Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JD87

Protein Details
Accession S2JD87    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-84EEKARLAEKAEKKRLKKEMTKEERQAQREINRKNREKKKSKKDLNKKRKRGELTDDEEBasic
102-121VEPVKKPKAEKKKKEMEYGIBasic
307-326RSKPWLMREKQKAERPHNTSHydrophilic
341-387SASEEQPYKRQRKDYNQGGEHGEEKREFRERRPKKAVNHEKVKPGQAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-77RLAEKAEKKRLKKEMTKEERQAQREINRKNREKKKSKKDLNKKRKRG
106-115KKPKAEKKKK
365-378KREFRERRPKKAVN
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGSKDKKEQDDAFNVLQEITDVLVDEEEKARLAEKAEKKRLKKEMTKEERQAQREINRKNREKKKSKKDLNKKRKRGELTDDEEEEKEEPKEPVLDADGNVVEPVKKPKAEKKKKEMEYGIWVGNLSYGTTLATIKEFFKECGEITRIKCPKGNGAKNYNKGFAYIFFSTPEEAAKGVAMSEKKLEGRSLLIKDSENFERADGSKAPTEAEKREIKKQKNPPCPTLFLGNLSFDTTEKSIREQFEWAGEIRKVRMATFEDSGKCKGFGYVDYHEVESATKAIRAPDKHMLDGRKVRVEFGSAEAHMRSKPWLMREKQKAERPHNTSNDAAADSTAAAAAASASEEQPYKRQRKDYNQGGEHGEEKREFRERRPKKAVNHEKVKPGQALYAAQRQKPSVQEFKGTKVTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.36
3 0.29
4 0.22
5 0.15
6 0.1
7 0.08
8 0.06
9 0.06
10 0.07
11 0.07
12 0.09
13 0.1
14 0.1
15 0.11
16 0.1
17 0.11
18 0.12
19 0.15
20 0.23
21 0.31
22 0.42
23 0.52
24 0.61
25 0.66
26 0.75
27 0.81
28 0.82
29 0.82
30 0.81
31 0.82
32 0.83
33 0.86
34 0.85
35 0.84
36 0.83
37 0.77
38 0.72
39 0.68
40 0.67
41 0.66
42 0.68
43 0.69
44 0.71
45 0.77
46 0.82
47 0.85
48 0.88
49 0.89
50 0.91
51 0.92
52 0.92
53 0.93
54 0.94
55 0.95
56 0.95
57 0.96
58 0.96
59 0.95
60 0.93
61 0.92
62 0.89
63 0.85
64 0.84
65 0.82
66 0.78
67 0.74
68 0.67
69 0.59
70 0.52
71 0.45
72 0.36
73 0.28
74 0.21
75 0.17
76 0.15
77 0.14
78 0.15
79 0.14
80 0.15
81 0.16
82 0.16
83 0.14
84 0.16
85 0.15
86 0.13
87 0.13
88 0.12
89 0.1
90 0.11
91 0.17
92 0.19
93 0.21
94 0.26
95 0.36
96 0.47
97 0.58
98 0.66
99 0.7
100 0.76
101 0.8
102 0.84
103 0.79
104 0.72
105 0.69
106 0.62
107 0.52
108 0.42
109 0.35
110 0.26
111 0.22
112 0.18
113 0.1
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.08
122 0.09
123 0.12
124 0.13
125 0.13
126 0.14
127 0.15
128 0.15
129 0.18
130 0.2
131 0.22
132 0.23
133 0.32
134 0.34
135 0.34
136 0.36
137 0.33
138 0.39
139 0.45
140 0.51
141 0.48
142 0.55
143 0.61
144 0.66
145 0.68
146 0.61
147 0.51
148 0.44
149 0.37
150 0.29
151 0.26
152 0.2
153 0.18
154 0.16
155 0.17
156 0.16
157 0.15
158 0.14
159 0.09
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.12
173 0.1
174 0.12
175 0.17
176 0.17
177 0.17
178 0.17
179 0.17
180 0.17
181 0.2
182 0.19
183 0.16
184 0.14
185 0.13
186 0.13
187 0.14
188 0.16
189 0.13
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.14
194 0.15
195 0.17
196 0.15
197 0.2
198 0.24
199 0.26
200 0.35
201 0.43
202 0.47
203 0.54
204 0.62
205 0.67
206 0.71
207 0.74
208 0.72
209 0.68
210 0.65
211 0.58
212 0.52
213 0.42
214 0.34
215 0.3
216 0.23
217 0.19
218 0.16
219 0.15
220 0.1
221 0.11
222 0.1
223 0.11
224 0.1
225 0.13
226 0.16
227 0.18
228 0.19
229 0.19
230 0.18
231 0.18
232 0.19
233 0.17
234 0.16
235 0.15
236 0.15
237 0.14
238 0.17
239 0.16
240 0.14
241 0.17
242 0.18
243 0.19
244 0.2
245 0.24
246 0.23
247 0.25
248 0.28
249 0.25
250 0.22
251 0.19
252 0.18
253 0.15
254 0.15
255 0.19
256 0.19
257 0.22
258 0.23
259 0.23
260 0.21
261 0.21
262 0.18
263 0.13
264 0.11
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.12
269 0.18
270 0.19
271 0.24
272 0.32
273 0.34
274 0.35
275 0.4
276 0.39
277 0.41
278 0.47
279 0.45
280 0.43
281 0.41
282 0.4
283 0.36
284 0.35
285 0.28
286 0.25
287 0.24
288 0.17
289 0.19
290 0.18
291 0.19
292 0.17
293 0.16
294 0.15
295 0.17
296 0.19
297 0.25
298 0.34
299 0.38
300 0.48
301 0.58
302 0.65
303 0.69
304 0.73
305 0.76
306 0.76
307 0.8
308 0.78
309 0.77
310 0.74
311 0.69
312 0.62
313 0.54
314 0.48
315 0.38
316 0.31
317 0.21
318 0.16
319 0.12
320 0.1
321 0.08
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.03
327 0.04
328 0.05
329 0.05
330 0.07
331 0.09
332 0.1
333 0.19
334 0.28
335 0.36
336 0.42
337 0.51
338 0.59
339 0.69
340 0.78
341 0.8
342 0.81
343 0.77
344 0.74
345 0.69
346 0.61
347 0.54
348 0.47
349 0.41
350 0.33
351 0.31
352 0.32
353 0.38
354 0.38
355 0.44
356 0.53
357 0.57
358 0.65
359 0.74
360 0.77
361 0.77
362 0.86
363 0.88
364 0.87
365 0.89
366 0.84
367 0.83
368 0.81
369 0.77
370 0.7
371 0.6
372 0.52
373 0.45
374 0.44
375 0.4
376 0.44
377 0.44
378 0.43
379 0.45
380 0.45
381 0.46
382 0.48
383 0.51
384 0.51
385 0.49
386 0.55
387 0.54
388 0.58
389 0.63