Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

S2JR82

Protein Details
Accession S2JR82    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-123MEDVRRERSRSPRSRSRSRSRSRSPKREARSRSRSPVRRSSSRRHDSPKRRRSFSRSRSRSPRGDRRGRRRSPSPPPRRRSRSPRRRSPIRGGRRNEBasic
242-279SYRHGGRDDRRGGRRRERSRSPRRRYYRSRSRSRSWSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-122RRERSRSPRSRSRSRSRSRSPKREARSRSRSPVRRSSSRRHDSPKRRRSFSRSRSRSPRGDRRGRRRSPSPPPRRRSRSPRRRSPIRGGRRN
243-279YRHGGRDDRRGGRRRERSRSPRRRYYRSRSRSRSWSR
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12363  RRM_TRA2  
Amino Acid Sequences MADYDRPASPKDEYDQRAIKSEDQQPMEDVRRERSRSPRSRSRSRSRSRSPKREARSRSRSPVRRSSSRRHDSPKRRRSFSRSRSRSPRGDRRGRRRSPSPPPRRRSRSPRRRSPIRGGRRNEANKEFHGTRDEPEMSNILGVFGLSLRTREVDLEEVFREFGTIEKVTIVYDHRSNRSRGFGFVYFKDQAEATRARDALNGMDIDDRKIRVDYSVTHRPHTPTPGEYMGERKPGYDRDRGSYRHGGRDDRRGGRRRERSRSPRRRYYRSRSRSRSWSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.5
3 0.48
4 0.51
5 0.5
6 0.49
7 0.47
8 0.51
9 0.51
10 0.47
11 0.46
12 0.42
13 0.46
14 0.47
15 0.45
16 0.39
17 0.39
18 0.45
19 0.48
20 0.53
21 0.58
22 0.63
23 0.67
24 0.74
25 0.76
26 0.77
27 0.83
28 0.87
29 0.87
30 0.87
31 0.87
32 0.89
33 0.89
34 0.92
35 0.92
36 0.93
37 0.91
38 0.9
39 0.89
40 0.89
41 0.87
42 0.87
43 0.86
44 0.83
45 0.84
46 0.85
47 0.84
48 0.82
49 0.83
50 0.8
51 0.81
52 0.79
53 0.79
54 0.8
55 0.8
56 0.79
57 0.79
58 0.81
59 0.82
60 0.86
61 0.86
62 0.84
63 0.82
64 0.82
65 0.81
66 0.82
67 0.81
68 0.81
69 0.78
70 0.79
71 0.82
72 0.83
73 0.83
74 0.82
75 0.82
76 0.81
77 0.84
78 0.84
79 0.85
80 0.89
81 0.86
82 0.84
83 0.81
84 0.8
85 0.81
86 0.82
87 0.82
88 0.82
89 0.82
90 0.85
91 0.85
92 0.86
93 0.85
94 0.86
95 0.86
96 0.86
97 0.89
98 0.88
99 0.89
100 0.87
101 0.87
102 0.86
103 0.85
104 0.84
105 0.78
106 0.74
107 0.74
108 0.72
109 0.67
110 0.62
111 0.55
112 0.47
113 0.48
114 0.42
115 0.33
116 0.32
117 0.27
118 0.22
119 0.24
120 0.24
121 0.19
122 0.19
123 0.19
124 0.14
125 0.13
126 0.12
127 0.07
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.08
140 0.09
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.1
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.08
156 0.1
157 0.11
158 0.1
159 0.15
160 0.18
161 0.23
162 0.27
163 0.29
164 0.31
165 0.36
166 0.34
167 0.31
168 0.32
169 0.31
170 0.32
171 0.31
172 0.34
173 0.28
174 0.27
175 0.26
176 0.21
177 0.18
178 0.19
179 0.2
180 0.17
181 0.2
182 0.21
183 0.2
184 0.21
185 0.22
186 0.17
187 0.17
188 0.15
189 0.11
190 0.15
191 0.14
192 0.16
193 0.17
194 0.17
195 0.16
196 0.16
197 0.16
198 0.14
199 0.16
200 0.19
201 0.24
202 0.33
203 0.34
204 0.36
205 0.39
206 0.41
207 0.43
208 0.44
209 0.39
210 0.32
211 0.35
212 0.36
213 0.34
214 0.31
215 0.32
216 0.3
217 0.33
218 0.31
219 0.27
220 0.27
221 0.34
222 0.38
223 0.41
224 0.41
225 0.42
226 0.49
227 0.5
228 0.54
229 0.56
230 0.55
231 0.56
232 0.57
233 0.59
234 0.58
235 0.65
236 0.67
237 0.66
238 0.71
239 0.71
240 0.76
241 0.78
242 0.83
243 0.83
244 0.84
245 0.86
246 0.87
247 0.91
248 0.93
249 0.92
250 0.92
251 0.92
252 0.93
253 0.92
254 0.92
255 0.92
256 0.91
257 0.92
258 0.9
259 0.89