Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

S2JMB4

Protein Details
Accession S2JMB4    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-36ASLMERARQKRREDEERRRREERABasic
304-323DPAARKPSAPPRRRYRDEEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-76ARQKRREDEERRRREERALREREEAQAQLARKRELQDKRQKSLIDQKKLMKGQEKKKI
201-226PKKVNAQKRDRRSIAEIQREIRRSKG
254-317PPPSSASIPARRRPLSPPPPRPTSKRPALVADRKPPPPAMRRMPFSGRPLDPAARKPSAPPRRR
412-419RLKKRRKN
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MAQATQVAKQQDASLMERARQKRREDEERRRREERALREREEAQAQLARKRELQDKRQKSLIDQKKLMKGQEKKKIQTEKSVKSRTNNAFSNVKSTPASRKNAAVLFAEKKKPVHMSFDDLMKKAKEQSVSKGGSKDKATTPPPPKKYGTYEKGTSSGNDSNTPTIYNRIRKPEPTKSSPAHLEGGMSARERARQLVSEPPKKVNAQKRDRRSIAEIQREIRRSKGIRSDDEDERPRDPRLSGSSSKSSSRYPPPPSSASIPARRRPLSPPPPRPTSKRPALVADRKPPPPAMRRMPFSGRPLDPAARKPSAPPRRRYRDEEEDEEDEELASFIVDDDDDDDPRYSRGPRRNSYSDEISKIFRYDRTRYANDPVYSDDDMEADARDVLREEKRSERIARREDQIEEQKELERLKKRRKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.34
4 0.42
5 0.48
6 0.53
7 0.57
8 0.6
9 0.63
10 0.7
11 0.77
12 0.79
13 0.83
14 0.84
15 0.88
16 0.89
17 0.83
18 0.77
19 0.76
20 0.74
21 0.74
22 0.74
23 0.72
24 0.68
25 0.69
26 0.68
27 0.62
28 0.57
29 0.47
30 0.4
31 0.36
32 0.34
33 0.34
34 0.37
35 0.34
36 0.34
37 0.38
38 0.43
39 0.48
40 0.56
41 0.62
42 0.66
43 0.69
44 0.71
45 0.68
46 0.66
47 0.67
48 0.66
49 0.65
50 0.62
51 0.64
52 0.67
53 0.7
54 0.68
55 0.67
56 0.66
57 0.67
58 0.7
59 0.72
60 0.7
61 0.75
62 0.79
63 0.73
64 0.74
65 0.74
66 0.74
67 0.75
68 0.78
69 0.73
70 0.68
71 0.75
72 0.72
73 0.7
74 0.63
75 0.58
76 0.55
77 0.51
78 0.53
79 0.43
80 0.38
81 0.31
82 0.31
83 0.36
84 0.37
85 0.42
86 0.37
87 0.4
88 0.42
89 0.42
90 0.42
91 0.34
92 0.32
93 0.33
94 0.37
95 0.38
96 0.36
97 0.34
98 0.36
99 0.4
100 0.37
101 0.39
102 0.35
103 0.38
104 0.37
105 0.44
106 0.43
107 0.38
108 0.39
109 0.31
110 0.3
111 0.27
112 0.28
113 0.27
114 0.27
115 0.33
116 0.39
117 0.41
118 0.43
119 0.44
120 0.43
121 0.42
122 0.41
123 0.38
124 0.33
125 0.37
126 0.38
127 0.42
128 0.5
129 0.54
130 0.57
131 0.59
132 0.58
133 0.55
134 0.6
135 0.6
136 0.57
137 0.53
138 0.52
139 0.48
140 0.47
141 0.43
142 0.36
143 0.31
144 0.28
145 0.24
146 0.23
147 0.22
148 0.21
149 0.21
150 0.22
151 0.17
152 0.19
153 0.23
154 0.28
155 0.31
156 0.38
157 0.4
158 0.46
159 0.53
160 0.58
161 0.59
162 0.58
163 0.61
164 0.55
165 0.56
166 0.52
167 0.47
168 0.38
169 0.31
170 0.25
171 0.18
172 0.18
173 0.15
174 0.12
175 0.11
176 0.1
177 0.12
178 0.12
179 0.13
180 0.12
181 0.12
182 0.14
183 0.22
184 0.3
185 0.35
186 0.36
187 0.37
188 0.39
189 0.4
190 0.46
191 0.45
192 0.47
193 0.51
194 0.58
195 0.64
196 0.69
197 0.69
198 0.65
199 0.61
200 0.6
201 0.57
202 0.57
203 0.51
204 0.47
205 0.5
206 0.5
207 0.45
208 0.38
209 0.36
210 0.29
211 0.31
212 0.36
213 0.35
214 0.36
215 0.4
216 0.44
217 0.42
218 0.47
219 0.47
220 0.4
221 0.37
222 0.36
223 0.32
224 0.28
225 0.24
226 0.22
227 0.23
228 0.27
229 0.28
230 0.31
231 0.35
232 0.35
233 0.37
234 0.35
235 0.33
236 0.32
237 0.36
238 0.39
239 0.41
240 0.44
241 0.46
242 0.47
243 0.47
244 0.46
245 0.46
246 0.45
247 0.47
248 0.48
249 0.49
250 0.53
251 0.52
252 0.5
253 0.48
254 0.53
255 0.55
256 0.59
257 0.65
258 0.64
259 0.7
260 0.72
261 0.74
262 0.71
263 0.7
264 0.68
265 0.63
266 0.59
267 0.58
268 0.63
269 0.66
270 0.64
271 0.64
272 0.61
273 0.57
274 0.57
275 0.53
276 0.5
277 0.48
278 0.5
279 0.51
280 0.51
281 0.53
282 0.57
283 0.59
284 0.58
285 0.55
286 0.54
287 0.45
288 0.43
289 0.42
290 0.42
291 0.4
292 0.4
293 0.43
294 0.38
295 0.37
296 0.39
297 0.46
298 0.51
299 0.56
300 0.59
301 0.64
302 0.71
303 0.78
304 0.8
305 0.78
306 0.78
307 0.77
308 0.74
309 0.69
310 0.61
311 0.56
312 0.49
313 0.39
314 0.28
315 0.21
316 0.15
317 0.08
318 0.06
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.06
325 0.08
326 0.09
327 0.11
328 0.12
329 0.12
330 0.13
331 0.16
332 0.19
333 0.26
334 0.34
335 0.42
336 0.48
337 0.57
338 0.63
339 0.66
340 0.68
341 0.69
342 0.65
343 0.6
344 0.55
345 0.5
346 0.45
347 0.41
348 0.36
349 0.33
350 0.35
351 0.36
352 0.43
353 0.48
354 0.51
355 0.53
356 0.59
357 0.61
358 0.55
359 0.52
360 0.46
361 0.43
362 0.39
363 0.36
364 0.28
365 0.2
366 0.19
367 0.18
368 0.14
369 0.1
370 0.1
371 0.09
372 0.09
373 0.1
374 0.15
375 0.2
376 0.24
377 0.28
378 0.35
379 0.41
380 0.48
381 0.56
382 0.6
383 0.64
384 0.68
385 0.7
386 0.68
387 0.67
388 0.64
389 0.64
390 0.65
391 0.59
392 0.54
393 0.5
394 0.47
395 0.46
396 0.46
397 0.45
398 0.45
399 0.5