Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2K804

Protein Details
Accession S2K804    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
513-538QSSSQQQQQNKKKSRYSNSQQQHDNNHydrophilic
544-567AGGGKIDNKKKKSNNNKSATHESKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
Amino Acid Sequences MYYPPIDNAPNAAAVASSPAIIPTTRDEDDLEIIVHDESMNNVSSVDTRRSSSSDQNKPIDLKKQLEFYFSRQNLVNDTFLVSQMDADLYVPISLVANFRRVREWTMDIDFIVQTLRDSSAVTVDESGTKVKPNISVQRNTVIWRDVPECTQDEINDLLKELNSPPVQSIKQDIGNMWYFTFESEDDALKLLLGVRGKSFKGQAIAARMKSEPVLRVQGRAFAAAAASVSPSFTHQNIKAEGQNQSSSSSHEPPIALSELPPVYAYNGVGMNGSNFYYPSYPSYNSNKRNNYGHVPFRYNNNQQTHINNNNSNNSYQQQQQQQQQQQQLHHHHHQPPTSLSNRHENRFIDNQKSIQVGGRSARGGGYNTNKPRYYRNVPESNTADNVVENRLSKLTLNDTASRPPPSQPQRQAQHSTQQRQTSTLYQNNKQQHHTKMSNNSKFTNNNNSNSHHSQRQQQQQQPNVLYAKPNDTTNDTASSSNTNTATATAATNTNRNSNTQSNLPSKQQHPHQSSSQQQQQNKKKSRYSNSQQQHDNNSNTHHAGGGKIDNKKKKSNNNKSATHESKENTKQNKQEIVELKPTHFPPLPNQQPSTAIAMDQPAPPARSVADIVKSTVAPQSKKQTAEETPHKASQPVSPPTPPATATHTEQEITNAFSYADMLKKKHH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.13
3 0.1
4 0.09
5 0.08
6 0.09
7 0.1
8 0.1
9 0.12
10 0.14
11 0.2
12 0.21
13 0.22
14 0.23
15 0.24
16 0.26
17 0.25
18 0.21
19 0.15
20 0.15
21 0.13
22 0.12
23 0.1
24 0.08
25 0.08
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.09
30 0.1
31 0.14
32 0.18
33 0.22
34 0.22
35 0.23
36 0.26
37 0.31
38 0.35
39 0.41
40 0.47
41 0.52
42 0.58
43 0.6
44 0.62
45 0.62
46 0.63
47 0.62
48 0.58
49 0.54
50 0.5
51 0.54
52 0.5
53 0.52
54 0.49
55 0.46
56 0.5
57 0.45
58 0.44
59 0.39
60 0.39
61 0.39
62 0.39
63 0.34
64 0.24
65 0.26
66 0.23
67 0.21
68 0.21
69 0.15
70 0.12
71 0.11
72 0.11
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.07
82 0.1
83 0.11
84 0.19
85 0.2
86 0.22
87 0.26
88 0.27
89 0.31
90 0.33
91 0.35
92 0.32
93 0.35
94 0.34
95 0.3
96 0.3
97 0.26
98 0.2
99 0.17
100 0.12
101 0.08
102 0.09
103 0.1
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.11
108 0.12
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.13
114 0.15
115 0.13
116 0.14
117 0.15
118 0.16
119 0.21
120 0.27
121 0.36
122 0.41
123 0.45
124 0.46
125 0.5
126 0.5
127 0.47
128 0.42
129 0.35
130 0.29
131 0.28
132 0.28
133 0.23
134 0.23
135 0.24
136 0.24
137 0.23
138 0.23
139 0.19
140 0.19
141 0.2
142 0.21
143 0.18
144 0.16
145 0.14
146 0.13
147 0.14
148 0.13
149 0.17
150 0.16
151 0.16
152 0.17
153 0.22
154 0.23
155 0.22
156 0.25
157 0.22
158 0.24
159 0.25
160 0.24
161 0.23
162 0.25
163 0.24
164 0.21
165 0.18
166 0.15
167 0.14
168 0.15
169 0.11
170 0.1
171 0.11
172 0.12
173 0.11
174 0.12
175 0.11
176 0.09
177 0.09
178 0.07
179 0.09
180 0.09
181 0.1
182 0.11
183 0.14
184 0.15
185 0.17
186 0.18
187 0.18
188 0.19
189 0.2
190 0.21
191 0.26
192 0.31
193 0.29
194 0.3
195 0.28
196 0.26
197 0.26
198 0.25
199 0.19
200 0.17
201 0.24
202 0.23
203 0.26
204 0.26
205 0.29
206 0.27
207 0.26
208 0.23
209 0.14
210 0.14
211 0.1
212 0.1
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.07
219 0.09
220 0.1
221 0.15
222 0.16
223 0.21
224 0.23
225 0.25
226 0.26
227 0.27
228 0.29
229 0.27
230 0.26
231 0.23
232 0.24
233 0.22
234 0.22
235 0.23
236 0.22
237 0.21
238 0.21
239 0.2
240 0.17
241 0.2
242 0.18
243 0.14
244 0.11
245 0.13
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.1
267 0.13
268 0.14
269 0.19
270 0.27
271 0.36
272 0.43
273 0.51
274 0.53
275 0.53
276 0.56
277 0.55
278 0.53
279 0.5
280 0.49
281 0.45
282 0.45
283 0.43
284 0.45
285 0.49
286 0.48
287 0.49
288 0.45
289 0.45
290 0.41
291 0.44
292 0.45
293 0.44
294 0.43
295 0.39
296 0.38
297 0.39
298 0.38
299 0.35
300 0.3
301 0.24
302 0.22
303 0.21
304 0.24
305 0.27
306 0.31
307 0.36
308 0.43
309 0.47
310 0.51
311 0.53
312 0.52
313 0.48
314 0.5
315 0.5
316 0.48
317 0.48
318 0.49
319 0.49
320 0.49
321 0.47
322 0.42
323 0.38
324 0.37
325 0.36
326 0.32
327 0.29
328 0.35
329 0.37
330 0.36
331 0.38
332 0.34
333 0.35
334 0.4
335 0.41
336 0.36
337 0.34
338 0.33
339 0.31
340 0.3
341 0.26
342 0.2
343 0.17
344 0.14
345 0.14
346 0.15
347 0.13
348 0.13
349 0.13
350 0.11
351 0.11
352 0.14
353 0.18
354 0.24
355 0.28
356 0.33
357 0.34
358 0.34
359 0.38
360 0.42
361 0.44
362 0.45
363 0.49
364 0.52
365 0.53
366 0.58
367 0.55
368 0.49
369 0.43
370 0.35
371 0.27
372 0.19
373 0.18
374 0.13
375 0.12
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.11
382 0.13
383 0.16
384 0.18
385 0.21
386 0.22
387 0.25
388 0.27
389 0.29
390 0.26
391 0.24
392 0.31
393 0.35
394 0.42
395 0.46
396 0.53
397 0.56
398 0.62
399 0.66
400 0.59
401 0.61
402 0.6
403 0.6
404 0.56
405 0.55
406 0.49
407 0.45
408 0.45
409 0.43
410 0.42
411 0.42
412 0.42
413 0.41
414 0.48
415 0.53
416 0.54
417 0.52
418 0.52
419 0.51
420 0.54
421 0.55
422 0.54
423 0.57
424 0.65
425 0.67
426 0.63
427 0.6
428 0.56
429 0.55
430 0.53
431 0.54
432 0.48
433 0.47
434 0.48
435 0.49
436 0.51
437 0.53
438 0.52
439 0.47
440 0.44
441 0.47
442 0.52
443 0.58
444 0.6
445 0.62
446 0.66
447 0.66
448 0.7
449 0.63
450 0.58
451 0.5
452 0.42
453 0.38
454 0.31
455 0.3
456 0.24
457 0.24
458 0.22
459 0.24
460 0.26
461 0.25
462 0.26
463 0.23
464 0.22
465 0.22
466 0.22
467 0.19
468 0.2
469 0.18
470 0.15
471 0.14
472 0.14
473 0.14
474 0.12
475 0.11
476 0.09
477 0.12
478 0.13
479 0.17
480 0.18
481 0.22
482 0.22
483 0.24
484 0.28
485 0.29
486 0.31
487 0.32
488 0.37
489 0.38
490 0.41
491 0.44
492 0.44
493 0.45
494 0.49
495 0.52
496 0.56
497 0.55
498 0.57
499 0.58
500 0.6
501 0.63
502 0.65
503 0.66
504 0.63
505 0.63
506 0.69
507 0.72
508 0.76
509 0.78
510 0.77
511 0.76
512 0.79
513 0.82
514 0.82
515 0.82
516 0.82
517 0.81
518 0.81
519 0.81
520 0.76
521 0.76
522 0.72
523 0.67
524 0.58
525 0.53
526 0.49
527 0.42
528 0.37
529 0.3
530 0.23
531 0.2
532 0.21
533 0.23
534 0.25
535 0.32
536 0.4
537 0.46
538 0.51
539 0.6
540 0.65
541 0.7
542 0.75
543 0.79
544 0.82
545 0.82
546 0.84
547 0.83
548 0.85
549 0.8
550 0.72
551 0.66
552 0.58
553 0.59
554 0.61
555 0.62
556 0.59
557 0.61
558 0.64
559 0.66
560 0.72
561 0.63
562 0.63
563 0.59
564 0.57
565 0.59
566 0.54
567 0.49
568 0.47
569 0.46
570 0.44
571 0.41
572 0.37
573 0.35
574 0.44
575 0.51
576 0.51
577 0.52
578 0.48
579 0.48
580 0.48
581 0.46
582 0.35
583 0.26
584 0.21
585 0.22
586 0.22
587 0.2
588 0.21
589 0.2
590 0.21
591 0.21
592 0.2
593 0.18
594 0.19
595 0.21
596 0.22
597 0.24
598 0.23
599 0.25
600 0.26
601 0.25
602 0.24
603 0.27
604 0.28
605 0.26
606 0.32
607 0.4
608 0.44
609 0.47
610 0.49
611 0.51
612 0.52
613 0.59
614 0.61
615 0.59
616 0.59
617 0.61
618 0.59
619 0.53
620 0.48
621 0.46
622 0.46
623 0.45
624 0.44
625 0.42
626 0.45
627 0.47
628 0.47
629 0.41
630 0.34
631 0.34
632 0.34
633 0.35
634 0.37
635 0.35
636 0.33
637 0.32
638 0.33
639 0.28
640 0.26
641 0.23
642 0.18
643 0.16
644 0.15
645 0.17
646 0.16
647 0.21
648 0.22