Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S2JDP5

Protein Details
Accession S2JDP5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
203-227LEFTTGQRRPKRKAKYNSVEREQKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
210-217RRPKRKAK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.333, cyto_mito 2.166, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MASAKVFAKLQADQNSITQLAEHHSKQGSNLSNSSLAKKASLAAQRWHQNVLANQASAQNKKDPPSLCLHLYPTYFKFEHEDGFFSYKSQFKDFLACIKDKRLPGDLMDVFDQAQCRYYDGCLIVEIQDHRGQGTETAATTKRIVMKPTAESIWTDIALLSEEWGFPWTESIALQVEAQILIATEEPLCLDPTIQVTRVSNALEFTTGQRRPKRKAKYNSVEREQKLAKKAENNKLMTLMDSRAKRTFPFEPSFGKISFVQDWKSKKSKQGSEALSAIDIKKGKGRKNVSEAPVLSDGRKCVRTIRFERSEADKKVYTIVNIYVYNGDYDGIFRWGTVYDTSVNGGNIDFNIGPEFLMETYVLTLKSTYGQFNTIVCDNSNVNIVPPSPSTARIPTSMQQTQQQAQQQAATNFQLQQLHAQQNRAMQAKAAMLPPHQRALLAQAQAQQQQQQQQQQAQQQTALSQAQIQAQAQAQAQVQAAQAQALAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQALAQSQSQAHMQQLQQQAQSRASTPSQSHLSTPTISHATPLQQPASLPRQSLALPGNGMNSQQQTPTQAQAQLSAQHMAALQQQQQAAMQSMALPQRATQTSVPTSQINNMLPTNAVNTPQQQQQPQGMTAIQQAALQQALNGGNGQQITPQASLQRIQQLVATGAIPLATAQQLVSQLANSGNLQRQQAAAAAAAAAAAQQQQQQQQQQQQALQAQQQAQQQVQQQQQFNQQSPVQQRMQQQQQQQVPNPAQSQASLAASQLLAQMSPQHQQQMGVLMVRRNHLAQLAQQRSISPEELQVQIRQLQQLQQGILQAHQQQQQQAQLQAQQQAQQQALQQAQVRAAAAAAAQAGRTPQVSAHQIPSQQQQQQQQQGTPQQQPQQVPQQGSPAPNAQLNPQQAQILQQLMMQRNLNAMRGRGRGGVAGQNGGPLTQQQLAALQAMRQNGGMMRNVQDLNRSAMMAGLGPNRINSAALQAAAAAAAAAQQQQQQQQQQQAATGTPGTPGLTSIAAPGNGTPNVSAAALLGQQTQGLQQFQMNLQFQQQQAAAAAAAQQRNNMMNFQQQQQQQQGNNTPNSNNANS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.39
3 0.35
4 0.31
5 0.23
6 0.17
7 0.19
8 0.24
9 0.23
10 0.26
11 0.28
12 0.29
13 0.31
14 0.38
15 0.4
16 0.38
17 0.4
18 0.37
19 0.41
20 0.42
21 0.44
22 0.39
23 0.32
24 0.28
25 0.27
26 0.26
27 0.27
28 0.33
29 0.34
30 0.36
31 0.45
32 0.52
33 0.53
34 0.53
35 0.48
36 0.46
37 0.44
38 0.46
39 0.41
40 0.33
41 0.32
42 0.36
43 0.4
44 0.38
45 0.38
46 0.38
47 0.38
48 0.42
49 0.48
50 0.43
51 0.42
52 0.46
53 0.48
54 0.44
55 0.43
56 0.43
57 0.42
58 0.42
59 0.44
60 0.38
61 0.4
62 0.36
63 0.34
64 0.35
65 0.32
66 0.35
67 0.31
68 0.32
69 0.28
70 0.32
71 0.31
72 0.26
73 0.29
74 0.28
75 0.29
76 0.3
77 0.29
78 0.26
79 0.33
80 0.34
81 0.37
82 0.39
83 0.4
84 0.39
85 0.44
86 0.48
87 0.44
88 0.47
89 0.44
90 0.4
91 0.38
92 0.44
93 0.39
94 0.36
95 0.34
96 0.3
97 0.26
98 0.25
99 0.24
100 0.16
101 0.17
102 0.14
103 0.15
104 0.16
105 0.16
106 0.19
107 0.19
108 0.19
109 0.17
110 0.18
111 0.16
112 0.19
113 0.2
114 0.19
115 0.21
116 0.2
117 0.19
118 0.19
119 0.19
120 0.16
121 0.17
122 0.15
123 0.12
124 0.17
125 0.18
126 0.2
127 0.2
128 0.23
129 0.28
130 0.3
131 0.32
132 0.33
133 0.36
134 0.38
135 0.41
136 0.39
137 0.32
138 0.3
139 0.3
140 0.27
141 0.22
142 0.18
143 0.14
144 0.12
145 0.13
146 0.12
147 0.1
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.13
180 0.16
181 0.16
182 0.18
183 0.18
184 0.19
185 0.21
186 0.21
187 0.17
188 0.15
189 0.15
190 0.14
191 0.13
192 0.16
193 0.23
194 0.26
195 0.33
196 0.41
197 0.48
198 0.55
199 0.64
200 0.72
201 0.73
202 0.8
203 0.83
204 0.86
205 0.89
206 0.91
207 0.9
208 0.89
209 0.79
210 0.77
211 0.71
212 0.66
213 0.62
214 0.57
215 0.53
216 0.53
217 0.61
218 0.63
219 0.66
220 0.62
221 0.57
222 0.54
223 0.49
224 0.42
225 0.34
226 0.28
227 0.25
228 0.25
229 0.28
230 0.28
231 0.29
232 0.28
233 0.32
234 0.34
235 0.35
236 0.38
237 0.38
238 0.39
239 0.42
240 0.45
241 0.39
242 0.36
243 0.3
244 0.29
245 0.3
246 0.28
247 0.27
248 0.3
249 0.34
250 0.39
251 0.46
252 0.46
253 0.49
254 0.57
255 0.61
256 0.61
257 0.66
258 0.62
259 0.59
260 0.56
261 0.49
262 0.4
263 0.34
264 0.27
265 0.22
266 0.19
267 0.15
268 0.19
269 0.25
270 0.3
271 0.38
272 0.44
273 0.48
274 0.56
275 0.64
276 0.61
277 0.63
278 0.57
279 0.52
280 0.5
281 0.43
282 0.35
283 0.29
284 0.28
285 0.25
286 0.26
287 0.22
288 0.25
289 0.31
290 0.39
291 0.44
292 0.51
293 0.53
294 0.53
295 0.57
296 0.58
297 0.6
298 0.53
299 0.52
300 0.43
301 0.38
302 0.4
303 0.37
304 0.29
305 0.22
306 0.22
307 0.2
308 0.19
309 0.19
310 0.16
311 0.15
312 0.15
313 0.13
314 0.11
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.08
322 0.08
323 0.1
324 0.09
325 0.1
326 0.09
327 0.1
328 0.11
329 0.12
330 0.11
331 0.1
332 0.1
333 0.08
334 0.07
335 0.09
336 0.08
337 0.07
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.05
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.1
354 0.11
355 0.12
356 0.12
357 0.14
358 0.15
359 0.15
360 0.17
361 0.16
362 0.15
363 0.13
364 0.14
365 0.13
366 0.13
367 0.14
368 0.11
369 0.1
370 0.11
371 0.11
372 0.1
373 0.1
374 0.13
375 0.12
376 0.14
377 0.16
378 0.19
379 0.2
380 0.2
381 0.23
382 0.23
383 0.29
384 0.3
385 0.29
386 0.31
387 0.33
388 0.33
389 0.35
390 0.36
391 0.3
392 0.28
393 0.29
394 0.28
395 0.25
396 0.25
397 0.22
398 0.19
399 0.19
400 0.2
401 0.19
402 0.15
403 0.19
404 0.22
405 0.28
406 0.28
407 0.28
408 0.28
409 0.29
410 0.34
411 0.31
412 0.26
413 0.19
414 0.19
415 0.19
416 0.19
417 0.18
418 0.15
419 0.15
420 0.2
421 0.21
422 0.21
423 0.2
424 0.17
425 0.16
426 0.2
427 0.23
428 0.18
429 0.18
430 0.21
431 0.23
432 0.26
433 0.27
434 0.25
435 0.23
436 0.28
437 0.31
438 0.32
439 0.34
440 0.35
441 0.39
442 0.41
443 0.42
444 0.35
445 0.32
446 0.27
447 0.24
448 0.23
449 0.18
450 0.12
451 0.1
452 0.11
453 0.12
454 0.13
455 0.12
456 0.11
457 0.11
458 0.13
459 0.12
460 0.13
461 0.11
462 0.12
463 0.12
464 0.12
465 0.11
466 0.11
467 0.1
468 0.08
469 0.08
470 0.06
471 0.07
472 0.05
473 0.06
474 0.04
475 0.05
476 0.05
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.09
482 0.09
483 0.1
484 0.1
485 0.11
486 0.11
487 0.12
488 0.12
489 0.12
490 0.12
491 0.12
492 0.12
493 0.12
494 0.12
495 0.12
496 0.12
497 0.12
498 0.12
499 0.12
500 0.12
501 0.12
502 0.12
503 0.12
504 0.12
505 0.12
506 0.12
507 0.12
508 0.12
509 0.12
510 0.12
511 0.12
512 0.12
513 0.12
514 0.12
515 0.12
516 0.12
517 0.12
518 0.12
519 0.12
520 0.12
521 0.12
522 0.12
523 0.12
524 0.12
525 0.12
526 0.12
527 0.12
528 0.12
529 0.12
530 0.12
531 0.12
532 0.12
533 0.12
534 0.12
535 0.12
536 0.12
537 0.12
538 0.12
539 0.1
540 0.1
541 0.09
542 0.09
543 0.08
544 0.07
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.11
552 0.11
553 0.17
554 0.21
555 0.22
556 0.24
557 0.26
558 0.27
559 0.25
560 0.26
561 0.2
562 0.18
563 0.17
564 0.18
565 0.15
566 0.17
567 0.19
568 0.19
569 0.18
570 0.18
571 0.19
572 0.17
573 0.17
574 0.16
575 0.15
576 0.14
577 0.14
578 0.12
579 0.13
580 0.15
581 0.16
582 0.15
583 0.13
584 0.13
585 0.17
586 0.22
587 0.2
588 0.18
589 0.16
590 0.17
591 0.17
592 0.2
593 0.17
594 0.12
595 0.11
596 0.12
597 0.13
598 0.11
599 0.12
600 0.1
601 0.1
602 0.1
603 0.1
604 0.1
605 0.12
606 0.13
607 0.15
608 0.15
609 0.16
610 0.15
611 0.17
612 0.17
613 0.16
614 0.16
615 0.16
616 0.14
617 0.12
618 0.12
619 0.11
620 0.13
621 0.12
622 0.13
623 0.14
624 0.14
625 0.14
626 0.14
627 0.14
628 0.12
629 0.1
630 0.08
631 0.06
632 0.09
633 0.1
634 0.1
635 0.09
636 0.09
637 0.13
638 0.14
639 0.16
640 0.15
641 0.17
642 0.19
643 0.21
644 0.22
645 0.2
646 0.2
647 0.19
648 0.22
649 0.19
650 0.19
651 0.17
652 0.16
653 0.14
654 0.14
655 0.14
656 0.11
657 0.12
658 0.1
659 0.13
660 0.15
661 0.2
662 0.23
663 0.22
664 0.24
665 0.27
666 0.27
667 0.26
668 0.24
669 0.19
670 0.17
671 0.17
672 0.15
673 0.11
674 0.09
675 0.09
676 0.09
677 0.09
678 0.08
679 0.06
680 0.07
681 0.07
682 0.07
683 0.07
684 0.07
685 0.08
686 0.08
687 0.08
688 0.07
689 0.07
690 0.09
691 0.1
692 0.11
693 0.11
694 0.12
695 0.13
696 0.14
697 0.19
698 0.17
699 0.17
700 0.17
701 0.16
702 0.16
703 0.15
704 0.13
705 0.07
706 0.07
707 0.07
708 0.05
709 0.04
710 0.05
711 0.04
712 0.04
713 0.04
714 0.05
715 0.06
716 0.07
717 0.07
718 0.06
719 0.07
720 0.08
721 0.09
722 0.08
723 0.1
724 0.13
725 0.15
726 0.16
727 0.15
728 0.15
729 0.15
730 0.16
731 0.13
732 0.1
733 0.07
734 0.07
735 0.06
736 0.05
737 0.05
738 0.03
739 0.03
740 0.04
741 0.04
742 0.07
743 0.1
744 0.14
745 0.19
746 0.24
747 0.29
748 0.35
749 0.39
750 0.39
751 0.38
752 0.38
753 0.37
754 0.34
755 0.31
756 0.29
757 0.26
758 0.27
759 0.29
760 0.27
761 0.24
762 0.25
763 0.27
764 0.31
765 0.34
766 0.36
767 0.35
768 0.36
769 0.45
770 0.45
771 0.42
772 0.39
773 0.36
774 0.36
775 0.38
776 0.41
777 0.34
778 0.36
779 0.41
780 0.45
781 0.52
782 0.52
783 0.53
784 0.55
785 0.6
786 0.6
787 0.58
788 0.57
789 0.5
790 0.48
791 0.43
792 0.37
793 0.3
794 0.25
795 0.23
796 0.17
797 0.17
798 0.13
799 0.11
800 0.11
801 0.1
802 0.1
803 0.1
804 0.08
805 0.07
806 0.07
807 0.1
808 0.11
809 0.14
810 0.14
811 0.16
812 0.16
813 0.17
814 0.17
815 0.18
816 0.17
817 0.17
818 0.18
819 0.18
820 0.19
821 0.2
822 0.2
823 0.17
824 0.17
825 0.16
826 0.16
827 0.19
828 0.28
829 0.3
830 0.31
831 0.31
832 0.3
833 0.31
834 0.33
835 0.28
836 0.18
837 0.18
838 0.19
839 0.22
840 0.23
841 0.22
842 0.21
843 0.24
844 0.25
845 0.23
846 0.22
847 0.23
848 0.25
849 0.27
850 0.26
851 0.22
852 0.24
853 0.22
854 0.21
855 0.21
856 0.2
857 0.23
858 0.27
859 0.28
860 0.28
861 0.31
862 0.36
863 0.36
864 0.34
865 0.31
866 0.31
867 0.33
868 0.35
869 0.33
870 0.32
871 0.32
872 0.33
873 0.32
874 0.28
875 0.27
876 0.26
877 0.26
878 0.24
879 0.24
880 0.22
881 0.23
882 0.22
883 0.2
884 0.15
885 0.14
886 0.11
887 0.07
888 0.06
889 0.06
890 0.05
891 0.05
892 0.05
893 0.06
894 0.07
895 0.07
896 0.07
897 0.07
898 0.12
899 0.18
900 0.2
901 0.24
902 0.26
903 0.29
904 0.32
905 0.37
906 0.39
907 0.39
908 0.42
909 0.46
910 0.52
911 0.57
912 0.57
913 0.53
914 0.52
915 0.55
916 0.56
917 0.53
918 0.51
919 0.49
920 0.52
921 0.52
922 0.52
923 0.54
924 0.53
925 0.5
926 0.45
927 0.45
928 0.42
929 0.42
930 0.39
931 0.32
932 0.29
933 0.29
934 0.28
935 0.26
936 0.29
937 0.31
938 0.3
939 0.28
940 0.27
941 0.24
942 0.27
943 0.26
944 0.21
945 0.17
946 0.17
947 0.22
948 0.23
949 0.27
950 0.25
951 0.22
952 0.26
953 0.27
954 0.3
955 0.26
956 0.26
957 0.29
958 0.3
959 0.32
960 0.28
961 0.28
962 0.25
963 0.26
964 0.28
965 0.23
966 0.23
967 0.21
968 0.2
969 0.19
970 0.18
971 0.15
972 0.1
973 0.12
974 0.12
975 0.13
976 0.11
977 0.13
978 0.14
979 0.16
980 0.15
981 0.15
982 0.15
983 0.16
984 0.16
985 0.15
986 0.15
987 0.15
988 0.18
989 0.18
990 0.18
991 0.19
992 0.24
993 0.25
994 0.24
995 0.27
996 0.26
997 0.28
998 0.26
999 0.24
1000 0.19
1001 0.18
1002 0.18
1003 0.15
1004 0.16
1005 0.14
1006 0.15
1007 0.15
1008 0.15
1009 0.16
1010 0.16
1011 0.16
1012 0.13
1013 0.14
1014 0.14
1015 0.14
1016 0.13
1017 0.12
1018 0.11
1019 0.1
1020 0.1
1021 0.05
1022 0.03
1023 0.04
1024 0.04
1025 0.05
1026 0.06
1027 0.08
1028 0.11
1029 0.15
1030 0.2
1031 0.24
1032 0.29
1033 0.36
1034 0.4
1035 0.38
1036 0.39
1037 0.36
1038 0.33
1039 0.3
1040 0.25
1041 0.19
1042 0.15
1043 0.15
1044 0.13
1045 0.11
1046 0.11
1047 0.11
1048 0.1
1049 0.1
1050 0.12
1051 0.14
1052 0.13
1053 0.14
1054 0.14
1055 0.17
1056 0.17
1057 0.17
1058 0.15
1059 0.13
1060 0.14
1061 0.14
1062 0.12
1063 0.08
1064 0.09
1065 0.1
1066 0.1
1067 0.1
1068 0.09
1069 0.09
1070 0.1
1071 0.12
1072 0.14
1073 0.14
1074 0.14
1075 0.15
1076 0.18
1077 0.2
1078 0.28
1079 0.27
1080 0.25
1081 0.28
1082 0.32
1083 0.31
1084 0.32
1085 0.3
1086 0.24
1087 0.22
1088 0.22
1089 0.17
1090 0.12
1091 0.17
1092 0.18
1093 0.21
1094 0.2
1095 0.21
1096 0.23
1097 0.27
1098 0.28
1099 0.26
1100 0.24
1101 0.29
1102 0.33
1103 0.36
1104 0.4
1105 0.41
1106 0.47
1107 0.52
1108 0.56
1109 0.52
1110 0.56
1111 0.6
1112 0.61
1113 0.62
1114 0.59
1115 0.52
1116 0.52