.1
416	0.09
417	0.08
418	0.08
419	0.09
420	0.09
421	0.1
422	0.1
423	0.1
424	0.11
425	0.11
426	0.12
427	0.11
428	0.1
429	0.1
430	0.11
431	0.1
432	0.08
433	0.08
434	0.07
435	0.06
436	0.06
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.04
442	0.03
443	0.03
444	0.03
445	0.03
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.06
460	0.07
461	0.08
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.08
466	0.09
467	0.11
468	0.11
469	0.13
470	0.15
471	0.17
472	0.17
473	0.18
474	0.19
475	0.16
476	0.14
477	0.16
478	0.2
479	0.21
480	0.26
481	0.27
482	0.3
483	0.32
484	0.33
485	0.35
486	0.35
487	0.4
488	0.37
489	0.37
490	0.34
491	0.32
492	0.32
493	0.27
494	0.21
495	0.19
496	0.17
497	0.16
498	0.15
499	0.15
500	0.15
501	0.2
502	0.26
503	0.26
504	0.26
505	0.28
506	0.34
507	0.35
508	0.35
509	0.29
510	0.23
511	0.21
512	0.2
513	0.17
514	0.15
515	0.12
516	0.12
517	0.13
518	0.12
519	0.1
520	0.1
521	0.1
522	0.06
523	0.07
524	0.07
525	0.06
526	0.06
527	0.07
528	0.07
529	0.1
530	0.1
531	0.1
532	0.1
533	0.09
534	0.09
535	0.09
536	0.09
537	0.06
538	0.06
539	0.07
540	0.08
541	0.08
542	0.08
543	0.08
544	0.08
545	0.07
546	0.06
547	0.05
548	0.05
549	0.05
550	0.04
551	0.04
552	0.04
553	0.05
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.05
558	0.05
559	0.06
560	0.07
561	0.06
562	0.06
563	0.06
564	0.07
565	0.07
566	0.06
567	0.05
568	0.05
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.04
574	0.04
575	0.04
576	0.04
577	0.04
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.03
582	0.03
583	0.04
584	0.03
585	0.03
586	0.03
587	0.04
588	0.05
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.07
593	0.09
594	0.11
595	0.11
596	0.11
597	0.1
598	0.12
599	0.13
600	0.13
601	0.12
602	0.1
603	0.09
604	0.08
605	0.07
606	0.05
607	0.04
608	0.04
609	0.04
610	0.04
611	0.05
612	0.04
613	0.04
614	0.04
615	0.04
616	0.04
617	0.04
618	0.04
619	0.05
620	0.05
621	0.05
622	0.05
623	0.05
624	0.06
625	0.07
626	0.08
627	0.08
628	0.08
629	0.08
630	0.08
631	0.11
632	0.1
633	0.09
634	0.09
635	0.09
636	0.09
637	0.1
638	0.11
639	0.1
640	0.11
641	0.11
642	0.11
643	0.11
644	0.11
645	0.12
646	0.16
647	0.2
648	0.24
649	0.26
650	0.25
651	0.25
652	0.28
653	0.29
654	0.29
655	0.26
656	0.26
657	0.26
658	0.26
659	0.25
660	0.22
661	0.2
662	0.14
663	0.13
664	0.07
665	0.07
666	0.07
667	0.07
668	0.07
669	0.07
670	0.07
671	0.07
672	0.06
673	0.06
674	0.05
675	0.06
676	0.07
677	0.07
678	0.06
679	0.07
680	0.07
681	0.07
682	0.07
683	0.06
684	0.09
685	0.08
686	0.08
687	0.08
688	0.09
689	0.09
690	0.09
691	0.1
692	0.08
693	0.08
694	0.09
695	0.11
696	0.1
697	0.1
698	0.11
699	0.1
700	0.08
701	0.08
702	0.07
703	0.05
704	0.05
705	0.05
706	0.04
707	0.04
708	0.04
709	0.04
710	0.03
711	0.03
712	0.03
713	0.02
714	0.02
715	0.02
716	0.02
717	0.03
718	0.03
719	0.04
720	0.04
721	0.05
722	0.09
723	0.09
724	0.1
725	0.13
726	0.15
727	0.16
728	0.17
729	0.19
730	0.21
731	0.24
732	0.24
733	0.2
734	0.18
735	0.17
736	0.18
737	0.16
738	0.12
739	0.09
740	0.09
741	0.1
742	0.1
743	0.09
744	0.07
745	0.08
746	0.1
747	0.12
748	0.15
749	0.2
750	0.28
751	0.29
752	0.3
753	0.33
754	0.36
755	0.36
756	0.35
757	0.3
758	0.23
759	0.22
760	0.2
761	0.14
762	0.1
763	0.08
764	0.05
765	0.04
766	0.04
767	0.04
768	0.04
769	0.05
770	0.05
771	0.05
772	0.06
773	0.07
774	0.07
775	0.08
776	0.08
777	0.09
778	0.1
779	0.11
780	0.12
781	0.16
782	0.17
783	0.16
784	0.16
785	0.17
786	0.19
787	0.19
788	0.23
789	0.21
790	0.23
791	0.25
792	0.26
793	0.25
794	0.23
795	0.2
796	0.15
797	0.13
798	0.1
799	0.07
800	0.06
801	0.05
802	0.05
803	0.05
804	0.05
805	0.06
806	0.07
807	0.09
808	0.11
809	0.11
810	0.12
811	0.13
812	0.16
813	0.16
814	0.19
815	0.18
816	0.17
817	0.17
818	0.17
819	0.17
820	0.15
821	0.13
822	0.1
823	0.13
824	0.14
825	0.14
826	0.17
827	0.19
828	0.2
829	0.21
830	0.21
831	0.18
832	0.18
833	0.21
834	0.18
835	0.14
836	0.13
837	0.13
838	0.14
839	0.16
840	0.18
841	0.16
842	0.17
843	0.17
844	0.19
845	0.22
846	0.23
847	0.27
848	0.32
849	0.33
850	0.32
851	0.35
852	0.32
853	0.3
854	0.33
855	0.27
856	0.21
857	0.2
858	0.19
859	0.19
860	0.22
861	0.23
862	0.2
863	0.2
864	0.18
865	0.18
866	0.18
867	0.16
868	0.13
869	0.13
870	0.16
871	0.16
872	0.17
873	0.19
874	0.27
875	0.28
876	0.28
877	0.37
878	0.36
879	0.37
880	0.43
881	0.48
882	0.41
883	0.44
884	0.45
885	0.38
886	0.35
887	0.33
888	0.27
889	0.2
890	0.19
891	0.15
892	0.14
893	0.12
894	0.11
895	0.12
896	0.12
897	0.15
898	0.15
899	0.15
900	0.14
901	0.18
902	0.19
903	0.19
904	0.18
905	0.15
906	0.13
907	0.12
908	0.13
909	0.09
910	0.1
911	0.09
912	0.09
913	0.09
914	0.13
915	0.17
916	0.23
917	0.27
918	0.29
919	0.31
920	0.35
921	0.36
922	0.37
923	0.36
924	0.3
925	0.25
926	0.22
927	0.19
928	0.15
929	0.14
930	0.11
931	0.09
932	0.08
933	0.08
934	0.1
935	0.11
936	0.12
937	0.17
938	0.16
939	0.16
940	0.2
941	0.2
942	0.19
943	0.19
944	0.22
945	0.2
946	0.2
947	0.23
948	0.23
949	0.29
950	0.28
951	0.29
952	0.27
953	0.24
954	0.26
955	0.24
956	0.2
957	0.2
958	0.22
959	0.21
960	0.23
961	0.23
962	0.2
963	0.2
964	0.21
965	0.16
966	0.13
967	0.11
968	0.09
969	0.09
970	0.09
971	0.09
972	0.08
973	0.07
974	0.06
975	0.07
976	0.06
977	0.07
978	0.07
979	0.06
980	0.05
981	0.08
982	0.1
983	0.12
984	0.12
985	0.12
986	0.12
987	0.13
988	0.21
989	0.23
990	0.22
991	0.24
992	0.26
993	0.28
994	0.32
995	0.31
996	0.24
997	0.2
998	0.21
999	0.2
1000	0.18
1001	0.16
1002	0.12
1003	0.11
1004	0.1
1005	0.12
1006	0.13
1007	0.11
1008	0.14
1009	0.15
1010	0.15
1011	0.16
1012	0.16
1013	0.14
1014	0.17
1015	0.17
1016	0.21
1017	0.23
1018	0.24
1019	0.23
1020	0.23
1021	0.22
1022	0.17
1023	0.16
1024	0.11
1025	0.07
1026	0.08
1027	0.08
1028	0.07
1029	0.07
1030	0.07
1031	0.07
1032	0.1
1033	0.11
1034	0.14
1035	0.17
1036	0.2
1037	0.2
1038	0.21
1039	0.2
1040	0.17
1041	0.18
1042	0.19
1043	0.18
1044	0.18
1045	0.2
1046	0.2
1047	0.2
1048	0.22
1049	0.21
1050	0.19
1051	0.24
1052	0.23
1053	0.26
1054	0.29
1055	0.31
1056	0.3
1057	0.32
1058	0.38
1059	0.33
1060	0.32
1061	0.28
1062	0.27
1063	0.26
1064	0.27
1065	0.3
1066	0.23
1067	0.28
1068	0.33
1069	0.34
1070	0.37
1071	0.39
1072	0.4
1073	0.36
1074	0.39
1075	0.33
1076	0.37
1077	0.4
1078	0.37
1079	0.33
1080	0.3
1081	0.29
1082	0.34
1083	0.43
1084	0.43
1085	0.47
1086	0.52
1087	0.55
1088	0.61
1089	0.64
1090	0.62
1091	0.57
1092	0.51
1093	0.44
1094	0.37
1095	0.37
1096	0.3
1097	0.27
1098	0.28
1099	0.24
1100	0.22
1101	0.18
1102	0.19
1103	0.15
1104	0.15
1105	0.14
1106	0.1
1107	0.08
1108	0.09
1109	0.1
1110	0.1
1111	0.13
1112	0.13
1113	0.14
1114	0.13
1115	0.15
1116	0.15
1117	0.14
1118	0.13
1119	0.1
1120	0.11
1121	0.11
1122	0.11
1123	0.11
1124	0.09
1125	0.09
1126	0.1
1127	0.11
1128	0.12
1129	0.14
1130	0.14
1131	0.14
1132	0.15
1133	0.15
1134	0.15
1135	0.18
1136	0.22
1137	0.24
1138	0.25
1139	0.24
1140	0.24
1141	0.25
1142	0.24
1143	0.22
1144	0.18
1145	0.15
1146	0.15
1147	0.16
1148	0.18
1149	0.22
1150	0.25
1151	0.26
1152	0.26
1153	0.25
1154	0.24
1155	0.26
1156	0.26
1157	0.23
1158	0.23
1159	0.26
1160	0.25
1161	0.25
1162	0.28
1163	0.26
1164	0.26
1165	0.31
1166	0.26
1167	0.21

S2IZV5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer